• Genomics & Informatics
• /
• 제5권4호
• /
• pp.161-167
• /
• 2007

Glucuronidation by the uridine diphosphateglucuronosy-ltransferase 1A enzymes (UGT1As) is a major pathway for elimination of particular drugs and endogenous substances, such as bilirubin. We examined the relation of eight single nucleotide polymorphisms (SNPs) and haplotypes of the UGT1A gene with their clinical factors. For association analysis, we genotyped the variants by direct sequencing analysis and polymerase chain reaction (PCR) in 218 healthy Koreans. The frequency of UGT1A1 polymorphisms, -3279T>G, -3156G>A, -53 $(TA)_{6>7}$, 211G>A, and 686C>A, was 0.26, 0.12, 0.08, 0.15, and 0.01, respectively. The frequency of -118 $(T)_{9>10}$ of UGT1A9 was 0.62, which was significantly higher than that in Caucasians (0.39). Neither the -2152C>T nor the -275T>A polymorphism was observed in Koreans or other Asians in comparison with Caucasians. The -3156G>A and -53 $(TA)_{6>7}$ polymorphisms of UGT1A were significantly associated with platelet count and total bilirubin level (p=0.01, p=0.01, respectively). Additionally, total bilirubin level was positively correlated with occurrence of the UGT1A9-118 $(T)_{9>10}$ rare variant. Common haplotypes encompassing six UGT1A polymorphisms were significantly associated with total bilirubin level (p=0.01). Taken together, we suggest that determination of the UGT1A1 and UGT1A9 genotypes is clinically useful for predicting the efficacy and serious toxicities of particular drugs requiring glucuronidation.

• 한국임상약학회지
• /
• 제21권2호
• /
• pp.122-130
• /
• 2011

Objective: Although recombinant human erythropoietin (rhEPO) has revolutionized the treatment of anemia in chronic kidney disease (CKD) receiving hemodialysis (HD) with no need of blood transfusion, some patients have a blunted or appear to be resistant to rhEPO. There is a controversy in the causes of rhEPO resistance in maintenance HD patients with anemia. This study is to examine current anemia treatment outcomes and the factors influencing the rhEPO responsiveness in HD patient with CKD. Methods: The clinical parameters or factors relating to erythrompoietin treatment outcomes and erythropoietin responsiveness were collected from the HD patients in two large dialysis centers for three months. The collected paramenters included serum iron, total iron biding capacity (TIBC), transferrin saturation rate, ferritin, albumin, intact PTH, C-reactive protein (CRP), nPCR and medications such as an angiotensin converting enzyme inhbitor, an angiotension II receptor blocker and an HMG-CoA reductase inhibitor (HMG-CoA RI). The data were analyzed to examine the degree of acheiveing the anemia treatment goal and factors relating to ERI. Results: Among total 111 patients, 42 (42.3%) and 47 (37.8%) patients achieved the target Hct and Hb based on the Health Insurance Review and Assessment Services (HIRA) reimbursement criteria. In the higher ERI group (upper quartile), the patients had higher CRP levels (0.5 mg/dl) (p=0.0096), and lower TIBC score (<$240{\mu}g/dl$) (p=0.0027), and less patients were taking HMG-CoA RI (p=0.0019). Male patients (p=0.0204), patients with high TIBC score ($R^2$=0.084, p=0.0021) and patients taking HMG-CoA RI (p=0.0052) required to administer less dose of rhEPO meaning higher erythropoietin responsiveness. Conclusion: Less than 50% of CKD patients were achieving the goals of anemia by erythropoietin administration in large hospitals in Korea even though the goals were lower than those of NKF-K/DOQI practice guideline. The factors influencing ERI were sex, TIBC and HMG-CoA RI administration status, and neither an ACEI nor an ARB did not influence ERI.

