Park, Joon-Sang;Lee, Bum-Young;Chung, Soo-Il;Min, Mi-Kyung
The Journal of Korean Society of Virology
/
v.27
no.1
/
pp.9-17
/
1997
Hepatitis C virus (HCV) E2 protein is known to be one of putative envelope proteins. To develop a sensitive detection method for HCV infected tissues and cells, monoclonal antibodys (MAbs) to the E2 protein of HCV were prepared from mice immunized with recombinant baculovirus-expressing E2 protein (Bac-E2). Several hybridoma clones secreting various levels of MAb were isolated and isotypes of these MAb were determined. One clone (L.2.3.3) was used for ascites production and the E2-MAb was purified and characterized. The L.2.3.3 reacted well with both Bac-E2 and E. coli expressed glutathione-S-transferase-E2 (GST-E2) fusion proteins. Using HCV patient sera, E2 envelope protein was found to be localized in the cell membrane boundary both in CHO cells and insect cells which express HCV E2 protein. Similar result was obtained when same cells were treated with the MAb L.2.3.3. These results demonstrated that Bac-E2 protein is capable of eliciting high titer antibody production in mice.
Yang, Zhaoshou;Lee, Jihoo;Ahn, Hye-Jin;Chong, Chom-Kyu;Dias, Ronaldo F.;Nam, Ho-Woo
Parasites, Hosts and Diseases
/
v.54
no.2
/
pp.239-241
/
2016
Chikungunya virus (CHIKV), a tropical pathogen, has re-emerged and has massive outbreaks abruptly all over the world. Containing many dominant epitopes, the envelope E2 protein of CHIKV has been explored for the vaccination or diagnosis. In the present study, the antigenicity of a recombinant expressed intrinsically disorder domain (IUD) of E2 was tested for the detection of the antibody against CHIKV through western blot method. The gene of the IUD of E2 was inserted into 2 different vectors and expressed as recombinant GST-E2 and recombinant MBP-E2 fusion protein, respectively. Two kinds of fusion proteins were tested with 30 CHIKV patient sera and 30 normal sera, respectively. Both proteins were detected by 25 patients sera (83.3%) and 1 normal serum (3.3%). This test showed a relatively high sensitivity and very high specificity of the recombinant E2 proteins to be used as diagnostic antigens against CHIKV infection.
Hog cholera virus(HCV) was purified from virus infected Bovine kidney cells. From this virus, total protein was analyzed by SDS-PAGE gel electrophoresis and about 55 kDa band of E2 envelope protein was detected. The viral RNA was purified and E2 cDNA was amplified by RT-PCR. E2 cDNA fragment was cloned to PCRII-TOPO cloning vector and named pE2. The analysis of nucleotide sequence showed that this E2 cDNA fragment inserted into pE2 was 1191 nucleotides long and coded 397 amino acids.
Jaber, Abdullah All;Chowdhury, Zeshan Mahmud;Bhattacharjee, Arittra;Mourin, Muntahi;Keya, Chaman Ara;Bhuyan, Zaied Ahmed
Genomics & Informatics
/
v.19
no.4
/
pp.48.1-48.10
/
2021
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) encodes small envelope protein (E) that plays a major role in viral assembly, release, pathogenesis, and host inflammation. Previous studies demonstrated that pyrazine ring containing amiloride analogs inhibit this protein in different types of coronavirus including SARS-CoV-1 small envelope protein E (SARS-CoV-1 E). SARS-CoV-1 E has 93.42% sequence identity with SARS-CoV-2 E and shared a conserved domain NS3/small envelope protein (NS3_envE). Amiloride analog hexamethylene amiloride (HMA) can inhibit SARS-CoV-1 E. Therefore, we performed molecular docking and dynamics simulations to explore whether amiloride analogs are effective in inhibiting SARS-CoV-2 E. To do so, SARS-CoV-1 E and SARS-CoV-2 E proteins were taken as receptors while HMA and 3-amino-5-(azepan-1-yl)-N-(diaminomethylidene)-6-pyrimidin-5-ylpyrazine-2-carboxamide (3A5NP2C) were selected as ligands. Molecular docking simulation showed higher binding affinity scores of HMA and 3A5NP2C for SARS-CoV-2 E than SARS-CoV-1 E. Moreover, HMA and 3A5NP2C engaged more amino acids in SARS-CoV-2 E. Molecular dynamics simulation for 1 ㎲ (1,000 ns) revealed that these ligands could alter the native structure of the proteins and their flexibility. Our study suggests that suitable amiloride analogs might yield a prospective drug against coronavirus disease 2019.
