To estimate the genetic characteristics and cumulative power of discrimination (CPD) existing among Hanwoo (Korean cattle) and exotic foreign population (Angus, Herford, Charolais, Holstein) we used a total of 414 genomic DNAs from five breeds population (Hanwoo, Angus, Hereford, Charolais, Holstein). Genetic characteristics indices including mean allele number among loci, unbiased heterozygosity ($h_i$) within locus and polymorphic information content (PIC) and unbiased average heterozygosity (H) among loci in four breeds were calculated using the generated allele frequencies by each marker. The mean allele numbers for all loci ranged between 5 and 7 while heterozygosity (H) ranged from 0.75 (HW) to 0.64 (HF) among loci and across breeds heterozygosity (H) was 0.69. The generated unbiased average heterozygosity among loci in each breed was integrated to the global formula of CPD resulting in 99.71 % within the populations. The genetic variation of HW (Hanwoo) showed highest estimates among the analyzed breeds.
Olowofeso, O.;Wang, J.Y.;Shen, J.C.;Chen, K.W.;Sheng, H.W.;Zhang, P.;Wu, R.
Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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제18권8호
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pp.1066-1070
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2005
To estimate the cumulative power of discrimination (CPD) existing within Haimen chicken populations in China, we isolated a total of 252 genomic DNAs from four chicken populations (Rugao, Jiangchun, Wan-Nan and Cshiqishi) through a saturated salt procedure. All the genomic DNAs were used in a polymerase chain reaction (PCR) with ten microsatellite markers. Amplified PCR-products with the selected markers were separated on a 12% polyacrylamide gel with pBR322DNA/MspI used as internal standard marker. Genetic diversity indices including mean allele number among loci, unbiased heterozygosity ($h_i$) within locus, effective number of alleles ($N_e$) and polymorphism information content (PIC) as well as the unbiased average heterozygosity (H) among loci in the populations were calculated using the generated allele frequencies by each marker. The mean allele number for all loci ranged between 4.00${\pm}$0.33 (Rugao) to 4.90${\pm}$0.48 (Cshiqishi) and across populations for all loci was 4.60${\pm}$0.20, while (H) ranged from 0.65${\pm}$0.03 (Rugao) to 0.69${\pm}$0.03 (Jiangchun) among loci and across populations, (H) was 0.67${\pm}$0.01. The generated unbiased average heterozygosity among loci in each population was integrated to the global formula of CPD and the result demonstrated that the CPD within the four Haimen chicken populations was 98.75%.
본 연구는 토종닭 순계(적갈계통, 황갈계통), 토종닭 실용계와 오골계 및 외래품종(Hy-Line Brown: HB, White Leghorn: WL)을 대상으로 13종의 MS marker (ADL0309, ADL181, ADL190, ADL279, LEI0073, LEI0192, MCW083, MCW120, MCW153, MCW214, MCW217, MCW226, MCW322)을 활용하여 집단 및 품종간의 유전적 다양성을 분석 하였다. 13종의 MS marker 내에서 총 120개의 대립유전자를 확인 하였으며 평균 9.2개의 대립유전자를 보유한 것으로 나타났다. 관측된 이형질성, 기대되는 이형질성 및 PIC의 평균값은 각각 0.63, 0.72 그리고 0.678로 확인되었다. 가장 많은 평균대립유전자를 보유한 집단은 토종닭 실용계집단이 5.9로 확인 되었으며 기대되는 이형질성이 0.629로 비교적 높게 나타났다. 이는 토종닭 순계 집단을 이용한 3원 교잡을 통해 실용계집단을 생산하는 과정에서 기인한 것으로 추정된다. 집단 및 품종간의 유전적 유연관계를 분석한 결과 토종닭 순계집단 (R, Y)과 실용계집단(C)은 서로간에 가까운 유전적 거리를 유지하고 있는 것으로 확인되었다. 각 MS marker별 품종간의 이형접합률을 이용하여 각 개체들의 집단 내에서 품종을 식별 할 수 있는 확률인 누적품종식별력(CPD) 값을 계산한 결과 13종의 MS marker를 이용하여 개체의 품종을 구분할 수 있는 확률이 99.461%로 나타났다.
본 연구는 10종의 MS(microsatellite) Marker를 이용하여 한국 재래닭 품종 내 외모 특성에 의해 구분되는 3계통(적갈색: 60수, 황갈색: 46수, 흑색: 40수)과 오골계 집단(49수), 총 4계통(총 195수)에 대한 유전 특성을 분석하고, 이를 활용하여 동일성 검정을 실시할 경우 개체 식별에 대한 신뢰도를 검정하기 위해 실시하였다. 집단 간의 유전적 유연관계를 알아보기 위해 각 MS marker별 대립 유전자의 빈도를 산출하여 이를 근거로 집단간의 보정을 통한 방법을 이용하는 DISPAN program을 활용하여 유전적 거리에 대한 추정 결과 R(적갈색 계통)과 L(흑색 계통)간의 유전적 거리는 0.05로 가장 가까운 것으로 나타났으며, R과 Y(황갈색 계통, 0.073), Y과 L(0.083) 역시 가까운 유전적 거리를 나타내고 있음을 확인하였다. 반면, 재래닭 집단과 오골계 집단(S) 간의 유전적 거리는 0.149(R과 S), 0.144(Y과 S) 그리고 0.158(L과 S)으로 비교적 먼 것으로 나타나 재래닭 집단과 오골계 집단 간의 유전적 차별성을 확인할 수 있었다. 10종의 MS marker를 대상으로 누적 개체 식별력을 계산한 결과 99.999%로 확인되었고 $0.255{\times}10^{-7}$의 짝확률 값이 추정되었다.
