• Journal of Ecology and Environment
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• 제40권1호
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• pp.75-83
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• 2016

Background: In order to evaluate the effect of pH, known as a critical factor for shaping the biogeographical microbial patterns in the studies by others, on the bacterial diversity, we selected two sites in a similar geographical location (site 1; north latitude 35.3, longitude 127.8, site 2; north latitude 35.2, longitude 129.2) and compared their soil bacterial diversity between them. The mountain soil at site 1 (Jiri National Park) represented naturally acidic but almost pollution free (pH 5.2) and that at site 2 was neutral but exposed to the pollutants due to the suburban location of a big city (pH 7.7). Methods: Metagenomic DNAs from soil bacteria were extracted and amplified by PCR with 27F/518R primers and pyrosequenced using Roche 454 GS FLX Titanium. Results: Bacterial phyla retrieved from the soil at site 1 were more diverse than those at site 2, and their bacterial compositions were quite different: Almost half of the phyla at site 1 were Proteobacteria (49 %), and the remaining phyla were attributed to 10 other phyla. By contrast, in the soil at site 2, four main phyla (Actinobacteria, Bacteroidetes, Proteobacteria, and Cyanobacteria) composed 94 %; the remainder was attributed to two other phyla. Furthermore, when bacterial composition was examined on the order level, only two Burkholderiales and Rhizobiales were found at both sites. So depending on pH, the bacterial community in soil at site 1 differed from that at site 2, and although the acidic soil of site 1 represented a non-optimal pH for bacterial growth, the bacterial diversity, evenness, and richness at this site were higher than those found in the neutral pH soil at site 2. Conclusions: These results and the indices regarding diversity, richness, and evenness examined in this study indicate that pH alone might not play a main role for bacterial diversity in soil.

• 정보관리학회지
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• 제33권1호
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• pp.7-32
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• 2016

본 연구는 인용 정보와 주제범주 분류체계를 기반으로 한 기존 하향식 접근법과 달리 문헌에 출현한 단어정보를 기반으로 세부주제를 자동 추출하는 토픽 모델링을 사용하여 학제성을 측정하였다. JCR 2013의 Information & Library Science 주제범주에서 5년 영향력 지수 상위 20개 학술지의 최근 5년 동안의 논문 제목과 초록 텍스트를 분석대상으로 사용하였다. 학제성을 측정하기 위한 지수로 '분야적 다양성'을 나타내는 Shannon 엔트로피 지수와 Stirling 다양성 지수, '네트워크 응집성'을 나타내는 지수로는 토픽 네트워크의 평균 경로길이를 사용하였다. 계산된 다양성과 응집성 지수를 통해 학제성의 유형을 분류한 후 각 유형을 대표하는 학술지들의 토픽 네트워크를 비교하였다. 이를 통해 본 연구의 텍스트 기반 다양성 지수는 기존의 인용정보 기반 다양성 지수와 다른 양상을 보이고 있어 상호보완적으로 활용될 수 있으며, 다양성과 응집성을 모두 고려하여 분류된 각 학술지의 토픽 네트워크를 통해 개별 학술지가 다루는 세부주제의 특성과 연결 정도를 직관적으로 파악할 수 있었다. 이를 통해 토픽 모델링을 통한 텍스트 기반의 학제성 측정이 학술지의 학제성을 나타내는 데에 다양한 역할이 가능함을 확인하였다.

• 한국감성과학회:학술대회논문집
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• 한국감성과학회 2001년도 추계학술대회 논문집
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• pp.91-95
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• 2001

In this study, we estimated the behavior of the diversity of physiological responses under varied physical environmental factors by measuring variations of heart rate variability (HRV), an index of activity of cardiac autonomic control. Seven healthy young male adults consented and participated in the study. The environmental conditions consisted of thermal, lighting, and acoustic conditions. Two components of HRV were measured. one was the low frequency (LF) component of HRV, which provided a quantitative index of the sympathetic and parasympathetic (vagal) activities controlling the heart rate (HR). The other component measured was the high frequency (HF) component, which provided an index of the vagal tone. The percent contribution of physical environmental factors to the variations in HRV indices were calculated by ANOVA. The contribution of physical environmental factors to the variations in HR was higher than the contribution of HF and LF. However, the contribution of these factors was lower than the contribution related with individual difference in all indices. This result showed that the individual diversity of physiological responses is not a negligible quantity.

