• 제목/요약/키워드: Genotypic correlation

검색결과 50건 처리시간 0.029초

The C609T (Pro187Ser) Null Polymorphism of the NQO1 Gene Contributes Significantly to Breast Cancer Susceptibility in North Indian Populations: a Case Control Study

  • Yadav, Prasant;Mir, Rashid;Nandi, Kajal;Javid, Jamsheed;Masroor, Mirza;Ahmad, Imtiyaz;Zuberi, Mariyam;Kaza, RCM;Jain, SK;Khurana, Nita;Ray, Prakash Chandra;Saxena, Alpana
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
    • /
    • 제17권3호
    • /
    • pp.1215-1219
    • /
    • 2016
  • Background: Worldwide, breast cancer is the most common cancer among women and is a leading cause of cancer death. In the present study, we investigated the NQO1 C609T genotypic and allelic distribution in north Indian breast cancer patients. Materials and Methods: The genotypic distribution of the NQ01 C609T polymorphism was assessed in 100 invasive ductal carcinoma (IDC) breast cancer patients and 100 healthy controls using allele specific PCR (AS-PCR). Results: A lower frequency of the CC genotype was found in breast cancer patients (24%) than in the controls. On the other hand, TT genotype frequency was also found to be higher in female healthy controls (32%) than the female breast cancer patients (20%). The frequencies of all three genotypes CC, CT, TT in patients were 24%, 56% and 20% and in healthy controls 50%, 22% and 32% respectively. We did not find any significant correlation between the NQO1 C609T polymorphism and age group, grading, menopausal status and distant metastasis. A less significant association was found between the NQ01 C609T polymorphism and the stage of breast cancer (X2=5.931, P=0.05). Conclusions: The present study shows a strong association between NQO1 C609T polymorphism with the breast cancer risk in the north Indian breast cancer patients so that possible use as a risk factor should be further expel.

Henoch-Sch$\"{o}$nlein 자반증에서 Tumor Necrosis Factor-${\alpha}$ 유전자 다형성 분석 (Analysis of the Tumor Necrosis Factor-${\alpha}$ Promoter Polymorphism in Children with Henoch-Sch$\"{o}$nlein Purpura)

  • 양혜란;고재성;서정기
    • Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
    • /
    • 제10권1호
    • /
    • pp.11-19
    • /
    • 2007
  • 목 적: 본 연구에서는 Henoch-Sch$\"{o}$nlein 자반증으로 진단된 환아들에서 급성기와 관해기에 TNF-${\alpha}$ 농도를 측정함으로써 Henoch-Sch$\"{o}$nlein 자반증의 발병과 임상양상의 발현에 있어 TNF-${\alpha}$의 의의를 평가하고, 각 환자에서 TNF-${\alpha}$ -308, -238 유전자 다형성의 유전자형과 대립유전자 빈도를 분석함으로써 Henoch-Sch$\"{o}$nlein 자반증의 발병에 있어 TNF-${\alpha}$ 유전자 다형성이 갖는 의의를 알아보고자 하였다. 방 법: 2004년 3월에서 2005년 11월까지 서울대병원 및 분당서울대병원 소아과에 내원하여 Henoch-Sch$\"{o}$nlein 자반증으로 진단받은 40명의 소아 환자를 대상으로 하였고, 건강한 소아 환아 32명을 대조군으로 하였다. 후향적인 의무기록지 검토를 통해 환아들의 임상양상을 조사하여 임상 점수를 평가하였다. 환자군에서 급성기와 관해기에 혈청 TNF-${\alpha}$ 농도를 측정하였다. 환자군과 대조군에서 혈액을 채취하여 TNF-${\alpha}$ -308과 -238 유전자 다형성을 조사하였다. 결 과: Henoch-Sch$\"{o}$nlein 자반증으로 진단된 40명 (남아 20명, 여아 20명)의 환아에서 급성기에 측정한 혈청 TNF-${\alpha}$ 농도는 $23.17{\pm}11.31$ pg/mL였으며, 증세가 소실된 후에 측정한 혈청 TNF-${\alpha}$ 농도는 $10.56{\pm}5.59$ pg/mL로서 유의하게 감소하였다(p=0.000). 혈청 TNF-${\alpha}$와 Henoch-Sch$\"{o}$nlein 자반증의 임상 점수 간에 유의한 상관관계는 없었다(r=0.310, p=0.070). TNF-${\alpha}$ -308 유전자형 빈도는 환자군에서 GG 80%, GA 20% 였으며, 대조군에서는 GG 93.8%, GA 6.2%로서 환자군에서 높은 GA 유전자형의 빈도를 보였지만 통계적인 유의성은 없었다(P=0.094). TNF-${\alpha}$ -238 유전자형 분포는 환자군에서 GG 97.5%, GA 2.5%였으며, 대조군에서는 GG 93.8%, GA 6.3%로서 두 군 사이에 통계적인 유의성이 없었다(p=0.429). 결 론: TNF-${\alpha}$는 Henoch-Sch$\"{o}$nlein 자반증의 발병에 중요한 역할을 하는 사이토카인으로 여겨지지만, TNF-${\alpha}$ -308, -238 유전자 다형성이 Henoch-Sch$\"{o}$nlein 자반증의 발병과 다양한 임상양상의 발현에 미치는 영향에 대해서는 뚜렷한 연관성이 확인되지 못하였기에 향후 지속적인 연구를 통하여 Henoch-Sch$\"{o}$nlein 자반증의 발병기전과 유전적 감수성을 밝히려는 시도가 이루어져야 할 것이다.

