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Bacillus stearothermophilus $\beta$-D-Xylosidase 유전자의 크로닝 및 Escherichia coli에서의 발현 (Molecular Cloning and Expression of Bacillus stearothermophilus $\beta$-D-Xylosidase Gene in E. coli)

  • 오세욱;박성수;최용진;박영인
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제20권2호
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    • pp.136-142
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    • 1992
  • 토양 분리균인 B.stearothermophilus chromosome의 유전자 은행으로부터 E.coli HB101 균주에 $\beta$-D-xylosidase 생산능력을 갖게하는 5.4Kb와 6.4Kb의 두 DNA 절편을 분리, pBR322에 크로닝하여 각각 pMG01과 pMG02의 재조합 플라스미드를 얻었다. 상기 두 B.stearothermophilus DNA 절편의 restriction map을 작성하고 이것을 기초로 하여 $\beta$-D-xylosidase 유전자인자의 위치를 확인함과 동시에 pUC18에 subcloning하여 각각 2.2kb와 1.0kb의 DNA 단편이 삽입된 $\beta$-D-xylosidase 양성의 pMG1와 pMG2를 분리하였다.

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한국산 담수어류(잉어과) 몇종의 핵형과 DNA 상대량에 관한 연구 (Studies on the Karyotypes and Comparative DNA Values in Several Korean Cyprinid Fishes)

  • Kang, Yung-Sun;Park, Eun-Ho
    • 한국동물학회지
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    • 제16권2호
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    • pp.97-108
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    • 1973
  • 한국산 담수어류 4종(잉어과)에 대한 염색체 및 DNA 상대량을 조사하여 아래와 같은 결과를 얻어 이들의 세포유전학적 특징을 계통학적인 면에서 고찰하였다. 1) 참마자(Hemibarbus longirostris) 및 누치 (H. labeo)의 염색체수는 2n=50으로써 그중 참마자는 7쌍의 metacentric (A그룹), 14쌍의 submeta와 subtelocentric(B 그룹) 그리고 acro 내지 telocentric 염색체(C그룹) 4쌍으로 구성되며 arm수 (AN)는 92였다. 누치의 핵형은 A, B 및 C 그룹이 각각 9, 11 그리고 5쌍으로써 AN은 90이된다. 2) 버들개(Moroco lagowskii) 및 버들치 (M. oxycephalus)의 염색체수는 역시 2n=50이었으며, 이들의 핵형도 다같이 A그룹이 6쌍, B그룹이 14쌍 그리고 5쌍의 C그룹으로 이루어져 있으며 AN은 90이었다. 3) 4종의 DNA상대량은 모두 붕어의 약 60%에 해당하였다.

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고려인삼 Chlorophyll a/b Binding Protein(Cab) 유전자의 동정 및 분자적인 특성분석 (Molecular Characterization of a cDNA Encoding Chlorophyll a/b Binding Protein (Cab) from Panax ginseng C. A. Meyer)

  • 인준교;이범수;윤재호;손화;김세영;양덕춘
    • 한국자원식물학회지
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    • 제18권3호
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    • pp.441-449
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    • 2005
  • 광계II(PSII)는 고등식물의 chloroplast에서 두 개의 광합성 반응중심 중의 하나이다. Chlorophyll a/b 광수확 복합체는 광계II를 위한 안테나 역할을 수행한다. 본 연구에서는 인삼의 잎조직을 제작한 cDNA library로부터 chlorophyll a/b-binding protein (Cab) 유전자를 분리하였다. 인삼 Cab유전자는 935 bp의 염기와 265개의 아미노산 잔기(pI 5.63)로 구성된 한 개의 ORF를 포함하고 있으며, 단백질의 분자량은 28.6 kDa으로 추정되었다. 인삼에서 분리한 Cab 유전자는 기존에 식물에서 보고된 유전자들과 유사성을 나타내었으며, 유사도는 $68-92\%$로 나타났다. 아미노산 서열을 비교하여 유연관계를 분석한 결과 인삼의 Cab 유전자는 비교된 P. persica (AAC34983), A.thaliana (AAD28771), G. hirsutum (CAA38025), G. max (AAL29886), V. radiata (AAF89205) 등과 동일한 그룹으로 분리되었다.

