• 제목/요약/키워드: ITS 변이

검색결과 2,097건 처리시간 0.025초

위치지정 변이기법을 이용한 Bacillus thuringiensis var. kurstaki NRD 6-Stu 1의 육성 (Development of Bacillus thuringensis var. kurstaki NRD 6-Stu 1 by Site-Directed Mutagenesis)

  • 이종수
    • 자연과학논문집
    • /
    • 제6권1호
    • /
    • pp.41-48
    • /
    • 1993
  • 위치지정 변이기법을 이용하여 Bacillus thuringiensis var. kurstaki NRD 6의 내독소 유전자의 N말단 독성부위를 변이시켜 Bacillus thuringiensis var. kurstaki NRD 6-Stu 1을 육종하였다. 내독소에 대한 염기서열 조사결과, 변이주의 내독소 유전자부위에 Stu 1 인식부위가 생성되었고 특히, 이부위의 177번 염기 A가 C로 치환된 silent mutation이 일어났음을 확인하였다. 변이주의 내독소 유전자의 항원성질은 친주와 차이가 없었고 Choristoneura femiferana-1에 대한 독성도는 0.015~0.030ng으로 친주의 0.01~0.024ng과 유사하였으나 다른 친주계열인 B.t.kurstaki NRD 5의 500~1000ng과 B.t.kurstaki NRD 4(무독성)보다 강하였다.

  • PDF

수도와 육도품종의 논과 밭재배에 다른 변이성에 관한 연구 제2보 수량 및 주요미질성분의 변이 (Studies on the Variability of Lowland and Upland Rice Grown Under Lowland and Upland Conditions 2. Variation of Yield and Maj or Quality Components of Rice Kernels)

  • 최상진;정근식;최현옥
    • 한국작물학회지
    • /
    • 제25권1호
    • /
    • pp.25-30
    • /
    • 1980
  • 수도 6개품종과 육도 7개품종을 동시에 논재배와 밭재배 하였을 때 양조건하에서 일어나는 변이를 수량과 수최구성요소 및 미질면에서 검토한 바 다음과 같은 결과를 얻었다. 1. 수량은 수도나 육도 모두 논재배에서 증가하였는데 그 증가정도가 육도보다 수도에서 현저하였으며 논재배에서는 수도가, 밭재배에서는 육도가 더 높은 수량을 내었다. 2. 1ℓ중, 1000입중 및 수당입수에 있어서 수도는 전체적으로 논재배에서 높았으나 육도는 품종간에 변이의 차리가 있었으며 주당수수는 대부분 논재배에 서 증가하였다. 3. Amylose 함량은 메벼의 대부분이 밭재배에서 증가하였으나 찰벼에서는 논재배에서 증가하였으며 Alkali 붕괴도와 단백질함량은 전반적으로 밭재배에서 증가하는 경향이었다.

  • PDF

ITS 부위 염기서열과 RAPD분석을 통한 천문동의 지역별 변이 및 분자진화적 유연관계 (Geographical variation and evolutionary relationship of Asparagus cochinchinensis Lour. based on rDNA-ITS sequences and Random Amplified Polymorphic DNA(RAPD))

  • 문병철;추병길;지윤의;최고야;윤태숙;이아영;김호경
    • 한국한의학연구원논문집
    • /
    • 제14권1호
    • /
    • pp.129-135
    • /
    • 2008
  • Phylogenetic relationship and DNA polymorphism among local populations of the Asparagus cochinchinensis have been investigated based on nuclear ribosomal DNA ITS sequences and RAPD analysis in Korea. In result, two genetically distinct groups of local populations except Geoje were recognized by the phylogenetic tree both in rDNA-ITS and RAPD. One was called 'western coast group' that includes the Buan 1, 2 and Taean and the other was 'southern coast group' that includes Haenam, Yeosu and Namhae. Thus, the geographical relationship of Asparagus cochinchinensis was two well-typified clades. These results suggest that the geographical genetic variation of Asparagus cochinchinensis is closely connected with the slow and long period of propagation via the coast in Korean Peninsula.