  • PDF

육지면품종의 유용형질의 유전에 관한 연구 (Studies on the Inheritance of Agronomic Characteristics in Upland Cotton Varieties (Gossypium hirsutum L.) in Korea)

  • 계봉명
    • 한국작물학회지
    • /
    • 제21권2호
    • /
    • pp.281-313
    • /
    • 1976
  • 면화의 유용형질의 개별적 유전관계를 조기에 검정하고 이들의 상호관련성을 육종사업에 효율적으로 이용할 수 있는 기초자료를 얻고저 1969년부터 1972년까지 작물시험장목포지장실험포장(북위 $34^{\circ}47',$ 동경 $126^{\circ}20',$ 표고 1.5m)에서 육지면품종간의 Partial Diallel Cross $F_1$ 및 Paymaster$\times$Heujueusseo Trice의, 분리집단을 공시하여 Hetesosis, Combining Ability, 품종별우열성, 유전분산의 분할, 표현형 및 유전상관등을 조사한 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. Heterosis는 주당삭수와 소면수량에서 양친평균 보다 각각 27.84%, 37.26%의 증가경향을 보였고 기타 형질에서는 유의성이 없었다. 2. GCA에 있어서는 모든 형질에서 유의성이 있었고, SCA보다 GCA 효과가 컸으며, 품종별 GCA효과푸 Suwon# 1이 조숙으로, Paymaster 및 Arijona는 고소면로, Arijona는 장섬유의 방향으로 했다. 3. 소면수량의 SCA는 Mokpo #4, Mokpo #6, Heujueusseo Trice등을 편친으로 한 조합이 변이가 컷고, 기중 SCA효과가 가장 큰 조합은 Mokpo# 4$\times$Acala 1517W, Mokpo#$\times$D.P.L, Heujoeusseo Trice$\times$Paymaster 조합등으로서 비교적 대립형질이 많은 조합이었다. 4. 조만성의 유전은 조숙이 만숙에 대하여 완전우성조합 또는 조숙과 만숙의 상호간의 우성을 나타내지 못하는 중간성조합이 있었음에 따라 이것은 상가적 유전성분이 큰 Multi gene의 지배를 받는 것으로 추찰되였다. 조숙성의 우성강도가 가장 큰 품종으로서는 Heujueusseo Trice. Mokpo#6, Suwon#1 등이였다. 5. 삭중 및 종자 100립중의 유전은 뚜렸한 경향이 없었다. 6. 장섬유성인 Paymaster와 단섬유성인 Heujueusseo Trice간의 교잡조합의 $F_2,$ $F_3에$ 있어서의 섬유장분리는 장섬유가 단섬유에 대하여 완전 또는 부분우성의 단인자지배에 의하여 분리되였으며 세대가 진전됨에 따라 우성개체발현율이 감소되는 경향이였다. 또한 Diallel Cross $F_1으로$ 동시에 수개품종을 비교할 경우는 각품종의 섬유장의 폭이 다르고 우성의 정도가 다르기 때문에 다소 복잡한 대립인자작용으로 나타났다. 7. 