A bacterial strain named HY-3 that produces a highly active extracellular protease was isolated from the digestive tract of a spider, Nephila clavata. The bacterium was a Gram-negative, oxidase-negative, catalase-positive, nonhalophilic, nitrate-reducing, facultative anaerobe. Transmission and scanning electron microscopies demonstrated that the isolate was non-spare-forming, straight, rod-shaped, and motile by peritrichous flagella. The G+C content of the DNA was 57.0 mol%. The isoprenoid quinone type was ubiquinone with 8 isoprene units (Q-8). The morphological and biochemical characteristics including the predominant fatty acid and phospholipids profiles placed the isolate HY-3 in the family Enterobacteriaceae. Further biochemical characterization and phylogenetic studies including determination of an almost complete 16S ribosomal DNA sequence suggested that the bacterium was closely related to the genus Serratia. DNA-DNA hybridization analysis revealed that this extracellular protease-producing strain belongs to Serratia proteamaculans, which is also known far its association with insects.
Journal of Physiology & Pathology in Korean Medicine
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v.21
no.1
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pp.231-234
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2007
Dichlororinated bibenzyl compound (4) has been isolated from the New Zealand liverwort. This compound was elucidated using 1D/2D-NMR and mass spectral method. The compound (3) inhibited the growth of the Gram positive bacterium Bacillus subtilis ATCC 19659, (2 mm inhibition zone and 2 mm inhibition zone at 30 ${\mu}$g/disc), Candida albicans ATCC 14053, (2 mm inhibition zone and 2 mm inhibition zone at 30 ${\mu}$g/disc), and the dermatophytic fungi Trichophyton mentagrophytes ATCC 28185, (12 mm inhibition zone at 30 ${\mu}$g/disc) and Cladosporium resinae ATCC 52833 (2 mm inhibition zone at 30 ${\mu}$g/disc). This bibenzyl compound (4) exhibited antimicrobial activity.
Enterococcus faecalis CAUM157, isolated from raw cow's milk, is a Gram-positive, facultatively anaerobic, and non-spore-forming bacterium capable of inhabiting a wide range of environmental niches. E. faecalis CAUM157 was observed to produce a two-peptide bacteriocin that had a wide range of activity against several pathogens, including Listeria monocytogenes, Staphylococcus aureus, and periodontitis-causing bacteria. The whole genome of E. faecalis CAUM157 was sequenced using the PacBio RS II platform, revealing a genome size of 2,972,812 bp with a G+C ratio of 37.44%, assembled into two contigs. Annotation analysis revealed 2,830 coding sequences, 12 rRNAs, and 61 tRNAs. Further, in silico analysis of the genome identified a single bacteriocin gene cluster.
Acetic acid producing bacteria were isolated from deastringent persimmon vinegar and the major bacterium was identified using morphological and biochemical tests. Acetobacter sp. AH-1 was motile, gram negative rod with catalase positive and oxidase negative. The strain can grow up to 5 % ethanol and 2% NaCl as well as 25% glucose. Optimum temperature and pH for growth were 3$0^{\circ}C$ and 5.0, respectively. Volatile constituents of persimmon vinegar were analyzed by purge and trap sampling . Acetic acid adn alcohol were the largest volatile compounds quantitiatively in persimmon vinegar. Among alcohols, 20methyl-1-propanol, isoamyl alcohol and amyl alcohol were detected. Isovaleradehyde and benzaldehyde for aldehyde, isoamyl acteate, ethyl formate, propyl aceetate, and ethyl acetate for esters were likely to contribute to persimmon vivegar flavor.
Bacillus anthracis is a gram-positive spore-forming bacterium that causes the disease anthrax. In order to develop a DNA marker specific for Bacillus anthracis and to discriminate this species from Bacillus cereus group, we applied the randomly amplified polymorphic DNA (RAPD)-PCR technique to a collection of 29 strains of the genus Bacillus, including 22 species of the B. cereus group. A 709-bp RAPD marker (KHT5) specific for B. anthracis was obtained from B. anthracis BAK. The PCR product of internal primer set from the KHT5 fragment distinguished B. anthracis from the other species of the B. cereus group.
