• 한국해양생명과학회지
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• 제1권2호
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• pp.88-94
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• 2016

Determining the infection history of living organisms is essential for understanding the evolution of infection agents with their host, particularly for key aspects such as immunity. Viruses, which can spread between individuals and often cause disease, have been widely examined. The increasing availability of fish genome sequences has provided specific insights into the diversity and host distribution of retroviruses in fish. The shortspine spurdog (Squalus mitsukurii) is an important elasmobranch species; this medium-sized dogfish typically lives at depths of 100~500 m. However, the retroviral envelope polyprotein in dogfish has not been examined. Thus, the aim of the present study was to identify and analyze the retroviral envelope polyprotein in various tissues of dogfish. The 1334-base pair full-length novel cDNA of dogfish envelope polyprotein (dEnv) was obtained by 3' and 5'-rapid amplification of cDNA end analysis from S. mitsukurii. The open reading frame showed a complete coding sequence of 815 base pairs with a deduced peptide sequence of 183 amino acids that exhibited 34~50% identity with other fish and bird species. It was also expressed according to reverse transcription and real-time polymerase chain reaction in the kidney, liver, intestine, and lung, but not in the gill. This distribution can be assessed by identifying and analyzing endogenous retroviruses in fish, which consists of three main genes: gag, pol and env. Dogfish envelope polyprotein sequence is likely important in evolution and induces rearrangements, altering the regulatory and coding sequences. This is the first report of the identification and molecular characterization of retroviral envelope polyprotein in various tissues of S. mitsukurii.

• 한국수산과학회지
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• 제49권4호
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• pp.493-498
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• 2016

Squalus acanthias has been considered the valid scientific name for piked dogfish by many taxonomists, although others recognize two valid species, Squalus suckleyi and S. acanthias, based on differences in the numbers of precaudal vertebrae and their distribution. We compared Korean piked dogfish with S. acanthias from New Zealand using morphological and molecular methods to elucidate the taxonomy. The Korean piked dogfish was distinguished from S. acanthias from New Zealand by the number of precaudal vertebrae (70-75 in the former vs. 77-80 in the latter) and 540 base pairs in the mitochondrial DNA cytochrome c oxidase subunit I sequence (genetic distance: 0.007-0.013). Therefore, we suggest that the scientific name of the Korean piked dogfish be changed from S. acanthias to S. suckleyi.

• 수산해양기술연구
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• 제50권3호
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• pp.361-367
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• 2014

The aims of this study are to access the status and problems and draft possible solutions of Korean trawl fishery in New Zealand sea. The main target fish species for Korean trawlers in this sea were barracouta, blue mackerel, hake, hoki, jack mackerel, ling, oreo, orange roughy, southern blue whiting, spiny dogfish, squid and silver warehou. The Korean trawl fishery are suffering from a supply of seaman, continuous increasing coast of the counter partner, repair of vessel and seaman supply. It may be useful for getting over these difficulties to build a new trawler with a automatic operation system.

• 한국해양생명과학회지
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• 제3권1호
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• pp.1-8
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• 2018

Myosin is considered as the vital motor protein in vertebrates and invertebrates. Our present study was conducted to decipher the occurrence of myosin in dog fish (Squalus mitsukurii). We isolated one clone containing 979 bp cDNA sequence, which consisted of a complete coding sequence of 453 bp and a deduced amino acid sequence of 150 amino acids from the open reading frame with molecular weight, isoelectric point and aliphatic index are 16.72 Kda, 4.49 and 78.00, respectively. It contained 428 bp long 3' UTR with single potential polyadenylation signals (AATAAA). The predicted EF CA²⁺ binding domains were identified in residue 6-41, 83-118 and 133-150. A BLAST search indicates this protein exhibits a strong similarity to whale shark (Rhincodon typus) MLC3 (91% identical) and also house mouse (Mus musculus) MLC isoform 3f (81% identical). Phylogenetic analysis revealed that this protein is a MLC 3 isoform like protein. This protein also demonstrates highly conserved region with other myosin proteins. Homology modeling of S. mitsukuri was performed using crystal structure of Gallus gallus skeletal muscle myosin II based on high similarity. Reverse transcription-polymerase chain reaction (PCR), quantitative PCR results exhibits dogfish myosin protein is highly expressed in muscle tissue.