주당삭수는 대체로 초월우성이 강하게 나타났으며 따라서 상가적부분이 적게 표현되여 비대립유전자의 작용도 존재하는 것으로 였다. 8. 소면수량도 초월우성이 강하게 나타내여 비대립유전자의 작용도 존재하는 Multi gene에 의하여 지배되는 것으로 보였으며 대체로 다수성품종이 소수성품종에 비하여 우성이였다. 그러나 Heujeusseo Trice는 소수성품종으로서 초월우성을 나타내여 품종 및 조합에 따라서 상리한 반응을보였다. 9. 개화소요일수의 유전력은 39~34%였으나 협의 11%로 낮은 것은 우리 나라에서는 개체변이가 심하여 유전력이 다소 낮게 표현되는 것으로 사료된다. 또한 삭중의 유전력은 광의 30%, 협의 22%로 낮은 경향이였으나 Diallel Cross $F_1$ 에서는 다소 높게 나타났다. 10. 섬유장 및 소면비율의 유전력은 어느 경우에서도 높았으므로 선발효율이 클것으로 기대된다. 11. 주당삭수의 유전력 Diallel Cross 에서 30%, $F_2에서$ 협의 36%로 낮은 경향을 보였으나 광의 67%로 높았으므로 $F_2,$ $F_3에서는$ 양친의 특성을 어느정도 나타낼것으로 기대된다. 12. 소면수량의 유전력은 Diallel Cross 에서는 초월우성이 강하게 작용했기 때문에 낮은 우전력을 보였으나, $F_2,$ $F_3에서는$ 광의 38%, 협의 50%로서 비교적 높았다. 따라서 수량의 유전력은 $F_1에서는$ 극히 낮았으나, $F_2,$ $F_3세대에서는$ 높아가는 경향이였다. 13. 개화소요일수, 소면비율 및 섬유장의 상호간에는 $F_1,$ $F_2,$ F3에서 모두 표현형상관이 높았으므로 만숙품종 및 개체가 대체로 장섬유 및 고소면의 경향이였고 이들의 유전상관도 높기때문에 유전적관계가 컸었다. 개화소요일수와 소면수량과의 상관관계가 극히 낮았으므로 이들은 서로 독립형질로 사료되지만 주당 삭수와는 $F_3에서$ 부의 상관이 있으므로 조숙개체가 다삭성인 경향을 많이 보였다. 14. 소면비율과 섬유장과의 표현형 및 유전상관은 $F_1,$ $F_2,$ $F_3$ 모두 높았으므로 이 두 형질은 대체로 흡사한 형질이라고 인정할 수 있음에 따라 장섬유품종이 대체로 고소면성이였다. 또한 소면수량과 소면비율과는 Diallel Cross $F_1에서$ 정의 상관, $F_2에서는$ 섬유장과의 정의 상관을 보여 소면비율 및 섬유장도 소면수량에 다소 관여하는 것으로 나타났다. 15. 소면수량은 주당삭수와의 표현형상관이 $F_1,$ $F_2,$ $F_3$ 모두 고도의 전상관을 나타냈고, 유전상관도 높음에 따라 유전적인 관련성이 크다고 인정되였다. 따라서 다수성을 선발하려면 주당삭수가 많은 개체를 후기세대에서 선발하는 것이 선발효율이 크다고 사료된다. 또한 양질계통을 선발하기 위해서는 장섬유 및 고소면개체를 초기세대부터 선발해도 선발효율은 클것으로 기대되지만 이러한 개체는 동시에 만숙성을 내포할 가능성이 있었다.

