Muhammad Ma'ruf;Lalu Muhammad Irham;Wirawan Adikusuma;Made Ary Sarasmita;Sabiah Khairi;Barkah Djaka Purwanto;Rockie Chong;Maulida Mazaya;Lalu Muhammad Harmain Siswanto
Genomics & Informatics
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제21권4호
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pp.48.1-48.8
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2023
Liver cancer is the fourth leading cause of death worldwide. Well-known risk factors include hepatitis B virus and hepatitis C virus, along with exposure to aflatoxins, excessive alcohol consumption, obesity, and type 2 diabetes. Genomic variants play a crucial role in mediating the associations between these risk factors and liver cancer. However, the specific variants involved in this process remain under-explored. This study utilized a bioinformatics approach to identify genetic variants associated with liver cancer from various continents. Single-nucleotide polymorphisms associated with liver cancer were retrieved from the genome-wide association studies catalog. Prioritization was then performed using functional annotation with HaploReg v4.1 and the Ensembl database. The prevalence and allele frequencies of each variant were evaluated using Pearson correlation coefficients. Two variants, rs2294915 and rs2896019, encoded by the PNPLA3 gene, were found to be highly expressed in the liver tissue, as well as in the skin, cell-cultured fibroblasts, and adipose-subcutaneous tissue, all of which contribute to the risk of liver cancer. We further found that these two SNPs (rs2294915 and rs2896019) were positively correlated with the prevalence rate. Positive associations with the prevalence rate were more frequent in East Asian and African populations. We highlight the utility of this population-specific PNPLA3 genetic variant for genetic association studies and for the early prognosis and treatment of liver cancer. This study highlights the potential of integrating genomic databases with bioinformatic analysis to identify genetic variations involved in the pathogenesis of liver cancer. The genetic variants investigated in this study are likely to predispose to liver cancer and could affect its progression and aggressiveness. We recommend future research prioritizing the validation of these variations in clinical settings.
Objectives : The purpose of this study was to improve the practice level on dental hygienists'infection prevention by examining the actual condition of dental hygienists'infection control and analyzing factors of having influence upon this. Methods : A questionnaire survey was carried out from July 18, 2011 to August 26 targeting dental hygienists who work at medical institutions where are located in Daegu, Busan and Ulsan Metropolitan Cities and Gyeongsangnam buk-do. After then, the following conclusions were obtained. Results : 1. As a result of surveying practice by item in the practice level of infection prevention, the items with high practice level in the management of infectious diseases were surveyed to be 12 months(89.6%) for health-checkup cycle and to be having experience of vaccination(78.0%) for hepatitis type B. The items with high practice level in the management and practice of washing hands were indicated to be in order of regularly paper towel(87.7%) and hands cleaning after regular medical examination(80.5%). In the item of the practice on wearing and managing individual protection equipment, regularly wearing(93.1%) rubber globes given washing implements was indicated to be high. 2. As a result of analyzing working career, working institution, working region, and practice level of infectious-disease management, the appearance of fulfilling infection control guidelines at medical institution and the experience of education for infection control were indicated to have difference depending on working institution. Regularly health checkup was indicated to have difference depending on respondents' working career and working institution. 3. The whole average in the practice level of infection prevention according to working career, working institution, and working region was indicated to be 2.55 out of 3-point perfection. 4. Wearing latex gloves was indicated to have statistically significant difference depending on working institution(p<0.001) and working region(p<0.001). The exchange of latex gloves every patient and the use of paper apron had statistically significant difference depending on working region(p<0.001). 5. As a result of comparing the frequency of using protection equipment for preventing infection according to the management of infectious diseases, the statistically significant difference was shown depending on the appearance of infection control guidelines at medical institution(p<0.001), the appearance of having experience of health checkup(p<0.01), and the appearance of having experience of vaccination for hepatitis type B(p<0.05). Conclusions : The above-mentioned findings showed that the denture satisfaction of the denture-wearing senior citizens was linked to their subjective oral health awareness. Therefore it will be possible to improve denture-wearing elderly people's quality of life when oral health plans geared toward boosting their denture satisfaction are carried out.
