Mosmann, Jessica P.;Monetti, Marina S.;Frutos, Maria C.;Kiguen, Ana X.;Venezuela, Raul F.;Cuffini, Cecilia G.
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
/
v.16
no.3
/
pp.1151-1157
/
2015
Human papillomavirus (HPV) is responsible for one of the most frequent sexually transmitted infections. The first phylogenetic analysis was based on a LCR region fragment. Nowadays, 4 variants are known: African (Af-1, Af-2), Asian-American (AA) and European (E). However the existence of sub-lineages of the European variant havs been proposed, specific mutations in the E6 and LCR sequences being possibly related to persistent viral infections. The aim of this study was a phylogenetic study of HPV16 sequences of endocervical samples from C${\acute{o}}$rdoba, in order to detect the circulating lineages and analyze the presence of mutations that could be correlated with malignant disease. The phylogenetic analysis determined that 86% of the samples belonged to the E variant, 7% to AF-1 and the remaining 7% to AF-2. The most frequent mutation in LCR sequences was G7521A, in 80% of the analyzed samples; it affects the binding site of a transcription factor that could contribute to carcinogenesis. In the E6 sequences, the most common mutation was T350G (L83V), detected in 67% of the samples, associated with increased risk of persistent infection. The high detection rate of the European lineage correlated with patterns of human migration. This study emphasizes the importance of recognizing circulating lineages, as well as the detection of mutations associated with high-grade neoplastic lesions that could be correlated to the development of carcinogenic lesions.
Oh, Young Taek;Lee, Kang-Mu;Bari, Wasimul;Kim, Hwa Young;Kim, Hye Jin;Yoon, Sang Sun
Journal of Microbiology and Biotechnology
/
v.26
no.3
/
pp.627-636
/
2016
The causative agent of pandemic cholera, Vibrio cholerae, infects the anaerobic environment of the human intestine. Production of cholera toxin (CT), a major virulence factor of V. cholerae, is highly induced during anaerobic respiration with trimethylamine N-oxide (TMAO) as an alternative electron acceptor. However, the molecular mechanism of TMAO-stimulated CT production is not fully understood. Herein, we reveal that CT production during anaerobic TMAO respiration is affected by glucose fermentation. When the seventh pandemic V. cholerae O1 strain N16961 was grown with TMAO and additional glucose, CT production was markedly reduced. Furthermore, an N16961 Δcrp mutant, devoid of cyclic AMP receptor protein (CRP), was defective in CT production during growth by anaerobic TMAO respiration, further suggesting a role of glucose metabolism in regulating TMAO-mediated CT production. TMAO reductase activity was noticeably decreased when grown together with glucose or by mutation of the crp gene. A CRP binding region was identified in the promoter region of the torD gene, which encodes a structural subunit of the TMAO reductase. Gel shift assays further confirmed the binding of purified CRP to the torD promoter sequence. Together, our results suggest that the bacterial ability to respire using TMAO is controlled by CRP, whose activity is dependent on glucose availability. Our results reveal a novel mechanism for the regulation of major virulence factor production by V. cholerae under anaerobic growth conditions.
Background: DNA polymerase beta ($pol{\beta}$) is a key enzyme in the base excision repair pathway. It is 39kDa protein, with two subunits, one large subunit of 31 kDa having catalytic activity between exon V to exon XIV, and an 8 kDa smaller subunit having single strand DNA binding activity. Exons V to VII have double strand DNA binding activity, whereas exons VIII to XI account for the nucleotidyl transferase activity and exons XII to XIV the dNTP selection activity. Aim: To examine the association between $pol{\beta}$ polymorphisms and the risk of ovarian cancer, the present case control study was performed using 152 cancer samples and non-metastatic normal samples from the same patients. In this study, mutational analysis of $pol{\beta}$ genomic DNA was undertaken using primers from exons IX to XIV - the portion having catalytic activity. Results: We detected alteration in DNA polymerase beta by SSCP. Two specific heterozygous point mutations of $pol{\beta}$ were identified in Exon 9:486, A->C (polymorphism 1; 11.18%) and in Exon 11:676, A->C (polymorphism 2; 9.86%). The correlation study involving polymorphism 1 and 4 types of tissue showed a significant correlation between mucinous type with a Pearson correlation value of 4.03 (p=0.04). The association among polymorphism 2 with serous type and stage IV together have shown Pearson ${\chi}^2$ value of 3.28 with likelihood ratio of 4.4 (p=0.07) with OR =2.08 (0.3-14.55). This indicates that there is a tendency of correlation among polymorphism 2, serous type and stage IV, indicating a risk factor for ovarian cancer. Conclusion: Hence, the results indicate that there is a tendency for $pol{\beta}$ polymorphisms being a risk factor for ovarian carcinogenesis in India.
