John, Arun;Umashankar, Vetrivel;Krishnakumar, Subramanian;Deepa, Perinkulam Ravi
Genomics & Informatics
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제13권1호
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pp.15-24
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2015
Fatty acid synthase (FASN, EC 2.3.1.85), is a multi-enzyme dimer complex that plays a critical role in lipogenesis. This lipogenic enzyme has gained importance beyond its physiological role due to its implications in several clinical conditions-cancers, obesity, and diabetes. This has made FASN an attractive pharmacological target. Here, we have attempted to predict the theoretical models for the human enoyl reductase (ER) and ${\beta}$-ketoacyl reductase (KR) domains based on the porcine FASN crystal structure, which was the structurally closest template available at the time of this study. Comparative modeling methods were used for studying the structure-function relationships. Different validation studies revealed the predicted structures to be highly plausible. The respective substrates of ER and KR domains-namely, trans-butenoyl and ${\beta}$-ketobutyryl-were computationally docked into active sites using Glide in order to understand the probable binding mode. The molecular dynamics simulations of the apo and holo states of ER and KR showed stable backbone root mean square deviation trajectories with minimal deviation. Ramachandran plot analysis showed 96.0% of residues in the most favorable region for ER and 90.3% for the KR domain, respectively. Thus, the predicted models yielded significant insights into the substrate binding modes of the ER and KR catalytic domains and will aid in identifying novel chemical inhibitors of human FASN that target these domains.
ER와 리포터 유전자인 $\beta$-galactosidase가 도입된 효모재조합검색시험법을 이용하여 파라벤류의 내분비계 장애작용을 검색하였다. 양성대조 시험물질로 앞의 시험법들과 동일하게 E2와 BPA를 설정하여 파라벤류의 에스트로젠성을 비교분석 하였다. E2의 경우 $10^{-9}M$에서 가장 활성이 높게 관찰되었고, BPA의 경우 $10^{-7}M$에서 에스트로젠성이 가장 높았다. 파라벤의 경우 이소프로필파라벤이 $10^{-9}M$에서 $10^{-3}M$까지 시험하였을 때, 농도 의존적으로 에스트로젠성이 증가하였으며, $10^{-9}M$의 경우 가장 강력한 에스트로젠성을 보였다. 또한 양성대조군인 E2와 비교하였을 때, $10^{-7}M$에서 $10^{-3}M$까지의 이소프로필파라벤은 오히려 E2보다 높은 내분비계 장애작용이 검색되었다. 이소프로필파라벤을 제외한 나머지 파라벤류의 경우 $10^{-4}M$과 $10^{-5}M$의 프로필파라벤과 $10^{-3}M$과 $10^{-4}M$의 에틸파라벤에서 에스트로젠성이 관찰되었다. 또한 MCF-7세포주는 사람의 유방암 세포이면서 $ER{\alpha}$가 존재하여 에스트로젠 또는 에스트로젠 유사물질이 ER와 반응하여 세포의 성장을 유도하게 된다. 이번 연구에서 파라벤의 시험 이전에 이미 내분비계 장애물질로 널리 알려진 BPA와 체내에 존재하는 강력한 에스트로젠이면서 BPA보다 활성이 1000배정도 높다고 알려진 E2를 양성대조군으로 설정하여 MCF-7세포의 성장을 관찰하였다. 72시간동안 BPA와 E2를 다양한 농도로 MCF-7세포에 노출한 후 DNA 양을 측정하였더니, E2의 경우 $10^{-9}M$에서 대조군보다 약 2.5배의 세포성장을 관찰할 수 있었으며, BPA의 경우 $10^{-8}M$에서 대조군 보다 약 2.2배의 세포성장을 관찰할 수 있었다. 에틸파라벤의 경우 $10^{-7}M$에서 $10^{-4}M$까지 농도 의존적으로 MCF-7세포의 성장을 증가시켰고, $10^{-4}M$이 대조군에 비해 세포성장이 약 2.2배에 달하여 양성대조군과 비슷하면서 높은 에스트로젠 유사반응을 보였다. 프로필파라벤, 부틸파라벤, 이소부틸파라벤과 이소프로필파라벤의 경우 $10^{-5}M$의 농도에서 2배 이상의 세포성장이 유도되었고, 이소프로필파라벤의 경우 RPE값이 약 104%에 이르는 등, 내분비계 장애작용이 검색되었다. 한편, 본 연구팀은 ER에 대한 파라벤의 시험관 내 상경적 결합력을 측정하기 위해 $ER{\alpha}$와 $ER{\beta}$ competition binding assay kit를 사용하여 시험하였다. 이 시험법은 E2와 비교하여 파라벤류의 $ER{\alpha}$와 $ER{\beta}$에 반응하는 시험물질의 RBA(relative binding affinities) 값을 측정하였다. 파라벤의 $ER{\alpha}$ 상경적 결합시험의 경우. E2의 $IC_{50}$의 값이 $4.29{\times}10^{-9}$이었고, 이소부틸파라벤의 경우 $4.5{\times}10^{-7}$에 달하여 RBA값이 0.952가 계산되었다. 이전 연구에 의해 밝혀진 BPA의 경우 RBA값이 0.333인데 반하여, 이소부틸파라벤은 약 3배가 높은 내분비계 장애작용이 검색되었다. 