• 한국식품위생안전성학회지
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• 제27권3호
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• pp.317-324
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• 2012

본 연구는 식품원료의 진위여부를 판별하기 위한 시험법으로 일반 프라이머를 이용한 DNA barcode 기법을 도입하였다. 동물성식품원료의 경우 미토콘드리아 DNA 중 cytochrome oxidase subunit I(COI) 부위 검출을 위하여 디자인된 프라이머(LCO1490/HCO2198 및 VF2/FISH R2)와 cytochrome b(cyt b) 부위 검출을 위하여 디자인된 프라이머(L14724/H15915)를 사용하였다. 상기 3 종류의 프라이머를 사용하여 가축류 6종(소, 돼지, 염소, 양, 말 및 사슴), 가금류 4종(닭, 오리, 칠면조 및 타조), 어류 7종(명태, 대구, 청대구, 청어, 송어, 다랑어 및 우럭)을 대상으로 PCR 후 전기영동하여 예상되는 PCR 산물의 생성 유무를 확인하였다. 가축류 6종에 대하여는 LCO1490/HCO2198, VF2/FISH R2 및 L14724/H15915 프라이머를 사용한 경우 COI 및 cyt b가 모두 검출되었으며, 가금류 4종은 LCO1490/HCO2198 및 VF2/FISH R2 프라이머를 사용한 경우만 COI이 검출되었다. 또한 어류 7종은 VF2/FISH R2 프라이머를 사용한 경우에만 COI 부위가 검출됨을 확인하였다. 식물의 경우 엽록체 DNA 부위를 이용하여 디자인된 3 종류의 프라이머(trnH/psbA, rpoB 1F/4R 및 rbcL 1F/724R)를 사용하였다. 각각의 프라이머를 이용하여 식물 5종(마늘, 양파, 무, 녹차 및 시금치)에 대하여 실험한 결과 3종류의 프라이머에서 PCR의 산물을 모두 확인하였으며 trnH/psbA 프라이머의 경우 식물 종마다 PCR 산물의 크기는 다르게 검출되었다. 본 연구에서는 17종의 식품원료별 일반 프라이머 및 PCR 조건을 확립하였으며, 생산된 PCR 산물을 대상으로 염기서열을 결정하고 유전자은행에 있는 염기서열과 DB 비교 분석을 통하여 식품에 사용된 원료의 진위여부 판별에 적용이 가능할 것으로 기대된다.

• Environmental Analysis Health and Toxicology
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• 제21권4호
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• pp.323-330
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• 2006

The aim of current study was to evaluate the toxicity of nonylphenol(NP) on soil nematode, Caenorhabditi elegans. The stress-related gene expression, growth, reproduction and development have been employed to monitor soil toxicity. The 24-h median effect concentrations $(LC_{50s})$ of NP was $0.15mg/L$. The expressions of vitellogenin-6, vitellogenin-2, cytochrome P450 family protein 35a2 and apoptosis enhancer-1 genes were upregulated in C. elegans by NP exposure. Alterations in growth, reproduction and development were also observed in NP-exposed group and especially hatching failure was observed. The overall results indicate that C. elegans has considerable potential as sensitive markers for NP toxicity monitoring.

• 한국동물번식학회:학술대회논문집
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• 한국동물번식학회 2001년도 춘계학술발표대회
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• pp.16-16
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• 2001

