• Title/Summary/Keyword: IGS1

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Nuclear Ribosomal DNA Intergenic Spacer(IGS) I 영역의 분석에 의한 목질진흙버섯의 계통분류학적 위치 (Phylogenetic Analysis of Nuclear Ribosomal DNA Intergenic Spacer (IGS) I Region of Phellinus linteus)

  • 류영현;이진형;김종국
    • 한국균학회지
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    • 제32권2호
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    • pp.148-151
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    • 2004
  • 본 연구는 Phellinus linteus와 관련 담자균류 속간의 IGS I 영역의 분석에 기초한 분류체계를 정립하기 위해서 실시하였다. 실험에 사용된 Phellinus linteus 균주의 IGS I 영역은 730 bp였고 다른 담자균류의 IGS I 영역과 비교시 5' 말단부위의 $1{\sim}280\;base$까지는 각 균주들간의 보존성이 높게 나타났으며 3' 말단부위로 갈수록 보존성이 감소하다가 다시 증가하는 경향을 보였다. 담자균류의 IGS 영역에 대한 연구가 앞으로 진행된다면 ITS 영역의 비교와 더불어 새로운 계통분류지표로 이용될 수 있을 것이다.

GNSS Antenna PCO/PCV and Position Changes due to the Switch IGS08/igs08.atx to IGS14/igs14.atx

  • Choi, Byung-Kyu;Sohn, Dong-Hyo;Yoon, Ha-Su;Lee, Sang Jeong
    • Journal of Positioning, Navigation, and Timing
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    • 제11권2호
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    • pp.83-89
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    • 2022
  • For precise GNSS applications, the antenna phase center correction (PCC) is absolutely required. The PCC magnitude can reach the centimeter level with the antenna structure. In the present study, we first investigate the phase center offset (PCO) and phase center variation (PCO) of three different antenna models in two different reference frames, IGS08/igs08.atx and IGS14/igs14.atx. Clear L1 and L2 PCO differences were found between IGS08 and IGS14. In addition, the PCV showed characteristics that is dependent upon the signal direction (azimuth and elevation angle). The remarkable thing is that the changes of a Dorne Margolin choke-ring antenna model (AOAD/MT DOME) was very small in two reference frames. In order to analyze changes in positions according to different reference systems, GNSS data obtained from DAEJ, SUWN, and TSKB stations were processed by the precise point positioning (PPP) method. We suggest that an antenna PCO/PCV can affect the precise GNSS positioning on the order of several millimeters in two different reference frames.

GPS기반 준실시간 위치추적을 위한 IGS 예측궤도력 이상 검출 (Anomaly Detection of IGS Predicted Orbits for Near-Real-Time Positioning Using GPS)

  • 하지현;허문범;남기욱
    • 한국항행학회논문지
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    • 제15권6호
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    • pp.953-961
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    • 2011
  • IGS(Internation GNSS Service) 초신속궤도력에 포함된 예측궤도력은 실시간 혹은 준실시간 정밀 항법에 적합한 궤도력이다. 이 논문에서는 예측궤도력에서 발생할 수 있는 궤도 이상 발생 현황을 점검하고, NANU(Current Notice Advisories to NAVSTAR Users)와 IGS 방송궤도력(BRDC, Broadcast Ephemerides)를 이용하여 예측궤도력의 이상 검출 성능을 분석하였다. 그 결과 예측궤도력은 2010년 1년간 93회의 궤도 이상이 나타났으며, NANU를 이용할 경우 88%, NANU와 BRDC를 함께 사용할 경우 95%의 이상 검출이 가능함을 확인할 수 있었다.

Fusarium section Liseola 균주들에서 rDNA Intergenic Spacer 부위의 PCR-RFLP 분석 (PCR-RFLP Analysis of Ribosomal DNA Intergenic Spacer Region in Fusarium section Liseola.)

  • 이경은;최영길;민병례
    • 미생물학회지
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    • 제38권1호
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    • pp.7-12
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    • 2002
  • Fusarium section Liseola에 속하는 균주들의 rDNA IGS 부위를 중폭하고 여러개의 제한 효소로 처리하였다. 증폭된 IGS 부위의 길이는 F. moniliforme 12 만이 약 2.9 Kb 이고 나머지 균주들은 모두 약 2.6 Kb였다. 제한 효소 EcoRI, HincII, SalI, PstI 등은 ICS 부위를 절단하여 11균주들에서 9 haplotypes을 확인할 수 있었다. 본 연구에서의 Section Liseola에 속하는 균주들에 대한 결과에 앞서 연구되어진 Section Elegans에 속하는 균주들의 결과를 종합하여 dendrogram을 그렸을 때, IGS 부위를 종내에서와 마찬가지로 종간, section 간의 관계를 밝힐 수 있는 가능성을 제시하여 주었다.