• Journal of Korean Neurosurgical Society
• /
• 제53권4호
• /
• pp.207-212
• /
• 2013

Objective : Recent studies have shown encouraging progress toward the use of autogenic and allogenic mesenchymal stem cells (MSCs) to arrest, or even lead to partial regeneration in, intervertebral disc (IVD) degeneration. However, this technology is still in its infancy, and further development is required. The aim of this study was to analyze whether rat adipose-derived mesenchymal stem cells (ADMSC) can differentiate towards IVD-like cells after treatment with transforming growth factor ${\beta}3$ (TGF-${\beta}3$) in vitro. We also performed quantitative analysis of gene expression for ADMSC only, ADMSCs treated with TGF-${\beta}3$, and co-cultured ADMSCs treated with TGF-${\beta}3$. Methods : ADMSCs were sub-cultured to homogeneity and used in fluorocytometry assays for CD11, CD45, and CD90/Thy1. ADMSCs were differentiated in spheroid culture towards the chondrogenic lineage by the presence of TGF-${\beta}3$, dexamethasone, and ascorbate. We also co-cultured pure ADMSCs and nucleus pulposus cells in 24-well plates, and performed immunohistochemical staining, western blotting, and RT-PCR for quantitative analysis of gene expression. Results : Results of fluorocytometry were positive for CD90/Thy1 and negative for CD11 and CD45. TGF-${\beta}3$-mediated induction of ADMSCs led to the expression of the differentiation markers of intervertebral disc-like cells, such as aggrecan, collagen II, and sox-9. Co-cultured ADMSCs treated with TGF-${\beta}3$ showed higher expression of differentiation markers and greater extracellular matrix production compared with ADMSCs treated with TGF-${\beta}3$ alone. Conclusion : ADMSC treated with TGF-${\beta}3$ may be an attractive source for regeneration therapy in degenerative IVD. These findings may also help elucidate the pathologic mechanism of MSC therapy in the degeneration of IVD in vivo.

• Clinical and Experimental Pediatrics
• /
• 제53권5호
• /
• pp.639-643
• /
• 2010

Purpose: Hand-foot-mouth disease (HFMD) is a common viral illness in children, which is usually mild and self-limiting. However, in recent epidemics of HFMD in Asia, enterovirus 71 (EV71) has been recognized as a causative agent with severe neurological symptoms with or without cardiopulmonary involvement. HFMD was epidemic in Korea in the spring of 2009. Severe cases with complications including death have been reported. The clinical characteristics in children with neurologic manifestations of EV71 were studied in Ewha Womans University Mokdong Hospital. Methods: Examinations for EV71 were performed from the stools, respiratory secretion or CSF of children who presented neurologic symptoms associated with HFMD by realtime PCR. Clinical and radiologic data of the patients were collected and analyzed. Results: EV71 was isolated from the stool of 16 patients but not from respiratory secretion or CSF. Among the 16 patients, meningitis (n=10) was the most common manifestation, followed by Guillain-Barre syndrome (n=3), meningoencephalitis (n=2), poliomyelitis-like paralytic disease (n=1), and myoclonus (n=1). Gene analysis showed that most of them were caused by EV71 subgenotype C4a, which was prevalent in China in 2008. Conclusion: Because EV71 causes severe complications and death in children, a surveillance system to predict upcoming outbreaks should be established and maintained and adequate public health measures are needed to control disease.

• 한국버섯학회지
• /
• 제5권1호
• /
• pp.39-42
• /
• 2007

색소변이체에서 버섯 바이러스의 게놈인 dsRNA가 확인되었으며, 크기는 각각 5.8kb, 1.8kb 이었다. 느타리바이러스 진단용 프라이머인 PVP로 RT-PCR을 수행한 결과 500bp 크기의 특이밴드가 관찰되었다. 또한 양송이 바이러스 진단용 프라이머 LIVP와 MBVP에서도 특이밴드가 관찰되었으나 양송이 바이러스와는 다른 양상이었다. 원형느타리의 백색변이체 (MGL2205)에 존재하는 바이러스유사입자는 구형이었으며, 크기는 14, 20~45nm이었다. 균사체의 세포단면을 관찰한 결과 바이러스 순화액에서 확인된 바이러스유사입자와 비슷한 구형의 입자들이 관찰되었으며, 순화된 바이러스와 동일한 입자인지는 추후 확인되어야 할 것으로 사료된다. 원형느타리 백색변이체(MGL2205)에 존재하는 바이러스의 최적 증식 조건은 $15^{\circ}C$, pH 6, 배양기간 3주인 것으로 판단되며, 이 결과는 이와 유사한 재배적 조건에서 재확인되어야 할 것으로 사료된다.

