• 제목/요약/키워드: Cytochrome C oxidase

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Morphology, Molecular Phylogeny, and Fungicide Sensitivity of Phytophthora nagaii and P. tentaculata in Korea

  • Seung Hyun Lee;Bora Nam;Dong Jae Lee;Young-Joon Choi
    • Mycobiology
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    • 제51권5호
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    • pp.333-342
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    • 2023
  • Phytophthora species, classified under Oomycota, cause significant damage to various crops and trees. The present study introduced Phytophthora species, P. nagaii and P. tentaculata, new to Korea, which pose notable risks to their respective host plants. Our research provided a comprehensive description of these species taking into account their cultural features, morphological characteristics, and molecular phylogenetic analysis using the internal transcribed spacer rDNA region and cytochrome c oxidase subunit mtDNA genes (cox1 and cox2) sequences. In addition, this study first evaluated the sensitivity of P. nagaii and P. tentaculata to five anti-oomycete fungicides, finding both species most responsive to picarbutrazox and P. tentaculata resistant to fluazinam. The data can guide targeted treatment strategies and offer insights into effective control methods. The findings expand our understanding of the diversity, distribution, and management of Phytophthora species in Korea.

Three Seed Beetles (Coleoptera: Chrysomelidae: Bruchinae) New to South Korea, with DNA Barcoding Data

  • Hee-Wook Cho;Haechul Park;Soojeong Ahn;Oe Jung Kim;Kang-Rae Kim
    • Animal Systematics, Evolution and Diversity
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    • 제40권1호
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    • pp.108-111
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    • 2024
  • Three species of seed beetles, Acanthoscelides pallidipennis (Motschulsky, 1874), Bruchidius terrenus (Sharp, 1886), and Kytorhinus senilis Solsky, 1869, from South Korea are reported for the first time. These three species can be morphologically distinguished from other Korean bruchid species by the distinctive color pattern of the elytra, presence of subapical spines on hind femur, and exposed last three tergites of abdomen, respectively. In this study, partial sequences of mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I from Korean specimens of these species were generated. In addition, host plants, distribution maps, and photographs of the dorsal habitus and live specimens of each species are also included.

Indole, Indole-3-calbinol 및 Benzofuran이 간장 microsome과 cytosol의 약물대사 효소 활성도에 미치는 영향 (Differential Effects of Indole, Indole-3-carbinol and Benzofuran on Several Microsomal and Cytosolic Enzyme Activities in Mouse Liver)

  • 차영남;;;정진호
    • 대한약리학회지
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    • 제21권1호
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    • pp.1-11
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    • 1985
  • 이물질(xenobiotics) 대사에 관여하는 간장 microsome과 cytosol 효소 활성에 indole, indole-3-carbinol 및 benzofuran이 미치는 영향을 검색하기위하여 마우스에 이들 약물을 각각 5 mmole/kg씩 10일간 투여하여 다음 몇 가지의 성적을 얻었다. Benzofuran은 microsome 효소인 aniline hydroxylase, 7-ethoxycoumarin O-deethylase, p-nitrophenol UDPGA-transferase, epoxide hydrolase와 cytosol 효소인 glutathione S-tranferase, NADH : quinone reductase, UDP-glucose dehydrogenase의 활성도를 증가시켰다. 그러나 benzofuran과는 구조적으로 furan ring내의 N원소가 O원소로 치환되었을 뿐 주된 구조가 유사한 indole과 indole-3-carbinol 투여로는 UDPGA-transferase와 NADH: quinone reductase의 활성도 증가를 볼 수 없었으며, 특히 indole은 NADPH : cytochrome C reductase만을 증가시킨데 비하여 구조상 indole에 carbinol (methanol)기가 붙은 indole-3-carbinol은 수종의 mixed function oxidase와 아울러 특히 epoxide hydrolase의 활성도 역시 증가시켰다. 이러한 결과는 benzofuran과 indole-3-carbinol에 의한 epoxide hydrolase 활성도 증가의 기전의 일부를 설명할 수 있을 것으로 생각된다.

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형태 및 분자분석에 의한 한국산 참서대과 어류(가자미목) 2종의 재동정 (Re-identification of Two Tonguefishes (Pleuronectiformes) from Korea using Morphological and Molecular Analyses)

  • 권혁준;김진구
    • 한국수산과학회지
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    • 제49권2호
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    • pp.208-213
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    • 2016
  • The re-identification of two Korean tonguefishes, Cynoglossus interruptus and Symphurus orientalis, was carried out using eight specimens collected from Korean waters in 2007 and 2013. C. interruptus is characterized by having a single row of scales between rows connected to the supraorbital line and the middle lateral line, 107–113 dorsal fin rays, 86–89 anal fin rays, and 53–55 vertebrae. S. orientalis is characterized by having a 1-2-2-2-2 ID pattern, 97–100 dorsal fin rays, 83–89 anal fin rays, and 52–55 vertebrae. Molecular analysis using mitochondrial DNA Cytochrome Oxidase subunit I sequences showed that specimens of the two species corresponded well to Japanese C. interruptus and Taiwanese S. orientalis, respectively. Therefore, although several reports have raised questions regarding the distribution of C. interruptus and S. orientalis in Korean waters, morphological and molecular data confirm that these two species are indeed distributed in these waters.