치과진료실은 다양한 종류의 병원성 미생물에 항상 노출되어 있으며, 환자의 분비물과 에어로졸 형태의 여러 경로를 통해 실내가 오염될 경우 교차감염의 매개 장소가 될 수 있다. 교차감염의 위험이 산재되어 있는 치과진료와 치과진료실에서 교차감염 방지의 주체자는 치과위생사이다. 치과위생사는 임상 전문가로 활동하기 전에 감염방지에 대한 올바른 인식을 가지고 있어야 되며, 이러한 감염방지 인식수준은 임상실습에서부터 영향을 받는다. 이에 감염방지의 인식을 조사하고자 일부 4년제 대학교 치위생학과 교육과정 중 3학년 과정에 임상실습이 정규과목으로 정해져있는 학생 314명을 대상으로 자기기입식 설문조사를 실시하였다. 자료 수집은 2011년 12월 9일부터 2012년 2월 22일까지 수행하였고, 수집된 자료 중 응답이 불성실한 11부의 설문지를 제외한 303부를 SPSS WIN 20.0을 사용하여 최종 분석하였고, 다음과 같은 결론을 얻었다. 감염질환에 관한 인식 영역에서 교내 외 실습 경험군은 감염질환 인지의 중요성 문항에서 4.89점, B형간염 예방접종 의무의 문항에서는 4.65점, B형간염 예방접종 필요성 인식의 문항에서는 4.77점, 문진 실시하여 감염방지를 실천할 수 있는지에 대한 문항에서는 4.71점, 감염방지 교육의 도움에 관한 문항에서는 4.76점으로 가장 높았으며, 유의한 차이를 보였다. 치위생학과 학생들을 위한 체계적이고 다양한 감염방지 교육 프로그램 개발과 학년에 따른 차별적인 교육이 필요하다고 사료된다.
Human papillomavirus (HPV) type 52 is a high-risk HPV responsible for cervical cancer. HPV type 52 is common around the world and is the most common in some Asian regions. The available prophylactic HPV vaccines protect only from HPV types 16 and 18. Supplementing economical vaccines that target HPV type 52 may satisfactorily complement available prophylactic vaccines. A codon-adapted HPV 52 L1 gene was expressed in the methylotrophic yeast Hansenula polymorpha, which is used as an industrial platform for economical hepatitis B surface antigen particle production in China. We found that the recombinant proteins produced in this expression system could form virus-like particles (VLPs) with diameters of approximately 50 nm. This study suggests that the HPV 52 VLPs produced in this platform may satisfactorily complement available prophylactic vaccines in fighting against HPVs prevalent in Asia.
Choi, Jae-Woong;Kim, Jong-Wook;Nguyen, Lap P.;Nguyen, Huu C.;Park, Eun-Mee;Choi, Dong Hwa;Han, Kang Min;Kang, Sang Min;Tark, Dongseob;Lim, Yun-Sook;Hwang, Soon B.
