• 한국어병학회지
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• 제10권2호
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• pp.87-95
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• 1997

새우의 갑각에 흰점을 유발하는 특징을 가진 WSBV는 Baculovirus의 일종으로 여러 종류의 새우에 높은 치사율을 보이는 병원체로서 새우양식에 막대한 피해를 주고 있다. 본 연구에서는 국내에서 양식중인 대하에 질병을 유발한 WSBV의 특성을 알아내고자 치사한 새우로부터 바이러스의 게놈을 클로닝하여 재조합클론(E3)을 분자생물학적으로 분석하였다. E3의 염기서열을 분석한 결과, 이 클론은 AcNPV를 포함한 지금까지 알려진 어떠한 바이러스와도 뚜렷한 상동성(60%)을 보이지 않아 WSBV가 기존의 바이러스와 구분되는 새로운 바이러스임을 알 수 있다. E3의 염기서열에 기초하여 한쌍의 PCR 프라이머를 작성하였다. 병든 새우로부터 분리한 DNA를 30회 증폭한 결과, 예상크기의 산물을 얻을 수 있어 이 방법은 바이러스의 감염여부를 알아낼 수 있는 진단법으로도 활용가능하다.

• 미생물학회지
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• 제35권3호
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• pp.226-230
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• 1999

무지개송어 등의 연어과 어류에서 발생하는 전염성 조혈기괴사증 바이러스의 국내분리주인 IHNV-PRT 의 특성을 규명하기 위하여 IHNV-PRT 의 당단백질인 G를 암호화하고 있는 유전자의 일부를 PCR로 증폭한 후 cDNA를 클로닝하여 이들의 염기서열을 분석하였다. 이 PCR product 는 442 bp의 크기이었다. IHNV-PRT 의 G의 염기서열을 IHNV 의 다른 strain 과 비교 분석한 결과 IHNV-RB-76, IHNV-RB, IHNV-LR-73, IHNV-K, IHNV-WRAC, IHNV-SRCV, IHNV-CoI-85들의 G와 각각 95,94,94,94,93,93%의 상동성을 보였다. 그러나 넙치로부터 분리된 fish rhabdovirus 인 hirame rhabdovirus 의 G와는 81%의 사동성을 보였다. 이 결과로부터 IHNV 의 G 유전자는 비록 HRV 의 G 유전자와 유사성은 높지 않지만, IHNV 의 strain 에 관계없이 유사하다는 것을 알 수 있다.

• 한국양식학회지
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• 제10권2호
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• pp.171-178
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• 1997

Infectious pancreatic necrosis virus (IPNV)는 치어에 감염되어 치명적인 질병을 유발하는, 양식산업에 있어 중요한 어류 병원체이다. 본 연구에서는 IPNV를 신속, 정확하게 진단하는 방법을 개발하고자 IPNV의 항원성 단백질인 VP2 유전자 부분에서 선택한 primers를 이용하여 역전사-중합효소연쇄반응법(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction, RT-PCR)을 실시하였다. RT-PCR 증폭법으로 순수분리도니 IPNV dsRNA 40 ng 정도의 적은 양도 확인 할 수 있었으며, IHNV와 같은 다른 어류 병원체의 게놈을 RT-PCR templates로 사용하였을 경우는 어떠한 PCR 산물도 검출되지 않는 특이성을 보였다. 특히 유전자의 분리없이 조직 그 자체를 대상으로 RT-PCR을 행하는 in situ RT-PCR 방법으로 IPNV가 감염된 넙치 (Paralichthy olivaceus) 치어의 조직에서 IPNV 감염을 신속하게 확인할 수 있었다. 따라서 RT-PCR 및 in situ RT-PCR 방법은 IPNV를 신속, 정확하게 진단하는데 활용될 수 있을 것으로 생각된다.

