Initial work of microarray data analysis focused on identification of differentially expressed genes, and recently, the focus has moved to discovering significant sets of functionally related genes. We describe some problems of GSEA and PAGE, and propose a modified method to identify significant gene sets. The results based on a simulated experiment and real data analysis using a set of publicly available data show the superiority of the newly proposed method, GSA-AT, in detecting significant pathways with the accurate prediction.
Journal of Korean Society for Atmospheric Environment
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v.15
no.3
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pp.267-280
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1999
To investigate the characteristics of high-ozone occurrences in the Greater Seoul Area(GSA), three high-ozone episodes were selected, for which the ozone warning for concentration above 120 ppb might be issued. The selection was on the basis of morning wind directions and speeds, and daily maximum ozone concentrations measured between 1990 and 1997. The episodes chosen to meet selection criteria were seven days in July 1992, nine days in July 1994, and three days in August 1994, as respectively characterized by southwesterly, easterly, and calm winds in the morning. However, more than 80% of high-ozone days in the GSA were associated with calm winds and the concomitant accumulation of local emission in the morning, rather than being due to transport of ozone or its precursors. This is believed to be the primary reason why ozone concentrations in the GSA varied in a completely different manner even between adjacent monitoring stations. Several premises for initiating research studies for resolving these local variations of ozone concentrations in the GSA are also discussed.
Proceedings of the Korean Institute Of Construction Engineering and Management
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autumn
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pp.394-397
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2003
The Korea construction industry is now in a state where radical innovation is seriously considered. Among a variety of innovation topics, this paper focuses on innovation in public construction clients. The objective of this paper is to analyze GSA's Construction Excellence Program as a case study and to present key characteristics of the program from the perspectives of implications and lessons learned.
Kim, Yun-Young;Cho, Min-Cheol;Park, Je-Woong;Gotoh, Koji;Toyosada, Masahiro
Journal of Ocean Engineering and Technology
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v.17
no.6
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pp.38-46
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2003
Aim of this article is to propose Micro-Genetic Simulated Annealing (${\mu}GSA$) as a hybrid metaheuristics approach to find the global optimum of nonlinear optimisation problems. This approach combines the features of modern metaheuristics such as micro-genetic algorithm (${\mu}GAs$) and simulated annealing (SA) with the general robustness of parallel exploration and asymptotic convergence, respectively. Therefore, ${\mu}GSA$ approach can help in avoiding the premature convergence and can search for better global solution, because of its wide spread applicability, global perspective and inherent parallelism. For the superior performance of the ${\mu}GSA$, the five well-know benchmark test functions that were tested and compared with the two global optimisation approaches: scatter search (SS) and hybrid scatter genetic tabu (HSGT) approach. A practical application to structural sandwich panel is also examined by optimism the weight function. From the simulation results, it has been concluded that the proposed ${\mu}GSA$ approach is an effective optimisation tool for soloing continuous nonlinear global optimisation problems in suitable computational time frame.
Journal of the Computational Structural Engineering Institute of Korea
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v.20
no.3
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pp.239-246
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2007
In this paper a new equivalent static analysis method of dynamic behavior during progressive collapse is presented. The proposed analysis method uses the equivalent nodal load for the element stiffness which represents the dynamic behavior influence caused by the deletion of elements during progressive collapse analysis. The proposed analysis method improves the efficiency of progressive collapse analysis haying the iterative characteristic because the inverse of the structural stiffness matrix is roused in the reanalysis. By comparing the results obtained by this analysis method with those of GSA code analysis and time history analysis, it is shown that the results obtained by this analysis method more closely approach to those of time history analysis than by GSA code analysis.