Molecules and Cells
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제43권5호
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pp.469-478
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2020
Hepatitis C virus (HCV) propagation is highly dependent on cellular proteins. To identify the host factors involved in HCV propagation, we previously performed protein microarray assays and identified the LIM and SH3 domain protein 1 (LASP-1) as an HCV NS5A-interacting partner. LASP-1 plays an important role in the regulation of cell proliferation, migration, and protein-protein interactions. Alteration of LASP-1 expression has been implicated in hepatocellular carcinoma. However, the functional involvement of LASP-1 in HCV propagation and HCV-induced pathogenesis has not been elucidated. Here, we first verified the protein interaction of NS5A and LASP-1 by both in vitro pulldown and coimmunoprecipitation assays. We further showed that NS5A and LASP-1 were colocalized in the cytoplasm of HCV infected cells. NS5A interacted with LASP-1 through the proline motif in domain I of NS5A and the tryptophan residue in the SH3 domain of LASP-1. Knockdown of LASP1 increased HCV replication in both HCV-infected cells and HCV subgenomic replicon cells. LASP-1 negatively regulated viral propagation and thereby overexpression of LASP-1 decreased HCV replication. Moreover, HCV propagation was decreased by wild-type LASP-1 but not by an NS5A binding-defective mutant of LASP-1. We further demonstrated that LASP-1 was involved in the replication stage of the HCV life cycle. Importantly, LASP-1 expression levels were increased in persistently infected cells with HCV. These data suggest that HCV modulates LASP-1 via NS5A in order to regulate virion levels and maintain a persistent infection.
혈청의 종류에 따른 하이브라도마 2c3.1세포의 성 장과 간염 표면 항원에 대한 단얼클론항체 생산에 미치는 영향을 조사하였다. 혈청은 fetal bovine s sera, newborn bovine calf sera, including supple m mented calf sera, horse serum, goat serum의 종류 를 사용하였다. 혈 청농도를 0.5%, 1.25%, 2.5%, 5%(v/v)로 변화시키고, 초기 세포농도를 $5{\times}10^4, 1{\times}10^5, 2{\times}10^5,$ cells/ml로 변화하여 현탁배양한 후 각각의 배지에서 하이브리도마 세포성장과 생산된 단일클론항체의 최대값을 비교하였다. 초기 세포농도를 $1{\times}10^5,$ cells/mlcells/ml로 일정하게 유지하였을 때 세포성장은 혈청의 종류에 관계없이 혈청농도의 증가와 밀접한 관련이 있었고, 혈청농도의 증가에 따른 서l포성장 증가로 인하여 항체 생산도 또한 증가되였 다. 5%의 혈청농도에셔 세포성장과 항체 생산은 초기 세포농도의 증가함에 따라 증가하였다. 같은 종 류의 혈청이라도 혈청 제조사에 따라 세포성장과 항 체 생산에 따른 영향을 끼침을 알았다. 이들 결과로 부터 하이브라도마 세포성장과 항체 생산을 증가하고 세포배양 비용을 줄일 수 있는 혈청의 종류와 농도를 결정하였다.
The paradigm of chronic liver diseases has been shifting. Although hepatitis B and C viral infections are still the main causes of liver cirrhosis and hepatocellular carcinoma (HCC), the introduction of effective antiviral drugs may control or cure them in the near future. In contrast, the burden of nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD) has been increasing for decades, and 25 to 30% of the general population in Korea is estimated to have NAFLD. Over 10% of NAFLD patients may have nonalcoholic steatohepatitis (NASH), a severe form of NAFLD. NASH can progress to cirrhosis and HCC. NASH is currently the second leading cause to be placed on the liver transplantation list in the United States. NAFLD is associated with obesity, type 2 diabetes, dyslipidemia, and metabolic syndrome. The pathophysiology is complex and associated with lipotoxicity, inflammatory cytokines, apoptosis, and insulin resistance. The only proven effective treatment is weight reduction by diet and exercise. However, this may not be effective for advanced fibrosis or cirrhosis. Therefore, effective drugs are urgently needed for treating these conditions. Unfortunately, no drugs have been approved for the treatment of NASH. Many pharmaceutical companies are trying to develop new drugs for the treatment of NASH. Some of them are in phase 2 or 3 clinical trials. Here, pharmacologic therapies in clinical trials, as well as the basic principles of drug therapy, will be reviewed, focusing on pathophysiology.
