• 한국수의병리학회:학술대회논문집
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• 한국수의병리학회 2002년도 추계학술대회초록집
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• pp.142-142
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• 2002

돼지의 주요 장염 유발 바이러스인 돼지 전염성 위장염 바이러스 (transmissible gastroenteritis virus; TGEV), 돼지 유행성 설사증 바이러스 (porcine epidemic diarrhea virus; PEDV), 돼지 칼리시 바이러스 (porcine enteric calicivirus; PECV), 돼지 로타바이러스 A 형과 C 형 (porcine rotavirus; PRY, group A and C)을 동시에 감별 진단 할 수 있는 신속하고 정확한 oligonucleotide microarray 진단법을 개발하였다. 이 진단법은 유리슬라이드에 각각의 바이러스에 특이적인 부위에서 제작된 oligonucleotide probe를 찍은 DNA chip을 제작하여 여기에 각각의 바이러스를 역전사하고 cy5-dCTP를 포함한 multiplex PCR을 수행한 다음 hybridization 하였다. 이후 hybridization 결과는 fluorescence scanner를 이용하여 확인하였다. 이 새로운 microarray system은 RT-PCR과 같은 기존의 진단방법보다 소량의 바이러스를 민감하게 검사할 수 있을 뿐 아니라 hybridization을 통해 검사결과의 정확성을 확인할 수 있었다. 따라서 본 연구에서 개발한 microarray system은 돼지의 설사 유발 바이러스를 진단하는데 매우 유용한 진단 방법임을 확인하였다.

• 대한수의학회지
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• 제32권4호
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• pp.569-577
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• 1992

Group A 로타바이러스 VP6에 특이적으로 반응하는 단크론 항체를 이용하여 로타바이러스 감염이 의심되는 돼지 분변으로부터 로타 바이러스를 검색할 수 있는 효소면역측정법을 개발하였다. 이 효소면역측정법에서는 capture antibody로서 protein A-sepharose를 이용하여 단크론 항체로부터 순수 분리한 immunoglobulin을 사용하였으며 detecting antibody는 토끼 면역혈청으로부터 순수 분리한 immunoglobulin에 biotin을 label하여 사용하였다. 개발된 효소면역측정법의 민감도와 특이성을 전자현미경법 및 형광항체법의 것과 비교하여 보았을 때 서로 유사하였으며 분변재료로부터 로타바이러스를 검색하는데 유용한 것으로 나타났다. 개발된 효소면역측정법은 야외로부터 로타바이러스 검색을 위하여 수집된 많은 양의 분변재료를 실험실내에서 screen하는데 유용하게 사용될 것으로 생각된다.

• 한국동물위생학회지
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• 제30권4호
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• pp.489-496
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• 2007

An oligonucleotide microarray system was developed for the simultaneous detection of porcine epidemic diarrhea virus, transmissible gastroenteritis virus, porcine enteric calicivirus, porcine group A and C rotavirus. RNAs of the reference viruses and porcine diarrhea samples were extracted and amplified using one-step multiplex RT-PCR in the presence of cyanine 5-dCTP and hybridized on the microarray chip that spotted the virus-specific oligonucleotides. This system were approximately 10-to 100-fold higher in sensitivity than conventional RT-PCR, and the assay time was less than 3 hours. The relative sensitivity and specificity were 92% and 72.2%, respectively, based on 102 porcine diarrhea samples using RT-PCR as gold standard. These results suggested that the oligonucleotide microarray system in this study be probably more reliable and reproducible means for detecting porcine enteric viruses and that it could be of substantial use in routine diagnostic laboratories.

