• Journal of the Korean Data and Information Science Society
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• 제27권3호
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• pp.741-747
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• 2016

본 연구에서는 국가단위 개체모형을 이용하여 일반농가 한우의 도체중, 등심단면적, 등지방두께, 국내지방도에 대한 유전력를 추정하고 이를 국가단위 종모우 선발용 후대검정우 집단의 유전력과 비교하여 일반 한우농가 개량방향에 효율적인 기초자료로 활용하고자 한다. 일반농가 한우 107,020두 중 생산정보와 2008년부터 2012년까지의 도체성적 기록이 정확한 일반농가 한우 5,843두를 대상으로 다형질 개체모형을 사용하여 유전력를 추정하였다. 유전력를 추정하기 위해 도체형질에는 출생년도, 사육지역을 고정효과, 사육일령을 공변량으로 포함하였다. 일반농가 한우의 유전력를 추정한 결과 도체형질에 대한 유전력은 도체중 0.19, 등심단면적 0.17, 등지방두께 0.20, 근내지방도 0.23 이며 국가단위 씨수소 선발용 후대검정우 집단의 유전력에 비해 낮았다. 이는 사육지역의 환경, 암소 유전능력과 사육개월의 차이로 인해 낮게 나타났다. 따라서 본 연구에서도 현재 실시되어지고 있는 국가단위 씨수소 선발용 개체모형에 농가 한우집단에 사용할 수 있는 유전요인을 포함시켜 실용화 개체모형 개발이 시급하다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제30권10호
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• pp.1382-1387
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• 2017

Objective: During the last decade, genetic evaluation of dairy cows using longitudinal data (test day milk yield or 305-day milk yield) using random regression method has been officially adopted in several countries. The objectives of this study were to estimate covariance functions for genetic and permanent environmental effects and to obtain genetic parameters of 305-day milk yield over seven parities. Methods: Data including 60,279 total 305-day milk yield of 17,309 Iranian Holstein dairy cows in 7 parities calved between 20 to 140 months between 2004 and 2011. Residual variances were modeled by homogeneous and step functions with 7 and 10 classes. Results: The results showed that a third order polynomial for additive genetic and permanent environmental effects plus a step function with 10 classes for the residual variance was the most adequate and parsimonious model to describe the covariance structure of the data. Heritability estimates obtained by this model varied from 0.17 to 0.28. The performance of this model was better than repeatability model. Moreover, 10 classes of residual variance produce the more accurate result than 7 classes or homogeneous residual effect. Conclusion: A quadratic Legendre polynomial for additive genetic and permanent environmental effects with 10 step function residual classes are sufficient to produce a parsimonious model that explained the change in 305-day milk yield over consecutive parities of Iranian Holstein cows.

• 한국약용작물학회지
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• 제18권2호
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• pp.86-92
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• 2010

The polymorphism and the genetic relationships among 32 genetic resources of genus Nelumbo from Korea, Japan, China, USA, India, Thailand and Gabong were thoroughly investigated and extensively examined using ISSR markers. Out of 103 loci detected overall, 94 were identified to be polymorphic with a rate of 91.2%. The genetic similarity matrix revealed a wide range of variability among the 32 accessions, spanning from 0.227 to 0.833. The study findings indicate that the Nelumbo accessions have a high genetic diversity, and accordingly carry a germplasm qualifying as good genetic resources for cross breeding. According to the clustering analysis, different subspecies, N. nucifera and N. lutea, were divided into independent groups and all of the N. nucifera accessions could be classified into five categories. Compared to RAPD analysis, ISSR method showed a clearer picture of polymorphism among the accessions and exhibited a definite distinction even among the subspecies. In this respect, ISSR analysis is considered to be more effective in differentiating the accessions and subspecies of the genus Nelumbo than RAPD test.

