• 제목/요약/키워드: GPP

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Cloning, Over-expression, and Characterization of YjgA, a Novel ppGpp-binding Protein

  • Gnanasekaran, Gopalsamy;Pan, SangO;Jung, Wontae;Jeong, Kwangjoon;Jeong, Jae-Ho;Rhee, Joon Haeng;Choy, Hyon E.;Jung, Che-Hun
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제34권8호
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    • pp.2419-2424
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    • 2013
  • Guanosine-5'-diphosphate 3'-diphosphate (ppGpp) serves as alarmone in bacterial stringent responses. In this study, an affinity column was constructed by immobilizing ppGpp to NHS-Sepharose for isolating ppGpp-binding proteins. A novel ppGpp-binding protein, YjgA, was isolated and characterized by MALDI-TOF MS (matrix-assisted laser desorption ionization-time-of-flight mass spectrometry) coupled with two-dimensional gel electrophoresis. YjgA and truncated forms of YjgA were cloned and over-expressed in BL21 (DE3). The binding affinity of YjgA to ppGpp was determined by equilibrium dialysis. The interaction of YjgA with ppGpp was very specific, considering that the dissociation constant of YjgA with ppGpp was measured as $5.2{\pm}2.0{\mu}M$, while the affinities to GTP and GDP were about 60 and 30 times weaker than ppGpp. Expression of yjgA gene in Escherichia coli K-12 MG1655 was examined by reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). RT-PCR results revealed that yjgA was expressed from early to late stationary phase. The yjgA deletion mutant exhibited decreased cell number at stationary phase compared to parent strain and the over-expression of YjgA increased the cell number. These results suggested that YjgA might stimulate cell division under stationary phase. In most prokaryotic genome, about half of the protein candidates are hypothetical, that are expected to be expressed but there is no experimental report on their functions. The approach utilized in this study may serve as an effective mean to probe the functions of hypothetical proteins.

3GPP LTE FDD/TDD 듀얼 모드 하향 링크 수신기를 위한 개선된 주파수 동기 알고리즘 (An Enhanced Frequency Synchronization Algorithm for 3GPP LTE FDD/TDD Dual Mode Downlink Receiver)

  • 심명준;장준희;최형진
    • 한국통신학회논문지
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    • 제35권1C호
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    • pp.103-112
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    • 2010
  • 본 논문에서는 3GPP(3rd Generation Partnership Project) LTE(Long Term Evolution) FDD(Frequency Division Duplexing) / TDD(Time Division Duplexing) 듀얼 모드 하향 링크 수신기를 위한 주파수 동기 알고리즘을 제안한다. 일반적으로 3GPP LTE OFDMA(Orthogonal Frequency Division Multiple Access) 시스템에서의 대략적 주파수 동기는 PSS(Primary Synchronization Signal)를 이용한 상관 방식이 적용되며, 미세 주파수 동기는 OFDMA 심볼의 보호 구간(CP: Cyclic Prefix) 상관 방식이 적용된다. 그러나 기존의 대략적 주파수 동기 알고리즘들은 페이딩 환경에서 상관 패턴의 열화와 잡음의 제곱으로 인한 SNR(Signal to Noise Ratio) 손실로 충분한 성능 이득을 얻지 못한다. 또한 주파수 분할을 통하여 양방향 송수신되는 FDD 모드와 달리 TDD 모드에서는 상향링크 구간과 하향링크 구간이 시분할로 전송되기 때문에 TDD 모드에서 기존 미세 주파수 동기 알고리즘은 상향링크와 하향링크의 신호 전력의 차이로 인해 안정적인 동작을 수행할 수 없다. 따라서 본 논문에서는 기존 방식의 문제점을 분석하고, 이를 기반으로 3GPP LTE FDD 모드뿐 아니라, TDD 모드에서도 안정적인 동작이 가능한 주파수 동기 알고리즘을 제안하였다. 다양한 환경에서의 컴퓨터 모의실험을 통해 제안된 주파수 동기 알고리즘은 기존 방식들에 비해 우수한 성능을 보이며, 3GPP LTE FDD/TDD 듀얼 모드 하향 링크 수신기에서 안정적인 동작이 가능함을 입증하였다.

