• 제목/요약/키워드: Erwinia carotovora subsp.

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Biochemical and Thermal Stabilization Parameters of Polygalacturonase from Erwinia carotovora subsp. carotovora BR1

  • Maisuria, V.B.;Patel, V.A.;Nerurkar, A.S.
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제20권7호
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    • pp.1077-1085
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    • 2010
  • With an emphasis on its thermal behavior with different pHs and salts, the kinetic and thermodynamic parameters of the purified polygalacturonase (PG) from E. carotovora subsp. carotovora (Ecc) BR1 were studied, as the characterization of an enzyme is significant in the context of burgeoning biotechnological applications. The thermodynamic parameters for polygalacturonic acid hydrolysis by the purified PG were ${\Delta}H^*$=7.98 kJ/mol, ${\Delta}G^*$=68.86 kJ/mol, ${\Delta}S^*$=-194.48 J/mol/K, ${\Delta}G_{E-S}$=-1.04 kJ/mol, and ${\Delta}G_{E-T}$=-8.96 kJ/mol. In addition, its turnover number ($k_{cat}$) was 21/sec. The purified PG was stable within a temperature range of $20-50^{\circ}C$ and was deactivated at $60^{\circ}C$ and $70^{\circ}C$. The thermodynamic parameters (${\Delta}H^*$, ${\Delta}G^*$, ${\Delta}S^*$) for the irreversible inactivation of the PG at different temperatures ($30-60^{\circ}C$) were determined, where the effectiveness of various salts and different pHs (4-8) for the thermal stability of the PG were also characterized. The efficacy of various salts for the thermal stability of the PG was in the following order: $MgCl_2$ > $BaCl_2$ > KCl > $CaCl_2$ >NaCl. Therefore, the present work presents the biochemical, substrate hydrolysis thermodynamics and the thermal stabilization parameters of the PG from Ecc.

Biocontrol of Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum Using Bacteriophage PP1

  • Lim, Jeong-A;Jee, Samnyu;Lee, Dong Hwan;Roh, Eunjung;Jung, Kyusuk;Oh, Changsik;Heu, Sunggi
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제23권8호
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    • pp.1147-1153
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    • 2013
  • Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum (formerly Erwinia carotovora subsp. carotovora) is a plant pathogen that causes soft rot and stem rot diseases in several crops, including Chinese cabbage, potato, and tomato. To control this bacterium, we isolated a bacteriophage, PP1, with lytic activity against P. carotovorum subsp. carotovorum. Transmission electron microscopy revealed that the PP1 phage belongs to the Podoviridae family of the order Caudovirales, which exhibit icosahedral heads and short non-contractile tails. PP1 phage showed high specificity for P. carotovorum subsp. carotovorum, and several bacteria belonging to different species and phyla were resistant to PP1. This phage showed rapid and strong lytic activity against its host bacteria in liquid medium and was stable over a broad range of pH values. Disease caused by P. carotovorum subsp. carotovorum was significantly reduced by PP1 treatment. Overall, PP1 bacteriophage effectively controls P. carotovorum subsp. carotovorum.

비병원성 Pseudomonas solanacearum 접종에 의한 담배내 항균물질생성과 Peroxidase 및 Polyphenoloxidase의 변화 (Production of Antibacterial Substance, and Changes in Peroxidase nd Polyphenoloxidase Activities in Tobacco Plants Inoculated with Avirulent Isolate of Pseudomonas solanacearum)

  • 이영근;민태기;박원모
    • 한국식물병리학회지
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    • 제3권3호
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    • pp.203-209
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    • 1987
  • Pseudomonas solanacearum의 병원성균주 및 비병원성균주를 담배의 뿌리에 접종하여 그 잎과 줄기, 뿌리에서 P. solanacearum과 Erwinia carotovora subsp. carotovora, Escherichia coli에 대한 항균물질을 분리하였다. 담배즙액을 TLC plate에 발전시킨 결과 비병원성균주에 접종된 담배에서는 $R_f$ 0.6 부근에서, 병운성균주에 접종된 담배에서는 $R_f$ 0.9 부근에서 각각 항균물질을 분리할 수 있았다. 그러나 고압살균된 담배즙액배지에 병원성균주 및 비병원성균주를 3일간 배양한 배양여액에서는 항균물질의 생성이 인정되지 않았다. 비병원성균주 및 병원성균주에 접종된 담배잎에서는 무처리 담배에 비하여 peroxidase와 polyph-enoloxidase의 활성이 높았으나, 그 줄기와 뿌리에서는 효소활성의 차이가 없었다. 비병원성균주와 병원성균주로 처리된 담배 사이, 감수성품종인 BY4와 저항성품종 NC82 사이에도 두 효소의 활성과 동위효소형태의 차이가 없었다.