파라벤의 $ER{\beta}$ 상경적 결합시험의 경우. $ER{\alpha}$와 마찬가지로 이소부틸파라벤이 $1.94{\times}10^{-7}M$의 $IC_{50}$값을 가지면서 RBA값이 0.471이 계산되었다. 이것은 파라벤이 $ER{\alpha}$와 $\beta$모두와 결합을 할 수 있고 E2와 경쟁적으로 결합을 할 수 있으며 이는 내분비계를 방해할 수 있다는 것을 다시 한번 뒷받침 해주고 있다. 덧붙여 본 연구팀의 결과는 이소부틸파라벤의 경우 경쟁적으로 결합하는 능력 또한 내분비계교란물질로 잘 알려진 BPA만큼의 능력을 가지고 있는 것으로 나타났다. 결론적으로 in vitro적 방법으로 파라벤류들의 에스트로젠성을 측정한 결과 이미 보고된 연구와 비슷하게 화학 구조적으로 더 길거나 분지된 알킬기를 가지는 파라벤일수록 에스트로젠성이 더 강하게 나타났다. 따라서, 식품이나 화장품 등의 보존제로 사용되는 이 화학물질의 과다한 노출은 정상적인 내분비계에 큰 영향을 미칠 가능성이 있다고 판단된다.
The two major isoflavones in soy, genistein and daidzein, are well known to prevent hormone-dependent cancers by their anti estrogenic activity. The exact molecular mechanisms for the protective action are, however, not provided yet. It has been reported that genistein and daidzein have a potential anticancer activity through their antiproliferative effect in many hormone-dependent cancer cell lines. Transforming growth $factor-\beta1(TGF-\beta1)$ has also been found to have cell growth inhibitory effect, especially in mammary epithelial cells. This knowledge led to a hypothetical mechanism that the soy isoflavones-induced growth inhibitory effect can be derived from the regulation of $TGF-\beta1$ and $TGF-\beta$ receptors. In order to test this hypothesis, the effects of the soy isoflavones at various concentrations and periods on the expression of $TGF-\beta1$and $TGF-\beta$ receptors were investigated by using Northern blot analysis in human breast carcinoma epithelial cell lines, an estrogen receptor positive cell line (MCF-7) and an estrogen receptor negative cell line (MDA-MB-231). As a result, only genistein has shown a profound dose-dependent effect on $TGF-\beta1$ expression in the $ER^+$ cell line within the range of doses tested, and the expression levels are correspondent to their inhibitory activities of cell growth. Moreover, daidzein showed down-regulated $TGF-\beta1$ expression at a low dose, the cell growth proliferation was promoted at the same condition. Therefore, antiproliferative activity of the soy isoflavones can be mediated by $TGF-\beta1$ expression, and the effects are mainly, if not all, occurred by ER dependent pathway. The expression of $TGF-\beta$ receptors was induced at a lower dose than the one for $TGF-{\beta}1$ induction regardless of the presence of ER, and the expression patterns are similar to those of the cell growth inhibition. These results indicated that the regulation of $TGF-\beta$ receptor expression as well, prior to $TGF-\beta1$ expression, may be involved in the antiproliferative activity of soy isoflavones. Little or no expression of $TGF-\beta$ receptors was found in the MCF-7 and MDA-MB-231 cells, suggesting refractory properties of the cells to growth inhibitory effect of the $TGF-\beta$. The soy isoflavones can seemingly restore the sensitivity of growth inhibitory responses to $TGF-\beta1$ by re-inducing $TGF-\beta$ receptors expression. In conclusions, our findings presented in this study show that the antitumorigenic activity of the soy isoflavones could be mediated by not only $TGF-\beta1$induction but $TGF-\beta$ receptor restoration. Thus, soy isoflavones could be good model molecules to develop new nonsteroidal antiestrogenic chemopreventive agents, associated with, regulation of $TGF-\beta$ and its receptors.
