• Journal of Ginseng Research
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• 제38권1호
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• pp.16-21
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• 2014

Ginseng saponins exert various important pharmacological effects with regard to the control of many diseases, including cancer. In this study, the anticancer effect of ginsenosides on human cancer cells was investigated and compared. Among the tested compounds, ginsenoside-Rh2 displays the highest inhibitory effect on cell viability in HepG2 cells. Ginsenoside-Rh2, a ginseng saponin isolated from the root of Panax ginseng, has been suggested to have potential as an anticancer agent, but the underlying mechanisms remain elusive. In the present study, we have shown that cancer cells have differential sensitivity to ginsenoside-Rh2-induced apoptosis, raising questions regarding the specific mechanisms responsible for the discrepant sensitivity to ginsenoside-Rh2. In this study, we demonstrate that AMP-activated protein kinase (AMPK) is a survival factor under ginsenoside-Rh2 treatment in cancer cells. Cancer cells with acute responsiveness of AMPK display a relative resistance to ginsenoside-Rh2, but cotreatment with AMPK inhibitor resulted in a marked increase of ginsenoside-Rh2-induced apoptosis. We also observed that p38 MAPK (mitogen-activated protein kinase) acts as another survival factor under ginsenoside-Rh2 treatment, but there was no signaling crosstalk between AMPK and p38 MAPK, suggesting that combination with inhibitor of AMPK or p38 MAPK can augment the anticancer potential of ginsenoside Rh2.

• 한국식물학회:학술대회논문집
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• 한국식물학회 1999년도 제13회 식물생명공학심포지움 New Approaches to Understand Gene Function in Plants and Application to Plant Biotechnology
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• pp.63-67
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• 1999

We have isolated more than a dozen cDNA clones corresponding to genes that were expressed in Arabidopsis leaves when they were kept in the dark. The nucleotide sequence analysis showed that some of the clones encoded proteins with significant homology to $\beta$-glucosidase (din2), branched-chain $\alpha$-keto acid dehydrogenase subunit E1$\beta$(din3), and another subunit E2 (din4), yeast RAD23 (din5), asparagine synthetase (din6), pre-mRNA splicing factor SRp35 (din7), phosphomannose isomerase (din9), seed imbibition protein (din10), and 2-oxoacid-dependent oxidase (din11). Accumulation of transcripts from din3,4,6 and 10 occurred rapidly after the plants were transferred to darkness. Transcripts from din2,9, and 11 could be detected only after 24 h of dark treatment. Inhibition of photo-synthesis by DCMU strongly induced the accumulation of transcripts from those genes, and application of sucrose to detached leaves suppressed the accumulation both in the dark and by DCMU. These observations indicate that expression of the genes is caused by sugar starvation resulted from the cessation of photosynthesis. We further showed that din2-encoded protein also accumulated in senescing leaves. Given these results, possible roles of din genes in leaves in the dark and senescing leaves are discussed.

• 디지털콘텐츠학회 논문지
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• 제16권6호
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• pp.909-916
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• 2015

본 논문에서는 위상 공간 분석을 통해 3D 벡터 필드를 표현하는 방법을 제안한다. 이 방법은 상미분 방정식과 벡터 필드 위상과의 연결에 기초를 두고 있다. 위상 공간 분석은 위상 공간 형태의 자율 방정식 시스템의 기하학적 보간법이 되어야 한다. 이 방정식 시스템의 모든 해는 공간에서의 곡선이 아니라 곡선을 따라가는 점의 움직임과 일치한다. 이러한 분석은 이 논문의 기반이다. 새로운 방법은 3차원 벡터필드에서 육면체 셀을 5 또는 6개의 사면체 셀로 분해하는 것을 요구한다. 임계점은 각 사면체의 간단한 선형 시스템을 풀어서 간단하게 구할 수 있다. 각 사면체의 일반해에 의해 그려지는 전체 곡선과 사면체의 한 면을 포함하는 평면과의 교차점을 계산함으로써 탄젠트 곡선은 구해진다.