Activation Mechanism of Protein Kinase B by DNA-dependent Protein Kinase Involved in the DNA Repair System

  • Li, Yuwen;Piao, Longzhen;Yang, Keum-Jin;Shin, Sang-Hee;Shin, Eul-Soon;Park, Kyung-Ah;Byun, Hee-Sun;Won, Min-Ho;Choi, Byung-Lyul;Lee, Hyun-Ji;Kim, Young-Rae;Hong, Jang-Hee;Hur, Gang-Min;Kim, Jeong-Lan;Cho, Jae-Youl;Seok, Jeong-Ho;Park, Jong-Sun
    • Toxicological Research
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    • 제24권3호
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    • pp.175-182
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    • 2008
  • DNA-dependent protein kinase(DNA-PK) is involved in joining DNA double-strand breaks induced by ionizing radiation or V(D)J recombination and is activated by DNA ends and composed of a DNA binding subunit, Ku, and a catalytic subunit, DNA-PKcs. It has been suggested that DNA-PK might be $2^{nd}$ upstream kinase for protein kinase B(PKB). In this report, we showed that Ser473 phosphorylation in the hydrophobic-motif of PKB is blocked in DNA-PK knockout mouse embryonic fibroblast cells(MEFs) following insulin stimulation, while there is no effect on Ser473 phosphorylation in DNA-PK wild type MEF cells. The observation is further confirmed in human glioblastoma cells expressing a mutant form of DNA-PK(M059J) and a wild-type of DNA-PK(M059K), indicating that DNA-PK is indeed important for PKB activation. Furthermore, the treatment of cells with doxorubicin, DNA-damage inducing agent, leads to PKB phosphorylation on Ser473 in control MEF cells while there is no response in DNA-PK knockout MEF cells. Together, these results proposed that DNA-PK has a potential role in insulin signaling as well as DNA-repair signaling pathway.

Monothiolglycerol이 동결 융해 후 미니돼지 정자의 활성산소 억제, 미토콘드리아 활성 그리고 DNA Integrity에 미치는 영향 (Effect of Monothioglycerol on ROS Inhibition, Mitochondrial Activity, and DNA Integrity in Frozen-thawed Miniature Pig Sperm)

  • 박수정;김대영
    • 한국수정란이식학회지
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    • 제28권3호
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    • pp.265-271
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    • 2013
  • Cryopreservation and in vitro fertilization (IVF) protocols are important in genetic studies and applications to transgenic animals. Various studies about boar sperm cryopreservation have been studied for a long time. Those were about the use of extenders, the choice of sugars, the cooling and warming rates. The factors that influence the boar sperm are the dramatic changes in temperatures, osmotic and toxic stresses, and reactive oxygen species (ROS) generation. Among these factors, ROS generation is the main damage to DNA which is a principal genetic material and the most important for the practical applications. So we wondered whether ROS generation could be reduced. In previous study, monothioglycerol (MTG) was essential for the culture of embryo stem cells. Therefore we added MTG in the freezing extender based on lactose-egg yolk (LEY) with trehalose. For the assessment of the frozen-thawed sperm, we focused onmotility, membrane integrity and DNA damage. First, we used a computer-aided sperm analysis system for overall conditions of sperm such as motility and viability. Then we performed the sperm chromatin structure assay for DNA integrity and hypo-osmotic swelling test for membrane integrity. And our result showed the existence of MTG in the freezing extender caused less damage to DNA and higher motility in frozen-thawed boar sperm. Also we checked a relative antioxidant activity of MTG in modified Modena B extender. We concluded that this reagent can activate sperm mitochondria at MTG $0.2{\mu}M$, contribute to sperm motility and DNA integrity but there was no significant difference on membrane integrity. Also antioxidant activity of MTG in modified Modena B extender was proved.