• 분석과학
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• 제16권2호
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• pp.134-142
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• 2003

LC-ICP-MS를 이용한 어류중 비소의 종분화 분석을 위해 microwave-assisted extraction과 sonication extraction 방법을 비교하였다. Ultrasonic nebulizer와 cross flow nebulizer를 사용한 비소종들의 검출한계는 유사한 결과를 보였다. 분석된 비소 종들은 arsenobetaine (AsB), arsenite [As(III)], dimethylarsine acid (DMA), monomethylarsonic acid (MMA), arsenate [As(v)] 와 phenylarsonic acid (PAA) 이다. 두 가지 방법은 NRCC (National Research Council of Canada)의 표준물질인 DORM-2를 50% 메탄올로 추출하였다. arsenobetaine의 경우, 두 방법 모두 5% 이하의 상대표준편차와 82% 이상의 추출효율을 보였다. Arsenobetaine은 microwave assisted extraction 방법에서 $14.18{\pm}0.42mg\;kg^{-1}$을 보였고 sonication extraction 방법에서는 $13.54 {\pm}0.84mg\;kg^{-1}$을 보였다. dimethylarsine acid (DMA)의 경우 각각 $0.45{\pm}0.06mg\;kg^{-1}$과 $0.44{\pm}0.06mg\;kg^{-1}$를 보였다.

• 해양환경안전학회지
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• 제15권1호
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• pp.11-15
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• 2009

이산화탄소($CO_2$) 해양격리처리 방안의 실효성을 검토하기 위해서는 해양에 처리된 $CO_2$가 해양생태계 및 해양생물에 미칠 수 있는 영향에 대해서 광범위하게 정보를 축적할 필요가 있다. 본 연구에서는 두족류인 참문어 Octopus vulgaris를 대상으로 고농도 $CO_2$ 환경(1, 2, 3%-$CO_2$)에서의 폐사율 및 1%-$CO_2$ 환경에서의 생리학적 반응에 대해서 조사하였다. 참문어는 혈액채취를 위하여 복부대동맥에 케뉴레이션을 행한 후 호흡실에서 회복시켰다. 회복된 개체에 대하여 헤모림프의 산염기 조절인자에 대한 측정을 행하였다. 참문어는 3%-$CO_2$ 환경에서 72시간 안에 100% 폐사하였다. 헤모림프의 pH는 1%-$CO_2$ 노출 30분 후 유의하게 감소하였으나 실험종료 때까지 회복되지 않았으며, $[HCO_3^-]$는 $CO_2$ 노출 후 유의하게 증가하여 8시간에 7.8 mM를 나타내었으나 그 후 점차 감소하는 경향이었다. 헤모림프 이온$([Cl^-],\;[Na^+],\;[K^+])$들은 유의한 변화를 보이지 않았다. 본 연구 결과 참문어는 방어, 넙치와 같은 경골어류 및 별상어와 같은 판새류보다 $CO_2$에 민감한 것으로 사료된다.

• 한국식품과학회지
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• 제42권4호
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• pp.383-389
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• 2010

심해성 어류 등에 대한 메틸수은 기준규격 설정에 따른 사후 관리 차원의 모니터링을 실시하였다. 본 연구에 사용된 어종은 귀상어, 흑기흉상어, 곱상어, 청새리상어, 악상어, 적어, 은민대 및 체장메기 등 총 492건을 수거하여 메틸수은 함량을 조사하였다. 메틸수은 분석을 위한 분석법 타당성을 검토한 결과 GC-${\mu}ECD$의 검출한계와 정량한계는 0.002 mg/kg과 0.005 mg/kg으로 나타났으며 메틸수은의 검량선은 상관계수가 0.9992로 우수한 직선성을 보였고, 회수율은 84.2-98.5%(평균 93.4%)로 나타났다. 심해성 어류의 메틸수은 함량은 각 어종 별로 유의적인 차이가 있었으며, 메틸수은 함량[최소값-최대값(평균$\pm$표준편차), 단위: mg/kg]은 귀상어 0.157-2.009($\0.546{pm}0.311$), 청새리상어 0.211-0.878($0.501{\pm}0.154$) 및 곱상어 0.121-0.993($0.482{\pm}0.189$) 등에서 높게 나타났으며, 악상어 0.243-0.658($0.397{\pm}0.090$), 흑기흉상어 0.074-1.958($0.353{\pm}0.418$), 은민대구 0.038-0.807($0.302{\pm}0.201$) 및 적어 0.099-0.511($0.300{\pm}0.094$) 등에서는 낮은 것으로 나타났고, 체장메기의 경우 0.037-0.133($0.067{\pm}0.016$)으로 나타나 조사된 어종 중유의적으로 가장 낮은 함량을 나타내었다. 본 연구에서 조사된 심해성 어류 중 메틸수은 함량의 노출량 평가를 위해 JECFA의 PTWI와 비교 검토한 결과 상어류 0.7%, 은민대구 1.1% 및 체장 메기 0.3% 수준으로 나타났다. 또한 극단적인 노출량 평가를 위해서 어종별 메틸수은 최대 함량을 이용하여 산출한 결과도 상어류 2.9%, 은민대구 2.9% 및 체장메기 0.6% 수준으로 나타나 심해성 어류의 섭취로 인한 메틸수은 노출량은 안전한 수준인 것으로 판단된다.