• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제56권4호
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• pp.379-383
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• 2018

The present study was performed with morphological and molecular analysis (cox1 and nad1 mitochondrial genes) to identify the proglottids of spirometrid tapeworm found in the stool of an African lion, Panthera leo, in the Serengeti plain of Tanzania. A strand of tapeworm strobila, about 75 cm in length, was obtained in the stool of a male African lion in the Serengeti National Park ($34^{\circ}$ 50' E, $02^{\circ}$ 30' S), Tanzania, in February 2012. The morphological features of the adult worm examined exhibited 3 uterine coils with a bow tie appearance and adopted a diagonal direction in the second turn. The posterior uterine coils are larger than terminal uterine ball and the feature of uteri are swirling rather than spirally coiling. The sequence difference between the Spirometra species (Tanzania origin) and S. erinaceieuropaei (GenBank no. KJ599680) was 9.4% while those of S. decipiens (GenBank no. KJ599679) differed by 2.1% in the cox1 and nad1 genes. Phylogenetic tree topologies generated using the 2 analytic methods were identical and presented high level of confidence values for the 3 major branches of the 3 Spirometra species in the cox1 gene. The morphological and molecular findings obtained in this study were nearly coincided with those of S. ranarum. Therefore, we can know for the first time that the African lion, Panthera leo, is to the definitive host of this tapeworm.

• Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
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• 제18권3호
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• pp.187-192
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• 2015

Purpose: Measurement of serum ceruloplasmin level is the first step in screening for Wilson's disease (WD). Despite the rarity of WD in the general population, ceruloplasmin levels are routinely measured through hepatitis screening in both adults and children. Herein, we evaluated the diagnostic value of ceruloplasmin for the diagnosis of WD among children with hepatitis. Methods: We retrospectively reviewed data on serum ceruloplasmin levels measured as a serologic marker for patients with hepatitis at Asan Medical Center (Seoul, Korea) between from January 2004 to November 2013. The diagnosis of WD was confirmed by the identification of pathogenic variants in the ATP7B gene. To determine the diagnostic accuracy of ceruloplasmin, receiver operation characteristic (ROC) curves were constructed and the area under curve (AUC) were calculated. Results: Measurements of serum ceruloplasmin were performed in 2,834 children who had hepatitis. Among these, 181 (6.4%) children were diagnosed with WD. The sensitivity, specificity, and accuracy of a ceruloplasmin level of <20 mg/dL in the discrimination of WD were 93.4%, 84.2%, and 84.8%, respectively. In this study, 418 (14.7%) false-positive cases and 12 (0.4%) false-negative cases were noted. Using a ROC curve, a ceruloplasmin level of ${\leq}16.6mg/dL$ showed the highest AUC value (0.956) with a sensitivity of 91.2%, a specificity of 94.9%, and an accuracy of 94.7%. Conclusion: The measurement of serum ceruloplasmin was frequently used for the screening of WD in children, despite a low positive rate. The diagnostic value of ceruloplasmin may be strengthened by adopting a new lower cut-off level.

• 생명과학회지
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• 제20권10호
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• pp.1549-1555
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• 2010

Streptococcus suis는 사람과 돼지에서 다양한 감염을 유발하는 병원체이다. 2004년부터 2009년까지 경북지방 양돈장에서 병성감정 의뢰한 돼지 가검물을 대상으로 S. suis를 분리하여 생화학적 성상, 약제감수성 시험 및 PCR을 이용한 동정을 실시한 결과는 다음과 같다. 40개 농장에서 분리한 61주의 S. suis에 대하여 생화학적 성상시험 결과 모두 S. suis로 동정되었으며, VP 음성, hippurate, esculin, arginine decarboxylase 양성, lactose 분해능이 있는 것으로 나타났다. Trehalose와 starch 분해능은 비교적 높게 나타났으며 생화학적 성상에 따른 phenotype은 11형으로 나누어졌다. 항생제 감수성 시험 결과 대부분의 균주가 amoxicillin/clavulanic acid, ampicillin, cephalothin, cefoperazone, florfenicol에 높은 감수성을 나타내었지만 amikacin, kanamycin, neomycin, streptomycin, erythromycin, clindamycin, tetracycline에는 높은 내성을 나타내었다. 16S-rRNA 특이유전자 부위를 이용한 PCR 결과 공시균주 모두 304 bp에서 증폭산물이 관찰되었다. 이들 결과는 국내에서 사육되고 있는 돼지에서 S. suis 감염을 예방하는데 도움이 될 것으로 기대된다.