Genetic Clarification of Auricularia heimuer Strains Bred and Cultivated in Korea Using the ITS and IGS1 rDNA Region Sequences

  • Nitesh Pant;HyeongJin Noh;Won-Ho Lee;Seong Hwan Kim
    • Mycobiology
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    • 제51권2호
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    • pp.109-113
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    • 2023
  • Auricularia is one of the broadly cultivated edible mushrooms in Korea. Most of the Korean Auricularia strains used for cultivation and breeding are known as A. auricula-judae. Recently, this species has been reported to belong to a species complex. Therefore, this study was carried out to genetically clarify the bred and cultivated Korean A. auricula-judae strains. The internal transcribed spacer (ITS) and IGS1 rDNA region sequences were determined from 10 A. auricula-judae strains by PCR and sequencing. Variation in the nucleotide sequence and sequence length of the two rDNA regions were found among the seven A. auricula-judae strains. A maximum-likelihood (ML) phylogenetic tree based on the ITS sequences clearly placed all the 10 Korean A. auricula-judae strains in the A. heimuer clade of the A. auriculajudae complex. A. heimuer is diverged from A. auricula-judae. An ML phylogenetic tree based on the IGS1 sequences revealed the close relationship between Korean A. heimuer strains to Chinese A. heimuer strains. But each strain could be distinguishable by the IGS1 sequence. Furthermore, progeny strains in the seven Korean strains could be differentiated from their parental strains by the IGS1 sequence based phylogenetic tree. Our results are expected to be used to complement the distinction of domestic Auricularia cultivars.

오제스키병 바이러스 항원검출을 위한 면역조직화학적 연구 -조직절편내 immunogold-silver법- (Immunohistochemistry for detection of Aujeszky's disease virus antigens : Immunogold-silver method in tissue sections)

  • 김순복
    • 대한수의학회지
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    • 제28권2호
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    • pp.365-369
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    • 1988
  • 본 연구는 감염돼지와 조직배양세포의 동결 및 파라핀 절편에서 immunogold-silver(IGS)법을 이용하여 오제스키병 바이러스를 검출코자 하였으며, 이를 위해 자돈 5두와 돼지뇌유래 섬유 아세포 및 BHK 세포를 공시하였고, IGS법과 immunoperoxidase법의 1차 항원으로는 2종의 단크론성 항체와 고도면역혈청을 사용하였다. IGS법은 양성부위에서 흑색의 미세한 과립의 침착을 볼 수 있었고, immunoperoxidase법에 비해 탁월한 효과를 얻었으며, IGS법은 조직내에 존재하는 각종 바이러스 항원을 검출하는데 이용할 수 있을 것으로 생각된다.

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IGS 정밀궤도력을 이용한 SBAS 위성궤도 및 시계보정정보의 정확도 분석 (Accuracy Analysis of SBAS Satellite Orbit and Clock Corrections using IGS Precise Ephemeris)

  • 정명숙;김정래
    • 한국항행학회논문지
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    • 제13권2호
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    • pp.178-186
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    • 2009
  • SBAS(Satellite Based Augmentation System) 시스템에서는 GNSS 사용자들의 위치 정확도 향상을 위해 위성궤도 및 시계보정정보를 제공하고 있는데, 본 논문에서는 이러한 보정정보의 정확도에 대해 분석하였다. IGS(International GNSS Service)에서 제공하는 GPS 위성의 정밀궤도력을 참값으로 가정하고, 그에 대한 오차를 이용하여 정확도를 분석/수행하였다. 이때 IGS 정밀궤도력과의 정확한 비교를 위해 GPS 위성에 대한 안테나 위상중심 편차와 P1-C1 편이를 고려하였다. SBAS 위성궤도 및 시계보정 정보로는 미국의 WAAS와 일본의 MSAS 보정정보를 이용하였다. 정확도 분석을 통해 SBAS에서 제공하는 위성궤도 보정정보와 위성시계 보정정보가 상당한 상관관계를 가지고 있음을 확인하였다. 또한 보정정보의 정확도는 SBAS 시스템의 지상 네트워크 크기와 위성의 궤적에 영향을 받는 것을 확인하였다.