Luteolin, a Bioflavonoid, Attenuates Azoxymethane-Induced Effects on Mitochondrial Enzymes in Balb/c Mice

  • Pandurangan, Ashok Kumar;Sadagopan, Suresh Kumar Ananda;Dharmalingam, Prakash;Ganapasam, Sudhandiran
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제14권11호
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    • pp.6669-6672
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    • 2013
  • Colon cancer (CRC) is a serious health problem throughout the world. Development of novel drugs without side effects for this cancer is crucial. Luteolin (LUT), a bioflavonoid, has many beneficial effects such as antioxidant, anti-inflammatory and anti-proliferative potential. was a potent chemical carcinogen used for the induction of colon cancer. Colon carcinogenesis was initiated by intraperitoneal injection of azoxymethane (AOM) to mice at the dose of 15 mg/body kg weight in Balb/C mice for 3 weeks. Mice were treated with LUT at the dose of 1.2 mg/body kg weight orally. Mitochondrial enzymes such as isocitrate dehydrogenase (ICDH), ${\alpha}$-keto dehydrogenase (${\alpha}$-KDH), succinate dehydrogenase (SDH) and the activities of respiratory chain enzymes NADH dehydrogenase and cytochrome c oxidase were found to be elevated in AOM-treated animals. Treatment with LUT decreased the activities of all the parameters significantly. Hence, LUT might be a potent anticancer agent against colorectal cancer.

New Record of the Birdbeak Burrfish Cyclichthys orbicularis (Pisces: Diodontidae), in Korea

  • Lee, Won-Chan;Kim, Jeong Bae;Kim, Hyong Chul;Bae, Seung Eun;Ryu, Jung-Hwa;Kim, Jin-Koo
    • Fisheries and Aquatic Sciences
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    • 제17권4호
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    • pp.491-496
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    • 2014
  • A total of six specimens (57.03-100.72 mm in standard length) belonging to the family Diodontidae were collected around Jeju Island, Korea between July and August 2013. On the Basis of morphological and molecular analyses, we identified the specimens as Cyclichthys orbicularis (Bloch, 1785), a new record to the Korean fish fauna. Morphologically, the species is characterized by nine caudal fin rays, immovable spines on the head and body except the caudal peduncle, and small black spots dorsally. Some morphometric characters changed disproportionately with growth, which was a new finding. Caudal peduncle length, body width and preanus length to standard length tend to grow at a rate different from that of overall growth. When the 601 base pairs of mitochondrial DNA cytochrome c oxidase subunit I sequences of our specimens were compared with those of other diodontid fishes, our specimens clustered tightly around C. orbicularis (d = 0.000-0.002) in an NJ tree, with a high bootstrap value (99%). We herein describe the morphological and molecular traits of the specimens, and propose a new Korean name, "gud-ga-si-bok-sok" for the genus Cyclichthys, and "dung-geun-gud-ga-si-bok" for C. orbicularis.

Genetic Variability among Different Populations of Root Knot Nematodes Based on Their Encumbrance Response to Pasteuria Isolates Using PCR-RFLP

  • Kamran, Muhammad;Javed, Nazir;Ullah, Ihsan;Nazir, Shahid;Jamil, Shakra;Iqbal, Muhammad Zafar;Abbas, Huma;Khan, Sajid Aleem;Haq, Muhammad Ehetisham ul
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제35권1호
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    • pp.51-62
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    • 2019
  • A great variable response was observed when PP-3 and PP-J encumbered with 116 populations of root knot nematode (RKN) at two different temperatures ($25{\pm}2^{\circ}C$ and $30{\pm}2^{\circ}C$) and concentrations ($10^4$ and $10^5$ spores/ml). The PCR reaction amplified intergenic region between cytochrome oxidase subunit II gene (COII) and large subunit of rRNA gene (lrRNA) of the mitochondrial genome of different RKN species. The primer C2F3 and 1108 identified M. incognita with the highest frequency (52.6%) followed by M. javanica (36.8%) and M. arenaria (10.5%). The sizes of PCR products were 1.7 kb for M. incognita and M. javanica populations while populations of M. arenaria produced 1.1 kb fragment. The digestion with Hinf I yielded three different fragment length patterns on 1.5 % agarose gel. From current research it is concluded that intra-Meloidogyne genetic variability exist in RKN populations which have better encumbrance with P. penetrans.