  • PDF

한국산 붉은대극(대극과) 집단의 유전적 변이와 분화 (Genetic variation and differentiation among populations of Euphorbia ebracteolata (Euphorbiaceae) in Korea)

  • 조영우;박기룡
    • 식물분류학회지
    • /
    • 제45권1호
    • /
    • pp.1-7
    • /
    • 2015
  • 한국산 붉은대극 9집단에 대해 전분전기영동법을 이용하여 10개의 동위효소 유전자 좌위를 조사하였다. 붉은대극 집단은 기존의 대극속 식물과 비교해 볼 때 상대적으로 높은 집단 내 유전적 변이(A = 2.2, P = 61.1, $H_e$ = 0.165)와 낮은 집단 간 분화($F_{ST}$ = 0.075) 양상을 보여주었다. 붉은대극에서 나타나는 이와 같은 높은 집단 내 유전적 변이는 이들이 갖고 있는 오래 생존하고, 지역적으로 분포하며, 타가수분에 의존하는 생식특성으로 설명할 수 있다. 한국산 붉은 집단에서 보여주는 매우 낮은 유전적 분화와 독특한 대립인자가 나타나지 않는 특징은 이들 집단이 최근에 분화되었을 가능성을 시사하며, 동위효소 자료로 볼 때, 기존에 기재된 종하분류군인 풍도대극(var. coreana)과 설악대극(for. magna)은 붉은대극 한 종으로 통합하는 것이 적절한 것으로 추정된다.

단일염기다형성을 이용한 치과 질환 유전체 연구 (Genetic association study of single nucleotide polymorphism in dentistry)

  • 김지환;이재훈
    • 대한치과보철학회지
    • /
    • 제49권4호
    • /
    • pp.341-345
    • /
    • 2011
  • DNA 복제과정에서의 오류(error)에 의한 유전적 변이(genetic variation)를 통해 개개인이 가지고 있는 유전변이형을 조사하고 특정 질환에 대한 감수성의 차이를 밝히는 유전체 연관성 연구가 의학계 전반에 활발히 진행되고 있다. 개인 간의 DNA 상에 존재하는 염기서열의 차이를 보이는 유전적 변이를 통해 개인간의 형질이 다르게 표현 되는 것을 다형성이라고 하는데 다형성의 원인 중 염기 서열 한 쌍의 변이에 의하여 다른 형질로 표현되는 것을 단일염기다형성(Single Nucleotide Polymorphism; SNP)이라고 정의한다. 유전자 분석 기술의 놀랄만한 발전과 컴퓨터를 이용한 분석 프로그램의 개발에 의해 SNP과 질병의 연관성에 관한 연구는 의학계 모든 분야에서 가속화 되고 있다. 최근 급격하게 빨리 진척되는 연구들에 힘입어 특정 질병에 대한 특정 유전자가 가지는 위험도를 분석하고 환자를 유전적 위험도에 따라 분류하여 진단, 예방 및 치료하는 환자 맞춤식의 진료가 모든 의약학 분야에 적용 될 것으로 생각 된다. 치과 영역에서는 충치와 치주 질환과의 관련성에 대해서 초기 단계의 연구가 진행되고 있는 수준이다. 본 종설에서는 유전체 질병 연구의 현황과 치과 영역에서 시작된 연구를 소개 하고자 한다.

PBIL을 이용한 소형 스테레오 정합 및 대안 알고리즘 (A Simple Stereo Matching Algorithm using PBIL and its Alternative)

  • 한규필
    • 정보처리학회논문지B
    • /
    • 제12B권4호
    • /
    • pp.429-436
    • /
    • 2005
  • 본 논문에서는 유전자 알고리즘의 일반적인 문제점인 과도한 저장공간의 소모와 탐색의 비효율성을 줄이기 위해 PBIL을 이용한 단순한 스테레오 정합 기법을 제안한다. PBIL은 확률벡터에 기반해서 통계적 탐색과 경쟁학습을 이용하는 변종 유전자 알고리즘이며 확률벡터의 사용으로 인해 직렬 및 병렬 유전자 알고리즘군에 비해 단순한 구조를 가진다. 본 논문에서는 이 PBIL을 스테레오 정합 환경에 맞게 변형 및 단순화시켜 정합 알고리즘을 개발한다. 높은 적응성을 갖는 염색체는 생존 확률 또한 높다는 진화 법칙을 보존하면서 유전자 풀, 염색체 교차 및 유전자 돌연변이를 제거할 수 있으며 그 결과 저장공간을 줄이고 정합 규칙을 간소화하여 계산 비용을 감소시킬 수 있다. 추가적으로 다해상도 정합 기법처럼 넓은 영역의 변이 일관성을 획득하기 위해 변이 연속성에 대한 이웃들의 거리를 제어하는 방식을 추가하여 고정된 작은 정합창을 사용하면서 안정된 결과를 얻을 수 있게 한다. 마지막으로 단순한 시스템에 적용될 수 있게 하기 위해서 확률벡터를 사용하지 않는 제안한 알고리즘의 소형 대안 기법을 제시한다.