• 식물병연구
• /
• 제21권4호
• /
• pp.315-320
• /
• 2015

Soybean mosaic virus(SMV)는 potyvirus 속에 속하며, 모자이크, 괴사, 기형 등의 병징을 야기하고 국내에서는 11개 계통(G1 to G7, G5H, G6H, G7H, G7a)이 보고되어있다. Reverse transcription loop-mediated isothermal amplification(RT-LAMP) 방법은 등온에서 유전자 증폭이 가능하게 하며, 이 방법은 PCR 과정이나 전기영동 없이도 바이러스에 감염된 식물을 검출할 수 있는 이점이 있다. RT-LAMP의 최적반응 조건은 $58^{\circ}C$, 60분으로 확인되었다. 특이성 검정을 위해 콩에서 발생하는 여러 바이러스들과 보유중인 SMV의 9 계통에서 그 특이성을 확인하였다. 그 결과 SMV에 대한 RT-LAMP primer들의 종 특이성이 확인되었으며, SMV의 계통들에 대해서도 적용이 가능한 것으로 확인되었다. 항온수조와 heating block과 같은 간편한 등온 장치에서 재현성을 확인하기 위해 Thermocycler 기기와 비교하여 증폭 여부를 확인한 결과 반응의 차이는 나타나지 않았다. RTLAMP 반응 이후, 반응물을 전기영동과 SYBR Green I을 이용하여 자연광과 UV광에서 증폭 여부를 확인하였다. 그 결과 전기 영동, 자연광, portable UV light와 UV transilluminator에서 모두 반응이 확인되었다.

• 식물병연구
• /
• 제18권3호
• /
• pp.245-249
• /
• 2012

애멸구는 벼 생산에 있어서 흡즙에 의한 피해를 일으킬 뿐 아니라 벼줄무늬잎마름바이러스를 매개하는 매우 중요한 해충이다. 벼줄무늬잎마름병의 발생은 애멸구 발생과 매우 일치하므로 벼 농사에 벼줄무늬잎마름병 예방에 애멸구 관리가 매우 중요하다. 본 연구는 2011년 6월 충남 태안읍 근흥면 고남면 일대에 설치된 공중포충만을 이용하여 애멸구의 이동 및 바이러스 보독률을 조사하였으며, 애멸구 대량비래 후, 살충제(동부한농 etofenprox(10%))의 처리 횟수, 처리 시기에 따른 벼줄무늬잎마름병의 보독률을 조사하였다. 태안군 일대에서 애멸구 대량 비래후 약 1,217마리가 포획되었으며 이중 7.7%는 벼줄무늬잎마름바이러스, 4.4%는 벼검은줄오갈바이러스의 보독률을 보였다. 대량비래 후 2차례 살충제 처리는 벼줄무늬잎마름병 보독률의 변화가 1차례 처리와 차이는 없었으나 처리 시기를 대량 비래후 5-7일 사이에 처리하였을 경우 RSV의 피해감소 효과를 무처리 대비 87.6%까지 감소시킬 수 있었다. 따라서 본 연구 결과는 애멸구 대량 비래후 5-7일 사이에 한 번의 살충제 처리가 가장 효과적인 벼줄무늬잎마름바이러스 방제라 하겠다.