The Banna miniature pig (BNMP) is a representative miniature pig breed in China. Even though BNMP dwarfism is obvious, its underlying causative mutations remain unknown. In this study, the BNMP and Large White pig (LWP) serum growth hormone (GH) and insulin-like growth factor (IGF-1) levels were detected by ELISA and compared. BNMP serum IGF-1 levels were significantly lower than LWP levels (P<0.05). The miniature condition may arise from mutations in the GH and GH receptor (GHR) genes. Therefore, GH and GHR cDNA from the BNMP were cloned into a pMD18-T vector by RT-PCR using the total RNA obtained from the BNMP's pituitary and liver tissues. Sequencing results indicated that the open reading frame of the BNMP GH gene is composed of a 26-residue signal peptide and a 191-residue mature peptide. The coding sequence of the BNMP GHR gene contained 639 amino acids, including a signal peptide that is 18 amino acids long. Two amino acid substitutions, A09V and R22Q, were found in the signal peptide of the GH gene. Additionally, the S104P mutation was found in the BNMP's mature GH protein. Four mutations in the cytoplasmic domain of GHR may influence the downstream signal transduction of GHR, which needs further experimental evidence.
Background: Chronic myeloproliferative diseases are clonal stem cell diseases which occur as a result of uncontrollable growth and reproduction of hematopoietic stem cells, which are the myeloid series source in bone marrow. Recent studies have suggested that chronic inflammation can be a triggering factor in the clonal change in chronic myeloproliferative neoplasia (CMPN). In our study, we evaluated the existence of a chronic inflammation process in our Philadelphia negative (Ph-)CMPN patients using inflammation parameters in combination with demographic, laboratory and clinical characteristics of the patients. Materials and Methods: Demographic characteristics, clinical and laboratorial data, and thrombosis histories of 99 Ph-CMPN patients, who were diagnosed at our outpatient clinic of hematology in accordance with WHO 2008 criteria, were analyzed retrospectively,with 80 healthy individuals of matching gender and age included as controls. Complete blood counts, sedimentation, C reactive protein (CRP), JAK V617F gene mutations, abdomen ultrasound images and previous thrombosis histories of these patients were retrospectively analyzed. Results: Ph-CMPN and healthy control groups included 99 and 80 cases, respectively. PV, ET and MF diagnoses of patients were 43 (%43.4), 44 (44.4%) and 12 (12.1%), respectively. JAK V617F gene mutation was found to be positive in 64 (71.1%) of all cases and in 27(65.8%), 32 (82%), 5 (50%) of the cases in PV, ET and PMF groups, respectively. Thrombosis was determined as 12 (12%) in the entire group, 12.5% in the JAK V617F negative and 15.3% in the positive patients, with no statistical significance (p=0.758). No significant difference was observed between patients with and without previous thrombosis history in respect to hemogram parameters, sedimentation and CRP (p>0.05), neutrophil to lymphocyte ratio (NLR), erythrocyte distribution width (RDW), mean platelet volume (MPV) and sedimentation levels of the patient.
The mutational effects of pentachlorophenol (PCP) on the hypoxanthine phosphoribosyl transf erase (hprt) locus in human T-cell were analysed by T-cell clonal assay in vitro. Cells were exposed for 24 hours at primary culture to 0~100 ppm (W/V) PCP in dimethyl sulfoxide. Treated cells were allowed at the same time to stimulate by phytohemagglutinin (PHA) and T-cell growth factor (TCGF) and then seeded in medium containing 6-thioguanine to select for hprt-negative routants. We have also defined the optimal condition for the determination of mutant frequency. The parameters investigated include survival counting, first and second subculture for clonal efficiency plating and mutant plating. Under the optimal conditions, mutant frequencies of high dose-treated cells were significantly higher than those of non-treated or low dose cells. The results indicated a clear dose-effect relationship and showed that mutant frequency in 50 ppm PCP treated cell was 4.31$\times$$10^{-5}$ (background, 8.32$\times$$10^{-6}$). Above data strongly suggest that hprt mutation assay can be used as a biomarker for the environmental risk assessment.
Vibrio vulnificus is an opportunistic pathogen that causes a septicemia and expresses numerous virulence factors, in which luxS and smcR are genes encoding for components responsible for quorum-sensing regulation. In the present study, null mutants were constructed with lesions in each or both of these two genes from the V. vulnificus Vv$\Delta$Z strain, which is a lacZ$^{-}$ and chloramphenicol/streptomycin-resistant derivative of the wild-type ATCC29307 strain, and their phenotypes related to virulence were compared with those of the parental cells. $LD_{50}$ and histopathological findings of luxS-, smcR-, or luxS- smcR- deficient mutant were not different from those of the parent strain, a lacZ-deficient streptomycin-resistant strain in mice. However, time of death in mice was delayed, and numbers of bacteria survived in bloodstream after intraperitoneal injection in mice were decreased by mutation, especially luxS and smcR double mutant (VvSR$\Delta$ZSR). These phenomena were supported by increased serum sensitivity and delayed bacterial proliferation in both murine blood and iron-restricted medium. These results suggest that the luxS and luxR homologous genes in V. vulnificus could playa role in bacterial survival in host by enhancing proliferation and adjusting to changed environment.