• Molecules and Cells
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• 제24권1호
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• pp.16-26
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• 2007

Wild progenitor species provide potential gene sources for complex traits such as yield and multiple resistances to biotic and abiotic stresses, and thus are expected to contribute to sustainable food supplies. An introgression line 'IR71033-121-15' was derived from a wild species Oryza minuta (2n = 48, BBCC, Acc No. 101141) at IRRI. Introgression analysis using 530 SSR and STS markers revealed that at least 14 chromosomal segments distributed over 12 chromosomes had been introgressed from O. minuta. An $F_{2:3}$ population from the cross between IR71033 and Junambyeo (a Korean japonica cultivar) consisting of 146 lines was used for quantitative trait loci (QTL) analysis of 16 agronomic traits. A total of 36 single-locus QTLs (S-QTLs) and 45 digenic epistasis (E-QTLs) were identified. In spite of it's inferiority of O. minuta for most of the traits studied, its alleles contributed positively to 57% of the QTLs. The other QTLs originated from either parent, IR71033 or Junambyeo. QTLs for phenotypically correlated traits were mostly detected on introgressed segments. Fourteen QTLs corresponded to QTLs reported earlier, indicating that these QTLs are stable across genetic backgrounds. Twenty-two QTLs controlling yield and its components had not been detected in previous QTL studies. Of these, thirteen consisted of potentially novel alleles from O. minuta. QTLs from O. minuta introgression could be new sources of natural variation for the genetic improvement of rice.

• 한국가금학회:학술대회논문집
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• 한국가금학회 2005년도 제22차 정기총회 및 학술발표회
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• pp.64-65
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• 2005

Pumilio 유전자는 생식 세포의 발달과 분화에 중요한 역할을 한다고 알려져 있다. 우리는 이러한 Pumilio family인 Pum1, Pum2 유전자를 닭에서 클로닝하여 그 Pumilio homology domain의 구조와 단백질 염기서열이 초파리, 생쥐, 인간과 유사하다는 것을 밝혔고 이를 통해 이 유전자가 진화적으로 보존되어 있다는 것을 증명하였다. 또한 닭의 Pum1과 Pum2 genome 구조 역시 생쥐와 인간 Pum 유전자들의 구조와 일치하는 것을 보여주었다. Real-time RT-PCR 결과 닭의 배아의 여러 조직들 중 Pum1과 Pum2 유전자 모두 부화한 암컷 생식선에서의 발현 수준이 유의적으로 높았고, 특히 Pum2 유전자의 경우 부화한 병아리의 생식선뿐만이 아니라 12일령의 생식선에서도 발현 수준이 높았다. 결과적으로, 다른 동물에서 알려진 바와 같이 닭에서도 Pumilio 유전자들이 생식선 발달에 관여할 가능성이 크다는 것을 알수 있다.

• 한국식품영양학회지
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• 제22권3호
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• pp.396-401
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• 2009

본 실험은 경기 북부 일부 지역의 계란에서 미생물 오염도를 측정하여 계란의 위생 상태를 파악하고자 하였다. 조사 자료로서는 대형 마트에 유통 중인 계란 중에서 서로 브랜드가 다른 계란을 대상으로 하였다. 계란의 난각에 존재하는 일반 세균수를 측정하였다. 그 결과 $3.4{\times}10^4cfu/m{\ell}$로 상당히 높은 일반 세균수가 검출되었다. 다음으로는 식중독 지수의 중요한 지표가 되는 대장균 및 계란으로 인한 식중독에서 주요 원인 균으로 작용하는 살모넬라균의 오염 여부를 파악한 결과, 한 브랜드의 계란에서 대장균이 검출되었고, 살모넬라균은 검출되지 않았다. 또한 각 브랜드에 계란에서 검출된 세균을 분리 동정 한 결과, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas mendocina, Alcaligenes xylosoxidans, Alcaligenes faecalis, Enterobacter cloacae 등이 분리되었다. 이 세균들 중 일부는 사람에게 병원성을 나타내거나, 면역력이 약한 노약자나 어린이에게 기회감염 또는 병원 내 감염을 일으키기도 하는 것으로 알려졌다. 계란의 난각에서 분리된 대장균의 병원성 여부를 판정하기 위하여, 대장균의 DNA를 분리하여 PCR을 수행한 결과, 병원성 대장균들에서 특이적으로 나타나는 유전자형을 가지고 있지 않는 것으로 밝혀졌다. 위의 결과들을 종합하여 보면, 시중에 유통중인 계란의 난각에서 비록 살모넬라균과 병원성 대장균은 검출되지 않았지만, 사람에게 감염을 일으킬 수 있는 여러 병원성 세균들이 검출됨으로써 계란의 유통 및 판매에 더욱 철저한 위생관리가 필요할 것으로 사료된다.

