In addition to the recognition site for glutamate, the N-methyl-D-aspartate (NMDA)-preferring glutamate receptor subtype shows a binding site for glycine. In this paper, we present the effects of 3-(4,6-dichloro-2-carboxymethylamino-5,7-dichloroquinoline-2-carboxylic acid (MDL 29951), a potent inhibitor of glycine binding to the NMDA receptor, on glutamate dehydrogenase (GDH) from bovine brains. The incubation of GDH isoproteins from bovine brains with MDL 29951 resulted in a dose-dependent loss of enzyme activity Separately or together, 2-oxoglutarate and NADH did not give an efficient protection against the inhibition, indicating that GDH isoproteins saturated with NADH or 2-oxoglutarate are still open to attack by MDL 29951. MDL 29951 was an uncompetitive inhibitor with respect to both 2-oxoglutarate and NADH for GDH isoproteins. These results suggest that the binding site of MDL 29951 is not directly located at the catalytic site, and the inhibition of GDH isoproteins by MDL 29951 is probably due to a steric hindrance, or a conformational change altered upon the interaction of the enzyme with its inhibitor. The inhibitory effects of MDL 29951 on GDH isoproteins were significantly diminished in the presence of ADP. GDH I reacted more sensitively with ADP than GDH II on the inhibition by MDL 29951. Our results suggest a possibility that the two types of GDHs are differently regulated by MDL 29951, depending on the physiological concentrations of ADP.
International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
/
v.16
no.2
/
pp.67-74
/
2008
A line x tester analysis was carried out in mulberry (Morns spp.) under different salinity levels to determine the changes in the genetic interaction of various morpho-biochemical characters. Five mulberry genotypes, 3 females and 2 males, differing in salt tolerance were selected for the study. Clones of these parents along with clones of the F1 hybrids were planted in earthen pots and subjected to different levels of salinity (0.0%, 0.25%, 0.50%, 0.75% and 1.00% NaCl). Data on morphological and biochemical characters were subjected to line x tester analysis. The result revealed significant variation among the parents studied. The prominence of non-additive gene effect under control condition suggests the need for well chalked out breeding program to exploit the non-fixable variance of components for improvement of plant height, leaf size and leaf yield, chlorophyll and photosynthesis in mulberry. However, under salinity stress a shift from non-additive gene effect to additive gene effect for the above said character further suggests the need for a change in breeding strategy. The general combining ability (GCA) analysis has identified English black as the best combiner among the parents and the specific combining ability analysis (SCA) found crosses of English black X C776 and Rotndiloba x Mandalaya were good for Plant height and leaf size and English black X C776 and Rotundiloba x C776 were good for biochemical proline and chlorophyll. From the performance of parents and their crosses under different salinity levels and also under normal cultural conditions it is concluded that in mulberry different approaches are required to develop varieties for the irrigated and saline conditions.
Kim Chang-Beom;Rho Jong-Bok;Lee Hyun-Kyung;Choi Sang Ho;Lee Dong-Hun;Park Soon-Jung;Lee Kyu-Ho
Microbiology and Biotechnology Letters
/
v.33
no.1
/
pp.1-8
/
2005
Since Anton van Leeuwenhoek first observed a surface-associated multicellular structure of bacterial cells in the 17th century, it has been shown to exhibit an ability to form a biofilm by numerous bacterial species. The biofilm formation is composed of distinct developmental stages, which include an attachment/adhesion of a single cell, a proliferation toward monolayered coverage, a propagation to aggregated microcolony, a maturation to 3-dimensional structure, and subsequently a local degradation. Investigation to identify the essential factors for bacterial biofilm formation has been performed via classical genetic approaches as well as recently developed technologies. The initial stage requires bacterial motility provided by a flagellum, and outermembrane components for surface signal interaction. Type IV-pilus and autoaggregation factors, e.g., type I-fimbriae or Ag43, are necessary to reach the stages of monolayer and micro colony. The mature biofilm is equipped with extracellular polymeric matrix and internal water-filled channels. This complex architecture can be achieved by differential expressions of several hundred genes, among which the most studied are the genes encoding exopolysaccharide biosyntheses and quorum-sensing regulatory components. The status of our knowledge for the biofilms found in humans and natural ecosystems is discussed in this minireview.