Recent genome comparisons of E. coli B and K-12 strains have indicated that the makeup of the cell envelopes in these two strains is quite different. Therefore, we analyzed and compared the envelope proteomes of E. coli BL21(DE3) and MG1655. A total of 165 protein spots, including 62 nonredundant proteins, were unambiguously identified by two-dimensional gel electrophoresis and mass spectrometry. Of these, 43 proteins were conserved between the two strains, whereas 4 and 16 strain-specific proteins were identified only in E. coli BL21(DE3) and MG1655, respectively. Additionally, 24 proteins showed more than 2-fold differences in intensities between the B and K-12 strains. The reference envelope proteome maps showed that E. coli envelope mainly contained channel proteins and lipoproteins. Interesting proteomic observations between the two strains were as follows: (i) B produced more OmpF porin with a larger pore size than K-12, indicating an increase in the membrane permeability; (ii) B produced higher amounts of lipoproteins, which facilitates the assembly of outer membrane ${\beta}$-barrel proteins; and (iii) motility- (FliC) and chemotaxis-related proteins (CheA and CheW) were detected only in K-12, which showed that E. coli B is restricted with regard to migration under unfavorable conditions. These differences may influence the permeability and integrity of the cell envelope, showing that E. coli B may be more susceptible than K-12 to certain stress conditions. Thus, these findings suggest that E. coli K-12 and its derivatives will be more favorable strains in certain biotechnological applications, such as cell surface display or membrane engineering studies.
Proceedings of the Microbiological Society of Korea Conference
/
2000.10a
/
pp.78-82
/
2000
The AIDS epidemic continues unabated in many part of the world. After near two decades, no vaccine is available to combat the spread of this deadly disease. Much of the HIV -1 vaccine effort during the past decade has focused on the viral envelope glycoprotein, largely because it is the only protein that can elicit neutralizing antibodies (Nabs). Eliciting broadly cross-reactive Nabs has been a primary goal. The intrinsic genetic diversity of the viral envelope, however, has been one of the major impediments in vaccine development. We have recently completed a comprehensive study examining whether it is possible to elicit broadly acting Nabs by immunizing monkeys with mixtures of envelope proteins from multiple HIV -1 isolates. We compared the humoral immune responses elicited by vaccination with either single or multiple envelope proteins and evaluated the importance of humoral and non-humoral immune response in protection against a challenge virus with a homologous or heterologous envelope protein. Our results show that (1) Nab is the correlate of sterilizing immunity, (2) Nabs against primary HIV -1 isolates can be elicited by the live vector-prime/protein boost approach, and (3) polyvalent envelope vaccines elicit broader Nab response than monovalent vaccines. Nonetheless, our findings clearly indicate that the increased breadth of Nab response is by and large limited to strains included in the vaccine mixture and does not extend to heterologous non-vaccine strains. Our study strongly demonstrates how difficult it may be to elicit broadly reactive Nabs using envelope proteins and sadly predicts a similar fate for many of the vaccine candidates currently being evaluated in clinical trials. We have started to evaluate other vaccine candidates (e.g. genetically modified envelope proteins) that might elicit broadly reactive Nabs. We are also exploring other vaccine strategies to elicit potent cytotoxic T lymphocyte responses. Preliminary results from some of these experiments will be discussed.
