Partial genomic sequence of baulovirus associated with white spot syndrome (WSBV) isolated from penaeid shrimp P. chinensis

대하새우로부터 분리한 WSBV의 게놈서열 분석

Baculovirus associated with white spot syndrome (WSBV) is the causative agent of a disease with high mortalities and causes severe damage to shrimp cultures. In this study, we analyzed a recombinant clone (E3) obtained from a viral genomic library to characterize the causative agent in diseased shrimp Penaeus chinensis with white spot syndrome. According to the analysis of nucleotide sequence of E3, this clone did not showed considerable sequence homology with those of other known viruses, including baculovirus Autographa californica nuclear polyhedrosis virus (AcNPV), indicating that WSBV is a novel virus causing a serious disease in P. chinensis. Based on the sequence of E3 clone, a pair of PCR primers was designed. After 30 cycles of amplification, a specific product of the expected size was detected only if the total nucleic acids extracted from the diseased shrimp was used as a template DNA, suggesting that this method can be used to diagnose the virus infection in diseased shrimp.

새우의 갑각에 흰점을 유발하는 특징을 가진 WSBV는 Baculovirus의 일종으로 여러 종류의 새우에 높은 치사율을 보이는 병원체로서 새우양식에 막대한 피해를 주고 있다. 본 연구에서는 국내에서 양식중인 대하에 질병을 유발한 WSBV의 특성을 알아내고자 치사한 새우로부터 바이러스의 게놈을 클로닝하여 재조합클론(E3)을 분자생물학적으로 분석하였다. E3의 염기서열을 분석한 결과, 이 클론은 AcNPV를 포함한 지금까지 알려진 어떠한 바이러스와도 뚜렷한 상동성(60%)을 보이지 않아 WSBV가 기존의 바이러스와 구분되는 새로운 바이러스임을 알 수 있다. E3의 염기서열에 기초하여 한쌍의 PCR 프라이머를 작성하였다. 병든 새우로부터 분리한 DNA를 30회 증폭한 결과, 예상크기의 산물을 얻을 수 있어 이 방법은 바이러스의 감염여부를 알아낼 수 있는 진단법으로도 활용가능하다.