Yaacob, Nik Soriani;Nasir, Rabail;Norazmi, Mohd Nor
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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제14권11호
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pp.6761-6767
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2013
The nuclear receptor, peroxisome proliferator-activated receptor gamma ($PPAR{\gamma}$), is expressed in various cancer cells including breast, prostate, colorectal and cervical examples. An endogenous ligand of $PPAR{\gamma}$, 15-deoxy-${\Delta}^{12,14}$ prostaglandin $J_2$ (PGJ2), is emerging as a potent anticancer agent but the exact mechanism has not been fully elucidated, especially in breast cancer. The present study compared the anticancer effects of PGJ2 on estrogen receptor alpha ($ER{\alpha}$)-positive (MCF-7) and $ER{\alpha}$-negative (MDA-MB-231) human breast cancer cells. Based on the reported signalling cross-talk between $ER{\alpha}$ and $ER{\alpha}$, the effect of the $ER{\alpha}$ ligand, $17{\beta}$-estradiol (E2) on the anticancer activities of PGJ2 in both types of cells was also explored. Here we report that PGJ2 inhibited proliferation of both MCF-7 and MDA-MB-231 cells by inducing apoptotic cell death with active involvement of mitochondria. The presence of E2 potentiated PGJ2-induced apoptosis in MCF-7, but not in MDA-MB-231 cells. The $ER{\alpha}$ antagonist, GW9662, failed to block PGJ2-induced activities but potentiated its effects in MCF-7 cells, instead. Interestingly, GW9662 also proved capable of inducing apoptotic cell death. It can be concluded that E2 enhances $ER{\alpha}$-independent anticancer effects of PGJ2 in the presence of its receptor.
Park, Min-Ah;Hwang, Kyung-A;Lee, Hye-Rim;Yi, Bo-Rim;Choi, Kyung-Chul
Toxicological Research
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제27권4호
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pp.253-259
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2011
Transforming growth factor ${\beta}$ (TGF-${\beta}$) is involved in cellular processes including growth, differentiation, apoptosis, migration, and homeostasis. Generally, TGF-${\beta}$ is the inhibitor of cell cycle progression and plays a role in enhancing the antagonistic effects of many growth factors. Unlike the antiproliferative effect of TGF-${\beta}$, E2, an endogeneous estrogen, is stimulating cell proliferation in the estrogen-dependent organs, which are mediated via the estrogen receptors, $ER{\alpha}$ and $ER{\beta}$, and may be considered as a critical risk factor in tumorigenesis of hormone-responsive cancers. Previous researches reported the cross-talk between estrogen/$ER{\alpha}$ and TGF-${\beta}$ pathway. Especially, based on the E2-mediated inhibition of TGF-${\beta}$ signaling, we examined the inhibition effect of 4-tert-octylphenol (OP) and 4-nonylphenol (NP), which are well known xenoestrogens in endocrine disrupting chemicals (EDCs), on TGF-${\beta}$ signaling via semi-quantitative reverse-transcription PCR. The treatment of E2, OP, or NP resulted in the downregulation of TGF-${\beta}$ receptor2 (TGF-${\beta}$ R2) in TGF-${\beta}$ signaling pathway. However, the expression level of TGF-${\beta}1$ and TGF-${\beta}$ receptor1 (TGF-${\beta}$ R1) genes was not altered. On the other hand, E2, OP, or NP upregulated the expression of a cell-cycle regulating gene, c-myc, which is a oncogene and a downstream target gene of TGF-${\beta}$ signaling pathway. As a result of downregulation of TGF-${\beta}$ R2 and the upregulation of c-myc, E2, OP, or NP increased cell proliferation of BG-1 ovarian cancer cells. Taken together, these results suggest that E2 and these two EDCs may mediate cancer cell proliferation by inhibiting TGF-${\beta}$ signaling via the downregulation of TGF-${\beta}$ R2 and the upregulation of c-myc oncogene. In addition, it can be inferred that these EDCs have the possibility of tumorigenesis in estrogen-responsive organs by certainly representing estrogenic effect in inhibiting TGF-${\beta}$ signaling.