• 한국인터넷방송통신학회논문지
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• 제15권6호
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• pp.61-70
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• 2015

본 연구는 배경의 밝기와 색상 자극의 크기에 따라 인지될 수 있는 색의 차이가 있을 수 있다는 가정아래, 배경의 밝기를 차등적으로 적용하여 $2^{\circ}$와 $10^{\circ}$에 해당하는 자극의 크기를 비교하는 실험을 진행하였다. 실험결과, 배경의 밝기 및 실험 자극으로 사용된 Munsell 색상 속성의 조합에 따라 동일한 색상임에도 불구하고 colour를 각기 다르게 인지할 수 있다는 경향성을 볼 수 있었다. 실험 결과를 바탕으로 차후 대형 화면의 크기에서 모바일 크기의 화면으로 입력 영상이 전환 될 때 발생할 수 있는 색상 인지의 차이에 대해 본 실험 결과를 반영함으로써 모바일에서 가장 큰 이슈 중 하나인 전력 효율성이 반영 가능하며 2D 뿐만 아니라 3D나 홀로그램 영상처리 시 효과적인 입체 영상 재현 및 화질에도 기여할 수 있다.

• International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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• 제23권2호
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• pp.231-238
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• 2011

Attacin is an insect antibacterial protein that plays an important role in immune response to injury and infection. In this report, we have isolated and characterized of cDNA encoding for the attacin from the immunized larvae of swallowtail butterfly, $Papilio$ $xuthus$. A full length cDNA of $P.$ $xuthus$ attacin was obtained by employing annealing control primer (ACP)-based differential display PCR and 5' RACE. The complete $P.$ $xuthus$ attacin cDNA was comprised of 949 bp encoding a 250 amino acid precursor. It contains a putative 18 amino acid signal peptide sequence, a 42 amino acid propeptide sequence, and a 190 amino acid mature protein with a theoretical molecular mass of 19904.01 and a pI of 9.13. The putative mature protein of $P.$ $xuthus$ attacin showed 48-52% and 24-30% identity in amino acid sequences with that of lepidopteran and dipteran insects, respectively. Semiquantitive RT-PCR results revealed that the transcript of $P.$ $xuthus$ attacin gene was up-regulated at significant levels after injection with bacterial lipopolysaccharide (LPS). We sub-cloned cDNA fragment encoding mature $P.$ $xuthus$ attacin into the expression vector, highly expressed in $E.$ $coli$ BL21 cells, and its antibacterial activity was analyzed. Recombinant $P.$ $xuthus$ attacin evidenced considerably antibacterial activity against Gram-negative bacteria, $E.$ $coli$ ML 35 and $Klebsiella$ $pneumonia$.

• Journal of Applied Biological Chemistry
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• 제49권1호
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• pp.1-7
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• 2006

Differential display reverse transcription PCR (DDRT-PCR) analysis was performed on lily 'Marcopolo' bulb scale for isolation of expressed genes during bulblet formation. Cu/Zn lily-superoxide dismutase (LSOD) of 872 bp gene, with ability to scavenge reactive oxygen in stress environment, was isolated. Northern blot analysis showed expression levels of LSOD maximized 12 days after bulblet formation. Ti plasmid vectors were constructed with sense and antisense expressions of LSOD gene and transformed into potato. Southern blot analysis of transgenic potatoes revealed different copies of T-DNA were incorporated into potato genome. In transgenic potatoes, lily SOD gene was overexpressed in sense lines and not in antisense lines. In native polyacrylamide gel electrophoresis analysis, additional engineered LSOD was detected in sense overexpressed transgenic line only. Transgenic potatoes were subjected to oxidative stress, such as herbicide methyl viologen (MV). Transgenic potato lines with sense orientation exhibited increased tolerance to MV, whereas in antisense lines exhibited decreased tolerance. In vitro tuberization of transgenic potato with sense orientation was promoted, but was inhibited in transgenic potato with antisense orientation.