The purpose of this study is to provide the basic data on the development of ready-to-wear clothing for the elderly women as the population of the elderly has been constantly increasing as well as the purchasing power of the aged. The body measurements of 318 elderly women were taken. whose ages were over 60 years and enrolled in colleges for the elderly. sports centers. or business sites in Seoul and the neighboring districts. A total of 39 features in the lower body were used for the anthropometric measurement and analysis. The results of the study are as follows: 1. Indices of height and weight were used for factor analysis. cluster analysis, and discriminant analysis in order to 'classify lower body somatotype according to shape, excluding size factors. From the results of the factor analysis. the 5 factors showed the cumulative sum of square at 75.63%. 2. Somatotype were classified into two types according to a cluster analysis using height and weight dices. Type 1 is the group is relatively tall and has somewhat fat lower limbs. Type 2 is considered fat and has obesity factors around waist and abdomen area. The hit rate for the classified two groups showed the result at 95.9%.
This study was conducted to establish an individual identification system comprising of 19 microsatellite markers located on different bovine autosomes. The markers were typed on 257 animals from five cattle breeds. In total, 112 alleles were detected from the genotyping of 19 microsatellite markers. The average heterozygosities ranged from 0.292 to 0.824 and the polymorphic information content (PIC) ranged from 0.274 to 0.817 in Hanwoo. We found that there were differences in allele frequencies in Hanwoo when compared with other cattle breeds. The calculated cumulative power of discrimination (CPD) was 99.999% when nine microsatellite loci were used for analysis in the individual identification system. Also the matching probability, the probability that two unrelated animals would show the same genotypes, was estimated to be $0.44{\times}10^{-9}$. Therefore, the nine markers used in this study will be used for individual identification in two million Hanwoo individuals.
본 연구는 서로 다른 상염색체에 위치하고 있는 초위성체유전 표지를 활용하여 제주마 집단의 타 품종과의 차별적 유전특성분석과 제주마 집단에서 활용할 수 있는 효율적인 개체 식별 시스템 설정을 위해 수행되었다. 공시재료로서는 5품종에서 총 191두가 사용되었으며 13종의 좌위에 대한 개체별 유전자형을 분석하였다. 이들 13종에서 출현된 총 대립 유전자수는 제주마의 경우 155종이 나타났다. 한국 제주마 집단에서 나타난 평균 이형접합도는 0.317-0.902였으며 marker 다형성 정보량은 0.498-0.799로 나타났다. 제주마 집단에서 나타난 대립 유전자 발현 특성은 다른 외래 품종 집단과 매우 상이한 결과를 나타냈다. ATH4 좌위의 경우 제주마 집단에서는 5종의 대립 유전자가 고른 분포를 나타낸 반면 QUA종의 경우와 THO종집단에서 특정 좌위의 극단적 발현 빈도를 나타냈다. 품종특이성을 나타내는 분자표지의 대립유전자 발현양상이 확인되었으며 이러한 품종특이성 발현 분자표지는 집단 내 개체에 대한 품종식별 유전자표지로 활용이 가능한 것으로 나타났다. 9종의 초위성체 유전 표지를 활용할 경우 누적 개체 식별력은 99.9%를 나타냈으며 두 마리의 서로 다른 개체가 서로 같은 유전자형을 가질 짝확률은 $0.60\;{\times}\;10^{10}$으로 추정되었다. 따라서 9종의 선정된 유전표지는 제주마 품종 집단에서 적정 신뢰도를 제공할 수 있는 개체 식별 시스템을 설정할 수 있을 것으로 생각된다.
본 연구는 서로 다른 상염색체에 위치하고 있는 초위성체 유전 표지를 활용한 한국재래돼지 집단의 개체 식별시스템 설정을 위해 수행되었다. 공시재료는 4품종에서 총 446두가 사용되었으며 13종의 좌위에 대한 개체별 유전자형을 분석하였다. 이들 13종에서 출현된 이형접합도는 0.286-0.686였으며 marker 다형성 정보량은 0.399-0.796로 나타났다. 한국 재래돼지 집단에서 나타난 대립 유전자 발현 특성은 다른 대조 품종 집단과 매우 상이한 결과를 나타냈다. S0228좌위는 전체 8종의 대립유전자가 나타난 가운데 다른 3품종에서는 발현이 되지 않은 235 대립유전자가 한국 재래돼지 집단에서만 발현이 되었다. 5종의 초위성체 유전 표지를 활용할 경우 누적 개체 식별력은 99.999%를 나타냈으며 두 마리의 서로 다른 개체가 서로 같은 유전자형을 가질 짝확률은 $0.36{\times}10^{-9}$으로 추정되었다. 따라서 10종의 선정된 유전 표지는 한국재래돼지 집단에서 적정 신뢰도를 제공할 수 있는 개체 식별 시스템을 설정할 수 있을 것으로 생각된다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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