에스트로젠을 처리한 송사리의 간으로부터 choriogenin vitellogenin estrogen receptor의 발현량을 전사수준에서 Real-time을 사용하여 정량.비교하였다. 시험어종으로는 부화 후 5개월 이상된 성숙한 수컷 송사리(Oryzias latipes)를(체중 약 250mg/마리)를 사용하여 17$\beta$-estradiol(25ppt, 50ppt, 100ppt)에 24시간 노출시켰다. Fluorescence dye는 choriogenin vitellogenin estrogen receptor의 경우 FAM (6-carboxyfluorescein)을 사용하였으며, $\beta$-actin의 경우는 VIC를 사용하였다. 프로브에 사용하는 quencher dye는 TAMRA(6-carboxy-N',N',N',N'-tetramethyl rhodamine)을 사용하였다. Internal control로 사용된 $\beta$-actin은 17$\beta$-estradiol의 농도에 상관 없이 0~10pM 범위에서 일정하게 발현됨을 보여주었다. vitellogenin choriogenin L 및 choriogenin H는 17$\beta$-estradiol의 농도에 의존하여 발현이 증가되는 용량-반응양상(Dose-dependent)을 나타내었다. 반면, estrogen receptor는 모든 처리군에서 $10^{-2}$pM 정도로 발혐됨에 따라 본 시험농도의 17$\beta$-estradiol에 의해서는 거의 유도발현이 되지 않음을 보여주었다. choriogenin L, choriogenin H, vitellogenin I 및 estrogen receptor 발현감수성을 비교한 결과, 25ppt 및 50ppt의 17$\beta$-esoadiol 농도에서는 ChgL > ChgH > VTG I >ER의 순으로 감수성이 높았으며, 100ppt 노출에서는 ChgL > VTG I > Chg H > ER의 순으로 감수성이 높게 나타났다. 결론적으로 choriogenin이 에스트로젠물질에 의한 가장 민감한 생체지표임을 알 수 있었다.
The purpose of this study is to investigate effects of White Ginseng-Ejung-tang (EG) and Red Ginseng-Ejung-tang (ER) water extract on production of various cytokines such as interleukin (IL)-21, IL-25, IL-$28{\beta}$, erythropoietin (EPO), Exodus-2, monocyte chemotactic protein (MCP)-5, macrophage inflammatory protein (MIP)-$3{\alpha}$, MIP-$3{\beta}$, Fractalkine, and TARC in RAW 264.7 mouse macrophages stimulated by lipopolysaccharide (LPS). Levels of cytokines were measured by High-throughput multiplex bead array cytokine assay based on xMAP (multi-analyte profiling beads) technology. ER significantly decreased levels of IL-21, IL-25, IL-$28{\beta}$, EPO, Exodus-2, MCP-5, MIP-$3{\alpha}$, MIP-$3{\beta}$, TARC, and fractalkine for 24 h incubation at the oncentrations of 25 and 100 ${\mu}g/mL$ in LPS-induced RAW 264.7 (P < 0.05). But EG did not show any significant effect. These results suggest that ER has anti-inflammtory property related with its inhibition on the production of IL-21, IL-25, IL-$28{\beta}$, and chemokines such as EPO, MCP-5, MIP-$3{\alpha}$, MIP-$3{\beta}$, Fractalkine, Exodus-2, and TARC in LPS-induced macrophages.