In this study, the optimum parameters of Tuned Mass Dampers (TMDs) are proposed using Gravity Search Algorithm (GSA) and Particle Swarm Optimization (PSO) to reduce the responses of the structures. A MATLAB program is developed to apply the new approach to the benchmark 10 and 40-story structures. The obtained results are compared to those of other optimization methods used in the literature to verify the developed code. To show the efficiency and accuracy of the proposed methods, nine far-field and near-field worldwide earthquakes are applied to the structures. The results reveal that in the 40-story structure, GSA algorithm can reduce the Relative Displacement (RD) and Absolute Acceleration (AA) up to 43% and 21%, respectively while the PSO decreases them by 50% and 25%, respectively. In contrast, both GSA and PSO algorithms reduce the RD and AA about 29% and 21% for the 10-story structure. Furthermore, using the proposed approach the required TMD parameters reduce by 47% and 63% in the 40 and 10-story buildings in comparison with the referenced ones. Result evaluation and related comparison indicate that these methods are more effective even by using smaller TMD parameters resulting in the reduction of acting force from TMD, having smaller stiffness and damping factors while being more cost effective due to its decreased parameters. In other words, the TMD with optimum parameters can play a positive role in both tall and typical structures.
Journal of Korean Society for Atmospheric Environment
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v.21
no.3
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pp.357-365
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2005
The typical patterns of surface $O_3$ pollution and their dependence on meteorology were studied in the Greater Seoul Area (GSA) during warm season (April-September) from 1998 to 2002. In order to classify the $O_3$ pollution patterns, two-stage (average linkage then k-means) clustering technique was employed based on daily maximum $O_3$ concentrations obtained from 53 monitoring sites during high $O_3$ events (118 days). The clustering technique identified four statistically distinct $O_3$ pollution patterns representing the different horizontal distributions and levels of $O_3$ in GSA. The prevailed pattern (93 days, $49.5\%$) distinctly showed the gradient of $49.5\%$ concentrations going from west to east in GSA. Very high $49.5\%$ concentrations throughout GSA (24 days, $12.8\%$) were also found as a significant pattern of severe $O_3$ pollution. In order to understand the characteristics of $O_3$ pollution patterns, the relationship between $O_3$ pollution patterns and meteorological conditions were analyzed using both synoptic charts and surface/upper air data. Each pattern was closely associated with surface wind interacted with synoptic background flow allowing to transport and accumulate $O_3$ and its precursor. In particular, the timing and inland penetration of sea-breeze were apparently found to play very important role in determining $O_3$ distributions.
Journal of the Computational Structural Engineering Institute of Korea
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v.20
no.4
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pp.435-442
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2007
Since the Ronan Point apartment collapsed in 1968, researches on the progressive collapse have been intermittently conducted, and the collapse of the World Trade Center twin towers made the researches active again. In the United States guidelines such as GSA (2003) and DoD (2005) were provided for design and analysis of building structures against the progressive collapse. In this study the progressive collapse-resisting capacity of steel moment resisting frames designed by KBC-2005 was investigated using linear elastic static analysis and linear dynamic analysis procedures suggested in the guidelines. The results showed that in accordance with the GSA guideline the moment frame designed only for gravity load turned out to be vulnerable to the progressive collapse, whereas the lateral load resisting frame designed for earthquake load satisfied the criteria for progressive collapse. However both systems sailed to satisfy the criteria of the DoD-2005 guideline.
Journal of the Korean Society of Surveying, Geodesy, Photogrammetry and Cartography
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v.36
no.5
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pp.413-422
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2018
Many applications using satellite data from high-resolution multispectral sensors require an image fusion step, known as pansharpening, before processing and analyzing the multispectral images when spatial fidelity is crucial. Image fusion methods are to improve images with higher spatial and spectral resolutions by reducing spectral distortion, which occurs on image fusion processing. The image fusion methods can be classified into MRA (Multi-Resolution Analysis) and CSA (Component Substitution Analysis) approaches. To suggest the efficient image fusion method for Pleiades and KOMPSAT (Korea Multi-Purpose Satellite) 3 satellites, this study will evaluate image fusion methods for multispectral and panchromatic images. HPF (High-Pass Filtering), SFIM (Smoothing Filter-based Intensity Modulation), GS (Gram Schmidt), and GSA (Adoptive GS) were selected for MRA and CSA based image fusion methods and applied on multispectral and panchromatic images. Their performances were evaluated using visual and quality index analysis. HPF and SFIM fusion results presented low performance of spatial details. GS and GSA fusion results had enhanced spatial information closer to panchromatic images, but GS produced more spectral distortions on urban structures. This study presented that GSA was effective to improve spatial resolution of multispectral images from Pleiades 1A and KOMPSAT 3.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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