• 제목/요약/키워드: Indigenous yeast species

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문헌 및 기탁 균주 현황분석을 통한 자생 효모 목록 (Comprehensive Review of Indigenous Yeast Species in Korea: A Literature and Culture Collection Analysis)

  • 안초롱;김민경;김창무
    • 한국균학회지
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    • 제49권2호
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    • pp.211-242
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    • 2021
  • 국내 효모연구는 1910년 이래로 현재까지 주류, 식품, 환경 등의 분야에서 활발히 진행되고 있다. 그러나 국내에 서식하는 효모의 종 수와 목록에 대해서는 연구된 바가 없다. 한국에서 보고된 문헌에 기재된 효모 종과 균주센터가 보유하고 있는 효모를 조사한 결과 128속 681종(26변종 포함)이 국내에서 보고된 효모 종 수로 나타났다. 발표종 681종에 대한 분류학적 재검토 결과 142속 500종(9변종 포함)으로 확인되었다. 이 중 국가생물종목록에 기재되지 않아 새롭게 등록가능성이 있는 종은 334종이다. 국가생물종목록은 국내 서식 생물의 다양성 보전 및 관리에 활용되는 자료로, 국가 생물자원의 주권확보라는 측면에서 매우 중요하다. 따라서 국내에 서식하는 것으로 보고된 효모 종의 문헌과 균주에 대한 추가 검증 연구를 통해 국가생물종목록에 등록하는 후속 연구가 필요하다.

Antioxidant Activity of Indigenous Trametes Species in Korea

  • Kim, Minkyeong;Ahn, Chorong;Kim, Changmu
    • 한국균학회지
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    • 제49권4호
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    • pp.433-440
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    • 2021
  • The fungal genus Trametes is globally distributed and comprises various wood-decay species, including the well-known medicinal mushroom Trametes versicolor, a popular remedy in traditional Asian medicine. Trametes species produce antioxidants, which have a wide range of health benefits. The pressent study evaluated seven indigenous Trametes species from Korea, which were cultivated in three different media (dextrose-yeast extract, DY; malt extract-yeast extract, MY; malt extract broth, MEB) and tested for antioxidant activity using the 2,2-diphenyl-1-picrylhydrazyl and 2,2'-azino-bis(3-ethylbenzothiazoline-6-sulfonic acid) assays. We found that the medium consumption rate did not significantly differ between the media and among the strains (72-76%). However, the T. versicolor strains had a relatively low consumption rate (14-65%). The 2,2-diphenyl-1-picrylhydrazyl (DPPH) and 2,2'-azinobis(3-ethylbenzothiazoline-6-sulfonate) (ABTS) tests demonstrated that culture filtrates of T. cf. junipericola, T. orientalis, T. suaveolens, and T. versicolor possessed antioxidant activity against damage from free radicals. In particular, T. cf. junipericola (DY) and T. versicolor (MY) had >80% activity in the DPPH and ABTS assays, compared with that of the positive control (ascorbic acid). Thus, our study identified promising candidates with substantial antioxidant activity among the indigenous strains of Trametes spp. from Korea.

Taxonomic and Microbiological Report on Seven Yeast Species Unrecorded in the National Species List of Korea

  • Jung-Woo Ko;Ye-Jin Kim;Hye-Rim Ryu;Min-Kyeong Kim;Chorong Ahn;Changmu Kim;Cheon-Seok Park
    • 한국균학회지
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    • 제51권4호
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    • pp.287-306
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    • 2023
  • According to our previous study, 500 species of yeast exist in Korea, including nine variants comprising 142 genera and 48 classes in two phyla. Additionally, 4,483 fungal species have been documented at the National Institute of Biological Resources (NIBR). However, despite the industrial use of several yeasts, only 173 species formed part of the National Species List of Korea (NSLK) as of December 2021, mainly due to the lack of taxonomic descriptions. This study aimed to investigate the taxonomy of seven newly isolated yeast species (Hyphopichia burtonii, Starmerella sorbosivorans, Cyberlindnera mycetangii, Cutaneotrichosporon oleaginosum, Nakazawaea ernobii, Pichia kudriavzevii, and Schizosaccharomyces japonicus) for inclusion in the NSLK. The strains were clustered for the phylogenetic analysis of fungal rDNA (D1/D2-26S) sequences. This study provides descriptions of their cell morphology and physiological characteristics, the results of which confirm the indigenous origin of these seven species in Korea and recommend their inclusion in the NSLK.

Taxonomic Study on Six Yeast Species Unlisted in the National Species List of Korea

  • Chorong Ahn;Soonok Kim;Changmu Kim
    • 한국균학회지
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    • 제51권1호
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    • pp.7-24
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    • 2023
  • More than five hundreds of yeast species (including 9 variants) encompassing 142 genera and 48 classes of 2 phyla exist in Korea. However, only 173 species have been cataloged in the National Species List of Korea (NSLK), the backbone reference to claim sovereign rights over biological resources, as of December 2021, due to the lack of taxonomic descriptions, although some of these species are extensively used in industry. The present pilot study investigated the taxonomy of strains belonging to the six most widely used or frequently isolated yeast species (Meyeromyma guilliermondii, Saccharomyces cerevisiae, Saccharomycopsis fibuligera, Wickerhamomyces anomalus, Candida tropicalis, and Papiliotrema flavescens) to include these species in the NSLK. Strains with diverse habitats and geographic origins were retrieved from the National Institute of Biological Resources culture collection. These strains clustered in the same clade as the type strains of the designated species according to phylogenetic analysis of the D1/D2 sequences. Moreover, we described the cell morphology and physiological characteristics of representative strains of each species. This study suggests that these six species are indigenous to Korea and can be accordingly listed in the NSLK.

