• Title/Summary/Keyword: DnaB

Search Result 2,725, Processing Time 0.024 seconds

Histone Modifications During DNA Replication

  • Falbo, Karina B.;Shen, Xuetong
    • Molecules and Cells
    • /
    • 제28권3호
    • /
    • pp.149-154
    • /
    • 2009
  • Faithful and accurate replication of the DNA molecule is essential for eukaryote organisms. Nonetheless, in the last few years it has become evident that inheritance of the chromatin states associated with different regions of the genome is as important as the faithful inheritance of the DNA sequence itself. Such chromatin states are determined by a multitude of factors that act to modify not only the DNA molecule, but also the histone proteins associated with it. For instance, histones can be posttranslationally modified, and it is well established that these posttranslational marks are involved in several essential nuclear processes such as transcription and DNA repair. However, recent evidence indicates that posttranslational modifications of histones might be relevant during DNA replication. Hence, the aim of this review is to describe the most recent publications related to the role of histone posttranslational modifications during DNA replication.

한국 동해안에서 서식하는 진주담치(Mytilus edulis)의 미토콘드리아 DNA 다형현상 (Motochondrial DNA Polymorphism of the Blue Mussel (Mytilus edulis) Species Complex on the East Coast of Korea)

  • 김익수;민병윤;윤명희;김도훈
    • 생명과학회지
    • /
    • 제9권3호
    • /
    • pp.262-267
    • /
    • 1999
  • Mitochondrial DNA (mtDNA) polymorphism of the blue mussel (Mytilus edulis) species complex sampled from the east coast of Korean was studied using a partial sequence of COIII gene (336 bp). Samples obtained from three localities on the east coast of Korea revealed four haplotypes with two clearly differentiated mitochondrial clades (termed clades B and E), separated by 4.2% of minimum sequence divergence. This pattern indicates no difference between east and south coasts of Korea. According to population genetic theory on evolutionary characteristics of mtDNA, we concluded that mtDNA introgression from M. edulis to M. gallprovincialis might be a source for mtDNA polymorphism found in mussels on the east coast of Korea.

  • PDF

잡초성벼의 superoxide dismutase cDNA cloning과 재배벼로의 형질전환 (Isolation of Superoxide Dismutase cDNAS from an Weedy Rice Variety and Transformation of a Cultivated Rice Variety)

  • 박상규;박종석;이승인;서석철;김병극;조윤래;서학수
    • 한국환경농학회지
    • /
    • 제21권2호
    • /
    • pp.156-161
    • /
    • 2002
  • 냉해나 한발등의 환경스트레스에 대해 저항성을 유발하는 유전자를 환경스트레스에 강한 잡초성벼로부터 선발하고 이들 유전자를 재배벼에 도입하여 도입유전자 산물의 과량 발현을 통해 냉해나 한발 등에 대한 저항성이 향상된 벼를 선발하고자 하였다. 잡초성벼인 Bhutan 14Ad로부터 냉해 및 한발 저항성 유전자로 알려진 superoxide dismutase (SOD) cDNA를 분리하고자 mRNA를 분리하고 이 분리된 mRNA를 이용해 reverse transcriptase PCR방법으로 SOD cDNA를 cloning 하였다. 그 결과 2종의 SOD cDNA가 cloning되어 SOD-A, SOD-B로 명명하였다. 이들 cDNA의 염기서열을 결정한 결과 이들은 아미노산 서열 상동성이 88.4%를 나타내었으며, SOD-A는 Oryza sativa 계열의 Cu/Zn SOD유전자인 GenBank accession No. L36320와 99.3% 동일하였으며, SOD-B는 accession No. D01000과 100% 동일하였다. 이들 SOD-A와 SOD-B cDNA를 재배벼인 낙동벼에 형질전환하여 형질전환체 벼를 선발하였으며, 이들 형질전환체 벼의 냉해저항성및 한발저항성 검정을 통해 저항성이 향상된 형질전환체 벼를 선발하고 있다.

Cloning and Characterization of cDNA for Korean Rockfish (Sebastes schlegeli ) Insulin-like Growth Factor-I

  • Kwon, Mi-Jin;Jo, Jae-Yoon;Nam, Taek-Jeong
    • 한국해양바이오학회지
    • /
    • 제1권2호
    • /
    • pp.119-125
    • /
    • 2006
  • 어류의 insulin-like growth factor-I (IGF-I)의 생화학적 작용기작을 연구하기 위하여 한국산 조피볼락의 IGF-I cDNA 유전자 cloning을 행하였다. 완전한 cDNA 유전자 염기서열은 PCR과 RACE 방법을 통하여 얻어진 DNA로부터 결과를 얻을수 있었다. 결정된 IGF-I의 염기서열은 flounder, chinook salmon, human IGF-I의 염기서열과 비교한 결과 각각 93.6%, 90.7%, 85.4%의 높은 상동성을 보였다. 생화학적으로 활성이 있는 재조합 IGF-I을 얻기 위하여 IGF-I의 B-C-A-D domain 부분을 PCR로 얻은 뒤 E. coli BL21(DE3)에 넣어 overexpression 시켰다. Ni-NTA colummn을 사용하여 순수한 재조합 단백질을 정제할수 있었다. 정제된 단백질은 SDS-PAGE 상에서 7 kDa의 단일 band를 보여 주었으며 [$^3H$]-thymidine 결합정도를 측정하는 방법으로 활성을 가지고 있음을 확인할수 있었다.

