Journal of Korean Society of Environmental Engineers
/
v.32
no.12
/
pp.1094-1101
/
2010
Microbial fuel cells (MFC) were enriched using sediment Nakdong river, Hoidong river and protected water area in Gijang. The microbial community of sediment and enriched MFC was analyzed by FISH (fluorescent in situ hybridization) and 16S rDNA sequencing. ${\alpha}$-Proteobacteria, Acidobacter and Cyanobactia group were dominant in sediment by FISH. The coulombs of the final 10 peak of the 3 MFC (Nakdong, Hoidong, Gijang) were 0.64 C, 0.50 C, 0.61 C, respectively. When MFCs were enriched by sediment, ${\beta}$-, ${\gamma}$-Proteobacteria, Acidobacter and Firmicutes group increased 45~90%, 50~90%, 40~80% and 45~125%, respectively. In results of 16S rDNA sequencing, Roseomonas sp., Azospillium sp., Frateuria sp., Dyella sp., Enterobacter sp. and Deinocossus were isolated from Nakdong river and Azospillium sp., Delftia sp., Ralstonia sp., Klebsiella sp. and Deinococcus sp. were isolated from protected water area in Gijang and Pseudomonas sp., Klebsiella sp., Deinococcus sp., Leifsonia sp. and Bacillus sp. were isolated from Hoidong river.
Jang, Hyun Sup;Shin, Shoung Kyu;Song, Ji Hyeon;Hwang, Sun Jin
KSCE Journal of Civil and Environmental Engineering Research
/
v.26
no.6B
/
pp.695-701
/
2006
A toluene-degrading bacterial strain was isolated from a mixed culture that was maintained using toluene as a sole carbon and energy source. The isolated bacterium was classified as Pseudomonas sp. TBD4 based on the close relationship to bacteria belonging to this genus. A bottle study to determine biodegradation rates of individual aromatic compounds showed that the biodegradation was faster in the order of toluene, benzene, styrene, and p-xylene. However, when various mixtures were subjected to TDB4, styrene was degraded at the highest rate, indicating that both toluene and p-xylene could stimulate the degradation of other substrates whereas styrene played as an inhibitor. In addition, the mixed culture and TDB4 were inoculated to the bioactive foam reactor (BFR), and the reactor performance and the corresponding change of microbial community were monitored using the fluorescent in situ hybridization (FISH) method. When an inlet concentration of the VOC mixture increased to greater than 250 ppm, the overall removal efficiency dropped significantly. The FISH measurement demonstrated that the ratio of TDB4 to the total bacteria also decreased to less than 20% along with the decline in removal efficiency in the BFR. As a result, the periodic addition of the pre-grown TDB4 might have been beneficial to achieve a stable performance in the BFR operated over an extended period.
For scrutinizing the changes of aggregated bacteria in Lake Paldang, the FISH method was applied by using the rhodamine labeled probes, and total bacteria, chloropyll a concentrations and nutrients concentrations were measured. The aggregates were collected with sediment traps. The T-N, T-P, chlorophyll a concentrations of aggregates were higher 5-15 times, 81-140 and 49-66 times than water samples, respectively. Also, the bacterial numbers of aggregates were 200 times higher than those of water smaples. The ratios of each groups of water sample were 2.1-7.4% for $\alpha$-group, 4.5-8.3% for $\beta$-group, 2.1-7.4% for $\gamma$-group, 2.1-6.1% for Cytophaga-Flavobacterium group and 0.1-2.5% for 'other'group, respectively. While, in aggregates, the ratios of $\alpha$-, $\beta$-, $\gamma$- and Cytophaga-Flavobacterium groups were very small and most abundant group was 'other' bacteria. With these results, the aggregated bacteria in Lake Paldang had a particular group composition of bacteria.
Park, Jong-Woong;Lee, Young-Ok;Go, Jun-Heok;Ra, Won-Sik;Lim, Uk-Min;Park, Ji-Eun
Journal of Korean Society of Environmental Engineers
/
v.27
no.2
/
pp.138-144
/
2005
This study was carried out to investigate the changes of nitrifying bacterial populations including Nitrosomonas sp. and Nitrobacter sp. in $A^2/O$ pilot plant with the configuration of anaerobic-anoxic-oxic reactors. The suspended nitrifying bacterial populations in mixed liquor and those of attached populations on granular carrier surface made by molded waste tire were analyzed by Fluorescent in situ Hybridization(FISH) method. The nitrification rate of a pilot plant showed the value of $1.97{\sim}2.98\;mg\;N/g$ MLVSS hr. The ratios of suspended ammonia oxidizer including Nitrosomonas sp. (NSO) to total bacteria in each reactor were oxic < anoxic < anaerobic. On the contrary, the ratios of suspended nitrite oxidizer including Nitrobacter sp. (NIT) were anaerobic < anoxic < oxic. The thickness, dry density and mass of the attached biomass on granular carriers were $180{\sim}188\;{\mu}m$, $38.5{\sim}43.9\;mg/cm^3$, $29.4{\sim}32.5\;mg/g$, respectively. Also, the ratios of attached nitrifier to total bacteria on granular carriers were similar regardless of ammonia/nitrite-oxidizer (NSO; 3.2%, NIT; 2.8%) and very low compared to those(NSO; $22.8{\sim}28.4%$, NIT; $17{\sim}26%$) of suspended nitrifier.