• Animal Systematics, Evolution and Diversity
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• 제27권2호
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• pp.151-158
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• 2011

Fish community structure in the Pyeongchanggang River was investigated from April to November 2009. About 900 individuals representing 24 species from eight families at six sites in the Pyeongchanggang River were collected. It was similar to the 2001's survey and it was less than 2006's survey. The Korean endemic species, Zacco koreanus was the most abundant, whereas subdominant species were native species, such as Pungtungia herzi, Zacco platypus, Rhynchocypris kumgangensis and Rhynchocypris oxycephalus. Three endangered species were collected at the sampling area, Acheilognathus signifier (relative abundance [RA] 0.9%), Pseudopungtungia tenuicorpa (RA 1.4%), and Cottus koreanus (RA 3.6%). One natural monument species, Hemibarbus mylodon, was included. According to the analysis of ecological indicator characteristics, the relative proportion of tolerant species was 6.3% (57 individuals), whereas the proportion of sensitive species was 65.9% (593 individuals). Species evenness, richness and diversity indices decreased gradually through the month from April to November during the study. Community indices in Pyeongchanggang River showed a high evenness index (J'>0.6), a low level of species richness (R<3.5) and a medium level of diversity (1.5

• 한국동물학회:학술대회논문집
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• 한국동물학회 1997년도 한국생물과학협회 학술발표대회
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• pp.157.1-157
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• 1997

No Abstract, See Full Text

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제19권7호
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• pp.938-942
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• 2006

Genetic diversity of Magra - a lustrous carpet wool breed of India, was investigated by means of 25 ovine microsatellite markers proposed by the Food and Agriculture Organization and the International Society for Animal Genetics (FAO-ISAG). All used microsatellites amplified well and exhibited polymorphisms. A wide range of genetic variability was observed as allele number from 3 (BM6506, OarCP20) to 10 (CSSM31), observed heterozygosity from 0.200 (BM6506) to 0.947 (OarHH35), expected heterozygosity from 0.368 (CSSM47) to 0.864 (BM1314) and Polymorphism Information Content (PIC) from 0.347 (CSSM47) to 0.849 (BM1314). This supported the utility of these microsatellite loci in the measurement of genetic diversity indices in Indian sheep too. Various average genetic variability measures viz., allele diversity (5.7), observed heterozygosity (0.597), expected heterozygosity (0.694) and mean PIC (0.648) values showed high genetic variability despite accumulated inbreeding as reflected by the high average inbreeding coefficient ($F_{IS}=0.159$) due to the unequal sex ratio of the breeding animals.

• 환경영향평가
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• 제30권3호
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• pp.164-174
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• 2021

개체수와 종수에 기초한 기존 생물다양성 평가와 달리, 계통적 다양성 평가는 계통유전적 다양성 및 생태적 다양성도 평가할 수 있다. 본 연구에서는 서울특별시 철새보호구역으로 지정되어 다년간의 생태모니터링이 용이한 한강의 주요 하천인 중랑천, 청계천 및 안양천의 지난 9년간의 겨울철 조류상 장기 모니터링 결과를 이용하여 기존의 다양성 평가와 계통적 다양성 평가를 각각 수행한 뒤 각 결과가 내포하는 정보에 대해 고찰했다. 분석결과 중랑천과 안양천은 전반적으로 조류 개체수가 시계열적으로 감소한 반면 청계천은 개체수 변동이 없었다. 종 풍부도는 청계천에서 시간에 따라 소폭 상승한 반면, 중랑천과 안양천은 연도별로 차이가 없었다. 기존 종 다양도는 안양천을 제외한 중랑천과 청계천에서 시간에 따라 증가했는데, 계통적 종 다양도는 청계천에서만 증가하는 추세를 보였다. 이러한 생물다양성 평가 지수의 변동은 각 조사구역 내에서 발생한 공사 등의 인위적 요인에 의한 것으로 판단되며, 종 다양도와 계통적 종 다양도는 같은 결과를 반영하지 않는다는 것을 보여준다. 따라서 본 연구는 생물다양성 평가에 있어 유전 및 생태적 관점과 같은 다양한 시각에서 고려할 필요가 있음을 시사한다.

