• 제목/요약/키워드: GC content

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Transformation-associated recombination cloning에 의한 유전자 분리에 사용되는 target hook에 대한 GC content의 영향 (Effect of GC Content on Target Hook Required for Gene Isolation by Transformation-Associated Recombination Cloning)

  • 김중현;신영선;윤영호;장형진;김은아;김광섭;정정남;박인호;임선희
    • 미생물학회지
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    • 제39권3호
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    • pp.128-134
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    • 2003
  • Transformation-associated recombination (TAR) 클로닝법은 목적 유전자를 포함한 게놈 DNA와 그 유전자의 5' 또는 3' 말단 서열을 포함하고 있는 선형의 TAR vector를 동시에 출아효모의 spheroplast내로 co-penetration 시켜 상동부위에서 일어나는 재조합에 의해 환형의 Yeast Artification Chromosome(YAC)으로 분리되는 방법이다. 일반적으로 TAR 클로닝법에 의한 목적의 single-copy 유전자 분리 빈도는 전체 형질전환체의 0.01~1% 정도이다. 이러한 TAR 클로닝법을 개선하기 위하여 Tg.AC transgenic mouse를 모델계로 사용하여 유전자 분리에 대한 target hook 내의 GC content 가 미치는 영향을 조사하였다. 이러한 목적으로 한쪽에는 다양한 GC content(18~45%)를 지닌 transgene 특이적 hook을 포함하고 다른 한쪽은 B1 반복서열을 가지는 radial TAR vector를 사용하여 transgene 분리 빈도를 측정하였다. 그 결과 target hook의 GC content는 23% 이하의 경우, ~40%인 경우에 비해 두 배 정도 클로닝 빈도가 감소하였다. 따라서 TAR vector를 제작할 때, 유전자 분리에 이용되는 target hook의 GC content는 약 40% 일때 가장 적정한 것으로 나타났다. 또한 높은 target hook 내의 GC content(65%)위치분포에 의한 차이는 클로닝 빈도에 큰 영향을 미치지 않는 것으로 나타났다.

대한민국 대표 전통주 탁주의 알코올 도수 분석 (Alcohol content analysis for Takju, a representative traditional liquor in Korea)

  • 오창환
    • 문화기술의 융합
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    • 제8권6호
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    • pp.631-636
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    • 2022
  • 막걸리라고도 불리우는 전통 병행복발효주 탁주의 중요한 규격인 알코올분은 풍미와 연관이 깊은 요인이다. 알코올분 분석은 증류과정과 주정계 측정으로 구성된 부칭법이 주로 사용되고 있다. 본 연구에서는 GC법을 개선하여 신뢰성을 검증한 후 시중 유통 탁주 14종의 알코올분을 부칭법과 개선된 GC법으로 분석하였다. GC법의 정밀성 및정확성은 만족스러운 수준이었으며, 정량한계 및 정성한계는 0.5도 및 0.1도로 확인되었다. 표시도수 ±1을 초과한 비살균 탁주 3종 중 표시도수 6.0도를 초과하는 9.9도 (GC법) 및 10.1도 (부칭법)로 측정된 1종을 제외한 나머지는 -1.1도를 초과하였으나, 분석법의 에러범위에 해당되는 수준이었다. 14종 탁주의 알코올분 평균 정밀도 (%RSD)는 부칭법 36.2%에 비하여 GC법이 12.8%로 우수하였다. 본 연구에서 개선된 GC법은 넓은 범위의 탁주 중 알코올분 규격 관리 및 개선에 효율적 사용이 가능할 것으로 평가되었다.

Effect of Growth Conditions on Saponin Content and Ginsenoside Pattern of Panax ginseng

  • Lee, Mee-Hyoung;Park, Hoon;Lee, Chong-Hwa
    • 고려인삼학회:학술대회논문집
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    • 고려인삼학회 1987년도 Proceedings of Korea-Japan Panax Ginseng Symposium 1987 Seoul Korea
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    • pp.89-107
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    • 1987
  • For the elucidation of significance of saponin as quality criterion of ginseng ginsenoside content(GC) and ginsenoside pattern similarity(GPS) by simple correlation were investigated in relation to red ginseng quality factors, age, plant part, harvest season, mineral nutrition, soil physical characteristics, growth light and temperature, shading material, growth location, physiological disease and crop stand through survey of ginseng plantstions, field experiments, water culture and phytotron experiments. Effect of tissue culture was also reviewed. GC was negatively correlated with good quality of red ·ginseng and positively with bad quality. Age did not show any consistency with GC but GPS was less with the increase of age difference. GPS was less or not significant between taproot that is lowest in GC and epidermis highest, and significant between leaf and taproot. Harvest season marked with the lowest GC and Pattern was also different. Nutrient imbalance, the increase of hazardous soil nutrient and physical condition to growth increased GC, but GPS was little different. The higher the growth lights intensity and temperature the higher the GC but GPS was little changed. Root rust increased GC, but root scab decreased it. Sponge-like and inside cavity phenomena increased GC. Ginsenoside pattern of cultured tissues and rootlet showed great variation. These results strongly indicate that there are optimum saponin content and ginsenoside pattern and that these are accomplished under the optimum growth condition.

