MPEG(Motion Picture Expert Group)과 같은 멀티미디어 스트림은 연속적 재생으로 인해 데이터의 지속적인 디스크 검색을 요구한다. 따라서, 커널의 효율적인 지원이 필요한데, 유닉스 계열의 리눅스 버퍼 캐시 시스템은 비정기적이고 비실시간 데이터인 텍스트 데이터용으로 설계되었다. 대용량의 연속 미디어의 경우 커널 주소공간에서 사용자 주소공간으로의 대량의 복사가 이루어지므로 이 과정에서 CPU의 과중한 오버헤드가 발생한다. 이것은 시스템 처리율을 저하시킬 뿐만 아니라 QOS(Quality of Service)도 보장할 수 없다. 본 논문에서 이 메모리 복사 오버헤드를 감소시키기 위한 direct I/O와 one copy 기법을 리눅스 커널에서 설계 및 구현하였다. direct I/O는 디스크의 데이터를 커널 버퍼로 복사하지 않고 사용자 버퍼로 직접 복사하므로 CPU 오버헤드를 획기적으로 감소시킬 수 있다. 그리고, one-copy는 사용자 버퍼로 데이터를 복사하지 않고 직접 네트워크로 전송하는 기법이다. 구현 결과, CPU 오버헤드의 상당한 감소와 시스템의 처리율이 향상됨을 확인하였다.
Increasing the gene copy number has been commonly used to enhance the protein expression level in the yeast Pichia pastoris. However, this method has been shown to be effective up to a certain gene copy number, and a further increase of gene dosage can result in a decrease of expression level. Evidences indicate the gene dosage effect is product-dependent, which needs to be determined when expressing a new protein. Here, we describe a direct detection of the gene dosage effect on protein secretion through expressing the enhanced green fluorescent protein (EGFP) gene under the direction of the ${\alpha}$-factor preprosequence in a panel of yeast clones carrying increasing copies of the EGFP gene (from one to six copies). Directly examined under fluorescence microscopy, we found relatively lower levels of EGFP were secreted into the culture medium at one copy and two copies, substantial improvement of secretion appeared at three copies, plateau happened at four and five copies, and an apparent decrease of secretion happened at six copies. The secretion of EGFP being limiting at four and five copies was due to abundant intracellular accumulation of proteins, observed from the fluorescence image of yeast and confirmed by western blotting, which significantly activated the unfolded protein response indicated by the up-regulation of the BiP (the KAR2 gene product) and the protein disulfide isomerase. This study implies that tagging a reporter like GFP to a specific protein would facilitate a direct and rapid determination of the optimal gene copy number for high-yield expression.
Genome duplication(i.e. polyploidy) is a common phenomenon in the evolution of plants. The objective of this study was to achieve a comprehensive understanding of genome duplication for SNP discovery by Thymine/Adenine(TA) cloning for confirmation. Primer pairs were designed from 793 EST contigs expressed in the roots of a supernodulating soybean mutant and screened between 'Pureunkong' and 'Jinpumkong 2' by direct sequencing. Almost 27% of the primer sets were failed to obtain sequence data due to multiple bands on agarose gel or poor quality sequence data from a single band. TA cloning was able to identify duplicate genes and the paralogous sequences were coincident with the nonspecific peaks in direct sequencing. Our study confirmed that heterogeneous products by the co-amplification of a gene family member were the main cause of obtaining multiple bands or poor quality sequence data in direct sequencing. Counts of amplified bands on agarose gel and peaks of sequencing trace suggested that almost 27% of nonrepetitive soybean sequences were present in as many as four copies with an average of 2.33 duplications per segment. Copy numbers would be underestimated because of the presence of long intron between primer binding sites or mutation on priming site. Also, the copy numbers were not accurately estimated due to deletion or tandem duplication in the entire soybean genome.