The development of digital media made the change of architectural paradigm from tectonic to the surface and pattern. This means the transition to the new kind of materiality and the resurrection of ornament. This study started as an aim to apply biological pattern to architectural design from the new perception of pattern. Architectural patterns in the early era appeared as ladders, steps, chains, trees, vortices. But since 21st century, we can find patterns in nature like atoms and molecular structures, fluid forms of dynamics and new geometrical pattern like fractal and first of all biological patterns like viruses and micro-organisms, Voronoi cells, DNA structure, rhizomes and various hybrids and permutations of these. Pattern became one of the most important elements and themes of contemporary architecture through the change of materiality and resurrection of ornament with the new perception of surface in architecture. One of the patterns that give new creative availability to the architectural design is biological pattern which is self-organized as an optimum form through interaction with environment. Biological patterns emerge mostly as self-replicating patterns through morphogenesis, certain geometrical patterns(in particular triangles, pentagons, hexagons and spirals). The architectural application methods of biological patterns are direct figural pattern of organism, circle pattern, polygon pattern, energy-material control pattern, differentiation pattern, parametric pattern, growth principle pattern, evolutionary ecologic pattern. These patterns can be utilized as practical architectural patterns through the use of computer programs as morphogenetic programs like L-system, MoSS program and genetic algorithm programs like Grasshoper, Generative Components with the help of computing technology like mapping and scripting.
The complement system is a part of the natural immune regulation mechanism against invading pathogens. Complement activation from three different pathways (classical, lectin, and alternative) leads to the formation of C5-convertase, an enzyme for cleavage of C5 into C5a and C5b, followed by C6, C7, C8, and C9 in membrane attack complex. The C9 is the last complement component of the terminal lytic pathway, which plays an important role in lysis of the target cells depending on its self-polymerization to form transmembrane channels. To address the association of C9 with traits related to disease resistance, the complete porcine C9 cDNA was comparatively sequenced to detect single nucleotide polymorphisms (SNPs) in pigs of the breeds Hampshire (HS), Duroc (DU), Berlin miniature pig (BMP), German Landrace (LR), Pietrain (PIE), and Muong Khuong (Vietnamese potbelly pig). Genotyping was performed in 417 $F_2$ animals of a resource population (DUMI: $DU{\times}BMP$) that were vaccinated with Mycoplasma hyopneumoniae, Aujeszky diseases virus and porcine respiratory and reproductive syndrome virus at 6, 14 and 16 weeks of age, respectively. Two SNPs were detected within the third exon. One of them has an amino acid substitution. The European porcine breeds (LR and PIE) show higher allele frequency of these SNPs than Vietnamese porcine breed (MK). Association of the substitution SNP with hemolytic complement activity indicated statistically significant differences between genotypes in the classical pathway but not in the alternative pathway. The interactions between eight time points of measurement of complement activity before and after vaccinations and genotypes were significantly different. The difference in hemolytic complement activity in the both pathways depends on genotype, kind of vaccine, age and the interaction to the other complement components. These results promote the porcine C9 (pC9) as a candidate gene to improve general animal health in the future.
Paenibacillus polymyxa E681 is known to be able to suppress plant diseases by producing antimicrobial compounds and to promote plant growth by producing phytohormones, and secreting diverse degrading enzymes. In spite of these capabilities, little is known regarding the flow of information from the bacterial strain to the barley roots. In an attempt to determine the flow of information from the bacterial strain to barley roots, the strain was grown in the presence and absence of barley, and two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis (2D-PAGE) and MALDI-TOF mass spectrometry were used. 2D-PAGE detected approximately 1,000 spots in the cell and 1,100 spots in the supernatant at a pH 4-10 gradient. Interestingly, about 80 spots from each sample showed quantitative variations. Fifty-three spots from these were analyzed by MALDI-TOF mass spectrometry and 28 proteins were identified. Most of the cytosolic proteins expressed at higher levels were found in P. polymyxa E681 cells grown in the presence of barley rather than in the absence of barley. Proteins detected at a lower level in the surpernatant of P. polymyxa E68l cells grown in the presence of barley were lipoprotein, glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase, heat-shock protein HtpG, spermidine synthase, OrfZ, ribonuclease PH, and coenzyme PQQ synthesis protein, and flagellar hook-associated protein 2 whereas proteins detected at a higher level in the surpernatant of P. polymyxa E681 cells grown in the presence of barley included D-alanyl-D-alanine ligase A, isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, ABC transporter ATP-binding protein Uup, lipase. Many of the proteins belonging to plant-induced stimulons are associated with biosynthetic metabolism and metabolites of proteins and transport. Some of these proteins would be expected to be induced by environmental changes resulting from the accumulation of plant-secreted substances.
