Park, Eun-Hee;Lee, Ha-Yeon;Ryu, Yeon-Woo;Seo, Jin-Ho;Kim, Myoung-Dong
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.21
no.10
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pp.1064-1068
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2011
The osmotolerant yeast, Candida magnoliae, which was isolated from honeycomb, produces erythritol from sugars such as fructose, glucose, and sucrose. Erythrose reductase in C. magnoliae (CmER) reduces erythrose to erythritol with concomitant oxidation of NAD(P)H. Sequence analysis of the 5'-flanking region of the CmER gene indicated that one putative stress response element (STRE, 5'-AGGGG-3'), found in Saccharomyces cerevisiae, exists 72 nucleotides upstream of the translation initiation codon. An enzyme activity assay and semiquantitative reverse transcription polymerase chain reaction revealed that the expression of CmER is upregulated under osmotic and salt stress conditions caused by a high concentration of sugar, KCl, and NaCl. However, CmER was not affected by osmotic and oxidative stress induced by sorbitol and $H_2O_2$, respectively. The basal transcript level of CmER in the presence of sucrose was higher than that in cells treated with fructose and glucose, indicating that the response of CmER to sugar stress is different from that of GRE3 in S. cerevisiae, which expresses aldose reductase in a sugarindependent manner. It was concluded that regulation of CmER differs from that of other aldose reductases in S. cerevisiae.
In this study, the characterization of purified erythritol 4-phosphate dehydrogenase, key enzyme of erythritol biosynthesis, produced by Penicillium sp. KJ81 was investigated. Optimum production conditions of erythritol 4-phosphate dehydrogenase was 1 vvm areration, 200 rpm agitation, at $37^{\circ}C$ for 8 days in the medium containing 30% sucrose, 0.5% yeast extract, 0.5% $(NH_4)_2SO_4$, 0.1% $KH_2PO_4$, and 0.05%$MgCl_2$. Erythritol 4-phosphate dehydrogenase was purified through ultrafiltration and preparative gel electrophoresis from cell extract of Penicillium sp. KJ81. This enzyme was especially active on erythrose 4-phosphate with 1.07 mM of Km value. It gave a single band on native polyacrylamide gel electrophoresis and an isoelectric point of 4.6. The enzyme had an optimal activity at pH 7.0 and $30^{\circ}C$. It was stable between pH 4.0 and 9.0, and also below $30^{\circ}C$. The enzyme activity was completely inhibited by 1mM $Cu^{2+}$ and 1 mM $Zn^{2+}$, but was not significantly affected by other cations tested. This enzyme was inactivated by treatment of tyrosine specific reagent, iodine and tryptophan specific reagent, N-bromosuccinimide. The substrate of the enzyme, erythrose 4-phosphate showed protective effect on the inactivation of the enzyme by both reagents. These results suggest that tryptophan and tyrosine residues are probably located at or near active site of the enzyme.
The six soybean cultivars (Lee, Hill, Harosoy, Clark-63 Chippewa and R56-49) different in phosphorus sensitivity were cultured with $NH_4-N$, $NO_3-N$ or urea-N under water culture condition. Free sugars and organic chrematogram. Three peaks (unknown x, y and sucrose) were appeared as considerable main peaks. The X compound appeared as trace in the nitrate fed plant while unexpectedly high in ammonium or urea fed plant. The Y compound tend to decrase in urea fed plant. Sucrose was trace in ammonium fed plant but it was greater in urea onethan in nitrate one. The X was assumed a four carbon sugar acid derived from erythrose or a ring compound derived from purine or pyrimidine. While Y was assumed a hexose derived from glycolysis path. Since Y/x ratio is a good index of phosphorus sensitivity (inve rserelation) these compounds appears keycompounds to elucidate phosphorus sensitivity and ammonium toxicity.
The 3-Deoxy-D-arabinoheptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase is the first enzyme of aromatic amino acid-, folic acid-, and phenazine-1-carboxylic acid biosynthetic pathways. DAHP synthase of Bacillus sp. B-6 that produces phenazine-1-carboxylic acid was feedback inhibited by two intermediary metabolites of aromatic amino acid biosynthetic pathways, prephenate and chorismate, but not by other metabolites, such as anthranilic acid, shikimic acid, p-aminobenzoic acid, and 3-hydroxyanthranilic acid. DAHP synthase of Bacillus sp. B-6 was not inhibited by end products, such as aromatic amino acids, folic acid, and phenazine-1-carboxylic acid. The inhibition of DAHP synthase by prephenate and chorismate was non-competitive with respect to erythrose 4-phosphate and phosphoenolpyruvate. Prephenate and chorismate inhibited 50% of the DAHP synthase activity at concentrations of $2{\times}10^{-5}\;M$ and $1.2{\times}10^{-4}\;M$, respectively The synthesis of DAHP synthase of Bacillus sp. B-6 was not repressed by exogenous aromatic amino acids, folic acid, and phenazine 1-carboxylic acid, single or in combinations.
When a low-temperature treatment was given to a small sweet pepper variety Zairaisisi, the seed browning effect appeared soon. This change attracted the studies to determine and discuss the browning metabolites, polyphenolic compounds, and changes in their between-step components. (1) Chlorogenic acids were found as a polyphenolic compound in seed, whereas no flavanol-type polyphenol was observed. (2) There was sharp increase in total polyphenol content and chlorogenic acid with a low-temperature treatment. The contents of these substrates dropped below that of room-temperature treatment after the browning effect took place. (3) A marked increase in between-step metabolites phenylalanine, tyrosine, shikimic acid contents, and thus assumed activated shikimate pathway in this process. (4) It was suggested by determining the effect of specific metabolic inhibition and respiratory inhibitor administrations on enzymes that active biosynthesis of polyphenolic compounds takes place in shikimate pathway with combination of phosphoenolpyruvate and erythrose-4-phosphate connected to TCA cycle jaming after an active EMP pathway was gone through with sugars in pepper seeds at a low-temperature. (5) It was also suggested from the observation of increased K ion flow-out in pepper seeds with a low-temperature treatment that there is an abnormality in the plasma membrance.
Park, Chang-Hun;Park, Chang-Hun;Lee, Youn-Jin;Lee, Sang-Yup;Oh, Han-Bin;Lee, Jin-Won
Bulletin of the Korean Chemical Society
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v.32
no.2
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pp.524-530
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2011
In the present study, we demonstrate that SRM LC-MS/MS method developed by Luo et al. (ref. 10) can be successfully applied to the quantitative analysis of intracellular metabolites in E. coli that are collected at the exponential and stationary growth phases. A focus is given on measuring the changes in the concentrations of intracellular metabolites in batch cultures, which were induced during both the dynamically changing exponential and stationary growth phases. The following intracellular metabolites are quantified in the exponential and stationary phases of E. coli growth, using the SRM mode of a triple quadrupole mass spectrometer: glucose-1-phosphate, fructose-1,6-bisphosphate, phosphoenolpyruvate, pyruvate, acetyl-coenzyme A, 6-phosphogluconate, ribulose-5-phosphate, xylulose-5-phosphate, erythrose-4-phosphate. The determined intracellular metabolite concentration profiles are shown to be in a good agreement with the growth profiles of E. coli, which clearly indicates that SRM LC-MS/MS can be successfully used for following the metabolite changes induced at different growth stages.
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