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항세균성 항생물질을 생산하는 미생물의 분리, 동정 및 배양조건 (Isolation, identification, and culture conditions of the strain producing antibacterial antibiotic)

  • 유재홍;윤상홍;구본성;여윤수;박인철;이병무;류진창
    • 농약과학회지
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    • 제3권2호
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    • pp.1-7
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    • 1999
  • 식물에 세균성무름병(soft rot disease)과 검은반점병(blackleg)을 일으키는 Erwinia carotovora subsp. carotovora의 생육을 저해하는 균주를 토양으로부터 분리하고, 그 중 항균 활성이 가장 좋은 균주를 선별하여 균주의 동정, 항생물질의 최적 생산조건 및 생산된 항생물질의 특성을 연구 검토한 결과 다음과 같은 결론을 얻었다. 분리 균주의 형태학적, 배양학적 및 생리학적 특성을 검토한 결과 Bacillus sp.로 판단되어 분리균주를 Bacillus sp. YR-1로 명명하였다. 항생물질 생산을 위한 최적 조건을 검토한 결과, sucrose 2.0%(w/v), peptone 2.0%(w/v), NaCl 0.1%(w/v), pH 7.0의 배지 $35^{\circ}C$, 48시간 진탕배양 하였을 때, 항생물질의 생산성이 가장 좋았다.

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First Report on Bacterial Soft Rot of Graft-cactus Chamaecereus silvestrii Caused by Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum in Korea

  • Kim, Jeong-Ho;Joen, Yong-Ho;Kim, Sang-Gyu;Kim, Young-Ho
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제23권4호
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    • pp.314-317
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    • 2007
  • A soft stem rot disease was observed on Chamaecereus silvestrii (Korean name: Sanchui), a scion of graft-cactus, in major growing areas of Suwon (National Horticulture Research Institute), Anseong, Eumseong, Cheonan, Daegu, and Goyang, Korea during 2000 and 2001. Typical symptoms were soft rots characterized by moist and watery decay of the whole cactus stem, which initiated as small water-soaked lesions and enlarged rapidly to the entire stem. The causal organism isolated from the infected stems was identified as Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum (Erwinia carotovora subsp. carotovora) based on its physiological and biochemical characteristics and confirmed by the cellular fatty acid composition and Biolog analyses. Artificial inoculation of the bacterium produced the same soft rot symptoms on the cactus stems, from which the same bacterium was isolated and identified. This is the first report of the P. carotovorum subsp. carotovorum in the graft-cactus C. silvestrii in Korea.

고랭지 배추 무름병 방제를 위한 우수약제 선발 (Screening of effective control agents against bacterial soft rot on Chinese cabbage in alpine area)

  • 정은경;장현철;용영록;김병섭
    • 농약과학회지
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    • 제7권1호
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    • pp.32-37
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    • 2003
  • Erwinia carotovora subsp. carotovora에 의한 배추 무름병은 배추에서 가장 큰 문제가 되고 있는 병 중 하나이다. 본 연구는 배추 무름병 방제에 우수한 약제를 선발하여 무름병을 효과적으로 방제하고자 실시하였다. 항생제, 식물활성제 및 비병원성 Erwinia의 효과를 실험실내 약효 검정과 유묘 검정, 포장시험으로 수행하였다. 실험실내 약효 검정 방법으로는 paper disc 방법과 potato slice 방법을 수행하였다. 유묘 검정은 mineral oil 접종법을 사용하여 병발생을 균일하게 하여 수행하였다. 실험실내 약효 검정 결과 streptomycin과 oxolinic acid, bronopol 과 copper hydroxide 가 병원균의 생장 및 감자 절편의 부패를 크게 억제하였다. 그러나 식물 활성제들은 실험실내 약효 검정에서는 병원균의 생장 및 감자 절편의 부패를 크게 억제하지 못하였다. 배추 (강력여름배추) 유묘를 이용한 생물 검정에서 비병원성 Erwinia 는 83.5%의 방제가를 나타냈고, oxolinic acid, 항생제 streptomycin, validamycin 은 각각 95.2%, 91.2% 그리고 57.5% 의 방제가를 나타냈으며 구리제는 79.9% 의 방제가를 나타냈다. 그러나 acibenzolar-S-methyl 은 약해를 유발하여 방제가가 낮게 나타났다. 포장시험 결과 acibenzolar-S-methyl은 2000년 포장 시험 (산촌배추) 에서는 통계적으로 유의성 (p=0.05) 있는 방제 효과를 나타내었으나, 2001년 포장 시험 (강력여름배추) 에서는 약해를 일으켜 방제 효과가 낮게 나타났다. 이러한 차이는 배추 품종에 따른 약제에 대한 반응 차이에 기인한 것으로 사료된다. 2002 년 포장 시험에서는 streptomycin+copper가 79.7% 의 방제가를 나타냈고 copper hydroxide 와 비병원성 Erwinia 는 각각 71.9% 와 60.9% 의 방제가를 나타냈다.

