$H_2O/O_2$, $D_2O/H_2O$, $D_2O/H_$2 등의 반응계의 수소동위원소 교환반응용 전기방전을 이용하여 용이하게 일으킬 수 있다. 예를 들어, DC 코로나 방전을 위의 반응혼합물을 통하여 일으키면 여기된 상태의 반응물이 존재하는 플라즈마를 형성하게 된다. 이러한 플라즈마 내에서 반응물들은 양자에너지 준위의 여기, 이온화 그리고 라디칼 형성등을 통하여 매우 큰 반응성을 갖게되므로 실온에서도 용이하게 수소동위원소 교환반응을 일으킨다. 본 연구에서는 $H_2/D_2O$계의 기상에서의 교환반응에 대한 연구를 실시하였다. 위 반응계는 전기방전하에서 수소(H)와 중수소(D)간의 교환반응에 의하여 HDO와 HD를 생성하게 된다. 이러한 반응생성물을 FTIR 분광법을 이용하여 시간의 함수로 측정을 하였다.
Solvolyses of N-methyl-N-phenylcarbamoyl chlorides in aqueous binary mixtures of acetone, ethanol, methanol and in water, D2O, and 50% D2O-CH3OD are investigated at 25.0 $^{\circ}C.$ The Grunwald-Winstein plots of first-ord er rate constants for N-methyl-N-phenylcarbamoyl chlorides with YCl (based on 2-adamantyl chloride) show a dispersion phenomenon. The ring parameter (I) has been shown to give considerable improvement when it is added as an hI term to the original Grunwald-Winstein and extended Grunwald-Winstein correlations for the solvolyses of N-methyl-N-phenylcarbamoyl chlorides. This study has shown that the magnitude of l, m and h values associated with a change of solvent composition is able to predict the dissociative SN2 transition state. The kinetic solvent isotope effects determined in deuterated water are consistent with the proposed mechanism of the general base catalyzed and/or a dissociative SN2 mechanism channel for N-methyl-N-phenylcarbamoyl chlorides solvolyses.
The nucleophilic substitution reactions of dibutyl chlorophosphate (3) with substituted anilines ($XC_6H_4NH_2$) and deuterated anilines ($XC_6H_4ND_2$) are investigated kinetically in acetonitrile at $55.0^{\circ}C$. The obtained deuterium kinetic isotope effects (DKIEs; kH/kD) are secondary inverse ($k_H/k_D$ = 0.86-0.97) with the strongly basic anilines while primary normal ($k_H/k_D$ = 1.04-1.10) with the weakly basic anilines. The DKIEs, steric effects of the two ligands, activation parameters, cross-interaction constants, variation trends of the kH/kD values with X, and mechanism are discussed for the anilinolyses of the nine ($R_1O$)($R_2O$)P(=O)Cl-type chlorophosphates. A concerted mechanism is proposed with a backside nucleophilic attack transition state for the strongly basic anilines and with a frontside attack involving a hydrogen-bonded four-center-type transition state for the weakly basic anilines on the basis of the magnitudes, secondary inverse and primary normal, and variation trends of the $k_H/k_D$ values with X.
The stretching vibration of OH of ice Ih is studied by Car-Parrinello molecular dynamics in regarding the effect of mixed H/D contamination while the vibrational spectrum is considered by velocity-velocity autocorrelations of the sampled ensemble. When hydrogen atoms are immersed randomly into the deuterated ice, a typical vibrational frequency of OH stretching mode is observed to be similar to that from the pure $H_2O$ ice. When focusing on the correlation of isolated neighboring OH stretching, a narrower and blue shifted peak is observed at the high frequency range as a result of the screening from the complex many body correlations by $D_2O$ environment. It is also specifically related to the symmetric intermolecular correlations between neighboring OH stretching modes. More enhanced high frequency range can be explained by the expansion of such two body correlations to collective many body correlations among all possible OH stretching modes. This contribution becomes important when it involves in chemical interactions via excitation of such vibrational states.
순수한 액체의 증가압에 미치는 동위원소 효과를 연구하였고, 증기압 비를 계산하였다. Significant Structure Theory of Liquid를 사용한 계산결과에 의하면, $C_2H_4/C_2H_2D_2$(trans)계 에서는 분자량과 관성능률에 의한 효과가 현저하고, $C_2H_2D_2(trans)/C_2H_2D_2(cis)$계에서는 분자 회전이 자유롭지 못한 데서 오는 영점에너지 효과가 현저했다. 그리고, $CH_3OH/CH_3OD$계에서는 분자간 인력이 동위원소에 따라 다르기 때문임이 밝혀졌다. $CH_4/CD_4,\;SiH_4/SiD_4,\;GeH_4/GeD_4$ 동위원소계에서는 분자량에 의한 효과가 $CH_4/CD_4 >SiH_4/SiD_4 >GeH_4/GeD_4$의 순서로 감소함을 알 수 있었다.