The purposes of this study were 1) to assess the currunt documentation system 2) to identify the problems in communication regarding to documentation 3) to develop new documentation system 4) to suggest effective communication channel using new documentation system Research was conducted by direct observation, chart review, staffs interview and servey. Results were as follows: 1) nursing care plans were not used in ongoing care 2) documentation format was primarily narrative and charting was time consuming 3) documentation did not reflect the nursing process 4) patient records were not used as effective communication tool between case manager and part time nurse 5) difficult access to patient record for nurse manager created inefficiency in coordinating 6) documentation of patient education did not describe the precise contents of education, and the responses of the patients and evaluation To solve these problems, new documentation format was developed. With new formats nurses : 1) use standardized care plan which contains nursing diagnosis, ecpected outcome, time frame for evaluation, flow sheet for updating the plans 2) leave one copy of care plan at patient home for mutual agreement with patent and communication among nursing staffs 3) carry one copy of care plan for updating 4) document and evaluate the patient education using education check list keeping in patient's home 5) document nursing process in focus charting visit report 6) carry one copy of visit report 7) have one copy of visit report which was deligated to part time nurses 8) use documentation in direct communication with part time nurse 9) use beeper and memo to promote communication
선운사 대웅전의 훼손된 단청문화재를 대상으로 3차원(3D) 스캐닝을 활용한 간접전사방식을 통해 단청 문양에 직접 손을 대지 않고 1:1 비율로 모사도를 제작하였다. 기존 단청문양의 모사방법은 트레싱지를 단청 위에 대고 핀을 고정한 이후에 네임펜을 사용해서 아웃라인을 그리고 아웃라인을 사용해서 전체적인 비율로 모사도를 제작하고 있다. 때문에 대상 단청에 직접전사하는 수작업 방식으로 대상물의 손상 우려와 조사자 개인의 치수 오차가 항상 내재되어 있다. 본 연구는 기존의 단청문화재 모사도 제작 과정 방식에서 오는 여러 가지 문제점의 대안으로 3D 스캐닝을 통한 간접전사방식을 제안하여 형상의 왜곡이나 치수 오차의 발생을 감소시키고 훼손을 방지할 수 있었다. 연구 결과 비교적 객관적이고 정밀한 실제 비율의 모사도를 제작하였고 제작 과정에 관한 관련 데이터를 구축할 수 있었다. 또한 모사도 및 복원도의 제작뿐만 아니라 3D 원본데이터, 가공 3D 데이터, 부재도면 등의 다양한 자료들을 폭넓게 이용 가능하며 3D 컨텐츠 제작으로 새로운 가상 박물관의 운용 또한 가능할 것으로 생각된다.
The development and commercialization of industrial genetically modified (GM) organisms is actively progressing worldwide, highlighting an increased need for improved safety management protocols. We sought to establish an environmental monitoring method, using real-time polymerase chain reaction (PCR) and propidium monoazide (PMA) treatment to develop a quantitative detection protocol for living GM microorganisms. We developed a duplex TaqMan quantitative PCR (qPCR) assay to simultaneously detect the selectable antibiotic gene, ampicillin (AmpR), and the single-copy Escherichia coli taxon-specific gene, D-1-deoxyxylulose 5-phosphate synthase (dxs), using a direct cell suspension culture. We identified viable engineered E. coli cells by performing qPCR on PMA-treated cells. The theoretical cell density (true copy numbers) calculated from mean quantification cycle (Cq) values of PMA-qPCR showed a bias of 7.71% from the colony-forming unit (CFU), which was within ±25% of the acceptance criteria of the European Network of GMO Laboratories (ENGL). PMA-qPCR to detect AmpR and dxs was highly sensitive and was able to detect target genes from a 10,000-fold (10-4) diluted cell suspension, with a limit of detection at 95% confidence (LOD95%) of 134 viable E. coli cells. Compared to DNA-based qPCR methods, the cell suspension direct PMA-qPCR analysis provides reliable results and is a quick and accurate method to monitor living GM E. coli cells that can potentially be released into the environment.