가뭄 기간 총일차생산량과 환경 변수 간 상관관계 분석 (Relationship between gross primary production and environmental variables during drought season in South Korea)

  • 박종민;이달근;박진이;최민하
    • 한국수자원학회논문집
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    • 제54권10호
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    • pp.779-793
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    • 2021
  • 총일차생산량은 물 스트레스와 환경 변수에 의해 크게 영향을 받는다. 총일차생산량과 환경변수의 상관관계는 Moderate Resolution Imaging Spectroradiometer (MODIS) 알고리즘과 process-based model에 적용되어 총일차생산량을 계산하는데 활용된다. 그러나 MODIS 알고리즘에서는 물 스트레스를 수증기압차이(vapor pressure deficit)로만 고려하고 있으며, process-based model에서도 제한된 변수만으로 물 스트레스를 표현하여 총일차생산량을 산출하고 있다. 본 연구에서는 에디 공분산 기법, MODIS 알고리즘, 그리고 Community Land Model 4 (CLM 4) 시뮬레이션 결과에서 얻어진 총일차생산량이 환경 변수와 가지는 상관관계를 평년과 가뭄연도를 대상으로 분석하였다. 물 스트레스를 대표하는 지수는 수증기압차이와 evaporative fraction (EF)가 사용되었다. 본 연구에서는 structural equation modeling (SEM)을 활용하여 환경 변수와 EF가 총일차생산량에 끼치는 영향을 수치화하여 평가하였다. SEM을 통해 상관성을 분석한 결과, 수증기압차이가 과소평가될 경우 MODIS 알고리즘과 CLM 4 시뮬레이션에서 생산된 총일차생산량이 수증기압차이로부터 받는 영향이 제한적임을 확인하였다. 에디 공분산 기법으로 산출한 총일차생산량의 상관성 분석 결과, 경작지에서는 관개작업으로 인해 수증기압차이가 총일차생산량에 끼치는 영향이 감소하였으나 MODIS와 CLM 4에서 산출된 총일차생산량 데이터는 이러한 관개작업의 영향을 설명하는데 제한적이었다. 본 연구결과는 MODIS와 CLM 4에서 산출된 총일차생산량의 특성을 이해하고 한계를 분석하는 연구에 도움을 줄 것으로 예상된다.

LTE-A 제어 채널 영역에 대한 간섭 제어 수신기 (Interference Mitigation Receiver for Control Channel Region in LTE-A)

  • 황진엽;정만영;이상욱
    • 한국통신학회논문지
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    • 제41권8호
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    • pp.903-910
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    • 2016
  • 본 논문은 3GPP Rel-13 표준에서 진행되고 있는 제어 채널 영역에서 간섭 제어 수신기에 대한 동향 및 구현에 대한 연구이다. 3GPP에서는 Rel-12까지 단말의 데이터 수신 성능을 향상시키기 위해 셀 간 간섭을 제어/제거하거나 셀 간 협력을 통한 기술들을 표준화하고 그에 대한 요구 성능을 3GPP 표준에 반영하였다. 기본적으로 이러한 기술들은 단말이 기지국으로부터 전송되는 스케줄링 정보 등이 포함된 제어 채널을 주어진 환경에서 검출한 후에 적용된다. 하지만 셀 경계지역에서 제어 채널의 수신 성능도 셀 간 간섭으로 인해 저하된다. 따라서 인접 셀에 의한 제어 채널의 성능 저하를 개선하기 위해 제어 채널 간섭 제어가 필요하다. 본 논문에서는 현재 3GPP 표준에서 논의되는 제어 채널 간섭 제어 수신기에 대한 구조 및 성능을 분석하고 네트워크 환경에 따른 수신기 동작에 대해 알아본다.