Construction of CpG Motif-enriched DNA Vaccine Plasmids for Enhanced Early Immune Response

  • Park Young Seoub;Hwang Seung Ha;Choi Cha-Yong
    • Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
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    • 제10권1호
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    • pp.29-33
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    • 2005
  • A DNA vaccine methodology using eukaryote expression vectors to produce immunizing proteins in the vaccinated hosts is a novel approach to the development of vaccine and immuno-therapeutics, and it has achieved considerable success over several infectious diseases and various cancers. To further enhance its efficiency, attempts were made to develop novel plasmid vectors containing multiple immunostimulatory CpG motifs, for rapid and strong immune response. First, a 2.9 kb compact plasmid vector (pVAC), containing CMV promoter, polycloning site, BGH poly(A) terminator, ampicillin resistance gene and pBR322 origin was constructed. A pVAC-hEPO was also constructed, which contained a human erythropoietin gene, for evaluating the transfection efficiency of naked plasmid DNA both in vitro and in vivo. To examine the adjuvant effect of multi-CpG motifs on naked plasmid DNA, 22 and 44 enriched and unmethylated CpG motifs were introduced into pVAC to generate pVAC-ISS1 and pVAC-ISS2, respectively. $100{\mu}g$ of pSecTagB, pVAC, pVAC-ISS1 or pVAC-ISS2 were each injected intramuscularly into the tibilias anterior muscle of Balb/c mice. The level of interleukin-6 induced in the mice injected with pVAC-ISS1 and pVAC-ISS2 were significantly elevated after 12 hours, which were almost 2 and 2.5 times higher than that in the mice injected with pSecTagB, respectively. These results suggest that DNA vaccine plasmids with enriched CpG motifs can induce rapid secretion of interleukin-6 by lymphocytes. In conclusion, these vectors can contribute to the development of adjuvant-free DNA vaccinations against infectious diseases and various cancers.

Effect of Molecular Weights of Polyethyleneimine on the Polyplex Formation with Calf Thymus DNA

  • Cho, Tae-Sub;Jungho Han;Kim, Seog K.;Lee, Jae-Cheol
    • Macromolecular Research
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    • 제12권3호
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    • pp.276-281
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    • 2004
  • In this study we investigated the spectral properties, including electric absorption, circular and linear dichroism (CD and LD), and fluorescence emission, of DNA in a DNA-branched polyethyleneimine (BPEI) polyplex at various polymer molecular weights (M$\_$w/) and BPEI-amine-to-DNA-phosphate ratios (N/P ratios). All BPEIs exhibited a common N/P dependence in their absorption and CD spectra. At N/P ratios < 1.0, we observed some hyperchromism in the absorption spectrum, red-shifts in CD bands, and decreases in LD intensity and fluorescence intensity of intercalated ethidium. At intermediate N/P ratios, complete collapse of all spectra occurred. As the N/P ratio increased further, the polyplex dissolved in water. From its characteristic CD spectrum obtained under these conditions, we conclude that the DNA exists in a B-like form. The fluorescence and LD intensities never recovered even at high N/P ratios- which indicates that the dissolved polyplex possesses positive charges and the DNA in the polyplex is condensed despite its B-form CD spectrum. The N/P range in which the absorption and CD signals collapsed was wider when the BPEIs M$\_$w/ decreased. In the case where the BPEIs M$\_$w/ was 0.8 k, recovery of the absorption and CD spectral properties at a high N/P ratio was never achieved, which suggests that the molecular weight of the polymer plays an important role in its dissolution at a high N/P ratio.

출토 인골 DNA의 real-time PCR 정량에 의한 보존상태 평가 연구 - 부여 오수리 출토 인골을 중심으로 - (Evaluation of the preservation state of human skeletal remains using real-time PCR)

  • 권은실;조은민;김수훈;강소영
    • 보존과학연구
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    • 통권32호
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    • pp.171-183
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    • 2011
  • 본 연구는 충청남도 부여군 규암면 오수리 유적에서 발굴된 인골 4개체를 대상으로 조직학, 분자유전학, 골화학 분석 등 종합적인 연구를 통해 이들의 상관관계를 규명하고자 하였다. 실체현미경을 통해 인골 시료의 골조직 단면 구조를 관찰함으로써 각 시료의 조직학적 보존 상태를 단계별로 구분하였고, 잔존하는 단백질의 보존 상태는 콜라겐을 추출하여 수율을 측정함으로써 평가하였다. 또한 미토콘드리아 cytochrome b 유전자를 이용한 실시간 유전자 증폭법을 이용하여 각각의 인골 시료에 잔존하는 미토콘드리아 DNA의 상대적 보존량 및 복제수를 분석하였으며, 미토콘드리아 과변위부위의 염기서열을 동정하였다. 본 연구 결과 인골 시료의 조직학적 보존정도, 콜라겐 단백질의 잔존량, 미토콘드리아 DNA의 복제수는 상호 긍정적인 연관관계로 나타났다. 이 연구는 출토 인골의 생물 화학적 분석 가능성을 예측하기 위한 특성지표 연구의 중요자료로 활용 될 수 있을 것이다.