  • PDF

DNA 해프로트리와 유전적거리에 의한 가계족보의 계층화 (Genealogical Stratification by Genetic Distance and DNA Haplotrees)

  • 류광렬
    • 한국정보통신학회논문지
    • /
    • 제24권1호
    • /
    • pp.65-70
    • /
    • 2020
  • 본 논문은 유전자가계족보 작성을 위해 인체세포의 Y염색체와 X염색체의 DNA에서 해프로코드로 부터 해프로 그룹의 해프로트리, 유전적거리 및 전통가계족보를 결합하고 계층구조화한다. 적용지역은 충청지방으로 부계의 Y-DNA는 O그룹에서 O3a∗ 및 O2b∗ 그룹의 빈도가 높고, 모계의 mtDNA는 L3그룹의 D∗와 M∗그룹의 빈도가 비교적 높다. 유전자 거리 산정은 니의 표준유전적거리법을 적용한다. 실험결과 0.1는 바로 직계가족, 0.1에서 0.8은 근친이며, 1.0 이상은 친족으로 추정하기 어렵다. DNA의 해프로그룹과 해프로트리에 의해 STR은 친족 확인에 적합하고 SNP는 개인유전적식별이 정확하므로 한국전통 족보는 3가지 인수를 추가하므로 더 과학적인 계층화가 구현된다.

Efficient Induction of Th1-type Immune Responses to Hepatitis B Virus Antigens by DNA Prime-Adenovirus Boost

  • Lee, Chang-Geun;Yang, Se-Hwan;Park, Su-Hyung;Song, Man-Ki;Choi, So-Young;Sung, Young-Chul
    • IMMUNE NETWORK
    • /
    • 제5권1호
    • /
    • pp.1-10
    • /
    • 2005
  • Background: Chronic infection with hepatitis B virus (HBV) affects about 350 million people worldwide, which have a high risk of development of cirrhosis and hepatocellular carcinoma. Treatment of chronic HBV infection relies on IFN-${\alpha}$ or lamivudine. However, interferon-${\alpha}$ is effective in only about 30% of patients. Also, the occurrence of escape mutations limits the usage of lamivudine. Therefore, the development and evaluation of new compounds or approaches are urgent. Methods: We comparatively evaluated DNA and adenoviral vaccines expressing HBV antigens, either alone or in combined regimens, for their ability to elicit Th1-type immune responses in Balb / c mice which are believed to be suited to resolve HBV infection. The vaccines were tested with or without a genetically engineered IL-12 (mIL-12 N220L) which was shown to enhance sustained Th1-type immune responses in HCV E2 DNA vaccine. Results: Considering the Th1-type cytokine secretion and the IgG2a titers, the strongest Th1-type immune response was elicited by the DNA prime-adenovirus boost regimen in the presence of mIL-12 N220L. In addition, the codelivery of mIL-12 N220L modulated differentially the immune responses by different vaccination regimens. Conclusion: Our results suggest that the DNA prime-adenovirus boost regimen in the presence of mIL-12 N220L may be the best candidate for HBV vaccine therapy of the regimens tested in this study and will be worthwhile being evaluated in chronic HBV patients.

Naked Plasmid DNA를 이용한 빈혈 치료용 Direct Gene Transfer 시스템의 개발에 대한 연구 (Studies on Developing Direct Gene Transfer Based on Naked Plasmid DNA for Treating Anemia)

  • 박영섭;정동건;최차용
    • KSBB Journal
    • /
    • 제19권5호
    • /
    • pp.341-347
    • /
    • 2004
  • Several gene delivery therapies are being developed for treatment of serum protein deficiency. EPO is one of the most promising therapeutic agent for this treatment which is currently being investigated in depth. This study has the ultimate purpose of improving the gene delivery system for an increase of red blood cell production. A plasmid DNA was constructed smaller than other plasmids for an increase in penetration into animal cells, and two genes were cloned into each vector as a co-delivery system to express erythropoietin, and interluekin-3 or thrombopoietin, which can act on erythroid cell, thus activating hematopoiesis synergically. This co-delivery system has an advantage of decreasing the labour required for industrial production of DNA vaccine. A new plasmid vector, pVAC, in size 2.9 kb, was constructed with the essential parts from PUC 19 and pSectagB, which is much smaller than other plasmid vector and is the size of 2.9 kb. Co-delivery system was constituted by cloning human erythropoietin with each of human interluekin-3 gene or human thrombopoietin gene into both pVAC and pSectagB. As a result, the transfection efficiency of pVAC was higer than that of pSectagB in vitro, and hematocrit level of the mice injected with pVAC is higher than that of other mice. And co-delivery system, made of several plasmid DNAs, was expressed in vitro.