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다중 스케일 영상을 이용한 GAN 기반 영상 간 변환 기법 (GAN-based Image-to-image Translation using Multi-scale Images)

  • 정소영;정민교
    • 문화기술의 융합
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    • 제6권4호
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    • pp.767-776
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    • 2020
  • GcGAN은 기하학적 일관성을 유지하며 영상 간 스타일을 변환하는 딥러닝 모델이다. 그러나 GcGAN은 회전이나 반전(flip) 등의 한정적인 기하 변환으로 영상의 형태를 보존하기 때문에 영상의 세밀한 형태 정보를 제대로 유지하지 못하는 단점을 가지고 있다. 그래서 본 연구에서는 이런 단점을 개선한 새로운 영상 간 변환 기법인 MSGcGAN(Multi-Scale GcGAN)을 제안한다. MSGcGAN은 GcGAN을 확장한 모델로서, 다중 스케일의 영상을 동시에 학습하여 스케일 불변 특징을 추출함으로써, 영상의 의미적 왜곡을 줄이고 세밀한 정보를 유지하는 방향으로 영상 간 스타일 변환을 수행한다. 실험 결과에 의하면 MSGcGAN은 GcGAN보다 정량적 정성적 측면에서 모두 우수하였고, 영상의 전체적인 형태 정보를 잘 유지하면서 스타일을 자연스럽게 변환함을 확인할 수 있었다.

열분해-GC에 의한 면/폴리에스터 혼방 직물의 분석 (Analysis of Cotton/Polyester Fabrics using Pyrolysis Gas Chromatograpy)

  • 조미숙;김명덕;박성우;윤기준;남재도;이종훈;이영관
    • 폴리머
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    • 제27권3호
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    • pp.271-274
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    • 2003
  • 열분해 기체 크로마토그래피 (Py-GC)를 이용하여 섬유의 동일성과 함량을 조사하였다. 면사, 폴리에스터, 면과 폴리에스터 혼방사를 Py-GC를 이용하여 그 성분과 함량을 조사하였다. 면과 폴리에스터 성분은 각각의 특성 피이크를 나타내었으며, 특성 피이크의 면적은 각 성분의 함량이 증가함에 따라 비례적으로 증가함을 알 수 있었다. 또한 폴리에스터의 경우에 열분해로부터 생성되는 화합물의 성분을 질량 분광법을 이용하여 테레프탈산, 벤조산, 비닐 벤조산임을 확인할 수 있었으며, 이를 바탕으로 미지의 시료에 포함되어 있는 면과 폴리에스터의 함량을 정량 분석할 수 있었다.

Gender Classification of Low-Resolution Facial Image Based on Pixel Classifier Boosting

  • Ban, Kyu-Dae;Kim, Jaehong;Yoon, Hosub
    • ETRI Journal
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    • 제38권2호
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    • pp.347-355
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    • 2016
  • In face examinations, gender classification (GC) is one of several fundamental tasks. Recent literature on GC primarily utilizes datasets containing high-resolution images of faces captured in uncontrolled real-world settings. In contrast, there have been few efforts that focus on utilizing low-resolution images of faces in GC. We propose a GC method based on a pixel classifier boosting with modified census transform features. Experiments are conducted using large datasets, such as Labeled Faces in the Wild and The Images of Groups, and standard protocols of GC communities. Experimental results show that, despite using low-resolution facial images that have a 15-pixel inter-ocular distance, the proposed method records a higher classification rate compared to current state-of-the-art GC algorithms.