포장(圃場)과 수확(收穫) 후(後)에 가지과(科) 채소(菜蔬)에 무름병(病)을 일으키는 병원세균(病原細菌)의 동정(同定) (Identification of Soft Rotting Bacteria of Solanaceae Vegetables in the Fields and Post-harvest)

  • 최재을;한광섭
    • 농업과학연구
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    • 제18권2호
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    • pp.99-103
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    • 1991
  • 충남지방(忠南地方)의 농가(農家)와 전국(全國)의 주요시장(主要市場)으로 부터 수집(蒐集)한 고추, 도마토, 가지, 감자의 부패(腐敗) 과일 및 괴경으로 부터 분리(分離)한 106 균주(菌株)의 식물병원세균(植物病原細菌)을 분류학적(分類學的) 특성(特性)에 따라 구분(區分)한 결과(結果) Erwinia속(屬)이 98 균주, 형광색소(螢光色素)를 형성(形成)하는 Pseudomonas속(屬)이 8균주로 대별(大別)되었다. 98 균주의 Erwinia속(屬) 세균(細菌)은 세균학적(細菌學的) 특성(特性)에 따라 모두 E. carotovara subsp. carotovora로, 형광색소를 형성하는 Pseudomonas속(屬)의 8균주는 P. marginalis가 2균주, P. viridiflava가 6 균주로 동정(同定) 되었다.

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고추와 토마토 종자에서 종자전염 세균 및 바이러스의 동시 검출을 위한 One-step Multiplex RT-PCR 방법 (One-step Multiplex RT-PCR Method for Simultaneous Detection of Seed Transmissible Bacteria and Viruses in Pepper and Tomato Seeds)

  • 정규식;소은희
    • 식물병연구
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    • 제17권1호
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    • pp.44-51
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    • 2011
  • 우리나라에서 주로 재배되는 가지과작물의 종자 전염 병원균 중에서 세균성 병원균 Xanthomonns campestris pv. vesicatoria(Xcv), Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis (Cmm), Erwinia carotovora subsp. carotovora (Ecc)와 바이러스 병원균 Pepper mild mottle virus (PMMoV) and Tobacco mild green mosaic virus (TMGMV)를 종자로부터 동시검출하기 위한 One-step Multiplex RT-PCR을 개발하였다. 각각의 병원균을 특이적으로 증폭시키는 병원균 검출용 프라이머 15세트를 primer-blast 프로그램을 이용하여 제작하였고 각각의 병원균을 특이적으로 검출할 수 있는 5세트의 프라이머 세트(Cmm-F/R, Ecc-F/R, Xcv-F/R, PMMoV-F/R, TMGMVF/R)를 선발하였다. 이들 프라이머 세트는 프라이머간의 또는 병원균 cDNA간의 간섭없이 타겟 병원균만을 검출하였다. 가지과 작물 중에서 유통 중인 고추종자 20품종과 토마토종자 10품종에 대한 종자 감염 병원균 검출을 위한 PCR을 수행한 결과, 2개 품종의 토마토종자에서 Ecc가 검출되었고 4개 품종의 고추종자에서도 Ecc가 검출되었다. 특히 고추 종자에선 Ecc가 검출된 4개 품종 외에 1개 품종에서 PMMoV, TMGMV가 동시 검출되었다. 이로 인해 개발된 One-step multiplex RT-PCR은 서로 간섭 현상 없이 병원균을 효율적으로 검출할 수 있음을 보여 주었다.

제주지역에서 분리한 감자 줄기검은병균의 유전적 특성 (Genetic Characterization of Potato Blackleg Strains from Jeju Island)

  • 서상태;이승돈;이중섭;한경숙;장한익;임춘근
    • 식물병연구
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    • 제11권2호
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    • pp.140-145
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    • 2005
  • 제주지역의 감자 줄기검은병징으로부터 분리한 12균주의 유전적 특성을 분석하기 위해 Eca-specific PCR, PCR-RFLP, ERIC-PCR을 실시하여 그 결과를 E. carotovora대조균들과 비교하였다. Eca-specific PCR 결과 Eca 대조균들은 특이적 밴드를 형성한 반면, 줄기검은병균은 특이적 밴드를 형성하지 않았다. 또한, pel유전자의 RFLP분석 결과 줄기검은병균은 pattern 2를 나타내었으나, Eca 균주는 pattern 3을 나타내어 Eca와는 다른 특성을 보여주었다. 16S rDNA의 RFLP분석결과 이번 실험에 이용된 대부분의 균주가 pattern 1을 나타냈지만, 12개의 줄기검은병균 중 11개의 균이 pattern 2을 나타내어 Ecc와도 다른 특성을 보여주었다. 제주지역의 무름병징과 줄기검은병징을 나타내는 균주들의 유전적 관계를 분석하기 위해 ERIC-PCR을 실시한 결과 줄기검은병균들은 특이적 밴드를 형성하였으며, 서로 높은 유연관계를 보여주었다. 따라서 제주지역의 줄기검은병징으로부터 분리한 균주들은 Eca, Ecc균들과는 다른 특성을 가지고 있음을 알 수 있었다.