Toll-like receptor 7 (TLR7) is critical for the triggering of innate immune response by recognizing the conserved molecular patterns of single-stranded RNA (ssRNA) viruses and mediated antigenic adaptive immunity. To understand how TLR7 distinguish pathogen-derived molecular patterns from the host self, it is essential to be able to identify TLR7 receptor interaction interfaces, such as active sites or R848-agonist binding sites. The functional interfaces of TLR7 can serve as targets for structure-based drug design in studying the TLR7 receptor's structure-function relationship. In contrast to mammalian TLR7, chicken TLR7 (chTLR7) is unknown for its important biological function. Therefore, it has been targeted to mediate contrasting evolutionary patterns of positive selection into non-synonymous SNPs across eleven species using TLR7 conservation patterns (evolutionary conserved and class-specific trace residues), where protein sequence differences to the TLR7 receptors of interest record mutation that have passed positive section across the species. In this study, we characterized the Lys609 residue on chTLR7-ECD homodimer interfaces to reflect the current tendency of evolving positive selection to be transfer into a stabilization direction of the R848-agonist/chTLR7-ECDs complex under the phylogenetically variable position across species and we suggest a potential indicator for contrasting evolutionary patterns of both the species TLR-ECDs.
Rapid and accurate diagnosis of diseases is very important for appropriate treatment of patients. Recent advances in molecular-level interaction and detection technologies are upgrading the clinical diagnostics by providing new ways of diagnosis, with higher speed and accuracy. In particular, DNA microarrays can be efficiently used in clinical diagnostics which span from discovery of diseaserelevant genes to diagnosis using its biomarkers. Diagnostic DNA microarrays have been used for genotyping and determination of disease-relevant genes or agents causing diseases, mutation analysis, screening of single nucleotide polymorphisms (SNPs), detection of chromosome abnormalities, and global determination of posttranslational modification. The performance of DNA-microarray-based diagnosis is continuously improving by the integration of other tools. Thus, DNA microarrays will play a central role in clinical diagnostics and will become a gold standard method for disease diagnosis. In this paper, various applications of DNA microarrays in disease diagnosis are reviewed. Special effort was made to cover the information disclosed in the patents so that recent trends and missing applications can be revealed.
Lee, Young Seok;Kim, Jin Ki;Ryu, Seoung Won;Bae, Se Jong;Kwon, Kang;Noh, Yun Hee;Kim, Sung Young
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
/
v.16
no.7
/
pp.2793-2800
/
2015
In molecular-targeted cancer therapy, acquired resistance to gemcitabine is a major clinical problem that reduces its effectiveness, resulting in recurrence and metastasis of cancers. In spite of great efforts to reveal the overall mechanism of acquired gemcitabine resistance, no definitive genetic factors have been identified that are absolutely responsible for the resistance process. Therefore, we performed a cross-platform meta-analysis of three publically available microarray datasets for cancer cell lines with acquired gemcitabine resistance, using the R-based RankProd algorithm, and were able to identify a total of 158 differentially expressed genes (DEGs; 76 up- and 82 down-regulated) that are potentially involved in acquired resistance to gemcitabine. Indeed, the top 20 up- and down-regulated DEGs are largely associated with a common process of carcinogenesis in many cells. For the top 50 up- and down-regulated DEGs, we conducted integrated analyses of a gene regulatory network, a gene co-expression network, and a protein-protein interaction network. The identified DEGs were functionally enriched via Gene Ontology hierarchy and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pathway analyses. By systemic combinational analysis of the three molecular networks, we could condense the total number of DEGs to final seven genes. Notably, GJA1, LEF1, and CCND2 were contained within the lists of the top 20 up- or down-regulated DEGs. Our study represents a comprehensive overview of the gene expression patterns associated with acquired gemcitabine resistance and theoretical support for further clinical therapeutic studies.
The effects of temperature and day length during seed formation on the morphogenesis of lettuce seed were investigated using two cultivars of MSU 15 and MSU 16. Seed size and weight, and thickness of seed coat o f both cultivars greatly influenced by temperature, but fresh weights and dry matter weights of mother plants were influenced by day length, not by temperature. Interactions between the adaptive polymorphism and climatic conditions were also discussed. Environmental conditions affected the morphology of lettuce seed and this variation of seed morphology resulted from interaction between genetic potentialities and environmental conditions.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.