46,XX male is a rare sex constitution characterized by the development of bilateral testis in persons who lack a Y chromosome. Manifestations of 46,XX males are usually hypogonadism, gynecomastia, azoospermia, and hyalinations of seminiferous tubules. The incidence of XX male reversal is approximately 1 in 20,000 male neonates. The SRYgene is located at the short arm of the Y chromosome(Yp11.31) and codes for testis determining factor in humans. Here, the patient, who presented with a normal male phenotype, was referred for azoospermia. Conventional cytogenetic analysis showed a 46,XX karyotype. Quantitative fluorescent polymerase chain reaction(QF-PCR) and Multiplex PCR studies identified SRY gene. And, Fluorescence In Situ Hybridization(FISH) confirmed the SRY gene on the distal short arm of chromosome X. We identified the SRY gene on the distal short arm of chromosome X by molecular cytogenetic and molecular analyses. Therefore, molecular-cytogenetics and molecular studies were proved to be clinically useful adjunctive tool to conventional prenatal cytogenetic analysis.
Park, Ju-Yeon;Lee, Moon-Hee;Lee, Bom-Yi;Lee, Yeon-Woo;Ryu, Hyun-Mee;Park, So-Yeon
Journal of Genetic Medicine
/
v.4
no.1
/
pp.80-83
/
2007
A 36-year-old pregnant woman was referred for amniocentesis at 19.5 weeks gestation because of advanced maternal age and evidence of increased risk for Edward syndrome in the maternal serum screening test. Cytogenetic analysis of the cultured amniotic fluid cells revealed mosaicism for ring chromosome 11: 46,XX,r(11)[65]/ 45,XX,-11[16]/ 46,XX [34]. Parental karyotypes were normal. A targeted ultrasound showed intrauterine grow th restriction (IUGR). Cordocentesis was performed to characterize the ring chromosome and to rule out tissue specific mosaicism. Karyotype was confirmed as 46,XX,r(11) (p15.5q24.2)[229]/45,XX,-11[15]. And a few new form of ring w ere detected in this culture. The deletion of subtelomeric regions in the ring chromosome were detected by fluorescent in situ hybridization (FISH). The pregnancy was terminated. The fetal autopsy showed a growth-retarded female fetus with rocker bottom feet. We report a case of prenatally detected a de novo ring chromosome 11.
The dynamics of bacterial populations belonging to $\alpha\;\beta\;\gamma-subclass$ proteobacteria, Cytophaga-Flavobacterium (CF) group and sulfate reducing bacteria (SRB) in water column of the middle reaches of Nakdong River depending on sediment harvesting were analyzed by fluorescent in situ hybridization (FISH) at sediment harvesting site (near the Seongju bridge) and non-sediment harvesting site (near the Gumi bridge). In addition, some physico-chemical parameters such as temperature, pH, $chi-\alpha$ and electrical conductivity were measured. Regarding the number of total cell counts, cells stained by DAPI, there were no substantial quantitative differences between both sites, but those fluctuation at sediment Harvesting site was greater. And also the ratios of CFgroup and SRB to total cell counts tend to increase at sediment harvesting site with higher $chl-\alpha$, maybe due to the resuspension of sediment into water column. But the total proportion of all determined bacterial populations to total cell counts were greater at non-sediment harvesting site, compared with those at sediment harvesting site. Since the detectibility of bacteria by FISH depends on their metabolic activity, those lower proportion at the sediment harvesting site implies that sediment harvesting may lead to malfunction of those bacteria respect to nutrient recycling and subsequently negative effects on microbial food web.
