The lakes' metabolism bears important information for the assessment of the carbon budget due to the accumulation or loss of carbon in the lake as well as the dynamics of the food webs through primary production. A lake-scale metabolism is evaluated by Gross Primary Production (GPP), Ecosystem Respiration (R), and Net Ecosystem Production (NEP), which is the difference between the first two values. Methods for estimating GPP and R are based on the levels carbon and oxygen. Estimation of carbon is expensive because of the use of radioactive materials which requires a high degree of proficiency. The purpose of this study was to estimate Lake Daecheong ecosystem metabolism using high frequency water temperature data and DO measurement sensor, widely utilized in the field of water quality monitoring, and to evaluate the possibility of using the application method. High frequency data was collected at intervals of 10 minutes from September to December 2017 by installing a thermistor chain and a DO sensor in downstream of Daechung Dam. The data was then used to estimate GPP, R and NEP using the R public program LakeMetabolizer, and other metabolism models (mle, ols, kalman, bookkeep). Calculations of gas exchange coefficient methods (cole, crusius, heiskanen, macIntyre, read, soloviev, vachon) were compared. According to the result, Lake Daecheong has some deviation based on the application method, but it was generally estimated that the NEP value is negative and acts as a source of atmospheric carbon in a heterotrophic system. Although the high frequency sensor data used in this study had negative and positive GPP and R values during the physical mixing process, they can be used to monitor real-time metabolic changes in the ecosystem if these problems are solved.
Herbicides play a very important role in modern agriculture. However, the herbicide applied to the agricultural field may accumulate in the field, converting the advantages to environment pollution. Many small animals in the ecosystem such as alderfly, earthworm, butterfly, loach, frog, firefly, some birds and aquatic organisms have been known to disappear gradually. In addition, several behavior of herbicides including adsorption by soil, movement by water, photodecomposition, volatilization to air, absorption by plant, metabolism by soil microorganisms and so on, are proceeded while the herbicide remained in the environment. In this review, fate and behavior of herbicides in the environment and their effect on ecosystem after their application are focused on four aspects : the first is the absorption and metabolism of herbicides by plant; the second is the residues of herbicides in soil and water environments: the third is the accumulation and release of herbicides in aquatic organisms and the fourth is the translocation of herbicides in model agricultural ecosystem. Many factors may affect the behavior and fate of herbicides after their application, climatic conditions and soil properties seem to be the most important. Therefore, the fate and behavior of herbicide in Taiwan, located on subtropical region, may differ from those in Korea.
SBM을 이용하여 2006년 가막만의 담수, 염분, 영양염 등 물질 수지를 산정하였다. 담수유출량은 $-174.2{\sim}72.5{\times}10^3m^3/day$로 나타났으며 개방경계에서의 해수 교환에 의한 mixing volume은 $-2.4{\times}10^7\sim4.9{\times}10^7m^3/day$로 만 내외의 염분차이에 의해 크게 좌우 받았다. 육상기인 DIP와 DIN의 유입 flux의 범위는 397.0~1158 mole/day 및 1750~8328 mole/day의 범위로 다른 지역에 비해 낮았다. DIP의 소실 또는 생성은 물수지의 변동에 의해 크게 좌우 되는 특징을 보였으며, 또한, 물질체류시간에 의해 물질수지가 크게 좌우되어 NEM도 크게 달라지는 결과를 보였다.
Roderick I. Mackie;Hyewon Kim;Na Kyung Kim;Isaac Cann
Animal Bioscience
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제37권2_spc호
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pp.323-336
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2024
Molecular hydrogen (H2) and formate (HCOO-) are metabolic end products of many primary fermenters in the rumen ecosystem. Both play a vital role in fermentation where they are electron sinks for individual microbes in an anaerobic environment that lacks external electron acceptors. If H2 and/or formate accumulate within the rumen, the ability of primary fermenters to regenerate electron carriers may be inhibited and microbial metabolism and growth disrupted. Consequently, H2- and/or formate-consuming microbes such as methanogens and possibly homoacetogens play a key role in maintaining the metabolic efficiency of primary fermenters. There is increasing interest in identifying approaches to manipulate the rumen ecosystem for the benefit of the host and the environment. As H2 and formate are important mediators of interspecies interactions, an understanding of their production and utilization could be a significant starting point for the development of successful interventions aimed at redirecting electron flow and reducing methane emissions. We conclude by discussing in brief ruminant methane mitigation approaches as a model to help understand the fate of H2 and formate in the rumen ecosystem.