• 한국제4기학회지
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• 제13권1호
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• pp.91-98
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• 1999

부유성 유공충의 상대적인 양이 고기후 및 고해양환경의 해석에 미치는 영향을 1년 동안 관찰한 퇴적물 포집장치에 함유된 유공충의 연구로 행하여졌다. 본 연구는 저자들이 알고 있는 한 처음으로 행해진 것이다. 총 부유성 유공충의 수, 고기후의 지시자로 사용되는 부유성 유공충 G. bulliodes와 N. dutertrei)의 상대적인 양, 수온, 염도 등은 부유성 유공충 유생의 상대적인 양과 통계적으로 의미 있는 상관관계를 보이지 않는다. 하지만 부유성 유공충 유생의 상대적인 양은 종다양성지수(종 풍성도, 샤논-와이너 지수, 균등도)와 상관관계를 보인다. 이러한 결과는 유생의 양은 종의 상대적인 양에는 영향을 미치지 않으나 종다양성에는 영향을 미침을 의미한다. 따라서 퇴적물 포집장치에서 일년간 관찰한 결과에 의하면 부유성 유공충의 유생을 count 시 제외했을 때 종다양성 지수를 이용한 고기후/고환경해석시 주의 가 요망된다.

• 한국유기농업학회지
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• 제17권2호
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• pp.193-209
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• 2009

조사지역에서 출현한 저서성대형무척추동물은 총 3문 5강 13목 25과 32속 36종이었는데, 출현한 분류군별 양상을 보면 주로 정수역에서 출현하는 종들이 많았지만 일반적으로 유수역에서 출현하는 다슬기나 재첩, 각다귀 등도 출현하였다. 유기농법 지역에서 출현한 분류군은 3문 4강 12목 22과 27속 28종이었고, 관행농법을 하는 지역에서 출현한 분류군은 3문 5강 10목 19과 23속 25종으로 유기농법 지역에서 3종이 더 출현하였다. 출현 분류군별 특성은 크게 유의한 결과를 찾기 힘들었고, 관행농법지역에서 출현하지 않았으나 유기농법 지역에서만 출현한 종이 11종이었고, 관행농법 지역에서만 출현한 종이 8종이었다. 개체수는 두 지역간에 큰 차이가 있었는데, 관행농법 지역에서는 245개체가 출현한 반면 유기농법 지역에서 총 870개체가 출현하여 3.6배 이상 높게 나타났다. 종 다양도 지수는 1차 조사에서 관행농법 지역은 1.53-2.21의 범위와 유기농법 지역은 1.57-2.45의 범위를 나타내었다. 2차 조사에서는 각각 1.90-2.74와 0.71-2.61의 범위를 나타내어 우점도와 반대의 결과를 보여주었다.

• 한국물환경학회지
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• 제34권5호
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• pp.514-536
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• 2018

GPI (Group Pollution Index) using 29 indicator groups of Korean benthic macroinvertebrates was proposed in 1992, a higher category taxa-level index developed for rapid field assessment of organic water pollution. This study was performed to revise the assessment scheme of GPI based on taxonomic performance and ecological information accumulated since 1992. The original GPI was renamed SBMI (Simple Benthic Macroinvertebrates Index), and SBMI was based on saprobic valency of 26 indicator groups composed of higher category taxa (mainly family ~ phylum) excluding some genus or species-level taxa. SBMI revealed highly significant correlation with concentration of 5-day biochemical oxygen demand ($BOD_5$) (correlation coefficient r = 0.78, n = 569 sites), total suspended solids (r = 0.69), and total phosphorus (r = 0.77). Also, SBMI revealed strong correlation with Shannon-Weaver's species diversity (r = -0.85), Margalef's species richness (r = -0.85), and McNaughton's dominance (r = 0.83). Determination coefficient of SBMI to concentration of water quality items and values of community indices such as species diversity was 3 ~ 8 % and approximately 11 ~ 14 % higher than that of GPI, respectively. Correlation between SBMI and water quality factors or community indices such as species diversity did not reveal much difference compared to that of species-level indices, such as BMI (Benthic Macroinvertebrates Index) and ESB (Ecological Score of Benthic Macroinvertebrates). SMBI is a simple-qualitative index with higher category taxa easily identified, and is applicable for rapid field assessment of water environment impairment.