Isolation of wild yeasts from soils collected in Pochoen-si, Korea and characterization of unrecorded yeasts

  • Maeng, Soohyun;Park, Yuna;Srinivasan, Sathiyaraj
    • Journal of Species Research
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    • 제9권3호
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    • pp.204-209
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    • 2020
  • In 2019, as a subset study to discover indigenous yeast species in Korea, a total of 20 yeast species were isolated from soil samples collected in Pochoen-si. Among them, eight strains were unreported species. From the high 26S rRNA gene sequence similarity and formation of a robust phylogenetic clade with the closest species, it was determined that each strain belonged to independent and predefined yeast species. The 20 strains were assigned to the genera Aureobasidium (1 strain) and Meyerozyma (1 strain) of the phylum Ascomycota and Cystofilobasidium (2 strains), Filobasidium (1 strain), Naganishia (2 strains), Bullera (3 strains), Leucosporidium (9 strains) and Sampaiozyma (1 strain) of the phylum Basidiomycota. There is no official report of the following species in Korea: Leucosporidium creatinivorum (4 strains), Leucosporidium escuderoi(2 strains), Leucosporidium golubevii(1 strain) and Leucosporidium intermedium (2 strains). Basic biochemical characteristics, colony and cell morphology are also described in the species description section.

국내에 서식하는 꽃에서 분리한 야생 효모 분포 및 종 다양성 (Distribution and Species Diversity of Wild Yeasts Isolated from Flowers in Korea)

  • 김정선;이미란;김재윤;허준;권순우;윤봉식;김수진
    • 한국균학회지
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    • 제48권4호
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    • pp.475-484
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    • 2020
  • 국내에 서식하는 꽃에서 다양한 토착 효모를 분리 및 확보하고 효모의 분포 특성과 종 다양성에 관해 연구하였다. 국내 25지역에서 꽃 9종 77개체를 채집한 후 효모를 순수분리하였다. 효모 502균주의 large-subunit (LSU) rDNA 염기서열을 분석 및 상동성 비교로 각 효모의 종을 동정하였다. 분리된 효모는 총 50종으로 동정 되었고, 모든 꽃 시료로부터 Aureobasidium pullulans, A. leucospermi, Filobasidium magnum이 분리되었다. 꽃에 우점한 효모 3종을 제외하고, 효모 균주 수가 적게 분리된 종은 지역과 분리원에 따른 유의성을 확인할 수는 없었다. 본 연구를 통해 꽃으로부터 확보한 국내 토착 효모 50종은 산업적 활용을 위한 자원으로써 역할을 기대할 수 있고, 추후 효모와 기주 간의 상호작용이나 효모다양성 연구의 기초자료로써 활용될 수 있을 것이다.

Isolation of ten unrecorded yeasts from soil in Korea

  • Han, Joo Hyun;Oh, Hye Jin;Lee, Sang Eun;Kim, Myung Kyum
    • Journal of Species Research
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    • 제10권4호
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    • pp.336-343
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    • 2021
  • In 2020, as a subset study to discover indigenous yeast species in Korea, a total of 22 yeast species were isolated from soil samples collected in Gwangju-si, Gyeonggi-do. Among them, 10 strains were unreported species. From the high 26S rRNA gene sequence similarity and formation of a robust phylogenetic clade with the closest species, it was determined that each strain belonged independent and predefined yeast species. The 22 strains were assigned to the genera Dothiora (1 strain), Sarocladium (1 strain), Tetrapisispora (1 strain) and Torulaspora (2 strains) of the phylum Ascomycota; the genera Erythrobasidium (1 strain), Leucosporidium (4 strains), Ustilentyloma (2 strains), Fellozyma (1 strain), Sampaiozyma (2 strains), Filobasidium (1 strain), Solicoccozyma (2 strains) and Vishniacozyma (4 strains) of the phylum Basidiomycota. This is the first official report of the following species in Korea: Dothiora cannabinae (1 strain), Sarocladium strictum (1 strain), Fellozyma inositophila (1 strain), Filobasidium magnum (1 strain), Solicoccozyma phenolicus (1 strain), Solicoccozyma terreus(1 strain), Vishniacozyma tephrensis(1 strain) and Vishniacozyma victoriae (3 strains). Cell morphology, phenotypic features and biochemical features are described in the Species Description section.