• Journal of Genetic Medicine
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• 제19권2호
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• pp.63-75
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• 2022

Purpose: Osteoporosis is a common calcium and metabolic skeletal disease which is characterized by decreased bone mass, microarchitectural deterioration of bone tissue and impaired bone strength, thereby leading to enhanced risk of bone fragility. In this study, we aimed to identify novel genes for susceptibility to osteoporosis and/or bone density. Materials and Methods: To identify differentially expressed genes (DEGs) between control and osteoporosis-induced cells, annealing control primer-based differential display reverse-transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) was carried out in pre-osteoblast MC3T3-E1 cells. Expression levels of the identified DEGs were evaluated by quantitative RT-PCR. Association studies for the quantitative bone density analysis and osteoporosis case-control analysis of single nucleotide polymorphism (SNPs) were performed in Korean women (3,570 subjects) from the Korean Association REsource (KARE) study cohort. Results: Comparison analysis of expression levels of the identified DEGs by quantitative RT-PCR found seven genes, Anxa6, Col5a1, Col6a2, Eno1, Myof, Nfib, and Scara5, that showed significantly different expression between the dexamethason-treated and untreated MC3T3-E1 cells and between the ovariectomized osteoporosis-induced mice and sham mice. Association studies revealed that there was a significant association between the SNPs in the five genes, ANXA6, COL5A1, ENO1, MYOF, and SCARA5, and bone density and/or osteoporosis. Conclusion: Using a whole-genome comparative expression analysis, gene expression evaluation analysis, and association analysis, we found five genes that were significantly associated with bone density and/or osteoporosis. Notably, the association P-values of the SNPs in the ANXA6 and COL5A1 genes were below the Bonferroni-corrected significance level.

• 생명과학회지
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• 제18권8호
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• pp.1023-1030
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• 2008

SIPK와 WIPK의 상위 단계 인산화 효소로 알려진 NtMEK2가 DEX 유도성 시스템에 의해 밝혀졌다. 이 NtMEK2 유전자가 지속적으로 활성화된 돌연변이체인 $NtMEK2^{DD}$의 발현은 SIPK와 WIPK를 활성화 시켜 주므로 과민감 반응과 같은 세포 괴사를 야기하는 것으로 나타나 NtMEK2-SIPK/WIPK 체계가 담배에서 방어 반응을 조절하고 있음을 알 수 있었다. 그러나 NtMEK2-SIPK/WIPK 체계에 의해서 조절 되는 하위 기질이나 방어관련 유전자들에 대한 연구는 아직 미비한 상태이다. 그래서 본 연구는 NtMEK2-SIPK/WIPK 체계에 매개되는 하위 유전자들을 분리하기 위하여 $NtMEK2^{DD}$ 형질전환 식물체를 이용해 ACP에 기초한 DDRT-PCR을 수행하였다. 그 결과 본 연구를 통해 처음으로 pI2-4, MTS2, SINA, CDM1, HRGP 및 DEG45를 포함해 여섯 개의 DEG들을 선발하였다. 이 유전자들의 발현은 $NtMEK2^{DD}$ 형질전환에서 다시 확인하였으며 특히 pI2-4, CDM1, HRGP의 유전자 발현은 다른 유전자들과 비교해 볼 때 살리실산과 담배모자이크바이러스에 강하게 반응하여 증폭됨을 알 수 있었다. 이러한 결과를 볼 때 NtMEK2-SIPK/WIPK 체계에 의해 조절되는 세 개의 유전자는 병저항성에 관여하고 있음을 제시한다 하겠다.