C/V 흑연주철(黑鉛鑄鐵)의 조직(組織)과 기계적성질(機械的性質)에 미치는 Sb첨가효과(添加效果) (The Effects of Sb Additions on the Structures and Mechanical Properties of C/V Graphite Cast Iron)

  • 최양진;강인찬
    • 한국주조공학회지
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    • 제7권1호
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    • pp.53-59
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    • 1987
  • In order to study the infuence of Sb addition on the compacted vermicular graphite cast iron(C/V) and gray cast iron(GC), these specimen which had different Sb content(0-0, 1wt.%) were prepared. these specimen were tested for microstructure and mechanical properties. The result from this study are as follows. For C/V and GC, the microstructure of graphite appeared to be finer with increasing Sb content more than 0.06wt.% Ferrite disappeared from the matrix with addition of Sb more than 0.06wt.% in GC and more than 0.08wt.% in C/V. The size of the eutectic cell in GC was 4.5 to 7 times larger than that in C/V, but the decreasing tendancy of its size was more remarkable in GC than in C/V with increasing Sb content. The abrasion speed corresponding to the maximum amount of abrasion in the nabrasion test was found to be 1.37m/sec. GC sample weared 3.6 to 21 times faster than those of C/V did. the amount of abrasion demeased remarkably with Sb addition, and the abrasion rate was constant with Sb content over 0.04wt.%

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큰졸방제비꽃(Viola kusanoana)의 엽록체 염기서열 분석 (The chloroplast genome sequence of Viola kusanoana )

  • 고아름;유기억
    • 한국자원식물학회:학술대회논문집
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    • 한국자원식물학회 2021년도 춘계학술대회
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    • pp.22-22
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    • 2021
  • 큰졸방제비꽃(Viola kusanoana)의 엽록체 DNA 염기서열을 밝히고자 차세대염기서열분석법(NGS)을 이용하여 분석하였다. 재료는 경상북도 울릉군 나리분지에 자생하는 개체의 잎을 사용하였다. 염기서열 분석결과, 총 길이는 158,644 bp 였고, GC함량은 36.3%로 분석되었다. 구간별로는 LSC (Large single copy)지역이 86,999 bp (GC content: 33.9%)였고 SSC (Small single copy)지역은 17,439 bp (GC content: 29.9%)으로 분석되었으며 IR (Invertied repeats)지역은 27,103 bp (GC content: 42.2%)로 확인되었다. 유전자는 protein coding gene 77개, tRNA gene 30개, rRNA 4개 등 총 111개로 이는 선행 연구된 제비꽃속 8개 분류군과 유전자의 순서와 방향이 모두 일치하였다. 이를 통해 제비꽃속의 엽록체 게놈의 유전자는 상당히 보존되어 있음을 확인하였다.

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Microbiological Characteristics of Gouda Cheese Manufactured with Pasteurized and Raw Milk during Ripening Using Next Generation Sequencing

  • Park, Wonseo;Yoo, Jayeon;Oh, Sangnam;Ham, Jun-sang;Jeong, Seok-geun;Kim, Younghoon
    • 한국축산식품학회지
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    • 제39권4호
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    • pp.585-600
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    • 2019
  • Gouda cheese, one of most popular cheeses in the Korea, has been produced from only pasteurized milk in Korean dairy farms. Recently, it has become legally possible to produce ripened cheese manufactured with raw milk in Korea. In the present study, we investigated the physico-chemical and microbiological characteristics of Gouda cheese manufactured with raw (R-GC) or pasteurized milk (P-GC) during manufacturing and ripening. Particularly, this study characterized the bacterial community structure of two cheese types, which are produced without pasteurization during ripening based on next generation sequencing of 16S rRNA gene amplicons. During ripening, protein and fat content increased slightly, whereas moisture content decreased in both P-GC and R-GC. At the 6 wk of ripening, R-GC became softer and smoother and hence, the values of hardness and gumminess, chewiness in R-GC was lower than that of P-GC. Metagenomic analysis revealed that the bacterial genera used a starter cultures, namely Lactococcus and Leuconostoc were predominant in both P-GC and R-GC. Moreover, in R-GC, the proportion of coliform bacteria such as Escherichia, Leclercia, Raoultella, and Pseudomonas were detected initially but not during ripening. Taken together, our finding indicates the potential of manufacturing with Gouda cheese from raw milk and the benefits of next generation sequencing for microbial community composition during cheese ripening.

Complete genome sequences of Lactococcus lactis JNU 534, a potential food and feed preservative

  • Sangdon, Ryu;Kiyeop, Kim;Dae-Yeon, Cho;Younghoon, Kim;Sejong, Oh
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제64권3호
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    • pp.599-602
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    • 2022
  • A new bacteriocin-producing lactic acid bacteria isolated from kimchi was identified as Lactococcus lactis JNU 534, presenting preservative properties for foods of animal origin. In this study, we present the complete genome sequence of the bacterial strain JNU 534. The final complete genome assembly consists of one circular chromosome (2,443,687 bp [base pair]) with an overall GC (guanine-cytosine) content of 35.2%, one circular plasmid sequence (46,387bp) with a GC content of 34.5%, and one circular contig sequence (7,666 bp) with a GC content of 36.2%.