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Vitamin C가 방사선과 Aflatoxin B1을 처리한 흰쥐의 간세포에서 Aflatoxin B1-DNA Adduct 형성에 미치는 영향 (Effects of vitamin C on the formation of aflatoxin B1-DNA adduct in rat livers treated with radiation and aflatoxin B1)

  • 김소영;김한수;강진순
    • 한국식품저장유통학회지
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    • 제21권5호
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    • pp.747-756
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    • 2014
  • 본 연구는 흰쥐에게 $AFB_1$을 투여하거나 방사선과 $AFB_1$을 병합처리함으로 유발된 흰쥐의 간세포에서의 $AFB_1$-DNA 부가체의 형성과 세포의 산화적 손상에 대한 vitamin C의 효과를 조사하기 위하여 수행되었다. X-ray 조사는 실험기간 내 단 1회로 실험사육기간 1일에 조사 하였고 X-ray 조사 후 vitamin C를 투여하였으며 vitamin C 투여 1시간 후 $AFB_1$을 투여하였다. Vitamin C와 $AFB_1$은 모두 복강투여로 실험 사육 첫 일부터 1회 시작하여 3일에 한번씩, 5회 반복 투였으며 실험동물 사육기간은 총 15일로 하였다. ELISA에 의한 흰쥐의 혈청 내 $AFB_1$ 잔여 농도는 $AFB_1$ 단독 투여군에서 $5.17{\pm}0.34ng/mL$이었으나 여기에 vitamin C 혼합 투여군에서는 $3.23{\pm}0.76ng/ml$가 검출되었다. 간세포의 $AFB_1$-DNA adduct 농도는 $AFB_1$ 단독 투여군에서는 $9.38{\pm}0.41ng/mL$이었으며 2군에 vitamin C를 함께 투여한 3군에서는 $5.28{\pm}0.32ng/ml$로 나타나 2군에 비해 유의적으로(p<0.001) 44% 감소한 양상을 나타내었다. 한편 X선 조사와 $AFB_1$ 병합처리한 4군에 비해 4군에 vitamin C를 투여한 5군에서 혈청 내 $AFB_1$ 함량과 간세포의 $AFB_1$-DNA adduct 함량이 다소 감소하였으나 유의적인 차이는 없었다. 또한 면역조직화학적 관찰에서 $AFB_1$ 단독 투여군에서는 중심정맥과 혈관주변에서 $AFB_1$ 축적이 관찰되었는데 이러한 현상은 vitamin C를 혼합 투여함으로써 중심정맥과 혈관 주변의 갈색 침전이 현저하게 감소한 것으로 나타났다. 그러나 X선 조사와 $AFB_1$ 병합 처리한 군에서는 그 정도가 약했다.

산수유 클로로포름 추출물에 의한 B16/F10 melanoma세포의 증식억제효과 (Effect of Proliferation Inhibition on B16/F10 Melanoma Cell by Chloroform Extract from Cornis fructus)

  • 최원형;천현자;백승화;우원홍
    • Biomolecules & Therapeutics
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    • 제11권2호
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    • pp.151-156
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    • 2003
  • Cornis fructus have various biological effects and major chemical components have been tannins, saponins, ursolic acids, gallic acids, linoleic acids, morronisides, cornins and loganins. The main aim of the present study is measurment the effect of chloroform extract from Cornis fructus on proliferation inhibition and Cell death. Cells were cultured in the presence of chloroform extracts from Cornis fructus for 48 h. after 48h treatment of B16/F10 melanoma cells with chloroform extracts, the cells were observed a dose-dependent inhibitions of cell viability with cell death in their proliferation. the cells were estimated cell viability, cell number, total DNA fragmentation and chromatin condensation in a dose-dependent manner. It also caused cell death as measured by cell morphology, DNA fragmentation and nucleus chromatin condensation. therefore, these results suggest that chloroform extracts from C. fructus is inhibitory proliferation and is related to cell death in this cells.