• 한국식품과학회지
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• 제38권3호
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• pp.419-426
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• 2006

전국 각지에서 채집한 토양에서 분리한 25종의 내열성 균주 중 내열성 단백질 기수분해효소 활성을 갖는 균주 strain JE 375를 선별하였다. 본 균주는 gram 양성 간균의 특징을 나타냈으며 Bergey's Manual of Systematic Bacteriology와 Biochemical Tests for Identification of Medical Bacteria에 준하여 생화학적 특성을 검토한 결과 catalase 양성, 포자형성, motility 양성, glucose 발효, mannitol 발효, xylose 산화, hemolysis ${\beta}$균임을 보아 Bacillus sp.으로 추정 되었다. Strain JE 375의 whole cell fatty acid를 gas chromatography로 분석한 결과 $C_{15:0}$ iso 26.17%, $C_{16:0}$ iso 13.01%, $C_{17:0}$ iso 30.19%로 분석되어 Bacillus 계열로 동정되었다. 16S rDNA sequence분석 결과 strain JE 375는 Bacillus caldoxylolyticus와 sequence가 97.6% 일치하는 유사성을 보였으나 부분적으로 sequence의 차이가 있고 gene bank data base상에서 16S rDNA sequence가 일치하는 균주는 검색되지 않았다. 이 같은 실험 결과에 따라 strain JE 375는 기존에 발표되지 않은 새로운 균주로 판단되어 Bacillus sp. JE 375로 명명하였다. Bacillus sp. JE 375은 tryptone 1%, yeast extract 0.5%, NaCl 1%, maltose 1%의 배지조성분과 배양 온도 $65^{\circ}C$에서 20시간 동안 배양하였을 때 최대의 단백질 분해 효소를 생산하였다. Bacillus sp. JE 375로부터 단백질 분해 효소를 acetone으로 침전시키고 DEAE-sepharose column chromatography를 통하여 효소를 정제하여 SDS-PAGE를 통해 확인한 결과 55 kDa 크기의 band를 확인할 수 있었다. 이 효소의 최적 배양 온도는 $65^{\circ}C$이었으며 배지의 최적 pH는 6.5로 나타났다. pH에 대한 안정성은 중성 부근의 pH에서 효소 활성의 안정성이 높게 나타났다. 본 효소의 반응 조건을 검토한 결과 중성 조건에서 안정하였으며, $60^{\circ}C$의 고온에서 활성을 가졌다. 효소 활성은 1 mM $CaCl_2$ 첨가에 의해 증가하였다.

• 한국자원식물학회:학술대회논문집
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• 한국자원식물학회 2010년도 정기총회 및 춘계학술발표회
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• pp.17-17
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• 2010

