• 대한수의학회지
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• 제44권2호
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• pp.159-162
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• 2004

We investigated the cytogenetic characteristics of male black-striped field mouse (Apodemus agrarium) in Korea. Chromosome slides were obtained from blood cell cultures which were synchronized with thymidine blocking or not. In the chromosome slide which synchronization with thymidine blocking was employed on, the GTG(G bands by trypsin using Giemsa)-bands of high resolution were observed. The male black-striped field mouse has 48 chromosomes composed 46 autosomes and XY sex chromosomes. The centromeric regions of autosomes were positive to GTG-banding. According to this investigation, thymidine blocking in cell culture process was useful to get lengthened chromosomes. It may be necessary to employ RBG-banding technique to investigate complementary band patterns between R- and G-banding in black-striped field mouse.

• 생명과학회지
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• 제12권5호
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• pp.605-609
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• 2002

개의 염색체수는 2n=78이며 염색체의 형태를 보면 submetacentric chromosome metacentric chromosome인 X와 Y를 제외하고 모든 상염색체가 acrocentric chromosome이며 그 크기가 작고 크기의 차이가 나지 않는 염색체들이 많아 G-banding등에 의한 핵형의 표준화가 완전하게 이루어지고 있지 않다. 본 연구fl서는 G-banding high-resolution-banding NOR- banding등의 방법을 이용하여 개의 미소 염색체들에 대한 핵형 및 염색체 동정을 하고자 하였다. C-banding과 high-resolution banding에 의한 그 결과 아직 표준화가 되어 있지 않은 염색체 중 34번, 37번 등의 염색체에서 본 연구 결과가 차이가 있었으나 이는 해석상의 차이로 보이며 NOR-banding에 의한 분석결과 Y염색체와 3쌍의 상염색체에서 존재함을 확인 할 수 있었고 이는 개의 염색체 동정의 지표로 활용할 수 있으리라고 생각된다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제27권10호
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• pp.1778-1782
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• 2017

To identify and discriminate the bacterial species at the subspecific level, rep-PCR is a reliable genomic fingerprinting tool. Fourteen strains of bacteria were isolated from different food sources, identified as Leuconostoc citreum using 16S rRNA gene sequencing, and amplified using rep-primers (REP, ERIC, and $(GTG)_5$). Fingerprinting patterns generated bands in the range of 300-6,000 bp with REP, 150-6,000 bp with ERIC, and 200-1,700 bp with $(GTG)_5$ primers. In UPGMA dendrogram analysis, 14 strains were clustered into three clades (I, II, and III) with all the primers, thus differentiating them at the molecular level. The present study revealed the differentiation of L. citreum strains using rep-PCR.

• Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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• 제22권2호
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• pp.109-122
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• 1995

A technique is described for producing high resolution G- and R-banded chromosomes in human peripheral lymphocyte cultures. Cultured lymphocyte cells were exposed to ethidium bromide ($10{\mu}g/ml$) and colcemid ($0.02{\mu}g/ml$) each for 2.5h and 0.5h prior to harvest for high resolution G-banded chromosomes. High resolution R-band patterns were obtained by BrdU substitution which was revealed by the fluorochrome-photolysis-Giemsa staining technique. These methods are easy to perform and highly reliable. The data on relative length of chromosomes at the four mitotic stages are presented in units of percentage of haploid autosome length. The characteristic patterns of GTG-bands (G-bands after trypsin and Giemsa) and RBG bands (R-bands after BrdU and Giemsa) were analyzed.

• Plant Resources
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• 제5권3호
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• pp.169-175
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• 2002

The soybean cyst nematode (Heterodera glycines Inchinoe; SCN) is a devastating pest of soybean and is responsible for significant losses in yield. The use of resistant cultivars is the effective method to reduce or eliminate SCN damage. The objective of this research is to identify AFLP markers linked to the SCN resistant genes. Bulked genomic DNA was made from resistant and susceptible genotypes to SCN and a total of 19 primer combinations were used. About 31 fragments were detected per primer combination. The banding patterns were readily distinguished in resistant and susceptible bulked genotypes. Polymorphic fragments were detected between resistant and susceptible bulked genotypes in the primer combination of CGT/GGC, CAG/GTG and CTC/GAG. In primer combinations of CGT/GGC and CAG/GTG, bulked resistant genotype produced a polymorphic bands. However, in primer of CTC/GAG, bulked susceptible genotype produced a polymorphic fragments. Three AFLP markers identified as a polymorphic fragments between bulked genomic DNA were mapped in 85 F2 population. Among them, only two markers, CGT/GGC and CTC/GAG, was linked and was mapped. Broad application of AFLP marker would be possible for improving resistant cultivars to SCN.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제45권1호
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• pp.1-12
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• 2003