Zain Ul Abedien;Kainat Gul;Sara Khan;Maheen Shafiq;Khizar Rahman;Muhammad Hassan Nawaz
한국미생물·생명공학회지
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제51권2호
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pp.135-146
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2023
Viral oncology is focused on understanding the relationship between cancer and viruses, which are known to play a role in the development of certain types of cancer. Approximately 15-20% of human cancers are believed to be caused by oncogenic viruses, and as a result, there is significant interest in understanding how these viruses contribute to cancer development. There are several viruses that have been linked to cancer, including human papillomavirus, hepatitis B and C virus, Epstein-Barr virus, human T-cell lymphotropic virus type 1, Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus, and Merkel cell polyomavirus. Each of these viruses is associated with different types of cancer, and the mechanisms by which they contribute to cancer development are diverse. This article discusses these mechanisms as well as current and future strategies for preventing and treating virus-associated cancers with the goal of presenting a thorough review of the current state of knowledge in viral oncology and to highlight the importance of continued research in this field.
Lee, Boram;Ahn, Soomin;Kim, Haeryoung;Han, Ho-Seong;Yoon, Yoo-Seok;Cho, Jai Young;Choi, Young Rok
대한이식학회지
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제32권4호
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pp.108-112
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2018
Antibody-mediated rejection (AMR) is a major complication after ABO-incompatible liver transplantation. According to the 2016 Banff Working Group on Liver Allograft Criteria for the diagnosis of acute AMR, a positive serum donor specific antibody (DSA) is needed. On the other hand, the clinical significance of the histological findings of AMR in the absence of DSA is unclear. This paper describes a 57-year-old man (blood type, O+) who suffered from hepatitis B virus cirrhosis with hepatocellular carcinoma. Pre-operative DSA and cross-matching were negative. After transplantation, despite the improvement of the liver function, acute AMR was observed in the protocol biopsy on postoperative day 7; the cluster of differentiation 19+ (CD19+) count was 0% and anti-ABO antibody titers were 1:2. This paper presents the allograft injury like AMR in the absence of DSA after ABOi living donor liver transplantation with low titers of anti-ABO antibody and depleted serum CD19+ B cells.
Khai Viet Ninh;Dang Hai Do;Trung Duc Nguyen;Phuong Ha Tran;Tuan Hoang;Dung Thanh Le;Nghia Quang Nguyen
한국간담췌외과학회지
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제28권1호
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pp.34-41
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2024
Backgrounds/Aims: Liver transplantation (LT) provides a favorable outcome for patients with hepatocellular carcinoma (HCC) and was launched in Vietnam in 2004. In this study, we evaluated the short-term and long-term outcomes of LT and its risk factors. Methods: This retrospective study analyzed HCC patients who underwent LT at Viet Duc University hospital, Vietnam, from 01/2012-03/2022. The following data were gathered: demographics, virus infection, tumor characteristics, alpha-fetoprotein (AFP) level, Child-Pugh and MELD scores, selection criteria, type of LT, complications, 30-day mortality, and disease-free and overall survival (DFS and OS). Results: Fifty four patients were included, the mean age was 55.39 ± 8.46 years. Nearly 90% had hepatitis B virus-related HCC. The median (interquartile range) AFP level was 16.2 (88.7) ng/mL. The average MELD score was 10.57 ± 5.95; the rate of Child-Pugh A and B were 70.4% and 18.5%, respectively. Nearly 40% of the patients were within Milan criteria, brain-dead donor was 83.3%. Hepatic and portal vein thrombosis occurred in 0% and 1.9%, respectively; hepatic artery thrombosis 1.9%, biliary leakage 5.6%, and postoperative hemorrhage 3.7%. Ninety-day mortality was 5.6%. Five-year DFS and OS were 79.3% and 81.4%, respectively. MELD score and ChildPugh score were predictive factors for DFS and OS (p < 0.05). In multivariate analysis, Child-Pugh score was the only significant factor (p < 0.05). Conclusions: In Vietnam, LT is an effective therapy for HCC with an acceptable complication rate, mortality rate, and good survival outcomes, and should be further encouraged.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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