Members of the genus Bacillus are known to play an important role in promoting plant growth and protecting plants against phytopathogenic microorganisms. In this study, 21 isolates of Bacillus spp. were obtained from the root micro-ecosystem of Suaeda glauca. Analysis of the 16S rRNA genes indicated that the isolates belong to the species Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus velezensis, Bacillus subtilis, Bacillus pumilus, Bacillus aryabhattai and Brevibacterium frigoritolerans. One of the interesting findings of this study is that the four strains B1, B5, B16 and B21 are dominant in rhizosphere soil. Based on gyrA, gyrB, and rpoB gene analyses, B1, B5, and B21 were identified as B. amyloliquefaciens and B16 was identified as B. velezensis. Estimation of antifungal activity showed that the isolate B1 had a significant inhibitory effect on Fusarium verticillioides, B5 and B16 on Colletotrichum capsici (syd.) Butl, and B21 on Rhizoctonia cerealis van der Hoeven. The four strains grew well in medium with 1-10% NaCl, a pH value of 5-8, and promoted the growth of Arabidopsis thaliana. Our results indicate that these strains may be promising agents for the biocontrol and promotion of plant growth and further study of the relevant bacteria will provide a useful reference for the development of microbial resources.
A. tamarense로부터 ESTs library를 제작하였다. 이들의 염기서열을 분석하여 STX 생합성 관련 유전자를 클로닝하였다. 연구결과 827 클론의 염기서열이 분석되었고, 564개의 EST가 GenBank에서의 Blast search를 사용하여 기능에 따라 분류되었다. EST에서의 주요 유전자는 cellular organization, cell metabolism, energy, cell cycle과 DNA processing, cellular transport와 transport, cell rescue, defense, death와 aging 및 transcription 등으로 분석되었다. 특히 S-adenosylmethionine synthetase와 H2A histone family 유전자의 발현이 독성 A. tamarense에서 증가하였다. 이러한 결과는 두 개의 유전자가 A. tamarense에서의 삭시톡신 생합성을 검출하기 위한 좋은 바이오마커가 될 수 있음을 보여준다.
Recent development of novel techniques in systems biology have been used to improve and manipulate the rumen microbial ecosystem and gain a deeper understanding of its physiological and microbiological interactions and relationships. This provided a deeper insight and understanding of the relationship and interactions between the rumen microbiome and the host animal. New high-throughput techniques have revealed that the dominance of Proteobacteria in the neonatal gut might be derived from the maternal placenta through fetal swallowing of amniotic fluid in utero, which gradually decreases in the reticulum, omasum, and abomasum with increasing age after birth. Multi "omics" technologies have also enhanced rumen fermentation and production efficiency of dairy goats using dietary interventions through greater knowledge of the links between nutrition, metabolism, and the rumen microbiome and their effect in the environment. For example, supplementation of dietary lipid, such as linseed, affects rumen fermentation by favoring the accumulation of ${\alpha}$-linolenic acid biohydrogenation with a high correlation to the relative abundance of Fibrobacteriaceae. This provides greater resolution of the interlinkages among nutritional strategies, rumen microbes, and metabolism of the host animal that can set the foundation for new advancements in ruminant nutrition using multi 'omics' technologies.
Pesticide residues in soil could be affected to the growth of micro organisms and the activity of enzymes directly, and successively to the soil properties as pH, Eh and nitrogen metabolism. However, residues are diminished by degradation of soil microorganisms, run-off, leaching, volatilization, photodecomposition and uptake through crops. In this paper research results published in Korea were summarized about translocation of soil residues into crops, fates of residues in soil, effects to the activity of soil microorganisms and metabolic pathways of some pesticides. Generally speaking, pesticide residues in soil were not much affected to the agro-ecosystem except few chemicals. So it should be needed more further researches in this field, continuously.
Duan, Jiwei;Liu, Jun;Ma, Xueling;Zhang, Yue;Wang, Xiaohua;Zhao, Kai
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제27권1호
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pp.122-129
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2017
Termites are destructive to agriculture, forestry, and buildings, but they can also promote agro-ecosystem balance through the degradation of lignocellulose. Termite-triggered cellulose digestion may be clarified through microbial metabolism of cellulose products. In the present study, we characterized the activities of cellulase and its three components synthesized by the cellulase-producing fungal strain HDZK-BYTF620 isolated from the gut of Odontotermes formosanus. The protein components of cellulases were synthesized by strain HDZK-BYTF620, which were isolated and characterized using polyacrylamide gel electrophoresis, and the expression of the cellulases was studied at the proteome level.
The topic of this study is to ask and answer about 'What matters most in medicine'. And the purpose of this study is to establish paradigm which guarantee 'the original principles of science in medicine' and 'the safety of human life in medicine'. The organized characteristics of this study is as follows. 1. 'The harmony of nature (heaven, earth and human)' is the base of medicine. Because medicine control life directly and all life is 'the son of nature'. 2. 'The harmony of Eum and Yang' is the essential power of universe and the key of metabolism of all life including human, animals and plants. Because 'the nature of universe' and all 'Life field' is 'electro-magnetic field'. 3. The Convergence of Oriental medicine and Western medicine orients 'the harmony of Eum and Yang'.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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