본 연구는 위장관염을 일으키는 Vibrio fluvialis의 16S-23S rRNA intergenic spacer region을 분석하였다. ISR을 PCR 증폭 후 plasmid vector에 클로닝하여 염기서열을 분석하였다. 그 결과, ISR의 염기서열은 tRNA gene 조성과 크기에 따라 총 6개의 type으로 분류되었다. 각 type은 tRNA gene 조성과 수에 따라 ISR-A, ISR-E, ISR-El, ISR-lA, ISR-EKV, ISR-EKAV로 명명하였으며, ISR-A는 tRN $A^{Ala}$; ISR-lA, tRN $A^{Ile}$-tRN $A^{Ala}$; ISR-EKV, tRN $A^{Glu}$-tRN $A^{Lys}$-tRN $A^{Val}$; ISR-EKAV, tRN $A^{Glu}$-tRN $A^{Lys}$-tRN $A^{Ala}$-tRN $A^{Val}$; ISR-E와 El은 tRN $A^{Glu}$를 갖고 있었다. 이 중 ISR-EKV type은 minor type으로 존재하고 있으며, 여러 Vibrio종의 ISR-EKV type과 비교시 변이성이 높은 부위를 확인하였다. 따라서, 이 ISR-EKV의 염기서열을 여러 Vibrio종에서 V. fluuialis를 검출하기 위한 species-specific primer 제작에 이용하였다. 제작된 primer의 특이성은 여러 Vibrio 의 genomic DNA를 분리하여 PCR 반응으로 확인하였다. 그 결과, 제작된 primer는 V. fluvialis에 종 특이성이 있으며 여러 Vibrio종으로부터 빠른 검출이 가능함을 확인하였다.로부터 빠른 검출이 가능함을 확인하였다.
The plant growth-promoting rhizobacterium Ochrobactrum lupini KUDC1013 elicited induced systemic resistance (ISR) in tobacco against soft rot disease caused by Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum. We investigated of its factors involved in ISR elicitation. To characterize the ISR determinants, KUDC1013 cell suspension, heat-treated cells, supernatant from a culture medium, crude bacterial lipopolysaccharide (LPS) and flagella were tested for their ISR activities. Both LPS and flagella from KUDC1013 were effective in ISR elicitation. Crude cell free supernatant elicited ISR and factors with the highest ISR activity were retained in the n-butanol fraction. Analysis of the ISR-active fraction revealed the metabolites, phenylacetic acid (PAA), 1-hexadecene and linoleic acid (LA), as elicitors of ISR. Treatment of tobacco with these compounds significantly decreased the soft rot disease symptoms. This is the first report on the ISR determinants by plant growth-promoting rhizobacteria (PGPR) KUDC1013 and identifying PAA, 1-hexadecene and LA as ISR-related compounds. This study shows that KUDC1013 has a great potential as biological control agent because of its multiple factors involved in induction of systemic resistance against phytopathogens.
C4ISR 체계는 군사작전 지휘통제를 위한 중요 수단이다. 그러므로, 지휘통제체계의 마비를 위한 각종 변형된 사이버테러 시도에 노출되기 쉽다. 일반적인 정보체계는 IDS와 방화벽을 주요 정보보호 수단으로 활용하고 있으며, C4ISR 체계 역시 IDS와 방화벽을 주요 정보보호 수단으로 활용하고 있다. 그러나, IDS의 예상외의 행위패턴에 대한 잦은 오탐지와 변형된 공격패턴에 대한 미탐지로 인해 C4ISR 체계에서의 IDS의 활용이 제한되고 있다. 이번 연구에서는 IDS 탐색과정에서 변형 공격패턴이나 예상 외의 패턴을 자동 생성하는 IDS 구조를 제안한다. 제안하는 IDS 구조는 패턴의 생성과 검증을 통해 오탐지 또는 미탐지를 감소시킴으로써, C4ISR 체계에서의 정보보호를 향상시킬 것을 기대한다.