일본에 서식하는 큰납지리의 난발생과 초기생활사 (Development of Eggs and Early Life History of Acheilognathus macropterus (Acheilognathinae) from Japan)

  • 김치홍;;김민경;김우진
    • 한국어류학회지
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    • 제24권2호
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    • pp.101-109
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    • 2012
  • 중국으로부터 유입되어 일본의 이바라키현에서 정착한 큰납지리 Acheilognathus macropterus의 난발생과 자치어의 특성에 대해 관찰하였다. 담황색 수정란의 장타원형으로 난경은 장경이 2.68~2.86 mm (평균 $2.78{\pm}0.12mm$, n=40), 단경이 1.42~1.49mm(평균 $1.44{\pm}0.04mm$, n=40)였다. 암컷의 개체 당 채란된 알의 수는 124~180개 (평균 151개)였다. 수정란은 수온 $20{\pm}1.0^{\circ}C$에서 수정 후 78시간 만에 부화하였다. 부화 직후 자어의 크기는 3.8mm이고, 3일째부터는 S자 모양의 빠른 움직임을 보였다. 부화 후 25일 경에 소화기관이 완성되어 먹이를 먹기 시작하고 부출기에 이르렀다. 한국산 큰납지리와 외부형태나 미토콘드리아 cytochrome oxidase I (COI) 유전자의 차이는 크지 않았으나 수정란의 형태가 두 집단 간 뚜렷이 구별되어 분류학적인 논의가 필요하다.

파주시에서 수집한 폐사체 맹금류의 DNA 바코드 연구 (DNA barcoding of Raptor carcass collected in the Paju city, Korea)

  • 진선덕;백인환;이수영;한갑수;유재평;백운기
    • 한국환경생태학회지
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    • 제28권5호
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    • pp.523-530
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    • 2014
  • 2011년 6월 28일에 파주시 조리읍 장곡리 인근 도로에서 두부쪽이 손상되고, 해당연도에 태어난 맹금류 어린새를 발견하였고, 이를 DNA 바코드 기법으로 동정하였다. Mitochondrial DNA(mtDNA) cytochrome c oxidase I(COI) 유전자의 695bp 절편을 중합효소연쇄반응(polymerase chain reaction, PCR)으로 증폭하고 염기서열을 결정하였다. 결정된 염기서열을 BOLD systems과 NCBI의 BLAST에서 유사도 분석을 수행한 결과 총 5개체의 왕새매가 검색되었고, 염기서열의 동일성은 100%로 조사되었다. 또한, DNA 분자성판별 결과는 해당 개체가 암컷임을 나타내었다. 이러한 결과는 경기도 파주에서 1968년 이후 43년만에 왕새매의 번식이 확인된 중요한 정보로, 향후 광역야생동물구조센터는 야생동물의 사체 수거 시 인근 기탁등록보존기관과 연계하여 DNA시료를 확보하고 보다 정확한 종동정과 성판별 정보를 기록하는 등의 체계적인 관리시스템이 필요할 것으로 사료된다. 또한 이렇게 확보한 왕새매의 DNA 시료와 DNA 바코드 COI 유전자 서열은 유사종 연구의 참조표본(reference standard)로 이용될 수 있을 것이다.

두족류의 진위 판별을 위한 Real-time Quantitative PCR 검사법 개발 및 검증 (Development and Validation of Quick and Accurate Cephalopods Grouping System in Fishery Products by Real-time Quantitative PCR Based on Mitochondrial DNA)

  • 정인영;서용배;양지영;권기성;김군도
    • 한국식품위생안전성학회지
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    • 제33권4호
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    • pp.280-288
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    • 2018
  • 본 연구는 국내에서 생산되거나 해외에서 수입되어 국내에서 유통되는 수산물 중에서 두족류를 문어류, 낙지류, 오징어류, 주꾸미류, 꼴뚜기류의 5개 그룹으로 구분하여 분석하였다. 두족류 5개 그룹을 판별을 하기 위해 미토콘드리아에 존재하는 유전자를 분석하였고, 그 중에서 COI (mitochondrial cytochrome C oxidase subunit I), 16s rRNA (16s ribosomal RNA), 12s rRNA (12s ribosomal RNA) 내에서 상당히 유사한 DNA 서열 부분과 일부 서열 변화 부분이 확인되었다. 명확하게 두족류 5개 그룹 판별을 하기 위해 COI, 16s rRNA, 12s rRNA 유전자의 일부 서열 변화 부분에서 그룹 특이적 프라이머 세트를 디자인하였다. 국내 외에서 확보한 두족류 시료(참문어, 낙지, 살오징어, 아메리카 대왕오징어, 갑오징어, 주꾸미, 모래주꾸미, 하이야주꾸미, 참꼴뚜기, 창꼴뚜기, 한치꼴뚜기)의 genomic DNA을 추출하여 각 그룹의 특이적 프라이머를 이용하여 SYBR 기반의 real-time PCR 시스템에 의해 분석되었고, threshold cycle (Ct) value와 같은 real-time PCR 결과 분석에 의해 두족류 내 그룹 판별이 가능하였다(Table 3).