• 대한교통학회지
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• 제32권4호
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• pp.369-379
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• 2014

전통적인 사고예측모형은 통계적 회귀분석에 주로 의존하였으나, 이는 자료 분포 및 함수 형태에 대한 가정에 따른 한계를 가지고 있다. 이에 따라 일부 연구는 신경망 등의 비모수적 기법을 모형 구축에 활용하였으나, 이는 독립변수와 종속변수 간의 직접적인 관계 규명이 어렵다는 한계가 있다. 유전자 프로그래밍 기법은 모형 개발에 특별한 가정이 필요없고, 사고요인 규명이 가능하다는 장점이 있다. 따라서 본 연구에서는 고속도로의 사고예측에 유전자 프로그래밍 기법을 적용함으로써 이러한 한계를 극복하고자 하였다. 이를 위하여 경부고속도로에서 최근 3년간(2010-2012년) 구득된 자료를 활용하였으며, 보다 세밀한 사고 특성 규명을 위해 고속도로 구간을 직선 구간과 곡선 구간으로 구분하였다. 사고 발생에 중요한 영향을 미치는 변수를 선택하기 위하여 랜덤 포레스트 기법을 이용하였으며, 최종 선택된 변수들을 활용하여 사고예측을 위한 유전자 프로그래밍 모형을 구축하였다. 구축된 모형의 예측 성능을 평가하기 위해 음이항 회귀모형과 비교해본 결과, 유전자 프로그래밍 모형의 예측 성능이 더 우수한 것으로 나타났다.

• Journal of Genetic Medicine
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• 제7권2호
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• pp.133-137
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• 2010

목 적: Beckwith-Wiedemann 증후군(BWS)은 11p15 부위의 메칠화 양상의 이상으로 인한 overgrowth malformation symdrome이다. 11p15 부위에는 두 가지 imprinting center, 즉BWSIC1 (IGF2, H19)와 BWSIC2 (LIT1,KvDMR)가 존재한다. 본 연구에서는 methylation-specific (MS) PCR RFLP 방법을 이용한 BWS의 유전적 진단을 보고하고자 한다. 대상 및 방법: 임상 소견을 바탕으로 12명의 BWS 환자가 포함되었다. 환자의 말초혈액으로부터 염색체 핵형을 조사하였다. 분리한 DNA에 bisulfite를 처리한 후, LIT1, H19, IGF2 DMR부위는 각각의 MS primer를 이용하여 증폭하였다. 적절한 제한효소를 이용하여 절단 여부를 PAGE로 확인함으로써 각각의 DMR 부위에 대한 메칠화 이상 여부를 확인하였다. 결 과: 12명의 환자는 모두 정상 핵형을 보였다. MS-PCR RFLP 상 총 7명(53.8%)의 환자가 이상 소견을 보였으며, 모두 BWSIC2 (LIT1)에 비정상적 메칠화를 보였고 모두 부계 유래의 비메칠화된 allele만이 발견되었다. 결 론: 본 연구를통해MS-PCR RFLP 검사로BWS 환자의 약 50-60% 정도에서 유전적 진단이 가능함을 알 수 있었으며, 이는 BWSIC2 부위의 메칠화 이상을 발견하는데 손쉽게 이용될 수 있을 것으로 판단된다. 그러나, BWSIC1 부위의 메칠화 이상은 발견이 어려우며, 이 부위의 이상을 발견하기 위해서는 메칠화를 정량적으로 분석할 수 있는 방법이 필요하다.

• 한국산림과학회지
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• 제103권2호
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• pp.182-188
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• 2014

ISSR 표지를 이용하여 전나무 6개 집단의 유전다양성과 유전구조를 분석하였다. 6개 ISSR primer로 유전다양성을 추정한 결과, 집단별 다형성 유전자좌의 비율은 평균 85.6%, 이형접합도 기대치($H_e$)는 0.288로 나타났다. AMOVA 결과, 전체 유전변이에서 5.6%는 집단간, 94.4%는 집단내 개체간 차이에 기인하는 것으로 나타났다. 베이즈 추론에 근거한 유전분화는 ${\theta}^{II}$와 $G_{ST}$가 각각 0.045, 0.038로, 근연교배 정도는 0.509로 추정되었다. Mental 검증에서 집단간 지리적 거리가 멀수록 유전적으로 상이한 것으로 판명되었다(r = 0.74, P < 0.05). UPGMA 방법과 PCA 결과에 따라서 남원, 청도, 문경 집단을 한 군집으로, 인제, 홍천, 평창 집단을 다른 군집으로 나눌 수 있었다. 베이즈 군집분석에서는 유전변이 분포에 따라서 남원, 문경 집단이 한 군집으로 인제, 홍천, 평창, 청도 집단이 다른 한 군집으로 묶여서 2개의 상위 군집으로 나뉘었다. 빈도주의 분석에 따른 '군집'을 반영한 AMOVA 결과에서 전체 유전변이의 3.9%를 군집의 영향으로 설명할 수 있었으며, 전나무 집단의 지리적 분포는 베이즈 분석보다는 UPGMA 방법에 의한 구분과 일치하는 것으로 나타났다.