Ethylene, known as a stress hormone regulate wide developmental processes including germination, root hair initiation, root and shoot primordial formation and elongation, leaf and flower senescence and abscission, fruit ripening. The acceleration of ethylene biosynthesis in plant associated with environmental and biological stresses. 1-Aminocycloprophane-1-carboxlyate deaminase(ACCD) is an enzyme that cleaves ACC into and ammonia, a precursor of the plant hormone ethylene. Plant growth-promoting rhizobacteria (PGPR) having ACCD can decrease endogenous ACC level of tissue, resulting in reduced production of ethylene in plants. ACC deaminse was a key enzyme for protect stressed plants from injurious effects of ethylene. ACCD gene was encoded from Pseudomonas flourescens, PGPR and was cloned in Escherichia coli. We expressed the recombinant ACCD(rACCD) containing 357 amino acids with molecular weight 39 kDa that revealed by SDS-PAGE and western blot. The rACCD was purified by Ni-NTA purification system. The active form of rACCD having enzyme activity converted ACC to a-ketobutyrate. The optimal pH for ACC deaminase activity was pH 8.5, but no activity below pH 7.0 and a less severe tapering activity at base condition resulting in loss of activity at over pH 11. The optimal temperature of the enzyme was $30^{\circ}$ and a slightly less severe tapering activity at 15 - 30$^{\circ}$, but no activity over $35^{\circ}$. P. flourescens ACC deaminase has a highly conserved residue that plays in allowing substrate accessibility to the active sites. The enzymatic properties of this rACCD will provide an important reference for analysis of newly isolated ACCD and identification of newly isolated PGPR containing ACCD.

• 식물분류학회지
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• 제43권4호
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• pp.252-262
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• 2013

캄보디아 캄폿주 프놈보콜국립공원에 대한 식물상 조사 중 열대성 전기생식물인 B. fungosa var. indica를 발견하였다. 이들의 숙주를 확인하기 위해 숙주의 뿌리와 더불어 주변에 위치한 목본 식물을 채집하였으며, 이들을 DNA barcoding 방법을 사용하여 동정하였다. DNA barcode 마커로는 엽록체 rbcL 및 matK 유전자 구간을 적용하였으며, 15개의 숙주 뿌리와 7개의 주변 목본식물로부터 성공적으로 PCR 증폭 및 염기서열을 확보하였다. 숙주 뿌리로부터 얻어진 숙주의 염기서열은 앵초과, 노박덩굴과, 도금양과, 그리고 물푸레나무과로 식별되었으며, 주변의 목본식물은 물푸레나무과, 도금양과, 무환자나무과, 장미과, 물레나물과, 철쭉과와 녹나무과였다. 속 수준에서 앵초과는 Myrsine, 노박덩굴과는 Euonymus, 도금양과는 Syzygium, 물푸레나무과는 Olea 등으로 각각 식별되었으나, 종 수준에서의 동정은 불가능하였다. 앵초과 Myrsine와 물푸레나무과 Olea는 본 연구를 통해 최초로 B. fungosa var. indica의 숙주로 확인되었다. 추가적인 채집 조사 및 비교 연구, DNA barcoding을 통해 해당 지역의 생물다양성과 Balanophora속 식물의 숙주 식물 및 진화에 대해 좀더 명확하게 확인이 가능할 것으로 판단된다.

• 식물병연구
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• 제12권3호
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• pp.168-177
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• 2006

한국농업미생물자원센터(Korean Agricultural Culture Collection, KACC)에 보존되어 있는 Colletotrichum gloeosporioides 39 균주와 C. acutatum 5 균주를 ribosomal DNA-ITS와 $\beta$-tubulin 부분염기서열과 PDA와 Benomyl-PDA배지에서의 생장 특성에 의하여 재동정 하였다. 그 결과 13 균주가 Talhinhas 등의 C. acutatum A2 그룹으로, 5 균주가 C. acutatum A3 그룹으로, 1 균주가 C. acutatum A4 그룹으로, 18 균주가 Moriwaki 등의 C. gloeosporioides ribosomal DNA group(RG) 4로 2 균주가 C. gioeosporioides RG6로 2 균주가 c. boninense RG5로 2 균주는 C. coccodes RG2 그리고 1 균주는 c. dematium RG12로 재동정되었다. 이들 중에서 한국에서 분리된 31 균주는 12 균주가 C. acutatum A2 그룹으로, 1 균주가 C. acutatum A3 그룹으로, 14 균주가 C. gloeosporioides RG4 로 2 균주가 C. gloeosporioides RG6로 1 균주가 C. boninense RG5로 그리고 1 균주는 C. dematium RG12로 동정되었다. 더불어 C. acutatum/C. gloeosporioides의 분류적인 특징과 국내 주요 기주별 분포 등에 대하여 고찰하였다.