• 미생물학회지
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• 제36권2호
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• pp.103-108
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• 2000

한국에서 분리된 전염성 조혈괴저바이러스(infectious hematopoietic necrosis virus, IHNV)인 IHNV-PRT의 non-viron(NV)단백질을 암호화하고 있는 cDNA를 클로닝하여 이들의 염기서열을 분석하였다. NV는 336bpzmrl의 open reading frame을 포함하였으며 이로부터 111개의 아미노산 서열을 외국에서 분리된 IHNV들과 비교 분석한 결과 90-95%의 상동성을 보였다. 이러한 사실은 INHV의 NV단백질 유전자들은 IHNV의 strain에 관계없이 매우 보존되어 있음을 나타내준다. Northern blotting을 사용하여 NV의 발현을 측정한 결과 감염 후 20 시간분터 발현이 증가함을 확인 힐수 있었다. NV가 바이러스의 증식에 필요한지의 여부를 확인하기 위하여 바이러스 유전자의 antisense DNA를 사용하여 바이러스 증식 억제에 관한 실험을 수행하였다. Glycoprotein (G)의 antisense DNA를 처리한 경우 바이러스의 증식이 거의 억제된 반면 NV에 대한 antisense DNA를 처리한 경우 바이러스 증식에 거의 변화가 없었다. 이로부터 배양중인 세포가 있어서 NV는 증식에 필수적이지 않은 것으로 판단된다.

• 한국어병학회지
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• 제26권3호
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• pp.163-171
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• 2013

PCR (polymerase chain reaction) 법은 신속하고 정확하여 바이러스성 질병진단을 위해 널리 사용되지만 조직병리학적인 정보를 제공하지 못한다. 반면에 in-situ hybridization (ISH) 법을 사용하면 바이러스를 빠르게 검출할 수 있을 뿐 아니라 조직에서의 분포도 알 수 있다. 본 연구에서는 RSIV, VHSV, 그리고 VNN 바이러스들의 조직내 분포 및 조직 병리학적인 특성을 확인하기 위하여 이 바이러스들에 감염된 에 감염된 양식 넙치의 어류의 다양한 조직들을 대상으로 ISH 법을 적용하였다. 그 결과 이들 세 종류의 바이러스가 각각 다른 조직 및 세포들에 감염함을 확인 할 수 있었다. 본 연구 결과는 ISH법이 어류 병원성 바이러스의 신속 검출 뿐 아니라 조직 병리학적인 특성 확인에도 유용함을 제시한다.

• Genomics & Informatics
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• 제20권1호
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• pp.11.1-11.20
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• 2022

Vibrio harveyi belongs to the Vibrio genus that causes vibriosis in marine and aquatic fish species through double-stranded DNA virus replication. In humans, around 12 Vibrio species can cause gastroenteritis (gastrointestinal illness). A large amount of virus particles can be found in the cytoplasm of infected cells, which may cause death. Despite these devastating complications, there is still no cure or vaccine for the virus. As a result, we used an immunoinformatics approach to develop a multi-epitope vaccine against most pathogenic hemolysin gene of V. harveyi. The immunodominant T- and B-cell epitopes were identified using the hemolysin protein. We developed a vaccine employing three possible epitopes: cytotoxic T-lymphocytes, helper T-lymphocytes, and linear B-lymphocyte epitopes, after thorough testing. The vaccine was developed to be antigenic, immunogenic, and non-allergenic, as well as having a better solubility. Molecular dynamics simulation revealed significant structural stiffness and binding stability. In addition, the immunological simulation generated by computer revealed that the vaccination might elicit immune reactions in the actual life after injection. Finally, using Escherichia coli K12 as a model, codon optimization yielded ideal GC content and a higher codon adaptation index value, which was then included in the cloning vector pET2+ (a). Altogether, our experiment implies that the proposed peptide vaccine might be a good option for vibriosis prophylaxis.

• 한국어병학회지
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• 제37권1호
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• pp.1-8
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• 2024

The advantages of replicon vectors of RNA viruses include a high ability to stimulate innate immunity and exponential amplification of target mRNA leading to high expression of foreign antigens. The present study aimed to construct a DNA-layered nervous necrosis virus (NNV) replicon vector system in which the capsid protein gene was replaced with a foreign antigen gene and to compare the efficiency of foreign antigen expression between the conventional DNA vaccine vector and the present replicon vector. We presented the first report of a nodavirus DNA replicon-based foreign antigen expression system. Instead of a two-vector system, we devised a one-vector system containing both an NNV RNA-dependent RNA polymerase cassette and a foreign antigen-expressing cassette. This single-vector approach circumvents the issue of low foreign protein expression associated with the low co-transfection efficiency of a two-vector system. Cells transfected with a vector harboring hammerhead ribozyme-fused RNA1 and RNA2 (with the capsid gene ORF replaced with VHSV glycoprotein ORF) exhibited significantly higher transcription of the VHSV glycoprotein gene compared to cells transfected with either a vector without hammerhead ribozyme or a conventional DNA vaccine vector expressing the VHSV glycoprotein. Furthermore, the transcription level of the VHSV glycoprotein in cells transfected with a vector harboring hammerhead ribozyme-fused RNA1 and RNA2 showed a significant increase over time. These results suggest that NNV genome-based DNA replicon vectors have the potential to induce stronger and longer expression of target antigens compared to conventional DNA vaccine vectors.