Crude extract of bioconverted linoleic acid using Pseudomonas aeruginosa PR3 was evaluated for its antibacterial activity against food-borne pathogenic bacteria. Crude extract showed antibacterial activity against four Gram-positive bacteria, Staphylococcus aureus (ATCC 6538), S. aureus (KCTC 1916), Listeria monocytogenes (ATCC 19166), and Bacillus subtilis (ATCC 6633), and one Gramnegative bacterium, Pseudomonas aeruginosa (KCTC 2004), with minimum inhibitory concentrations ranging from 750 to $1,500\;{\mu}g{\cdot}ml^{-1}$. S. aureus and B. subtilis were selected for growth inhibition assays with bioconverted linoleic acid. Major antibacterial effects occurred at lag phase.
Pulmonary actinomycosis is a chronic pulmonary infection characterized by suppuration, abscess formation, and dense scarring. The causative agent, Actinomyces israelii, is a gram-positive, microaerophilic bacterium that resemble fungi. We recently treated two cases of pulmonary actinomycosis. A patient was underwent right lower lobectomy under the impression of bronchiectasis. Pulmonary actinomycosis was diagnosed of postoperatively. He was medicated with high-dose penicillin parenterally. The other patient was also undergone right lower lobectomy under the impression of broncholithiasis and received parenteral penicillin and oral roxythromycin. There was no recurrence or development of empyema. The purpose of this paper is to review of our experience and to enhance consideration of pulmonary actinomycosis.
[ ${\beta}-1,3-Glucan$ ] (curdlan) is a water-insoluble polysaccharide composed exclusively of ${\beta}-1,3\;linked$ glucose residues. Extracellular curdlan was mostly synthesized by Agrobacterium species and Alcaligenes faecalis under nitrogen-limiting conditions. In this study, we screened the microorganisms capable of producing extracellular curdlan from soil samples. For the first time, we reported Gram-positive bacterium Bacillus sp. SNC 107 capable of producing extracellular curdlan in appreciable amounts. The effect of different carbon sources on curdlan production was studied and found that the yield of curdlan was more when glucose was used as carbon source. It was also found that maximum production was achieved when the initial concentration of ammonium and phosphate in the medium was 0.5 and 1.9 g/L respectively. In this study the curdlan production was increased from 3 to 7g/L in shake flask cultures.
Journal of the Korea Institute of Military Science and Technology
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v.14
no.2
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pp.305-312
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2011
Bacillus anthracis(Ba) is a Gram-positive spore-forming bacterium that causes the disease anthrax. The feature of Ba is the presence of two large virulence plasmids, pXO1 and pXO2. Molecular genotyping of Ba has been difficult to the lack of polymorphic DNA marker. Ba isolated from Korea has been genotyped using various nucleotide analysis methods, such as 16s rDNA sequencing and multiple-locus variable-number tandem repeat (MLVA) analysis. We identified genotypes that represent a genetic lineage in the B1 cluster. This study emphasized the need to perform molecular genotyping when attempting to verify a strain-specific Ba.
Bacillus thuringiensis subsp. morrisoni PG-14 is a gram-positive soil bacterium producing mosquitocidal parasporal inclusions composed of several crystal proteins. Among these crystal protein genes, cryIVD gene is one of major component which has 72 kDa in size. However, these parasporal inclusions sink quickly from the surface of water where mosquito larval feeding occurred. To develope mosquitocidal cyanobacterium, therefore, we constructed the expression vector, pCYASK 5-1 harboring cryIVD gene. The expression vector, pCYASK5-1 was transformed into the cyanobacterium Syne- chocystis PCC6803 reported as a natural mosquito larval food source and the transformants were selected with kanamycin. Expression of IVD gene in transformant was characterized by SDS-polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) and immunoblot analysis. The mosquitocidal activity of a transformant was determined with Culex tritaeniorhynchus. The results showed that, the transformed cyanobacterium is toxic to mosquito larvae and will be expected as a potential agent that is used for mosquito control.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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