Apoptosis로 일컬어지는 예정된 세포사멸(programmed cell death)은 개별 세포의 입장에서는 곧바로 사멸을 의미하지만, 정상적인 고등 생물의 입장에서는 개체의 발생과 분화하는데 프로그램된 과정이다. 자발적 세포사멸은 다른 조직에 비해 생식 조직인 난소나 정소에서 복잡한 apoptosis 기작들을 가지리라 사료된다. 본 연구는 Bcl-2 family중 apoptotic protein인 Bax에 대해 suppression하는 유전자를 yeast system을 활용하여 돼지 정소와 난소로부터 각각 cDNA library를 구축한 후 탐색하였다. 탐색에 활용된 cDNA library는 돼지의 정소와 난소로부터 mRNA를 분리하여 yeast vector인 pAD-GAL4-2.1에 구축하였고, 마우스 bax 유전자는 gal 1 promoter의 조절 하에 glucose 배지에서는 유도되지 않고, galactose 배지에서만 선택적으로 Bax를 발현할 수 있는 효모 vector(pL19-bax)를 구축하였다. Bax에 의한 apoptosis suppressor를 탐색하기 위해 우선 효모 W303에 pL19-bax를 transform하여 glucose 배지에서 Bax의 발현을 억제하였다. pL19-bax를 가진 효모에 정소와 난소로부터 구축된 cDNA library를 transform 시키고, transform된 효모는 각각 Bax에 의한 toxicity를 저해하는 유전자를 찾기 위해 스크린되었다. 이러한 방법으로 정소 cDNA library 탐색에서는 5 $\times$ $10^{6}$ transformant중 39개, 난소cDNA library 탐색에서는 2 $\times$ $10^{6}$ transformant중 26개의 콜로니가 생존하였다. 이들 콜로니로부터 유전자를 분리하여 분석해 본 결과 여러 그룹으로 분류할 수 있었다. 각 그룹의 관련 유전자는 protein synthesis/degradation 12종, oxidation/reductation 5종, detoxin/ cell cycle promoter 3종, signal transduction/growth factor 5종, 그리고 알려지지 않은 유전자 9종이었다. 그 중, bax-toxicity inhibition에 강력한 survival phenotype을 가지는 유전자(pSEDL)를 동정하였다. 이것은 T3-4-1 콜로니로부터 분리하였는데 140개 아미노산으로 이루어진 인간 SEDL(GenBank, XM_013096) 유전자와 매우 유사한 homology를 가지며, bax와 관련된 기능은 밝혀져 있지 않다. 이외에도 분리된 유전자에는 NADH, thioreduction, 그리고 cytochrome oxidase와 같은 positive 유전자 군이 크로닝되어, Bax를 이용한 효모에서 apoptosis suppressor에 관련된 유전자를 손쉽게 스크린하는 것이 가능하고, 분리된 유전자의 기능을 예측할 수 있어 지금까지 보고된 유전자 크로닝법 보다는 강력한 수단으로 활용될 수 있다는 사실을 시사하였다. 그러나, ORF에 관계없이 Bax 발현에 저항하는 유전자군이 선발된다든지 하는 문제점은 금후 검토가 필요하리라 사료된다.

• 방사선산업학회지
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• 제2권3호
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• pp.97-104
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• 2008

Cinnamate-4-hydroxylase (C4H) is a key enzyme of phenylpropanoid pathway, which leads a variety of secondary metabolites to participate in differentiation and protection of plant against environmental stresses. In this study, we isolated a full-length cDNA of the C4H gene from a black raspberry (Rubus occidentalis L.), using a reverse transcriptase-PCR and rapid amplification of the cDNA ends (RACE)-PCR. The full-length cDNA of the RocC4H gene contained a 1,515 bp open reading frame (ORF) encoding a 504 amino acid protein with a calculated molecular weight of about 57.9 kDa and an isoelectric point (pI) value of 9.1. The genomic DNA analysis revealed that RocC4H gene had three exons and two introns. By multiple sequence alignment, RocC4H protein was highly homologous with other plant C4Hs, and the cytochrome P450-featured motifs, such as the heme-binding domain, the T-containing binding pocket motif (AAIETT), the ERR triad, and the tetrapeptide (PPGP) hinge motif, were highly conserved. Southern blot analysis revealed that RocC4H is a single copy gene in R. occidentalis.