• 한국어병학회지
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• 제23권1호
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• pp.1-8
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• 2010

무지개 송어 발안란의 이동 이력과 IHNV G gene 염기서열의 계통학적 분석에 의해 IHNV의 국내 이동에 대해서 처음으로 조사되었다. IHNV RtWanju09 분리주는 IHNV RtPy91과 RtJe00의 JRt Shizuoka lineage에 속하는 것으로 나타났으며, 강원도에서 분리된 IHNV RtPy91과 RtWanju09 사이의 G gene의 유전적 차이는 1.77%였고, 약 20년간 우리나라의 JRt Shizuoka lineage에 속하는 한국 분리주들은 최대 3.03%의 유전적 차이를 나타내 계속적으로 바이러스가 진화하는 것을 알 수 있었다. 또한 전라북도 지역에서 분리된 IHNV RtWanju09 분리주는 IHNV가 오염된 강원도 지역산 발안란이 전라북도에 전파되었을 것으로 사료된다.

• 미생물학회지
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• 제27권3호
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• pp.225-230
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• 1989

1983년 우리나라에서 처음으로 전염성췌장괴저 바이러스가 분리되기 시작한 이래 여러가지 종류의 내수며 양식 물고고기로부터 이 바이러스가 검출되어 왔다. 세계적으로 안정되고 있는 세가지 표준혈청형 즉 VR-299, Sp 그리고 Ab형 에 대한 중화항체 실험으로, 우리나라에서 발견되는 전염성췌장괴저 바이러스는 주로 VR-299형임이 확인되어 왔으나 대청댐에서 양식된 송어로부터 발견된 한 주의 바이러스는 독특한 혈청형을 보이고 있어 그 특성을 조사하였다. 이 바이러스로부터 단백질과 핵산을 분리하여 세가지 표준 혈청형 바이러스의 그것과 비교하여 본 결과, 크기에 있어 분명한 차이가 보였고 중화항체를 이용한 감염저지 실험으로 Sp 형과 비교적 가까운 연관관계를 가지는 거승로 밝혀졌으나, 세가지 표준 혈청과는 뚜렷이 구분되는 새로운 혈청형으로 판정되었다.

• The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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• 제8권4호
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• pp.213-218
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• 2004

Primary fish-odor syndrome (FOS) is a genetic disorder caused by defective flavin-containing mono-oxygenase 3 gene (FMO3) with deficient N-oxidation of trimethylamine (TMA), causing trimethylaminuria (TMAU). By contrast, secondary FOS can be acquired by decreased FMO activities in patients with chronic liver diseases, but the underlying mechanisms are unknown. In the present study, we examined plasma NOx concentrations and viral DNA contents as well as in vivo FMO activities and their correlations in chronic viral hepatitis (CVH) patients. Plasma concentration of NOx was significantly increased by 2.1 fold $(56.2{\pm}26.5\;vs.\;26.6{\pm}5.4\;{\mu}M,\;p<0.01)$, and it was positively correlated with plasma hepatitis B virus (HBV) DNA contents $(r^2=0.2838,\;p=0.0107)$. Furthermore, the elevated plasma NOx values were inversely and significantly correlated with in vivo FMO activities detected by ranitidine-challenged test $(8.3%\;vs.\;20.0%,\;r^2=0.2109,\;p=\0.0315)$. TMA N-oxidation activities determined in CVH patients without challenge test were also significantly low (73.6% vs. 95.7%, p< 0.05). In conclusion, these results suggested that secondary FOS could be acquired by the endogenously elevated NO in patients with CVH.