보리 단백질의 특성과 지역간 변이 (Quantity and Quality of Seed Protein and Its Regional Variation in Barley)

  • 남중현;이은섭;홍병희;김기준
    • 한국작물학회지
    • /
    • 제35권5호
    • /
    • pp.387-392
    • /
    • 1990
  • 보리 양질 다수성품종 육성을 위하여 단백질 함량의 품종별, 지역별 변이, 품종별 아미노산조성 및 단백질 함량과 농업형질과의 관계를 구명하여 단백질이 양과 질을 개선할 수 있는 기초자료를 얻고자 수행한 연구결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 보리의 단백질 함량은 겉보리 12.0-15.7%, 쌀보리 9.2-15.4%, 맥주보리 11.4-15.9% 범위의 변이를 보이고, 겉보리 품종이 맥주보리나 쌀보리 품종들 보다 높았다. 2. 보리중 필수아미노산 함량은 쌀보리가 맥주보리, 겉보리에 비해 높았다. 3. 단백질 함량은 재배지역에 따라 큰 변이를 보였는데 3맥종 모두 중부지방에서 생산한 것이 남부지방에서 생산한 것보다 높았다. 4. 단백질 함량과 출수기와의 관계는 겉보리에서는 유의성 있는 부의 상관을 보였으나 쌀보리, 맥주보리에서는 뚜렷한 경향이 없었다. 5. 찰보리 및 통보리 001의 숙기 isogenic line을 이용하여 숙기에 따른 단백질 함량의 변이를 조사한 결과 조숙이 만숙보다 단백질 함량이 높은 편이었다.

  • PDF

한국산 여뀌속 Persicaria절(마디풀과)의 핵 리보오솜 ITS 염기서열 변이 (Variation of nuclear ribosomal ITS sequences of Polygonum section Persicaria (Polygonaceae) in Korea)

  • 곽명해;김민하;원효식;박종욱
    • 식물분류학회지
    • /
    • 제36권1호
    • /
    • pp.21-40
    • /
    • 2006
  • 본 연구에서는 한국산 여뀌속 Persicaria절 분류군들에 대학 핵 리보오솜 (nrDNA)의 ITS 염기서열 분석을 수행하여 본 절 분류군들의 유연관계를 추정하고자 하였다, 본 연구결과 본 절 분류군의 nrDNA ITS 구간 염기서열은 본 절 분류군의 분류학적 타당성, 한계 및 계급설정 및 분류군 간의 계통적 유연관계를 추정하는 데 있어 유용한 것으로 나타났다. ITS 염기서열 분석결과 얻어진 neighbor-joining tree에서 본 절 한국산 분류군들은 크게 P.amphibium과 나머지 분류군들을 포함하는 ground의 2개의 계열로 구분되었다. 나머지 분류군들을 포함하는 두번째 계열은 다시 (1) P. lapathifolium, (2) P. persicaria와 P. viscoferum, (3) P. orientale 및 P. viscosum, (4) P. japonicum 및 (5) P. longisetum, P. erecto-minus var. koreense, P. caespitosum var. laxiflorum, P. hydropiper, P. pubescence, P. tinctorium, P. foliosum, P. trigonocarpum을 포함하는 group으로 세분되었다. 이러한 결과는 과거 형태적 식별형질에 의해 제안되었던 본 절 분류군간의 유연관계와 근본적으로 일치하였다.

먹물버섯류(Coprinus spp.)의 ITS II 영역 염기서열에 의한 유연관계 분석 (Genetic Relationships of Coprinus spp. on the Basis of Sequences in ITS II Region)

  • 박동석;고승주;김양섭;석순자;송재경;여윤수;류진창;성재모
    • 한국균학회지
    • /
    • 제27권1호통권88호
    • /
    • pp.27-31
    • /
    • 1999
  • 먹물버섯속(Coprinus spp.)의 분자 생물학적 분류 가능성을 모색하기 위해 rDNA의 cluster중 ITS II영역을 PCR 증폭하여 염기서열을 밝혔다. 이들의 ITS II 영역은 $253{\sim}275$ 염기쌍으로 이루어져 있었으며 균주간 ITS II염기서열의 유사도는 $50.3{\sim}100%$로 나타났다. 이들의 염기서열을 이용해 분류도를 작성한 결과, Singer의 형태적 분류체계와 거의 유사한 결과를 보였으나 이들 그룹의 기준종(type species)인 C. comatus는 기타 종들과의 유사도에서 50% 수준의 저조한 상동성을 보여 주었다. 이와 같은 결과로 볼 때 이 종은 기존의 다수 학자들이 보고한 단일 계통진화를 해온 속이란 점에서는 다소 의문점을 남기었고, ITS II 영역은 종내 변이는 없는 것으로 보여지며 종내의 균주간의 변이가 밝혀진 그룹에 대해서는 종에 대한 재검토가 필요하다고 본다.

  • PDF