  • PDF

누에의 실용형질에 대한 유전력, 유전상관 및 경로계수의 분석 (Heritability, Genetic Correlation and Path Coefficient Analysis of Economic Characters in the Silkworm, Bombyx mori)

  • 정원복
    • 한국잠사곤충학회지
    • /
    • 제31권2호
    • /
    • pp.91-101
    • /
    • 1989
  • 가잠육종의 선발에 대한 유전적 Parameter를 추적학 ldnl해 누에 일본종계통 3, 중국종계통 4 모두 7개 품종을 이면교배하여 주요 견성과 사질의 유전력과 유전상관을, 그리고 유전상관의 값을 이용하여 여러 형질이 직접 또는 간접적으로 견사량에 미치는 영향을 구명하기 위한 경로계수를 추정하였다. 원잠종을 재료로 한 각 형질의 유전력은 F1, F2세대에서 5령경과, 단견중, 견층중, 견층비율, fibroin량, 견층연감율, 견사량 등이 모두 76.65% 이상이었다. 형질상호간의 상관관계를 F1, F2 세대에서 자웅별로 보면 표현형상관과 유전상관의 값은 대체로 정의 방향이었고, 유전상관의 값이 표현형상관의 값보다 일반적으로 높았다. 견사량과의 형질상호간의 상관관계에서 단견중, 견층중, 견층비율, fibroin량 등은 F1, F2세대의 자웅이 모두 0.727 이상의 높은 유전상관 값을 보였다. 주요 형질들의 유전력이 대체로 높고 유전상관의 값이 정의 방향이므로 이들 형질은 선발이 용이할 것으로 기대된다. 경로계수는 견사량에 관여하는 직접효과가 F1세대에서 자의 견층중이 0.991, 웅의 단견중이 0.803이고, F2세대에서 웅의 견층비율이 0.938, 웅의 fibroin량이 0.930으로서 정의 방향으로 그 효과가 크게 표현되었다. 경로계수에서 견사량에 관여하는 직·간접효과가 세대간과 자웅간에 차이는 있으나 주로 증량적 형질인 단견중, 견층중 등의 영향이 컸을 것으로 평가된다.

  • PDF

인삼(人蔘) 주요(主要) 양적(量的) 형질(形質)의 유전(遺傳)에 관(關)한 연구(硏究) (Studies on the Heredity of Important Quantitativc Charactrs of the Kirean Gingseng(Panax gonseng))

  • 김영래;조재성
    • 농업과학연구
    • /
    • 제1권1호
    • /
    • pp.5-8
    • /
    • 1974
  • 인삼(人蔘)의 육종(育種)을 위(爲)한 몇가지 기초정보(基礎情報)를 얻기 위(爲)하여 국내(國內) 육성계통(育成系統) 16계통(系統)을 대상(對象)으로 하여 조사(調査) 분석(分析)하였던 바 그 결과(結果)를 요약(要約)하면 다음과 같다. 1. 인삼(人蔘)의 각 주요(主要) 양적(量的) 형질중(形質中) 경장(莖長)이(0.7050) 가장 높은 유전력(遺傳力)을 보였고 반면 엽장(葉長)의 유전력(遺傳力)이 (0.5674) 가장 낮았다. 2. 엽장(葉長)과 경직경간(莖直徑間)의 유전형(遺傳型) 상관(相關)이 (0.9844) 가장 높았고, 엽장(葉長)과 경장간(莖長間)의 유전형(遺傳型) 상관(相關)이 (0.8649) 가장 낮았으나 표현형(表現型) 상관(相關)에 있어서는 경장(莖長)과 경직경간(莖直徑間)이 (0.8788) 가장 높았으며 경장(莖長)과 경직경간(莖直徑間)이 (0.7950) 가장 낮았다. 3. 각 형질간(形質間)의 공유전력은 경장(莖長)과 경직경간(莖直徑間)이 가장 높았으며 엽장(葉長)과 경장간(莖長間)이 가장 낮은 값을 나타내었다. 4. 재식위치(栽植位置)에 따르는 각 형질(形質)의 변이(變異) 정도(程度)는 경장(莖長)이 가장 컸던 반면 경직경(莖直徑)에서 가장 적은 경향(傾向)이 있다.