• 한국유기농업학회지
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• 제12권2호
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• pp.197-207
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• 2004

Identification of animals has been used with an e ar tag with dummy code and blood typing has been used for paternity and individual identification in live animals. Various genetic markers are different for breeds of pig and hence, it is necessary to identity the discrete genetic marker in korean native pig. A total of 240 pigs were used to find korean native pig population specific markers that expressed in population of korean native pigs. To identify the individual traceability, 20 animals were randomly chosen and tested for a whole process from being live to slaughter stages. The candidate genetic marker used in the study were 18 DNA microsatellites which were identified in pig genome. The number of alleles of those DNA microsatellites ranged form a minimum of 3 to maximum of 6. The heterozygote frequency rang6d from 0.44 to 0.69. Effective number of alleles for each DNA microsatellotes were 2 to 4. By choosing 6 candidate genetic markers among all, the traceability of individual identification was estimated as accurate as 99.99%(p>0.0014), nearly.

• Proceedings of the National Institute of Ecology of the Republic of Korea
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• 제3권4호
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• pp.191-198
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• 2022

Natural habitats of the Korean long-tailed goral (Naemorhedus caudatus) have been fragmented by anthropogenic activities in South Korea in the last decades. Here, the individual identity, genetic variation, and population differentiation of the endangered species were examined via the multiple-tube approach using a non-invasive genotyping method. The average number of alleles was 3.16 alleles/locus for the total population. The Yanggu population (1.66) showed relatively lower average number of alleles than the Inje population (3.67). Of the total 19 alleles, only seven (36.8%) alleles were shared by the two populations. Using five polymorphic out of six loci, four and six different goral individuals from the captive Yanggu (n=24) and the wild Inje (n=28) population were identified, respectively. The allele distribution was not identical between the two populations (Fisher's exact test: P<0.01). A considerably low migration rate was detected between the two populations (no. of migrants after correction for size=0.294). Additionally, the F statistics results indicated significant population differentiation between them, however, quite low (F_ST=0.327, P<0.01). The posterior probabilities indicated that the two populations originated from a single panmictic population (P=0.959) and the assignment test results designated all individuals to both populations with nearly equal likelihood. These could be resulted from moderate population differentiation between the populations. No significant evidence supported recent population bottleneck in the total Korean goral population. This study could provide us with useful population genetic information for conservation and management of the endangered species.

• International Journal of Control, Automation, and Systems
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• 제3권4호
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• pp.564-570
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• 2005

This paper provides a basis for investigating 'The Origin of Artificial Species,' as a robot can be considered as an artificial creature. To design an artificial creature, its general internal architecture is presented and its artificial chromosomes are proposed as its essential components. Rity as an artificial creature is developed in a virtual world of PC to test the world's first robotic 'chromosomes,' which are a set of computerized DNA (Deoxyribonucleic acid) codes for creating robots (artificial creatures) that can have their own personality, and can ultimately reproduce their kind, or even evolve as a distinct species. The effectiveness of the artificial chromosomes is demonstrated by implanting the genetic code into two Ritys living in a virtual world, in order to define their personality.

• 제어로봇시스템학회:학술대회논문집
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• 제어로봇시스템학회 2003년도 ICCAS
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• pp.1521-1524
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• 2003

In this paper, we propose a "Distance Correlation Selection operator (DCS)" as a new selection operator. For Genetic Algorithm (GA), many improvements have been proposed. The MGG (Minimal Generation Gap) model proposed by Satoh et.al. shows good performance. The MGG model has all advantages of conventional models and the ability of avoiding the premature convergence and suppressing the evolutionary stagnation. The proposed method is an extension of selection operator in the original MGG model. Generally, GA has two types of selection operators, one is "selection for reproduction", and the other is "selection for survival"; the former is for crossover and the latter is the individuals which survive to the next generation. The proposed method is an extension of the former. The proposed method utilizes distance information between individuals. From this extension, the proposed method aims to expand a search area and improve ability to search solution. The performance of the proposed method is examined with several standard test functions. The experimental results show good performance better than the original MGG model.