부산의 가물치 양식장으로부터 분리된 A. veronii bv. sobria 와 A. caviae를 대상으 로 16S-23S rRNA Intergenic Spacer Region을 cloning 하여 염기서dufd을 분석하였다. A. veronii bv. sobria 는 4그룹의 band pattern이 형성되었고 A. caviae는 1그룹만이 존재하였 다. A. veronii bv. sobria 의 4그룹에 대한 band 수는 2~4개까지 다양하게 나타났으며. 479~481 bp (ISR-1), 513~524 bp (ISR-2), 537~539 bp (ISR-3) 의 염기서열을 밝혀냈다. A. caviae는 3개의 band가 형성되었고,470~480bp (ISR-1), 521~525bp (ISR-2),568~602 bp (ISR-4)의 염기서열을 가지고 있었다. 그리고 이들에 대한 tRNA를 분석한 결과 ISR-1은 tRNAIle(GAT), tRNAAla(TGC)를 가지고 있고 ISR-2,3,4는 tRNAGlu(TTC)를 가지고 있었 다. A. caviae는 ISR-4의 151~281 bp에서 A. veronii bv. sobria 가 가지고 있지 않은 보존 적인 염기서열을 가지고 있었다. 그 중 A. vaviae의 178~197 bp 염기서열을 primer로 design하여 PCR을 실시한 결과 A. caviae 균주에서만 종특이적으로 생성되는 450 bp 정도 의 밴들르 얻을수 있었다.
Lipopolysaccharide, siderophore, and cyclic dipeptide have been shown to be necessary for ISR induction by pseudomnads. However, there is no report on cloning of genes or generating specific mutants involving in ISR activity. A biological control bacteium P. chlororaphis O6 induces resistance to Erwinia carotovora subsp. carotovara SCCI in tobacco and induces drought resistance in Arabidopsis. To isolate genes involved in ISR activity and induction of drough resistance of O6, we constructed Tn5 mutants and were used to screen for ISR activity and drought resistance activity using microtiter assay with tobacco and Arabidopsis. Thirty-three ISR-deficient mutants were selected, and the nine ISR-deficient mutants were also lost activity of drought resistance. The flanking sequence analysis of the ISR and drought resistance-deficient mutants showed that a gacS gene encoding a two-component sensor kinase, and a mce gene encoding a protein involved in mycobacterial cell entry were mutated. The flanking sequence of each Tn5 mutant altered ISR activity is currently under investigation. These results indicate that gacS and mce are important genes in induction of ISR activity and drought resistance of P. chlororaphis O6. Our works will open opportunities for identification of bacterial genes or traits that are involved in ISR activity and induced drought resistance of P. chlororaphis O6.
학회 저널은 우리 모두가 가꾸고 지켜 나가야할 귀중한 재산이다. 최근 ISR 저널의 성격에 대해 여러 가지 의견이 개진되어오고 있다. 특히 실무 지향적이고 현장 업무에 기여할 수 있는 지식의 공유 장소라는 원래의 목표가 이루어져왔는가에 대해 많은 우려가 나오고 있는 실정이다. 이에 ISR 논문의 현상을 분석하고, 이를 기초로 ISR 저널이 나아갈 방향에 대해 논문의 성격과 심사 방안 등에 대해 몇 가지 제안을 드리고자 한다. 여기서 제시된 안을 토대로 학회 모두의 활발한 의견 개진과 토론이 이어지길 기대한다.
우리 군이 정보전 능력을 갖추기 위한 최우선 과제는 $C^4ISR$체계의 구축이라 할 수 있다. 21세기 지식.정보 중심이 전장에서 $C^4ISR$체계가 가장 핵심적인 기능과 역할을 담당하므로 $C^4ISR$능력의 확보가 없이는 적의 의도를 적시에 파악할 수 없을 뿐만 아니라 적절한 대응 역시 불가능하기 때문이다. 따라서 우리 군이 미래를 대비하고 향후 정보화전쟁에서 승리하기 위해서는 분산된 정보체계를 통합하고 정보화 전문인력을 효율적으로 운용해야 하며, 21세기 지식.정보 중심의 전장에서 가장 핵심적인 기능과 역할을 담당하는 국방 $C^4ISR$체계를 중점적으로 개척할 필요가 있다.