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느티만가닥버섯의 ITS (internal transcribed spacer) 영역의 2차구조 분석 (Secondary Structure of the Ribosomal Internal Transcribed Spacer (ITS) Region of Hypsizygus marmoreus)

  • 우주리;윤혁준;유영현;이창윤;공원식;김종국
    • 생명과학회지
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    • 제23권10호
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    • pp.1260-1266
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    • 2013
  • 본 연구에서는 H. marmoreus 3-10균주와 H. marmoreus 1-1균주의 ribosomal DNA (rDNA) cluster의 분석이 수행되었다. Small subunit (SSU)와 intergenic spacer 2 (IGS 2)는 부분적으로 염기서열이 결정되었고, internal transcribed spacer 1 (ITS 1), 5.8S, internal transcribed spacer 2 (ITS 2), large subunit (LSU), intergenic spacer 1 (IGS 1), 5S는 완전하게 염기서열이 결정 되었다. 팽이버섯 H. marmoreus 3-10균주와 H. marmoreus 1-1균주의 rDNA cluster는 총 7,049 bp로 결정되었다. SSU은 1,796 bp, ITS1은 229 bp, 5.8S은 153 bp, ITS2는 223 bp, LSU은 3,348 bp, IGS1은 390 bp, IGS2은 900 bp로 염기서열이 분석되었다. 결정된 rDNA cluster의 총 7,049 bp 중에서 17 bp가 다름이 확인되었고, 각각 SSU (2 bp), ITS (3 bp), LSU (9 bp), IGS (3 bp)에서 차이를 확인하였다. ITS regions의 2차 구조 결과 5개의 stem-loop가 있음이 드러났다. 흥미롭게도, 이들 stem-loop 사이에서 stem-loop V에서 한 개의 상이한 염기가 다른 2차 구조를 나타냄을 확인하였다.

녹지량 지표로서 녹시율 개념을 도입한 서울시 가로 환경 특성 분석 (Analysis of Street Environment in Seoul by Introducing Index of Greenness in Streetscape)

  • 조용현;정용문;김광동
    • 한국조경학회지
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    • 제34권1호
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    • pp.1-9
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    • 2006
  • The purposes of this study are to develop the concept and the measurement method of IGS(Index of Greenness in Streetscape) and to analyze the present condition of street environments through field surveys of IGS in Seoul. IGS is a new index which directly expresses human's perceptions of plants in a street and defined as the area ratio of which leaves of plants occupy in an eye-level view of a person standing on the center line of a street. In practice, IGS can be calculated from a photograph taken from a center point of a street at about 1.5 meter height from the ground with single lens reflex camera equiped with 50mm standard lens. The photograph must have a special composition in a way that the center point of the photograph is positioning at the visual vanishing point of street center line. Then the IGS can be calculated by computing the percentage of the area covered with the plant leaves in the photograph. Types of streets in Seoul were classified according to road functions into 4 types. We performed field surveys and calculated IGSs from 300 sample sites in Seoul. Followings summarize some of study results. The average IGSs for arterial roads, highways, alleys and back streets are 16.91%, 16.33%, 13.97% and 7.50% respectively. The difference of average IGS values between Ginkgo biloba and Platanus occidentalis was relatively large. From observation IGSs from April 4th, 2003 to October 2nd, 2003, it was evident that the range and timing of each plant species' IGS change is not the same. According to questionnaire to public officials taking charge of street greening, the current evaluated IGS is 24.4%, and it is expected to be 40.7% in the future.

T4 티미딜산 생성효소 유전자의 Splicing 활성에 있어 Internal Guide Sequence 구조의 기능적 역할 (Functional Role of the Internal Guide Sequence in Splicing Activity of T4 Thymidylate Synthase Gene in vivo)

  • Shin, Sook;Park, In-Kook
    • 미생물학회지
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    • 제31권3호
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    • pp.208-213
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    • 1993
  • The structural and functional roles of IGS element of T4 td intron in thymidylate synthase activity in vivo were investigated Site-directed mutagenesis was employed to crete mutations of IGS element of T4 td intron, When a U-G pari was changed to a U-C pari in the 5' splice site of P1 stem of td intron, the activity of thymidylate synthase was completely abolished whereas the wild type retained the normal activity of enzyme. When U at 12 position within IGS element was changed to C, the activity of thymidylate synthase was approximately 32% of that of the wild type. Comparison of enzyme activities suggests that IGS element within P1 structure is an essential requirement for splicing of td gene in vivo.

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