네트워크 사용자의 급속한 증가로 네트워크 내의 부하를 감당하기에는 많은 어려움을 가져왔다. 이와 같은 이유로 기존의 TCP/IP에서 세션을 통하여 노드들 간의 통신을 연결하는 방식에서 현재는 하나의 채널을 통해 고속의 I/O가 가능하도록 하는 기술이 많이 연구되고 있다. 그 대표적인 것으로 인피니밴드가 있다. 인피니밴드는 프로세싱 노드와 입출력 장치 사이의 통신, 프로세스간 통신에 대한 산업 표준이 되고 있고 프로세싱 노드와 입출력 장치를 연결하기 위해 스위치 기반의 상호 연결은 전통적인 버스 입출력을 대체하는 새로운 입출력 방식이 사용된다. 또한 인피니밴드에서는 현재 많은 이슈가 되고 있는 RDMA 방식을 이용해 원격지 서버들 간에 직접 메모리 접근 방식을 통해 CPU와 OS의 로드를 최소화하고 있다. 본 논문에서는 RDMA를 적용한 새로운 채널 기반 네트웍의 프로토콜인 SDP(Socket Direct Protocol)를 구현하여 SDP_STREAM의 패킷 처리량에 대한 성능을 평가한다. 그리고 이에 대한 성능 평가를 위해서 Netperf 툴을 이용했다. 특히 Zero-Copy방식을 사용하지 않는 일반적인 소켓 API을 이용한 TCP_STREAM과 Zero-Copy방식을 이용한 SDP_STREAM의 패킷 처리량을 비교했으며 성능 평가 결과는 기존의 TCP_STREAM 패킷 처리량에 비해 약 3배 이상 향상된 결과를 나타냈다.
Journal of Information Technology Applications and Management
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제24권1호
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pp.1-10
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2017
Recently, the problem of plagiarism has emerged as a big social issue because not only literature but also thesis become the target of plagiarism. Even the government requires conformation for plagiarism of high-ranking official's thesis as a standard of their ethical morality. Plagiarism is not just direct copy but also paraphrasing, rewording, adapting parts, missing references or wrong citations. This makes the problem more difficult to handle adequately. We propose a plagiarism detection scheme called a bit signature in which each unique word of document is represented by 0 or 1. The bit signature scheme can find the similar documents by comparing their absolute and relative bit signatures. Experiments show that a bit signature scheme produces better performance for document copy detection than existing similar schemes.
In the security environments of heterogeneous multidatabase systems, not only the existing local autonomy but also the security autonomy as a new constraint are required. From global aspects, transactions maintain consistent data value when they assure serializability. Also, secure properties must protect these transactions and data values to prevent direct or indirect information effluence. This paper proposes scheduling algorithm for global transactions to ensure multilevel secure one-copy quasi-serializability (MLS/1QSR) in security environments of multidatabase systems with replicated data and proves its correctness. The proposed algorithm does not violate security autonomy and globally guarantees MLS/1QSR without indirect information effluence in multidatabase systems.
멀티플레이어 온라인 게임을 위한 주요 구조는 전형적으로 클라이언트-서버, 멀티 서버, P2P(peer-to-peer) 구조 등이 있다. P2P 구조는 본질적인 분산과 협동 특성으로 인하여 구축 비용이 저렴하며 플레이어들 간에 직접 통신을 수행함으로써 빠른 응답시간과 높은 규모조정성을 가질 수 있다. 그러나 P2P 구조는 여러 가지 어려움이 존재한다. 플레이어들 간에 게임을 분산시키므로 제어 유지가 어렵고 특정 플레이어의 고의적인 부정행위에 취약해지는 경향도 있다. 또한 갱신과정의 충돌 현상이 여러 사이트에서 발생될 수 있기 때문에 P2P 시스템에서 일관성 제어를 제공하는 것도 더욱 어렵다. 비일관성을 회피 또는 정정하기 위하여 대부분의 멀티플레이어 게임은 객체에 대한 갱신이 주 사본에 먼저 수행되는 주 사본 기법을 사용한다. 본 논문은 멀티플레이어 온라인 게임을 위한 P2P 구조에서 각 객체에 대한 일관성을 제공하며 갱신 결과의 전송 메카니즘이 존재하는 주 사본 모델과 이에 대한 성능 분석 결과를 기술한다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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