Ryu, Choong-Min;Choi, Hye Kyung;Lee, Chi-Ho;Murphy, John F.;Lee, Jung-Kee;Kloepper, Joseph W.
The Plant Pathology Journal
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제29권2호
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pp.182-192
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2013
Numerous root-associated bacteria (rhizobacteria) are known to elicit induced systemic resistance (ISR) in plants. Bacterial cell-density-dependent quorum sensing (QS) is thought to be important for ISR. Here, we investigated the role of QS in the ISR elicited by the rhizobacterium, Serratia marcescens strain 90-166, in tobacco. Since S. marcescens 90-166 produces at least three QS signals, QS-mediated ISR in strain 90-166 has been difficult to understand. Therefore, we investigated the ISR capacity of two transgenic tobacco (Nicotiana tabacum) plants that contained either bacterial acylhomoserine lactone-producing (AHL) or -degrading (AiiA) genes in conjunction with S. marcescens 90-166 to induce resistance against bacterial and viral pathogens. Root application of S. marcescens 90-166 increased ISR to the bacterial pathogens, Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum and Pseudomonas syringae pv. tabaci, in AHL plants and decreased ISR in AiiA plants. In contrast, ISR to Cucumber mosaic virus was reduced in AHL plants treated with S. marcescens 90-166 but enhanced in AiiA plants. Taken together, these data indicate that QS-dependent ISR is elicited by S. marcescens 90-166 in a pathogen-dependent manner. This study provides insight into QS-dependent ISR in tobacco elicited by S. marcescens 90-166.
Journal of Information Technology Applications and Management
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제19권2호
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pp.1-15
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2012
Many IS researchers had the greatest interesting in publication in leading IS journals. Studies of measuring research performance of Information Systems (IS) are the most important research areas. Today, many IS researchers considered Management Information Systems Quarterly (MISQ), Information Systems Research (ISR), and Journal of Management Information Systems (JMIS) as the leading IS journals. In this study, we analyzed the published papers of Korean and overseas Koreans related IS researchers in ISR, MISQ, and JMIS from 2001 to 2010. The results of this study appeared the trend of increasing frequency of publication of IS research in south Korea in the leading IS journals such as ISR, MISQ, JMIS. The findings of this research showed the excellent performance of IS researchers and provided valuable information regarding publications performance of IS researchers in leading IS Journals.
We have examined the 16S-23S rRNA intergenic spacer region (ISR) of Vibrio vulnificus KCTC 2959. ISRs were amplified by primers complementary to conserved regions of 16S and 23S rRNA genes. ISR amplicons were cloned and sequenced. Analysis of the ISR sequences showed that V. vulnificus KCTC 2959 contains five types of polymorphic ISRs. Size of ISRs ranged from 424 to 741 bp in length and the number of tRNA genes ranged from one to four. The ISRs were designated as ISR-E $(tRNA^{Glu}),\;ISR-IA\;(tRNA^{Ile}-tRNA^{Ala})$, ISR-EKV $(tRNA^{Glu}-tRNA^{Lys}-tRNA^{Val})$, ISR-IAV $(tRNA^{Ile}-tRNA^{Ala}-tRNA^{val})$ and ISR-EKAV $(tRNA^{Glu}-tRNA^{Lys}-tRNA^{Ala}-tRNA^{Val})$ based on their tRNA genes. Multiple alignment of representative sequences from different Vibrio species revealed several domains of high sequence variability. We used the sequences of variable domains to design species-specific primer for detection PCR. Specificity of the primers was examined using genomic DNA prepared from 18 different Vibrio species. The results showed that the PCR using primers designed in this study can be used to detect V. vulnificus from other Vibrio species.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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