PBNM과 DiffServ 적용한 3GPP 서비스의 QoS 해석 (QoS Analysis of 3GPP Service based on PBMN and DiffServ)

  • 송복섭;김정호
    • 한국콘텐츠학회논문지
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    • 제11권12호
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    • pp.570-577
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    • 2011
  • 본 논문에서는 3GPP 서비스의 QoS에 정책 기반 망 관리 기법이 적용되지 않고 DiffServ 기술에 적용된 경우를 우선 해석하고, 다음으로 정책 기반 망 관리 기법(PBNM)과 DiffServ 기술이 연계된 경우를 적용하여 QoS 성능개선을 검증한다. PBNM과 DiffServ를 적용했을 때, 출력링크 용량에 75%의 최선형 트래픽이 발생해도 음성 트래픽의 양이 1 msec 정도 줄어들었다. 비디오 트래픽 역시 데이터 트래픽과 같은 취급을 받으므로 DiffServ 때에 비해 패킷 손실율이 줄어들어 0 에서 $10^{-4}$ 정도의 결과를 가져옴을 알 수 있었다. 적합한 정책 PBNM과 DiffServ을 적용하면 기존의 정해진 QoS 메커니즘의 영향을 받지 않고 적합한 정책을 사용하는 것만으로도 3GPP 서비스의 QoS 수준에 맞도록 망을 운영, 관리 할 수 있음을 알 수 있었다. 이에 따른 해석적 방법은 버클리 대학의 NS-2를 통하여 기존 시스템에 의무화된 DiffServ 기술과 차세대 망에서 의무화된 PBNM과 DiffServ 기술이 적용된 경우에 대해 성능평가 한다.

3GPP LTE 하향링크 시스템의 초기 셀 탐색기 SSS 검출 시 복잡도 최소화를 위한 CP 길이 선 결정 알고리즘 (Complexity Reduced CP Length Pre-decision Algorithm for SSS Detection at Initial Cell Searcher of 3GPP LTE Downlink System)

  • 김영범;김종훈;장경희
    • 한국통신학회논문지
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    • 제34권9A호
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    • pp.656-663
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    • 2009
  • 3GPP (3rd Generation Partnership Project) LTE (Long Term Evolution) 시스템의 하양링크에서는 초기 동기화 및 셀 탐색 과정을 수행하기 위해 PSS (primary synchronization signal) 와 SSS (secondary synchronization signal) 시퀀스를 사용한다. 단말기는 PSS를 이용하여 슬롯 타이밍과 주파수 동기, 그리고 셀 ID를 획득한 후 SSS를 검출해야 하는데, 3GPP LTE에서 지원되는 2 종류의 CP (Cyclie Prefix) 길이로 인해 2번의 FFT를 수행하여 SSS reference 신호와의 cross-correlation을 이용해 무선 프라밍 타이밍과 셀 그룹 ID를 획득한다. 본 논문에서는 단말기의 셀 탐색기에서 SSS 검출 시 복잡도를 최소화하기 위해 extended CP로 전송한 경우 CP 길이를 선 결정하여 FFT와 cross-correlation의 계산 복잡도를 최대 50%까지 감소시키는 알고리즘을 제안한다. 컴퓨터 모의실험을 통해 매우 작은 성능 열화를 가지면서, 복잡도는 크게 감소하는 결과를 확인할 수 있었다.

SMS 부호화 복호화 모듈 검증 방법에 대한 연구 (A Study on the Verification Scheme of SMS Encoding and Decoding Module)

  • 최광훈
    • 한국컴퓨터정보학회논문지
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    • 제15권6호
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    • pp.1-9
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    • 2010
  • 본 논문에서는 3GPP(3rd Generation Partnership Project)에서 정의한 SMS PDU (Protocol Data Unit) 포맷을 주어진 SMS 부호화 복호화 모듈에서 정확하게 구현했는지 검증하는 방법을 제안한다. 기존 SMS 관련 도구들은 SMS 게이트웨이를 통해 송수신하거나 또는 SMS PDU 해석을 목적으로 개발되어 3GPP에서 정의한 세부 SMS PDU 규격에 따라 정확히 구현했는지 테스트하는 용도로는 적합하지 않다. 본 논문에서 제안한 방법은 함수형 언어 Haskell로 작성된 QuickCheck 라이브러리를 활용해 3GPP에서 정의한 구조에 맞는 SMS PDU 테스트 데이터를 자동 생성하여 SMS 부호화 복호화 모듈을 테스트한다. C언어로 작성된 리눅스 모바일 플랫폼 SMS 모듈에 적용하여 이 모듈의 부호화 복호화 기능을 테스트한 결과 BCD 포맷 시간 정보를 잘못 해석하는 사례 등 중요한 오류들을 발견할 수 있었다. 제안한 방법은 3GPP에서 정의한 규격에 맞추어 SMS PDU를 생성하기 때문에 일반적인 SMS 모듈들에 모두 적용 가능한 장점을 지닌다. 본 논문에서 사용한 방법과 같이 QuickCheck 라이브러리를 통해 다른 네트워크 프로토콜 데이터 규격에 대한 부호화 복호화 검증에도 응용할 수 있을 것이다.