Kim, Yoon-Myung;Choi, In-Hee;Kim, Jun Suk;Kim, Ja Hye;Cho, Ja Hyang;Lee, Beom Hee;Kim, Gu-Hwan;Choi, Jin-Ho;Seo, Eul-Ju;Yoo, Han-Wook
Clinical and Experimental Pediatrics
/
v.59
no.sup1
/
pp.25-28
/
2016
Phelan-McDermid syndrome is a rare genetic disorder caused by the terminal or interstitial deletion of the chromosome 22q13.3. Patients with this syndrome usually have global developmental delay, hypotonia, and speech delays. Several putative genes such as the SHANK3, RAB, RABL2B, and IB2 are responsible for the neurological features. This study describes the clinical features and outcomes of Korean patients with Phelan-McDermid syndrome. Two patients showing global developmental delay, hypotonia, and speech delay were diagnosed with Phelan-McDermid syndrome via chromosome analysis, fluorescent in situ hybridization, and multiplex ligation-dependent probe amplification analysis. Brain magnetic resonance imaging of Patients 1 and 2 showed delayed myelination and severe communicating hydrocephalus, respectively. Electroencephalography in patient 2 showed high amplitude spike discharges from the left frontotemporoparietal area, but neither patient developed seizures. Kidney ultrasonography of both the patients revealed multicystic kidney disease and pelviectasis, respectively. Patient 2 experienced recurrent respiratory infections, and chest computed tomography findings demonstrated laryngotracheomalacia and bronchial narrowing. He subsequently died because of heart failure after a ventriculoperitoneal shunt operation at 5 months of age. Patient 1, who is currently 20 months old, has been undergoing rehabilitation therapy. However, global developmental delay was noted, as determines using the Korean Infant and Child Development test, the Denver developmental test, and the Bayley developmental test. This report describes the clinical features, outcomes, and molecular genetic characteristics of two Korean patients with Phelan-McDermid syndrome.
Park, Hong-Ki;Jung, Eun-Young;Jung, Mi-Eun;Jung, Jong-Moon;Ji, Ki-Won;Yu, Pyung-Jong
Journal of Life Science
/
v.17
no.9
s.89
/
pp.1284-1289
/
2007
The Biological Activated Carbon (BAC) process in the water treatments represents a kind of biofiltration process which capabilities of bacteria to remove organic matters are maximized. It enables to eliminate organic matters and effectively reduce microbial regrowth potentials. As attached bacteria employ natural organic matter as a substrate, they are significantly dependent on indigenous microorganisms. In this study, characteristics of bacterial community by culturable and unculturable Methods have been conducted in a pilot plant using SAC in water treatment process at the downstream of the Nakdong River. Based on the results, HPC and bacterial- production for coal-based activated carbon material were $1.20{\sim}56.2{\times}l0^7$ cfu/g and $1.2{\sim}3.7\;mgC/m^{3}h$, respectively, in the SAC process. The highest level of attached bacteria biomass and organic carbon removal efficiency was found in the coal-based activated carbon. The genera Pseudomonas, Flavobacterium, Alcaligenes, Acilzetobacter, and Spingomonas were identified for each activated carbon material. Pseudomonas vesicularis was the dominant species in the coconut- and coal-based materials, where as Pseudomonas cepacia was the dominant species in the wood-based material. The Scanning Electron Microscope (SEM) observation of the activated carbon surface also found the widespread distribution of rod form and coccus. The community of attached bacteria was investigated by performing Fluorescent in situ hybridization (FISH) analysis. a group was dominant in coal, wood and coccunt-based materials, ${\alpha},\;{\beta}\;and\;{\gamma}$ group ranged from 27.0 ${\sim}$ 43.0%, 7.1 ${\sim}$ 22.0%, 11.3 ${\sim}$ 28.6%, respectively. These results suggest that a group bacterial community appears to be regulated removal efficiency of organic material in water treatment process.
Lee, Ji Eun;Moon, Kwang Bin;Hwang, Jong Hee;Kwon, Eun Kyung;Kim, Sun Hee;Kim, Jong Won;Jin, Dong Kyu
Clinical and Experimental Pediatrics
/
v.45
no.9
/
pp.1126-1133
/
2002
Purpose : Prader-Willi syndrome(PWS) is a complex disorder affecting multisystems with characteristic clinical features. Its genetic basis is an expression defect in the paternally derived chromosome 15q11-q13. We analyzed the clinical features and genetic basis of PWS patients for early detection and treatment. Methods : We retrospectively studied 24 patients with PWS in Department of Pediatrics, Samsung Medical Center, from September 1997 to September 2001. We performed cytogenetic and molecular genetic techniques using high resolution GTG banding techniques, fluorescent in situ hybridization and methylation-specific PCR for CpG island of SNRPN gene region. Results : The average birth weight of PWS patients was $2.67{\pm}0.47kg$ and median age at diagnosis was 1.3 years. The average height and weight of PWS patients under one year at diagnostic time were located in a 3-10 percentile relatively, and a rapid weight gain was seen between two and six years. Feeding problems in infancy and neonatal hypotonia were the two most consistently positive major criteria in over 95% of the patients. In 18 of the 24 cases(75%), deletion of chromosome 15q11-q13 was demonstrated and one case among 18 had an unbalanced 14;15 translocation. In four cases without any cytogenetic abnormality, it may be considered as maternal uniparental disomy and the rest showed another findings. Conclusion : We suggest diagnostic testing for PWS in all infants/neonates with unexplained feeding problems and hypotonia. It is necessary for clinically suspicious patients to undergo an early genetic test. As the genetic basis of PWS was heterogenous and complex, further study is required.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.