The nucleophilic substitution reactions of O-ethyl phenyl phosphonochloridothioate with substituted anilines ($XC_6H_4NH_2$) and deuterated anilines ($XC_6H_4ND_2$) are kinetically investigated in acetonitrile at $55.0^{\circ}C$. The deuterium kinetic isotope effects (DKIEs) invariably increase from a secondary inverse DKIE ($k_H/k_D$ = 0.93) to a primary normal DKIE ($k_H/k_D$ = 1.28) as the substituent of nucleophile (X) changes from electron-donating to electron-withdrawing. These can be rationalized by the gradual transition state (TS) variation from a backside to frontside attack. A concerted $S_N2$ mechanism is proposed. A trigonal bipyramidal TS is proposed for a backside attack while a hydrogen-bonded, four-center-type TS is proposed for a frontside attack.
We study the uncertainty stemming from different theoretical models in the spectroscopic factors extracted from experiments. We use three theoretical approaches, the distorted wave Born approximation (DWBA), the adiabatic distorted wave approximation (ADWA) and the continuum discretized coupled-channels method (CDCC), and analyze the $^{12}C(d,p)^{13}C$, $^{14}C(d,p)^{15}C$ reactions. We find that the uncertainty associated with the adopted theoretical models is less than 20%. We also investigate the contribution from the remnant term and observe that it gives less than 10% uncertainty. We finally make an attempt to explain the discrepancy in the spectroscopic factors of $^{17}C(\frac{3}{2}^+)$ between the ones extracted from experiments and from shell model calculations by analyzing the $^{16}C(d,p)^{17}C$ reaction.
The nucleophilic substitution reactions of dicyclohexyl phosphinic chloride [3; $cHex_2$P(=O)Cl] with substituted anilines ($XC_6H_4NH_2$) and deuterated anilines ($XC_6H_4ND_2$) are investigated kinetically in acetonitrile at 60.0 $^{\circ}C$. The anilinolysis rate is too slow to be rationalized by the stereoelectronic effects. The rate is contrary to expectations for the electronic influence of the two ligands and exhibits exceptionally great negative deviation from the Taft's eq. The deuterium kinetic isotope effects (DKIEs) involving deuterated anilines invariably change from primary normal ($k_H/k_D$ > 1; max $k_H/k_D$ = 1.10 with X = 4-MeO) with the strongly basic anilines (X = 4-MeO, 4-Me, 3-Me) to secondary inverse ($k_H/k_D$ < 1; min $k_H/k_D$ = 0.673 with X = 3-Cl) with the weakly basic anilines (X = H, 4-F, 4-Cl, 3-Cl). A concerted $S_N2$ mechanism is proposed on the basis of both secondary inverse and primary normal DKIEs. The obtained DKIEs imply that the fraction of a frontside attack increases as the aniline becomes more basic. A hydrogen-bonded, four-center-type transition state is suggested for a frontside attack, while the trigonal bipyramidal pentacoordinate transition state is suggested for a backside attack.
The anti-Ex-A IgG was specifically labeled with stable isotopes, DL-His-2,4-$d_2$, L-Phe-$d_5$, L-Trp-$d_5$, L-Tyr-2,6-$d_2$ and L-[1-$^{13}C$]Trp, by growing hybridoma cell in serum-free medium. By use of NMR spectroscopy with selectively labeled Fab fragment, we applied a paratope mapping on antigen-antibody complex. Assignments of the observed carbonyl carbon resonances have been determined by using $^{13}C$-$^{15}N$ double labeling method in order to assign the Trp resonances. Photo CIDNP was also applied to investigate the antigen-binding site(s) on the surface residues of antibody. We found that Trp 36, which is located at the $V_H$ domain, is an important residue to bind to Ex-A, however, two Tyr on the surface of anti-Ex-A IgG plays no crucial role to bind to antigen. On the basis of these results, we demonstrate that stable isotope-aided NMR strategy can be extended to molecular structural analyses of the complex of an Fab fragment and a protein antigen.
The aminolysis of O-methyl S-aryl thiocarbonates with benzylamines are studied in acetonitrile at -45.0$^{\circ}C$. The ${\beta}_X$(${\beta}_{nuc}$) values are in the range 0.62-0.80 with a negative cross-interaction constant, ${\rho}_{XZ}$ = -0.42, which are interpreted to indicate a concerted mechanism. The kinetic isotope effects involving deuterated benzylamine nucleophiles ($XC_6H_4CH_2ND_2$) are large, $k_H/k_D$ = 1.29-1.75, suggesting that the N-H(D) bond is partially broken in the transition state by forming a hydrogen-bonded four-center cyclic structure. The concerted mechanism is enforced by the strong push provided by the MeO group which enhances the nucleofugalities of both benzylamine and arenethiolate from the putative zwitterionic tetrahedral intermediate.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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