3GPP2 C.S0024-A v.2.0 표준을 적용한 CDMA2000 1x EV-DO 보안 계층 설계 및 구현 (Design and Implementation of the CDMA2000 1x EV-DO Security Layer to which applies 3GPP2 C.S0024-A v.2.0 Standard)

  • 양종원;조진만;이태훈;서창호
    • 정보보호학회논문지
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    • 제18권1호
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    • pp.59-65
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    • 2008
  • CDMA2000 1x EV-DO 에서의 보안 계층은 현재 3GPP2를 통해 표준화 규격(C.S0024-A v2.0)을 완성해 나가고 있는 중이다. 이에 따라 CDMA2000 1x EV-DO 환경의 AT(Access Terminal)와 AN(Access Network) 간 전송되는 데이터에 대한 보안 기능을 적용하기 위하여 표준 문서에 명시된 보안 계층 구현에 필요한 보안 장치가 요구되고 있다. 본 논문은 3GPP2의 C.S0024-A v2.0 표준을 준용한 CDMA2000 1x EV-DO 보안계층 설계 및 구현을 통해 AT와 AN간의 안전하고 빠른 데이터 전송 및 다양한 플랫폼 환경에 적용 가능한 보안계층 시스템을 실제 적용했다.

Effect of Grape Pomace Powder, Mangosteen Peel Powder and Monensin on Nutrient Digestibility, Rumen Fermentation, Nitrogen Balance and Microbial Protein Synthesis in Dairy Steers

  • Foiklang, S.;Wanapat, M.;Norrapoke, T.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제29권10호
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    • pp.1416-1423
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    • 2016
  • This study was designed to investigate the effect of grape pomace powder (GPP), mangosteen peel powder (MPP) and monensin on feed intake, nutrients digestibility, microorganisms, rumen fermentation characteristic, microbial protein synthesis and nitrogen balance in dairy steers. Four, rumen fistulated dairy steers with initial body weight (BW) of $220{\pm}15kg$ were randomly assigned according to a $4{\times}4$ Latin square design to receive four treatments. The treatments were as follows: T1 = control, T2 = supplementation with monensin at 33 mg/kg diet, T3 = supplementation with GPP at 2% of dry matter intake, and T4 = supplementation with MPP at 30 g/kg diet. The steers were offered the concentrate diet at 0.2% BW and 3% urea treated rice straw (UTRS) was fed ad libitum. It was found that GPP supplemented group had higher UTRS intake and nutrient digestibility in terms of neutral detergent fiber and acid detergent fiber than those in control group (p<0.05). Ammonia nitrogen ($NH_3-N$) and blood urea-nitrogen concentration were higher in monensin, GPP and MPP supplemented groups (p<0.05). Total volatile fatty acids and propionate in the GPP group were higher than those in the control group (p<0.05) while acetate concentration, and acetate to propionate ratio were decreased (p<0.01) when steers were supplemented with GPP, monensin, and MPP, respectively. Moreover, protozoal populations in GPP, MPP, and monensin supplementation were significantly lower than those in the control group (p<0.05), while cellulolytic bacterial population was significantly higher in the control group (p<0.05). Nitrogen retention, microbial crude protein and efficiency of microbial nitrogen synthesis were found significantly higher in steers that received GPP (p<0.05). Based on this study it could be concluded that the GPP has potential as an alternative feed supplement in concentrate diets which can result in improved rumen fermentation efficiency, digestibility and microbial protein synthesis in steers fed on treated rice straw.