Estrogen-induced proliferation in estrogen receptor (ER)-positive breast cancer cells is primarily mediated through two distinct intracellular receptors, $ER{\alpha}$ and $ER{\beta}$. Although tumor necrosis factor alpha ($TNF{\alpha}$) and $E2/ER{\alpha}$ are known to exert opposing effects on cell proliferation in MCF-7 cells, the mechanism by which $TNF{\alpha}$ antagonizes $E2/ER{\alpha}$-mediated cell proliferation is not well understood. The present study suggests that reduced cell survival in response to $TNF{\alpha}$ treatment in MCF-7 cells may be associated with the down-regulation of $ER{\alpha}$ protein. The decrease in $ER{\alpha}$ protein level was accompanied by an inhibition of $ER{\alpha}$ gene transcription. Cell viability was decreased synergistically by the combined treatment with $ER{\alpha}$-siRNA and $TNF{\alpha}$. Furthermore, pretreatment of cells with the PI3-kinase (PI3K)/ Akt inhibitor, LY294002, markedly enhanced $TNF{\alpha}$-induced down-regulation of the $ER{\alpha}$ protein, suggesting that the PI3K/Akt pathway might be involved in control of the $ER{\alpha}$ level. Moreover, down-regulation of $ER{\alpha}$ by $TNF{\alpha}$ was not inhibited in cells that were pretreated with the proteasome inhibitors, MG132 and MG152, which suggests that proteasome-dependent proteolysis does not significantly influence $TNF{\alpha}$-induced down-regulation of $ER{\alpha}$ protein. In contrast, the effect of the PI3K/Akt inhibitor on $ER{\alpha}$ was blocked in cells that were treated with LY294002 in the presence of the proteasome inhibitors. Collectively, our findings show that the $TNF{\alpha}$ may partly regulate the growth of MCF-7 breast cancer cells through the down-regulation of $ER{\alpha}$ expression, which is primarily mediated by a PI3K/Akt signaling.
Larrea nitida is a plant that belongs to the Zygophyllaceae family and is widely used in South America to treat inflammatory diseases, tumors and menstrual pain. However, its pharmacological activity remains unclear. In this study we evaluated the property of selective estrogen receptor modulator (SERM) of Larrea nitida extracts (LNE) as a phytoestrogen that can mimic, modulate or disrupt the actions of endogenous estrogens, depending on the tissue and relative amount of other SERMs. To investigate the property of SERM of LNE, we performed MCF-7 cell proliferation assays, estrogen response element (ERE)-luciferase reporter gene assay, human estrogen receptor (hER) binding assays and in vivo uterotrophic assay. To gain insight into the active principles, we performed a bioassay-guided analysis of LNE employing solvents of various polarities and using classical column chromatography, which yielded 16 fractions (LNs). LNE showed high binding affinities for $hER{\alpha}$ and $hER{\beta}$ with $IC_{50}$ values of $1.20{\times}10^{-7}$ g/ml and $1.00{\times}10^{-7}$ g/ml, respectively. LNE induced $17{\beta}$-estradiol (E2)-induced MCF-7 cell proliferation, however, it reduced the proliferation in the presence of E2. Furthermore, LNE had an atrophic effect in the uterus of immature rats through reducing the expression level of progesterone receptor (PR) proteins. LN08 and LN10 had more potent affinities for binding on $hER{\alpha}$ and ${\beta}$ than other fractions. Our results indicate that LNE had higher binding affinities for $hER{\beta}$ than $hER{\alpha}$, and showed SERM properties in MCF-7 breast cancer cells and the rat uterus. LNE may be useful for the treatment of estrogen-related conditions, such as female cancers and menopause.
$CdGaInS_4$ and $CdGaInS_4:Er^{3+}$ single crystals crystallized in the rhombohedral(hexagonal) structure. with lattice constants $a=3.913{\AA},\;c=37.245{\AA}$ for $CdGaInS_4$, and $a=3.899{\AA}$ and $c=36.970{\AA}$ for $CdGaInS_4:Er^{3+}$. The optical absorption measured near the fundamental band edge showed that the optical energy band structure of these compounds had a direct and indirect band gap. the direct and indirect energy gaps are found to be 2.771 and 2.503 eV for $CdGaInS_4$, and 2.665 and 2.479 eV for $CdGaInS_4:Er^{3+}$ at 10 K. The temperature dependence of the optical energy gap was well represented by the Varshni equation. In $CdGaInS_4$, the values of ${\alpha},\;{\beta}$ of the direct and the indirect energy gap were found to be $7.57{\times}10^{-4}eV/K$. $6.53{\times}10^{-4}eV/K$ and 240K. 197K. and the values of ${\alpha}$ and ${\beta}$ of the direct and the indirect energy gap in the $CdGaInS_4:Er^{3+}$ were given by $8.28{\times}10^{-4}eV/K,\;2.08{\times}10^{-4}eV/K$ and 425 K, 283 K, respectively.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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