Lactobacillus plantarum Bacteriophage SC 921의 phage particle protein 및 genome의 특성 (Phage Particle Proteins and Genomic Characterization of the Lactobacillus plantarum Bacteriophage SC 921.)

  • 김재원;신영재;심영섭;유승구;윤성식
    • 한국미생물·생명공학회지
    • /
    • 제26권2호
    • /
    • pp.117-121
    • /
    • 1998
  • 김치로부터 분리한 Lactobacillus plantarum bacteriophage SC 921은 M.O.I가 0.2일 경우 용균효과가 빠르게 진행됨을 알 수 있었고, SDS-PAGE를 실시하여 phage particle protein을 조사해 본 결과 4개의 major protein으로 구성되어 있는데 이들은 각각 48, 34, 32, 29 kDa으로 구성되어 있다. Exo III로 30분간 반응시킨 후 S1 nuclease를 처리하여 DNA의 형태를 조사해 본 결과 intact DNA는 linear form의 double strand를 유전전달 물질로 가지고 있었다. 제한효소에 대한 절단 효과를 조사한 결과, Sma I에 대해서 1개, Xba I, Cla I, Kpn I, EcoRI에 대해서 각각 2, 4, 5, 6개의 절단부위를 가지고 있으며, Hind III에 대해서는 절단부위가 매우 많은 것을 알 수 있었다. Hind III를 이용하여 intact DNA의 genome size를 측정해본 결과 약 66.5 kbp정도였다. 위의 실험결과와 restriction enzyme mapping을 통해 기존에 알려진 bacteriophage B2와 비교해본 결과 숙주 균주는 같으나 단백질적인 구조나 유전전달물질로 본 구조는 서로 다름을 알 수 있었다.

  • PDF

Centromere Repeat DNA Originated from Brassica rapa is Detected in the Centromere Region of Raphanus sativus Chromosomes

  • Hwang, Yoon-Jung;Yu, Hee-Ju;Mun, Jeong-Hwan;Bok, Kwang;Park, Beom-Seok;Lim, Ki-Byung
    • 원예과학기술지
    • /
    • 제30권6호
    • /
    • pp.751-756
    • /
    • 2012
  • Fluorescence in situ hybridization (FISH) is a powerful tool for the detection of DNA sequences in the specific region of the chromosomes. As well as for the integrated physical mapping, FISH karyotype analysis has to be preceded. Karyotype of Raphanus sativus 'Wonkyo 10039' was analyzed by a dual-color FISH technique; using various repetitive DNA probes, including 5S rDNA, 45S rDNA, and centromere retrotransposon. The length of the somatic metaphase chromosome ranged from 1.35 to $2.06{\mu}m$ with a total length of $15.29{\mu}m$. The chromosome complements comprised of eight pairs of metacentrics and one pair of submetacentric. Bleached DAPI Band analysis revealed a heterochromatin region, covering 28.6% to 50.4% each chromosomes. 5S and 45S rDNA sequences were located on two and three pairs of chromosomes, respectively. The centromere retrotransposon of Brassica (CRB) is a major component in Brassica related species that has been maintained as a common centromere component. CRB signals were detected on the centromere and pericentromeric region of R. sativus 'Wonkyo 10039' and three basic Brassica species (B. rapa, B. nigra, and B. oleracea). These results will provide a valuable background for physical mapping and elucidation of the evolutionary relationship among the Brassica related species.

조류의 종 특이 구별을 위한 항체 유전자의 이용 (Practical Use of DNA Polymorphisms in the Avian Immunoglobulin Light Chain Constant Domain for Species-specific PCR)

  • 최진원;강석진;박명선;김진규;한재용
    • Journal of Animal Science and Technology
    • /
    • 제50권1호
    • /
    • pp.9-18
    • /
    • 2008
  • 본 연구에서는 조류에서 종 특이적인 DNA 염기서열변이를 검증하기 위하여 닭, 꿩, 칠면조, 메추리의 immunoglobulin light chain constant domain 유전자를 클로닝하여 DNA염기서열을 분석하였다. 종간에 구별이 가능한 DNA 염기서열변이가 위의 유전자에서 관찰되었다. PCR을 이용하여 종을 구별하기 위하여 종 사이에 특이적인 DNA 염기서열 부위에 한 쌍의 종 특이적인 프라이머를 제작하였다. 또한 비교실험을 위하여 이미 알려진 cytochrome b와 tapasin 유전자에서도 두 쌍의 종 특이적 프라이머를 제작하였다. PCR결과 세 쌍의 프라이머 모두 종 특이적으로 DNA를 증폭하였다. Immunoglobulin 유전자의 염기서열 변이를 이용한 종 특이적인 PCR 방법은 조류의 유전자원 보존을 위한 이종간 카이메라 연구에 유용하게 이용될 수 있을 것이다.