  • PDF

틸라피아 Oreochromis niloticus의 성비 결정에 미치는 암수어미의 영향 (Influences of Parental Pairs on Progeny Sex Ratios of Nile Tilapia Oreochromis niloticus)

  • 권준영;권혁추
    • 한국양식학회지
    • /
    • 제19권2호
    • /
    • pp.99-108
    • /
    • 2006
  • Sex of the Nile tilapia Oreochromis niloticus is mainly determined by an XX/XY system. However, accumulating evidences suggest the existence of additional sex modifying factors including environmental, autosomal and parental influences. In order to investigate the possibility of parental effects on sex ratios of tilapia progenies, in this study, a series of crosses was carried out using gynogenetic clonal fish, neomales, normal males and females, and YY fish. Crosses between clonal XX male and clonal female have yielded only female progenies and no parental influences were observed. However, in the crosses between clonal males and normal females, female parents were significantly associated with the progeny sex ratios ($X^2$=20.046, 7 d.f., p<0.01). Progeny sex ratios from the crosses between neomales and normal females ($X^2$=60.491, 5 d.f and $X^2$=28.072, 2 d.f.) also showed significant association with female parents (P<0.001). The stability of progeny sex ratios from repeated spawns were confirmed by using 6 different parental pairs. In 16 crosses between normal males and normal females, sex ratios of progenies showed clear maternal influences, and further analysis of the results revealed a negative correlation ($r^2$=0.7718, p<0.05) between the sex ratios of progenies from two different males, indicating a strong paternal influence. No statistically significant relationship between survival rates and sex ratios of progenies was observed in any genotypic groups. Taken together, the influence of parental pairs on progeny sex ratios in this species is evident although the cause of this influence is not clear.

버어리종, 황색종, 양건종, 담배의 유전분석에 관한 연구 I. $F_1$의 잡종강세, 상관 및 조합능력 (STUDIES ON THE GENETIC ANALYSIS AMONG BURLEY, FLUE-CURED AND SUN-CURED TYPE TOBACCO 1. HETEROSIS, CORRELATION AND COMBINING ABILITY OF $F_1$ HYBRID)

  • 한철수
    • 한국연초학회지
    • /
    • 제7권2호
    • /
    • pp.99-109
    • /
    • 1985
  • The present studies were carried out to obtain some basic informations of the breeding of tobacco varieties. Genetically divergent 8 varieties, 3 flue-cured, 2 burley and 3 sun-cured tobaccos, were used in half diallel cross. In order to analyze the heterosis, combining abilities, modes of inheritance and correlations for some agronomic and chemical characters, 8 parents and 28 $F_1$ were tested. The results obtained were summarized as follows: The percentages of heterosis for stem diameter, internode length and total sugar content in $F_1$ hybrid were 3.6%, 3.1% and 10.6%, whereas these for days to flower, total alkaloids and leaves per plant were -6.3%, -6.9% and -5.0%, respectively. Yield had significant positive genotypic correlations with plant height, days to flower and leaf length, but negative with internode length and total sugar content. It also had significant prositive phenotypic correlations with plant height, days to flower, leaves per plant, leaf length, leaf width and leaf shape index (Leaf length/leaf width). General (GCA) and specific combining abilities (SCA) for all characters of $F_1$ hybrid were significant. The effects of GCA were positive on yield, plant height, stem diameter, leaves per plant and days to flower of Burley 21. And those were positive on yield, leaf shape index and plant height, but negative on leaves per plant and total nitrogen of Hicks. The effects of SCA for yield and leaves per plant were greater than those of others on the combinations of Coker 139 and Burley type, respectively.

  • PDF

Genotype $\times$ Environment Interaction for Yield in Sesame (Sesamum indicum L.)

  • Shim, Kang-Bo;Kang, Churl-Whan;Hwang, Chung-Dong;Pae, Suk-Bok;Choi, Kyung-Jin;Byun, Jae-Cheon;Park, Keum-Yong
    • 한국작물학회지
    • /
    • 제53권3호
    • /
    • pp.297-302
    • /
    • 2008
  • Application of genotype by environment ($G\;{\times}\;E$) interaction would be used for identifying optimum test condition of the varietal adaptation in the establishment of breeding purpose. Yield and yield components were used to perform additive main effect and multiplicative interaction (AMMI) analysis. Significant difference for $G\;{\times}\;E$ interaction were observed for all variable examined. For yield, 0.18 of total sum of squares corresponded to $G\;{\times}\;E$ interaction. Correlation analysis was carried out between genotypic scores of the first interaction principal component axis (IPCA 1) for agronomic characters. Significant correlations were observed between IPCA 1 for yield and capsule bearing stem length (CBSL), number of capsule per plant (NOC). The biplot of grain yield means for IPCA1 which accounted for 34% of the variation in total treatment sums of squares showed different reaction according to $G\;{\times}\;E$ interaction, genotypes and environments. Taegu showed relatively lower positive IPCA1 scores, and it also showed smaller coefficient variation of yield mean where it is recommendable as a optimal site for the sesame cultivar adaptation and evaluation trial. In case of variables, Yangbaek and M1 showed relatively lower IPCA1 scores, but the score direction showed opposite each other on the graph. Ansan, Miryang1, Miryang4, and Miryang6 seemed to be similar group in view of yield response against IPCA1 scores. These results will be helpful to select experimental site for sesame in Korea to minimize $G\;{\times}\;E$ interaction for the selection of promising genotype with higher stability.