본 연구에서는 국내 고유 재래 가축들의 유전정보와 유전학적 개량의 기초자료 제공을 목적으로 고분염 분석(high-resolution banding) 방법에 의한 한국재래계의 염색체 분염 표지를 제시하였다. 본 연구에 공시된 한국재래계로서는 축산기술연구소에서 계통화 시킨 황갈색 및 적갈색 계통으로 이들이 생산한 수정란의 초기 배자를 이용하여 염색체 분석을 수행하였으며 닭의 초기배자에 EtBr 및 colchicine을 처리함으로써 보다 양호한 고정도 염색체를 획득하였다. 한국재래계의 GTG-banding 결과 모든 상동염색체간에 뚜렷하고 특징적인 band 양상을 얻을 수 있었으며, Leghorn 및 국제표준핵형(ISSAK)과 비교시 염색체의 형태적 양상에서는 거의 차이가 없는 것으로 분석되었고 대표적 landmark간에도 거의 일치되는 양상을 보였다 그러나 대부분의 한국재래계의 대형염색체에서 더 많은 G-band의 분리 양상을 보이고 특히 1번 및 Z 염색체에서 특징적 분리 양상의 차이를 보였다. 한국재래계의 C-banding 분석에서는 세포별 heterochromatin의 다형성을 보이기는 하나 대부분의 염색체의 동원체와 말단부위에서 C- band가 나타났으며, Z 염색체 장완 말단부와 W 염색체 전체에서는 거의 모든 세포에서 C-band가 출현하였다. 또한 3번 염색체 동원체와 Z 염색체 장완 말단부에서 특징적 다형성을 나타내어 이들 염색체들에서는 상동염색체간 heterochromatin의 이형적 양상(heteromorphic)이 존재함을 밝혔다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제45권6호
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• pp.901-910
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• 2003

본 연구는 한국재래돼지 염색체의 핵형 제시를 위하여 G-banding, C-banding 및 AgNORs를 분석하였다. 시험에 공시된 공시축은 축산기술연구소에서 선발 육종중인 재래돼지 종모돈 50두를 대상으로 각 개체별 혈액채취로서 혈액배양을 이용한 핵형 분석을 수행하였다. 한국재래돼지의 핵형은 38, XX 또는 XY로서 5쌍의 submetacentric chromosomes(Group I), 짧은 단완을 가진 2쌍의 acrocentric chromosomes(Group II), 5쌍의 metacentric chromosomes(Group III) 및 동원체가 말단부에 있는 6쌍의 acrocentric chromosomes(Group IV)로 구성된 36개의 상 염색체와 metacentric인 XX 또는 XY 성 염색체로 구성되어 있다. 재래돼지의 G-banding은 각 상동 염색체별 고유한 특징적 밴드 양상을 나타내고 있으며, 전체 염색체의 형태적 특징이나 대표적 landmarks는 국제표준핵형과 큰 차이가 없는 양상이다. 그러나 재래돼지의 경우 국제표준핵형에 비하여 보다 많은 band가 출현하였고 특히 1번, 3번, 5번, 6번, 7번, 8번, 13번, 14번, 15번, 16번, 17번, 18번 및 X 염색체에서 sub-bands의 분리를 나타내었다. 재래돼지의 C-banding은 비록 각 염색체들 간 heterochromatin의 양적 다형성이 존재하지만 거의 모든 상염색체의 동원체 부위에 C-bands가 나타나고, Y 염색체는 염색체의 전장에 걸친 heterochromatin의 분포를 보였다. AgNOR 염색에 의한 재래돼지의 NORs는 8번 및 10번 염색체의 동원체 부위에 확인되었고, 세포 당 NORs의 수는 2개에서 4개까지 관찰되었으며, 평균 2.13개로 분석되었다. 10번 염색체의 경우 모든 상동염색체에서 NORs가 나타나나 8번 염색체에서는 수적 다형성뿐만 아니라 양적 다형성을 나타내었다. 품종 간 NORs의 비교 분석에서 재래돼지의 NORs 수가 Yorkshire에 비해 유의적으로 높게 나타나 돼지의 NORs 분포 양상은 특히 8번 염색체에 있어 품종 간, 개체 간 및 세포 간에 다형적 변이 양상이 존재하는 것으로 사료된다.