• 식물병연구
• /
• 제19권4호
• /
• pp.331-337
• /
• 2013

2006년 풍기지역 인삼(Panax ginseng)에서 바이러스병 유사증상이 관찰되었으며, 매년 발병율이 증가하였다. 인삼에서 이러한 증상은 지금까지 생리장해의 일부로 다루어졌다. 그러나 전자현미경에서 사상형 바이러스가 관찰되었고, DNA 칩 및 염기 서열 분석으로 Watermelon mosaic virus(WMV) 감염으로 인한 결과로 확인되었다. 인삼에 발생한 WMV 분리주는 생물검정에서 기존에 알려진 WMV 분리주들과는 새로운 병원성 계통으로 확인되어 WMV-Insam 계통으로 명명하였다. 본 논문은 인삼에 발생한 WMV에 관한 최초보고이다.

• 원예과학기술지
• /
• 제28권4호
• /
• pp.627-637
• /
• 2010

최근 들어 우리나라에서 토마토 소비가 급증하고 있으며 많은 토마토 품종이 시장에서 거래되고 있다. 그러나 토마토 품종 육성에 이용되는 부모 계통의 유전적 다양성이 낮아 형태적인 특성에 의한 토마토 품종의 구분은 매우 어려운 현실이다. 이에 따라 토마토의 품종을 구별해 낼 수 있는 분자표지의 개발이 필요한 실정이다. 본 연구에서는 SNP를 탐색하고 토마토 품종 구분을 위한 SNP 마커를 개발하였다. SNP분자표지는 고추 유전체 서열로부터 파생된 COS II 분자표지와 인트론 기반 분자표지를 기반으로 선발되었으며, HRM분석을 통해 다형성을 테스트 하였다. 전체 628개의 프라이머 조합 가운데 PCR을 통해 크기가 500bp 이하의 단일 밴드가 증폭된 417개의 프라이머 조합을 선발하였다. 417개의 프라이머 조합을 이용해 4개의 토마토 계통을 대상으로 HRM 분석을 실시하였으며, 다형성을 보인 70개의 프라이머 조합을 선발하였다. 70개의 프라이머 조합을 이용하여 32개의 토마토 품종을 대상으로 HRM 분석을 실시하였다. HRM분석을 통해 총 11개의 SNP 분자표지가 선발되었으며, 이 분자표지를 이용해 시판중인 32개의 토마토 품종을 모두 구분할 수 있었다.

• 한국미생물·생명공학회지
• /
• 제44권4호
• /
• pp.504-511
• /
• 2016

락툴로오스는 기존에 화학적인 이성화법을 통해 생산해왔던 기능성 당으로서 프로바이오틱스나 장내균총 개선을 위한 의약품으로 활용되어 왔다. 최근 락툴로오스 화학전환법의 단점인 촉매제거와 부산물제거 에너지손실등의 문제를 해결할 수 있는 생물촉매를 이용한 락툴로오스 전환법이 대두되었다. 본연구에서는 유당의 낮은 용해도와 락툴로오스의 효율적전환을 위해 최적의 효소를 선별하여 무작위 돌연변이법으로 유전자를 개량하여 열내성이 $75^{\circ}C$까지 증진되고 활성이 1.3배 향상된 효소를 선별하였다. 이 효소를 정제하여 사용하는 대신 본 연구에서는 과량 발현시킨 대장균을 Ca-alginate로 고정화하여 $70^{\circ}C$에서 200 g/l의 유당과 회분식으로 반응시켜 43%의 전환 수율을 확인하였다. 반복회분식 실험에서 고정화된 담체는 비교적 안정적이었으며 4회 반복반응 후에도 80% 이상의 활성을 유지하고 있었다. 산업적인 방법을 개발하기 위해 고정화 담체를 이용한 반응기의 운전 최적화와 담체의 안정화를 증진시키는 추가적인 연구가 필요하지만, 본 연구에서는 열내성 특성을 이용하여 정제된 효소가 아닌 효소를 발현하는 세포자체를 고정화 시킴으로써 경제성있는 생산에 대한 방법론을 제시하였다.