• 대한임상검사과학회지
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• 제49권2호
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• pp.141-149
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• 2017

2015년 3월부터 2017년 2월까지 2년간 Multiplex-PCR을 이용한 소아청소년의 급성설사질환 원인규명을 위해 의뢰된 521 분변 검체를 대상으로 5종의 바이러스 검사와 10종의 세균검사를 실시한 521 분변 검체 중 바이러스나 세균이 확인된 170명 중 중복 감염이 확인된 9명의 검체를 포함하여 179개의 양성검체의 결과를 분석한 결과 남아가 102명(56.98%), 여아가 77명(43.02%)이었으며, 3~4세(51.96%), 5~6세(12.29%) 연령대에서 가장 높은 양성율을 보였다. 179건의 양성 검체 중 중복감염을 포함한 209건(209/521, 40.12%)을 분석한 결과 norovirus-GII 감염이 88건(88/521, 16.89%), Campylobacter spp. 감염이 26건(26/521, 4.99%), rotavirus 감염이 18건(18/521, 3.45%), Clostridium difficile Toxin B 감염이 18건(18/521, 3.45%), adenovirus 감염이 17건(17/521, 3.26%), Clostridium perfringens 감염은 16건(16/521, 3.07%), astrovirus 감염은 11건(11/521, 2.11%), Salmonella spp. 감염은 5건(5/521, 0.96%), norovirus-GI, Yersinia spp., Aeromonas spp. 감염은 각각 3건(3/521, 0.58%), verocytotoxin-producing E. coli 감염은 1건(1/521, 0.19%), Vibrio spp, E. coli O157:H7, Shigella spp. 감염은 나타나지 않았다. 유아기(6세 이하)의 계절별 분리 양상을 확인한 결과는 기온이 낮은 겨울(11~2월)에는 주로 norovirus-GI, norovirus-GII가 유행하였고, 기온이 상승하기 시작하는 봄(3~5월)에는 rotavirus가 유행하는 경향을 전형적인 장염바이러스의 경향을 보였다. Astrovirus 경우에는 norovirus-GI, norovirus-GII, rotavirus가 유행하는 시기가 아닌 4월~10월에 유행하는 경향을 보이고, adenovirus인 경우에는 8월~2월까지 유행하는 경향을 보였다. 연령이 높아질수록 바이러스뿐만 아니라 세균이 원인이 되어 급성설사질환을 유발하는 것으로 나타났으며, 다중 중합효소연쇄반응으로 원인을 파악하고자 할 때에는 유아기 때에는 바이러스 검사를 의뢰하는 것이 유효하지만 연령이 높아짐에 따라 바이러스와 세균을 동시에 의뢰하는 것이 바람직하다고 사료된다.

• 한국동물위생학회지
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• 제45권2호
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• pp.101-110
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• 2022

This study was performed to investigate infectious gastrointestinal diseases in 115 Korean cats (83 indoors and 32 outdoors) with digestive signs such as diarrhea, anorexia or abdominal distention. Detection of infectious pathogens was analyzed using real-time PCR. As a result, 85 of 115 Korean cats were detected with feline corona virus (FCoV), feline parvo virus, Group A rotavirus, Clostridium perfringens (C. perfringens), Campylobacter coli (C. coli), Campylobacter jejuni, enterotoxigenic Escherichia coli, enteropathogenic Escherichia coli, Salmonella spp., Tritrichomonas foetus, Cyclospora cayetanensis, and Giardia lamblia. The most frequently detected pathogen was C. perfringens (52 cats, 61.2%), followed by FCoV (43 cats, 50.6%) and C. coli (16 cats, 18.8%). Also, single infection was the most common (43 cats), followed by double infection in 31 cats, triple infection in 7 cats, and quadruple infection in 4 cats. There was no significant relationship between pathogen detection and age, gender, living environment, weather, and diarrhea. However, there was a significant difference between the age group under 1 year and the age group 1~7 (P value<0.05). In this study, cats with suspected gastrointestinal infection were randomly evaluated, and other factors that could affect pathogen detection were insufficiently considered. For this reason, additional epidemiological investigations with a larger number of cats and sufficient consideration of the causes that may affect the results are needed. Nevertheless, it is thought that this study can also provide valuable information on gastrointestinal pathogens in Korean cats.