Kim, Yeong Hoon;Lee, Jihoo;Kim, Young-Eun;Chong, Chom-Kyu;Pinchemel, Yanaihara;Reisdorfer, Francis;Coelho, Joyce Brito;Dias, Ronaldo Ferreira;Bae, Pan Kee;Gusmao, Zuinara Pereira Maia;Ahn, Hye-Jin;Nam, Ho-Woo
Parasites, Hosts and Diseases
/
v.56
no.1
/
pp.61-70
/
2018
We developed a Rapid Diagnostic Test (RDT) kit for detecting IgG/IgM antibodies against Zika virus (ZIKV) using monoclonal antibodies to the envelope (E) and non-structural protein 1 (NS1) of ZIKV. These proteins were produced using baculovirus expression vector with Sf9 cells. Monoclonal antibodies J2G7 to NS1 and J5E1 to E protein were selected and conjugated with colloidal gold to produce the Zika IgG/IgM RDT kit (Zika RDT). Comparisons with ELISA, plaque reduction neutralization test (PRNT), and PCR were done to investigate the analytical sensitivity of Zika RDT, which resulted in 100% identical results. Sensitivity and specificity of Zika RDT in a field test was determined using positive and negative samples from Brazil and Korea. The diagnostic accuracy of Zika RDT was fairly high; sensitivity and specificity for IgG was 99.0 and 99.3%, respectively, while for IgM it was 96.7 and 98.7%, respectively. Cross reaction with dengue virus was evaluated using anti-Dengue Mixed Titer Performance Panel (PVD201), in which the Zika RDT showed cross-reactions with DENV in 16.7% and 5.6% in IgG and IgM, respectively. Cross reactions were not observed with West Nile, yellow fever, and hepatitis C virus infected sera. Zika RDT kit is very simple to use, rapid to assay, and very sensitive, and highly specific. Therefore, it would serve as a choice of method for point-of-care diagnosis and large scale surveys of ZIKV infection under clinical or field conditions worldwide in endemic areas.
Hepatitis C virus (HCV) is a causal agent of the chronic liver infection. To understand HCV morphogenesis, we studied the assembly of HCV structural proteins in insect cells. We constructed recombinant baculovirus expression vectors consisting of either HCV core alone, core-E1, or core-E1-E2. These structural proteins were expressed in insect cells and were examined to assemble into particles. Neither core-E1 nor core-E1-E2 was capable of assembling into virus-like particles (VLPs). It was surprising that the core protein alone was assembled into core-like particles. These particles were released into the culture medium as early as 2 days after infection. In our system, HCV structural proteins including envelope proteins did not assemble into VLPs. Instead, the core protein itself has the intrinsic capacity to assemble into amorphous core-like particles. Furthermore, released core particles were associated with HCV RNA, indicating that core proteins were assembled into nucleocapsids. These results suggest that HCV may utilize a unique core release mechanism to evade the hosts defense mechanism, thus contributing to the persistence of HCV infection.
The truncated $E1_{192-283}$ and $E2_{384-649}$ genes of hepatitis C virus (HCV) linked to the gene for glutathione S-transferase (GST) were constructed and their expressions were analyzed. The $GST-E1_{192-283}$ fusion gene overexpressed the fusion protein in E. coli as a soluble form, while the $GST-E1_{192-383}$ plasmid did not express expected fusion protein. The purified $GST-E1_{192-283}$ fusion protein was efficiently cleaved by thrombin. More than 90% pure, HCV $E1_{192-283}$ protein was obtained by GST-agarose chromatography. The truncated $GST-E2_{384-649}$ fusion gene expressed the fusion protein mainly as an insoluble form, whereas the $GST-E2_{384-740}$ did not express the fusion protein. The truncated $GST-E1_{182-283}$ and $GST-E2_{384-649}$ fusion proteins reacted specifically with an HCV patient serum. In addition, mice immunized with either the purified $E1_{192-283}$ or $GST-E2_{384-649}$ proteins generated specific antibodies to each antigen. The results suggested that hydrophobic carboxyl portions of the E1 and E2 proteins might affect expression levels as well as the solubility of each fusion protein in bacteria. Also, the truncated E1 protein with Tyr-192 to Ser-283 contained antigenic epitope(s) which could be specifically recognized by an HCV patient serum.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.