Aspergillus caninus (Syn: Phialosimplex caninus): a New Isolate from Field Soils in Korea

  • Adhikari, Mahesh;Gurung, Sun Kumar;Kim, Sang Woo;Lee, Hyun Goo;Ju, Han Jun;Gwon, Byeong Heon;Kosol, San;Bazie, Setu;Lee, Hyang Burm;Lee, Youn Su
    • 한국균학회지
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    • 제46권4호
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    • pp.383-392
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    • 2018
  • During the study of indigenous fungal communities in soil samples collected from various field soils in Sancheong, Gyeongsangnam-do, Korea in 2017, several species of Aspergillus were discovered. Aspergillus caninus (KNU17-7) was isolated, identified, and described based on the results from macro and micro morphological characteristics and molecular characterization. Morphologically, it was identified using five different growth media: potato dextrose agar, oatmeal agar, yeast extract sucrose agar, czapek yeast extract agar, and malt extract agar. For the molecular identification, sequencing of internal transcribed spacer, ${\beta}-tubulin$, and calmodulin genes was performed. Based on this characterization, our study isolate was identified as Aspergillus caninus. This fungal species has not been officially reported in Korea before, and we report here with its morphological and molecular phylogenetic characterization.

울릉도 수집 균주의 배양조건에 따른 균사 생장 특성 비교 (Comparison of Mycelial Growth Characteristics According to Culture Conditions of Ulleungdo Collection Strains)

  • 김민경;안초롱;김창무
    • 한국균학회지
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    • 제48권2호
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    • pp.75-85
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    • 2020
  • 본 연구에서는 울릉도에서 수집한 자생 버섯 균주 5종의 평판배지 배양 특성과 액체배양에서의 특성을 확인하여 자생 균류의 이용을 위한 기초 정보를 확보하였다. 5종의 야생 균주의 최적 배양온도는 25-30℃이고, pH는 4.0-5.0의 산성임을 확인하였다. 특히P. brumalis는 35℃에서 생장 속도가 가장 빠른 것으로 보아 고온성 버섯으로 판단된다. 실험에 사용한 상용 배지 중 최적 배지는 F. punctata의 경우 MEPA 배지, P. ulleungus는 MMNA 배지, G. subnudus는 MEA 배지, T. kmetii는 MMNA 배지, 마지막으로P. brumalis는 모든 배지에서 빠른 생장 속도를 보였으며 6종류의 배지 중 MEA 배지는 모든 균주의 균사 밀도가 낮아 배양이 적합하지 않은 조성임을 확인하였다. P. brumalis는 5종의 균주중 가장 빠른 생육 속도를 보였으며, 반면에P. ulleungus는 가장 저조한 생장을 보여 같은 속(genus)의 종이지만, 생육특성의 차이가 극명함을 보였다. 액체배양을 통해 배양 기간에 따른 배양여액의 건조 중량을 비교한 결과 배양 기간이 길수록 건조량이 감소하는 양상을 보였으며, 특히 6개월 이전까지 큰 폭으로 감소하였다. 이 결과로 정치배양 조건에서의 액체배양은 한달 이상의 배양 시간이 주어져야만 배지 성분을 충분히 이용할 수 있다는 것을 확인하였다. 본 실험의 결과로 5종의 균주에 대한 최적 배양조건을 확립하고 향후 응용 연구에 기초 자료로 활용할 수 있을 것으로 기대한다.

식물병원진균을 길항하는 chitinase 생산성 생물방제균 Bacillus amyloliquefaciens 7079의 선발과 chitinase 생산조건 (Chitinase of Multifunctional Antagonistic Bacterium Bacillus amyloliquefaciens 7079 against Phy-tophathogenic fungi)

  • 한옥경
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제29권3호
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    • pp.142-148
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    • 2001
  • 경주 인근 지역의 토양으로부터 식물병원성 진균 Fusarium oxysprum과 phytophthora capsici를 동시에 길항할수있는 항진균성 항생물질 생산성 생물방제균을 분리하고, 성분을 함유한 병원진균의 세포벽을 분해하는 chitinase 생산성이 우수한 균주를 분리하고자 하였다. 분리된 생물방제균의 형태학적, 생화학적 및 배양학적으로 동정하여 잠정적으로 Bacillus amyloliquefaciens 7079로 동정하였다. 이 생물방제균이 생산하는 chitinase 생산의 최적 조건을 검토하여 본 결과 Chitin-yeast extract 배지(0.7% $K_2$$HPO_4$ 0.2% $KH_2$$PO_4$ 0.1%($NH_4$)$_2$$SO_4$ 0.05% sodium citrate 0.01% MgSO$_4$$7H_2$O 0.1% yeast extract, 0.1% coloida chitin)에서 pH는 7.0 배양온도는 3$0^{\circ}C$였고 배양한 후 3일 이 되었을 때 가장 많은 chitinase를 생산하였다. 또한 0.1% colloida chitin을 탄소원으로 하여 배양하였을 때 chitinase 생산성이 가장 좋았으며 0.15% proteose peptone NO .3 또는 0.1% tryptone 을 질소원으로 하여 배양하였을 때 효소 생산이 높게 나타났다. 선발된 생물방제균의 고추를 기주식물로한 in vivo pot 시험 결과 고추역병균 Phytophthora capsici에 좋은 길항력을 확인할 수 있었다.

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