Seo, Young Ho;Kim, Jang Su;Seo, Sung Chul;Seo, Won Hee;Yoo, Young;Song, Dae Jin;Choung, Ji Tae
Clinical and Experimental Pediatrics
/
v.57
no.4
/
pp.186-192
/
2014
Purpose: The prevalence of macrolide-resistant Mycoplasma pneumoniae (MRMP) has increased worldwide. The aim of this study was to estimate the proportion of MRMP in a tertiary hospital in Korea, and to find potential laboratory markers that could be used to predict the efficacy of macrolides in children with MRMP pneumonia. Methods: A total of 95 patients with M. pneumoniae pneumonia were enrolled in this study. Detection of MRMP was based on the results of specific point mutations in domain V of the 23S rRNA gene. The medical records of these patients were reviewed retrospectively and the clinical course and laboratory data were compared. Results: The proportion of patients with MRMP was 51.6% and all MRMP isolates had the A2063G point mutation. The MRMP group had longer hospital stay and febrile period after initiation of macrolides. The levels of serum C-reactive protein (CRP) and interleukin-18 in nasopharyngeal aspirate were significantly higher in patients who did not respond to macrolide treatment. CRP was the only significant factor in predicting the efficacy of macrolides in patients with MRMP pneumonia. The area under the curve for CRP was 0.69 in receiver operating characteristic curve analysis, indicating reasonable discriminative power, and the optimal cutoff value was 40.7 mg/L. Conclusion: The proportion of patients with MRMP was high, suggesting that the prevalence of MRMP is rising rapidly in Korea. Serum CRP could be a useful marker for predicting the efficacy of macrolides and helping clinicians make better clinical decisions in children with MRMP pneumonia.
Park, Kwang-Sun;Park, Ho-Won;Lee, Ju-Hyun;Seo, Hyun-Woo
Journal of the korean academy of Pediatric Dentistry
/
v.35
no.3
/
pp.539-547
/
2008
Apert syndrome is an autosomal dominant condition characterized by craniosynostosis, midface hypoplasia, and syndactyly of the hands and feet. It occurs in about 1 of every 65,000 to 160,000 births and is caused by a mutation in the fibroblast growth factor receptor 2(FGFR2) gene. Apert syndrome typically produces acrobrachycephaly(tower skull). The occiput is flattened, and there is a tall appearance to the fore head. Ocular proptosis is a characteristic finding, along with hypertelorism and downward slanting lateral palpebral fissures. The middle third of the face is markedly retruded and hypoplastic, resulting in a relative mandibular prognathism. The reduced size of the nasopharynx and narrowing of the posterior choana can lead to mouth breathing, contributing to an open-mouth apprance. Three fourths of all patients exhibit either a cleft of the soft palate or a bifid uvula. The maxillary hypoplasia leads to a V-shaped arch and crowding of the teeth. A 6-year-old male patient visited to the Department of Pediatric dentistry, Kangnung National University of Dental Hospital. He visited the hospital to get treatment of carious teeth. The purpose of this report is to present a specific dental manifestations about the apert syndrome.
Objective: As an iconic symbol of Qinghai-Tibetan Plateau and of high altitude, yak are subjected to hypoxic conditions that challenge aerobic metabolism. Matrix metalloproteinases-3 (MMP3) is assumed to be a key target gene of hypoxia-inducible factor-$1{\alpha}$ that function as a master regulator of the cellular response to hypoxia. Therefore, the aim of this investigation was to identify the DNA polymorphism of MMP3 gene in domestic yak and to explore its possible association with high-altitude adaptation. Methods: The single-nucleotide polymorphisms (SNPs) genotyping and mutations scanning at the MMP3 locus were conducted in total of 344 individuals from four domestic Chinese yak breeds resident at different altitudes on the Qinghai-Tibetan Plateau, using high-resolution melting analysis and DNA sequencing techniques. Results: The novel of SNPs rs2381 $A{\rightarrow}G$ and rs4331 $C{\rightarrow}G$ were identified in intron V and intron VII of MMP3, respectively. Frequencies of the GG genotype and the G allele of SNP rs2381 $A{\rightarrow}G$ observed in high-altitude Pali yak were significantly higher than that of the other yak breeds resident at middle or low altitude (p<0.01). No significant difference was mapped for SNP rs4331 $C{\rightarrow}G$ in the yak population (p>0.05). Haplotype GC was the dominant among the 4 yak breeds, and Pearson correlation analysis showed that the frequencies of GC was significantly lower in Ganan (GN), Datong (DT), and Tianzhu white yaks (TZ) compared with Pali (PL) yak. The two SNPs were in moderate linkage disequilibrium in high-altitude yaks (PL) but not in middle-altitude (GN, DT) and low-altitude (TZ) yaks. Conclusion: These results indicate that MMP3 may have been subjected to positive selection in yak, especially that the SNP rs2381 $A{\rightarrow}G$ mutation and GC haplotypes might contribute to adaptation for yak in high-altitude environments.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.