• 한국수의병리학회:학술대회논문집
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• 한국수의병리학회 2003년도 추계학술대회초록집
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• pp.32-32
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• 2003

Intestinal infections are common in growing pigs and can be caused by multiple pathogens, environmental and management factors [1]. Among the most important viruses in swine enteritis are porcine epidemic diarrhea virus (PEDV), transmissible gastroenteritis virus (TGEV), porcine enteric calicivirus (PECV), porcine group A rotavirus (PRV gp A) and bacteria are Escherichia coli and Salmonella spp. and protozoa is Isospora suis [1]. The DNA chip system can serve as a powerful tool that can be utilized for simultaneous detection of specific pathogenic bacteria strains and viruses [2,3]. The combination of PCR and DNA chip technology will provide a novel method for the detection of porcine enteric pathogens thus revolutionize the diagnosis and management of the disease. The aim of this study is to develop DNA chip system for the rapid and reliable detection of five major porcine enteric pathogens based on oligonucleotide DNA chip hybridization. (omitted)

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제47권2호
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• pp.317-322
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• 2019

Gastroenteritis with diarrhea is one of the most infectious diseases in the world following respiratory infections. Notably, diarrhea-causing viruses (DVs) cause more than 70% of such cases. In this study, 3,065 stool specimens from patients with diarrhea (median age, 1.1 years; range, 0.0-91.1 years), who were admitted to the DanKook University Hospital, were examined using multiplex reverse transcription PCR (mRT-PCR). The target viruses were astrovirus (AstV), enteric adenovirus (EAdV), group A rotavirus (RotV), norovirus GI (NoV-GI), and norovirus GII (NoV-GII). The mRT-PCR results were analyzed based on various factors such as seasonality, age, presence of co-infection, and analyzed trends. The detection rate of the DVs during the study period was found to be 30.8% (n = 943/3,065). When the detection rate was analyzed monthly, the DV detection rate was found to be highest between December to January. Of the detected DVs, NoV-GII was the most common, accounting for 45.5% of the detected viruses (n = 446/980). Notably, 86.5% (n = 848/980) of the pathogens were detected in individuals who were less than 5 years of age. During the study period, NoV-GII and RotV showed alternating trends. In addition, both the number and rate of co-infections increased.

• 한국임상수의학회지
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• 제29권5호
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• pp.377-383
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• 2012

송아지 설사병은 국내 축산산업에 큰 피해를 주는 중요한 질병이다. 다양한 감염성 원인체들이 송아지 설사병에 관련될 수가 있기 때문에 효과적인 치료를 위해서는 신속한 감별진단이 필수적이다. 따라서 소설사병 바이러스(BVDV), 소 코로나바이러스(BCoV), A형 소 로타바이러스(BRV), 살모넬라, $K99^+$ 대장균, Cryptosporidium parvum등의 6개의 주요 병원체들을 동시에 검출하는 두 개의 multiplex real-time PCR으로 구성된 PCR 패널을 개발하여 국내 농가에서 전북대학교 동물질병진단센터로 접수된 97개의 설사 분변을 검사하였다. 또한 현미경 검사법을 이용하여 97개의 분변에서 Coccidium 충란을 검사하였다. 개발된 multiplex PCR의 민감도는 BVDV, BCoV와 BRV의 경우는 0.1 $TCID_{50}$, $K99^+$ 대장균은 5 CFU, Salmonella는 0.5 CFU, Cryptosporidium는 50 oocysts로 측정되었다. 또한 multiplex PCR의 증폭효율은 병원체에 따라0.97에서 0.99였다. 국내에서 접수된97개의 분변 중 36개의 분변은 multiplex PCR에 의해 최소 하나의 병원체에 대해 양성으로 판정되었고, 6개의 샘플은 2개의 병원체에 동시에 양성반응을 보였다. 또한 1달 이상 연령의 송아지 분변48개에서는 Coccidium 충란이 발견되었다. 결과적으로, 새로이 개발된 multiplex real-time PCR은 BVDV, BCoV, BRV, $K99^+$ 대장균, Salmonella와 Cryptosporidium과 관련된 송아지 설사병을 신속하고 정확하게 진단할 수 있는 유용한 검사법이 될 수 있을 것으로 기대되며 향후 Coccidium까지 검출할 수 있는 동시 진단법이 개발될 필요가 있을 것으로 생각된다.

• Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
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• 제16권3호
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• pp.162-170
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• 2013

Purpose: To detect major acute gastroenteritis virus (rotavirus, norovirus, astrovirus, and enteric adenovirus) and non-enteric type of adenovirus (AdV) in the stools of intussusception patients and to investigate the clinical role of detected viruses. Methods: From March 2012 to February 2013, major acute gastroenteritis virus and non-enteric type of AdV were isolated from stool samples that collected from 44 patients treated for intussusception in Chungnam National University Hospital. Patients were divided according to age and isolated virus. Results: Virus was detected in 28 (63%) stool specimens. The virus detection rate was significantly lower in patients aged under 12 months (p = 0.04). Twenty-two patients (78.6%) had non-enteric adenovirus, 4 (14.3%) had norovirus, 1 (3.6%) had sapovirus, and 1 (3.6%) had astrovirus. AdV subgroup C (AdV 1, 2, 5, and 6) comprised the majority with 20 cases (90.9%). A monthly increment-and-decrement pattern of intussusception was similar to that of viral detection in the stool samples. Enema reductions were successful in 39 patients and surgical manual reductions were performed in 5 patients. Virus was detected in 24 patients (61.5%) of enema reduction group and 4 patients (80.0%) of surgical manual reduction group. All of the detected viruses were non-enteric adenovirus subgroup C (AdV 1, 5, and 6) in surgical reduction patients. Conclusions: The virus detection rate was high in the stools of intussusception patients. The pattern of seasonal intussusception occurrence rate was parallel with seasonal these viral detection rate in the stool samples. These findings suggest that viral infection plays an important role in the development of intussusception and further research is warranted.

• Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
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• 제9권1호
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• pp.1-13
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• 2006

목 적: 소아의 급성 위장관염은 매우 흔하고 입원율이 높은 중요한 질환이다. 본 연구에서는 지역 사회에서 소아의 급성 위장관염을 일으키는 대표적인 바이러스 및 세균을 대상으로 1년간 발생 경향에 대한 최근 자료를 제시하고자 하였다. 방 법: 서울대학교 보라매병원 소아과에 3일 이내의 급성 설사를 주소로 내원한 15세 미만의 소아를 대상으로 임상 검사 및 대변 검사를 시행하였다. 입원 소아는 2003년 4월부터 2004년 3월까지 1년간, 외래 소아는 2003년 4월부터 7월까지 단일 외래를 방문한 환아들에 국한하여 연구하였다. 방문 2일 이내에 대변 검체를 얻었으며 바이러스성 원인균 검사로는 로타바이러스, 장 아데노바이러스 항원 검출법을, 세균성 원인균 검사로는 Salmonella, Shigella, Vibrio, Campylobacter 균종 및 Yersinia enterocolitica 대해 배양검사를 시행하였고 병원성 E.coli (ETEC, EHEC, EPEC) 검출을 위해서는 PCR 법을 이용하였다. 입원 환아들은 전해질 검사를 포함한 혈액 검사를 같이 시행받았다. 결 과: 전체 입원 환아는 130명, 외래 환아는 28명이 대상에 포함되었으며, 6세 미만의 환아가 각각 94.6% (123명), 92.8% (26명)로 대부분을 차지하였다. 모두 단일 원인균이 분리되었으며 그 중 로타바이러스가 가장 흔한 원인균으로 입원 환아의 42.3% (55명)에서, 외래 환아의 29.6% (8명)에서 검출되었다. 대변 배양 검사에서는 비장티푸스성 살모넬라균이 입원 환아의 3.9% (4명), 외래 환아의 3.6% (1명)에서 배양되었다. 병원성 대장균은 입원 환아의 2.1% (2명/97명), 외래 환아의 25.0% (3명/12명)에서 분리되었으며 EPEC (4명), ETEC (1명) 순이었고 EHEC는 분리되지 않았다. 이외에 장 아데노바이러스와 Campylobacter, Yersinia, Shigella 균종은 한 예도 없었다. 결 론: 로타바이러스는 국내 지역 사회 병원에서 소아기 위장관염으로 입원하게 되는 가장 흔한 원인균이며 세균성 장염의 원인균으로는 비장티푸스성 살모넬라와 병원성 대장균, 특히 EPEC와 ETEC가 중요하다. Campylobacter 균종은 급성 설사로 입원하게 되는 환아에서는 흔하게 분리되지 않는 것으로 보여지나 외래 환아를 다수 포함한 대단위의 연구가 더 필요하리라 생각된다.