• 한국버섯학회지
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• 제10권3호
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• pp.120-128
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• 2012

표고균사에서 갈변시기를 조절하고 확인할 수 있는 유전공학적 시스템을 개발하여 톱밥재배용 표고균주를 조기에 선별할 수 있도록 표고균사가 갈변되는 동안 균사상태에서 특이적으로 발현되는 유전자를 분리하기 위하여 갈변되지 않은 균사와 갈변이 완전히 이루어진 균사에서 differential display를 실시하였다. 그 결과 이들 균사로부터 특이적으로 발현되는 두 개의 1.6kb와 1.2kb의 cDNA clone을 선발하여 염기서열을 분석하였다. 이 중 1.6kb의 cDNA단편은 Dugenia polichroa로부터 분리된 microsatellites 유전자와 100%의 상동성을 나타냈다. 그러나 1.2kb의 cDNA 단편은 3'부위에 poly A tail과 5 부위에 partial open reading frame를 가지고 있어 이를 primer로 제작한 후 갈변되지 않은 균사와 갈변이 이루어진 균사에서 RT-PCR을 실시하여 본 결과 갈변이 되지 않은 백색의 균사에서 발현이 확인되었다. 1.2kb의 cDNA 단편의 5' 부위의 염기서열 분석은 110개의 아미노산으로 구성된 partial open reading frame으로 나타났다. 이 유전자를 DNASIS database에서 상동성을 비교해 본 결과 Arabidopsis thaliata에서 분리된 dTDP-glucose 4,6-dehydratases 유전자와 DNA 수준에서는 66.7%, 아미노산 수준에서는 69.2%의 높은 상동성을 나타내었다. 갈변에 관련된 특이 유전자(BCR gene)를 확인하였다. 이 유전자는 산화 stress에 대해 저항성을 나타내는 기능을 가진 것으로 알려져 있어 표고 균사가 갈변될 때 repressor로서 작용할 것으로 생각된다. 따라서 이 유전자를 BCR (Brown Color Repressor) 유전자라고 명명하였다.

• 한국어류학회지
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• 제23권1호
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• pp.1-9
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• 2011

ACP (annealing control primer)를 사용하여 DDRT (differential display reverse transcription)-PCR 방법으로 볼락의 성장단계에 따라 발현량 차이를 나타내는 DEG (differentially expressed gene)를 확보하였다. ACP 120개를 분석하여 18개월령 근육조직에서보다 6개월령 근육조직에서 발현량이 많은 DEG 16개와 6개월령 근육조직에서보다 18개월령 근육조직에서 발현량이 더 많은 DEG22개의 염기서열을 분석하였다. DEG 염기서열을 BLAST 검색한 결과, parvalbumin (PVALB) 등 18개의 유전자(PVALB, NDKB, TPM, TnI, GAPDH, CKM2, factor 2 SERF2, AMPD, TRICA, ARHGAP15, ESD, hsp70, COL1A2, GST, Midllip1, MYL1, SERCA1B, FTH1)와 69~95%의 상동성을 나타냈다. Real time PCR 분석법으로 6개월령 근육조직에서 발현량이 많은 DEG14와 PVALB 유전자의 성장단계별 발현양상을 조사한 결과, 볼락이 성장함에 따라 발현량이 감소하였으며, 특히 PVALB 유전자는 6개월령 이후에는 발현량이 극히 적었다. 6개월령 근육조직에서보다 18 개월령 근육조직에서 발현량에서 많았던 CKM2 유전자는 성장함에 따라 발현량이 계속 증가하였고, 4세 이후에는 발현량이 감소하였다. DEG의 조직특이적 발현양상을 분석한 결과, DEG14는 근육, 간, 신장, 및 비장조직에서 발현되었으며, PVALB 유전자는 근육과 신장조직에서 발현되었고, 간과 비장조직에서는 발현되지 않았다. CKM2 유전자는 근육, 신장 및 비장조직에서 발현되었고, 간 조직에서는 발현되지 않았다. PVALB 유전자의 mRNA 크기는 659 bp 이며, 110개의 아미노산으로 구성되어 있다. Parvalbumin과 CKM2 유전자는 성장속도가 빠른 어류 선발에 이용할 수 있는 분자마커 개발에 활용하고자한다.