• ALGAE
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• 제35권2호
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• pp.157-165
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• 2020

Culture isolates of the genus Hypoglossum (Delesseriaceae, Rhodophyta) were obtained and their development and morphological structure over many years were followed in the laboratory. Molecular data (rbcL, large subunit ribosomal DNA, and cytochrome c oxidase subunit I) were obtained from these strains and evidence presented to recognize the new species: Hypoglossum sabahense from Sabah, Malaysia. Because various aspects of morphology in culture specimens differ significantly from types based on field specimens we have to rely mainly on the molecular criteria in ascribing a new taxonomic name here. This also is complicated by the major lack of molecular phylogenetic evidence for Hypoglossum and other Delesseriaceae. The 'Germling Emergence Method' and 'serendipity' are proving valuable in discovering significant new taxa from laboratory cultures which otherwise might never be known.

• International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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• 제9권1호
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• pp.145-148
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• 2004

As an initial step to define the molecular mechanism of diapause during embryogenesis of the silkworm, Bombyx mori, mRNA transcripts from diapausing eggs and diapause-activated eggs were compared by differential expression using cDNA microarray. Twenty-four individual cDNA clones were identified. Amomg them, ten genes including alcohol dehydrogenase, dead box-l, cytochrome oxidase subunit I and 18 wheeler showed increased expression in the diapause-activated eggs. The rest of fourteen genes showed increased expression in diapausing eggs.

• Toxicological Research
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• 제32권3호
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• pp.225-230
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• 2016

Zingiber officinale Roscoe has been widely used as a folk medicine to treat various diseases, including cancer. This study aims to re-examine the therapeutic potential of co-administration of natural products and cancer chemotherapeutics. Candidate material for this project, ${\alpha}$-zingiberene, was extracted from Zingiber officinale Roscoe, and ${\alpha}$-zingiberene makes up $35.02{\pm}0.30%$ of its total essential oil. ${\alpha}$-Zingiberene showed low $IC_{50}$ values, $60.6{\pm}3.6$, $46.2{\pm}0.6$, $172.0{\pm}6.6$, $80.3{\pm}6.6$ (${\mu}g/mL$) in HeLa, SiHa, MCF-7 and HL-60 cells each. These values are a little bit higher than $IC_{50}$ values of general essential oil in those cells. The treatment of ${\alpha}$-zingiberene produced nucleosomal DNA fragmentation in SiHa cells, and the percentage of sub-diploid cells increased in a concentration-dependent manner in SiHa cells, hallmark features of apoptosis. Mitochondrial cytochrome c activation and an in vitro caspase-3 activity assay demonstrated that the activation of caspases accompanies the apoptotic effect of ${\alpha}$-zingiberene, which mediates cell death. These results suggest that the apoptotic effect of ${\alpha}$-zingiberene on SiHa cells may converge caspase-3 activation through the release of mitochondrial cytochrome c into cytoplasm. It is considered that anti-proliferative effect of ${\alpha}$-zingiberene is a result of apoptotic effects, and ${\alpha}$-zingiberene is worth furthermore study to develop it as cancer chemotherapeutics.

• 동의생리병리학회지
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• 제19권4호
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• pp.1062-1067
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• 2005

The purpose of this study was to examine the inhibition effect of Zizania latifolia that has been used heart disease, Diabetes Mellitus and Skin disease for a long time on apoptosis induced by $H_2O_2$ in Neuro2A cell. Neuro2A cells were cultivated in RPMI(GibcoBRL) with $5\%$, FBS and treated with $H_2O_2$, and Zizania latifolia. We measured the cell viability and analyzed DNA fragmentation. Activity of PARP, Cytochrome C, caspase-9, caspase-3, p53, p21, Bax and Bcl-2 in the cell was examined by using western blot. The cell viability in Zizania latifolia treatment (60ug/ml<) decreased significantly compared with that of none treatment. (p<0.001) Zizania latifolia increased cell viability about twice as much as that being injury by $H_2O_2$. (Zizania Latifolia 20ug/ml, $H_2O_2$ 200uM, P<0.001) DNA fragmentation developed by $H_2O_2$, but was not developed in Zizania latifolia treatment. PARP, Cytochrome C, caspase-9 and caspase-3 activated all by $H_2O_2$ but were not activated in Zizania latifolia treatment.. P53, P2l and Bu activated by $H_2O_2$, and Bcl-2 got into inactivation. But the opposite results appeared in Zizania latifolia treatment. In conclusion, these results suggest that Zizania latifolia inhibit the development of DNA fragmentation and apoptosis by $H_2O_2$ and the antioxidant action of Zizania latifolia is effective. More researches about effect of Zizania latifolia are considered to need.