구기자 품종의 수량형질에 대한 유전통계량의 년차간변동 (Yearly Variation of Genetic Parameters for Yielding Characters of Tea Tree(Lycium chinense Miller) Varieties)

  • 권병선;이유식;이종일;이상래;박희진
    • 한국작물학회지
    • /
    • 제31권2호
    • /
    • pp.179-185
    • /
    • 1986
  • 구기자 육종의 수량형질에 대한 선발효율을 높이기 위한 기초연구로서 유전력, 표현형 상관, 유전상관, 환경상관 및 경노계수에 대해 연차간 유전통계량을 분석한 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 포기자의 수양형질중 생과중, 건과중 및 생근중의 유전분산이 가장 크고 년차간의 변동이 적었으며 기타의 형질도 유전분산이 환경분산보다는 컸고 연차간변동은 적었다. 2. 3개년간 전품종들을 Pool로 한 분석에서 연차와 품종 및 이들의 교호작용은 건과율 및 건근중률을 제외한 모든 수양형질에서 고도의 유의차가 인정되었으며 연차간변동도 적었다. 3. 광의의 유전력에서는 생과중, 건과중, 생근중, 건근중 및 지골피수량양에서 매우 높았고 연차간변동도 적었다. 4. 유전상관에서는 생과중과 건과중, 생근중과 지골피, 생근중과 지골피비율, 건근중과 지골피간에는 고도의 정의 상관으로 유의성도 높고 연차간의 변동도 적 었다. 5. 경노계수의 연차간변동은 대체로 적었으나 3개년간 모두 지골피수량에 직접, 간접으로 효과를 크게 미치는 형질은 생근중이었다.

  • PDF

남부지방에서 국내육성 및 도입옥수수 품종의 Silage 생산성 (Silage Productivity of Korean-Improved and Introduced Corn Genotypes in the Southern Part of Korea)

  • 이석순;김태주;배동호;함태수
    • 한국작물학회지
    • /
    • 제31권2호
    • /
    • pp.156-161
    • /
    • 1986
  • 옥수수 흑조위축병이 심한 남부지방에서 6개 국내육성품종과 6개 미국도입 품종의 흑조위축병 발생상황과 Silage 생산성에 관한 연구결과는 다음과 같다. 1. 흑조위축병에 의하여 간장의 위축이 심한 품종일수록 간장의 변이계수가 컸다. 2. 간장의 도수분포는 흑조위축병 이병율과 분포의 유형에 따라 3품종군으로 나눌 수 있었다. 3. 수확기의 흑조위축병 이병율과 간장 자수주비율, Silage 수량, 자수수량과는 부의 상관이 있었으나 Silage 중 자수비율과 간엽수량과는 상관이 없었다. 4. Silage 수량은 P. XCF38이 가장 높았고 수원 89호와 NC6131 이 가장 낮았으며 타 품종은 육성모지와 관계없이 비슷하였다. 5. 흑조위축병 이병율은 P. XCF38, 수원 89호, 진주옥이 가장 낮았으며 수원 19호, 광옥, 횡성옥, P. 3424는 이병률이 비교적 높았고 NC 6131은 생육초기부터 이병률이 가장 높았다. 6. 진주옥과 수원 89호는 흑조위축병에는 저항성이나 출사후 잎의 조기노화로 수량이 낮았다.

  • PDF