• 동의생리병리학회지
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• 제20권1호
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• pp.149-155
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• 2006

To prevent human body injury from oxidative stress, antioxidants are very important and many research about antioxidants are generally being conducted. Hydrogen peroxide($H_2O_2$) that is one of vitality oxygen species has been seen that cause various diseases, DNA damage and gene change. The purpose of this study was to examine the inhibition effect of Zizania latifolia Rhizoma on apoptosis induced by $H_2O_2$ in Neuro2A cell. Neuro2A cells were cultivated in RPMI(GibcoBRL) with 5% FBS and treated with $H_2O_2$ and Zizania latifolia Rhizoma. We measured the cell viability and analyzed DNA fragmentation. Activity of PARP, Cytochrome C, caspase-9, caspase-3, p53, p21, Bax and Bcl-2 in the cell was examined dy using western blot. The results obtained were as Follows: The cell viability in Zizania latifolia Rhizoma treatment (60ug/ml<) decreased significantly compared with that of none treatment. (P<0.001) Zizania latifolia Rhizoma increased cell viability about twice as much as that being injury by $H_2O_2$. (Zizania Latifolia Rhizoma 20ug/ml, $H_2O_2$ 200uM, P<0.001) DNA fragmentation developed by $H_2O_2$, but was not developed in Zizania latifolia Rhizoma treatment. PARP, Cytochrome C, caspase-9 and caspase-3 activated all by $H_2O_2$ but were not activated in Zizania latifolia Rhizoma treatment. P53, P2l and Bax activated dy $H_2O_2$, and Bcl-2 got into inactivation. But the opposite results appeared in Zizania latifolia Rhizoma treatment. In conclusion, these results suggest that Zizania latifolia Rhizoma inhibit the development of DNA fragmentation and apoptosis by $H_2O_2$ and the antioxidant action of Zizania latifolia Rhizoma is effective. More researches about effect of Zizania latifolia Rhizoma are considered to need.

• 생명과학회지
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• 제26권4호
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• pp.431-438
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• 2016

TRAIL은 정상세포에서는 세포독성을 나타내지 않는 반면, 암세포에서는 사멸을 유도하므로 항암제로 각광받고 있지만 많은 암세포에서 TRAIL에 저항성을 가지고 있는 것으로 알려져 있으므로 이를 극복해야하는 큰 어려움이 남아있다. 본 연구에서는 TRAIL에 저항성을 가지는 인간 방광암 세포주인 5637 세포를 이용하여 histone deacetylase 억제제인 sodium butyrate (SB)와 TRAIL을 혼합처리하였을 경우 유발되는 세포사멸 효과와 이와 관련된 분자생물학적 메카니즘을 연구하였다. 세포독성이 없는 조건의 TRAIL과 SB를 혼합처리 하였을 경우 SB 단독처리군 보다 세포사멸이 현저하게 증가하는 것으로 확인되었다. TRAIL과 SB의 혼합처리는 caspases (caspase-3, -8 and -9)의 활성화 및 PARP의 단편화를 유발하였다. 하지만 caspase 억제제에 의하여 TRAIL과 SB의 혼합처리에 의하여 유발되는 apoptosis가 현저하게 억제되는 것으로 나타났다. 또한 TRAIL과 SB의 혼합처리는 세포표면에 존재하는 DR5의 발현 증가 및 c-FLIP의 발현 감소를 유발하였으며, pro-apoptotic protein인 Bax와 세포질 cytochrome c의 발현 증가 및 anti- apoptotic protein인 Bcl-xL의 발현감소와 함께 tBid의 형성을 유발하였다. 이는 SB와 TRAIL의 혼합처리가 안전하고 선택적으로 TRAIL에 저항성을 가지는 방광암 세포에서 치료하는데 효과적인 전략임을 제시하는 결과이다.