Kim, Ju-Won;Cho, Ja Young;Kim, Dong-Gyun;Nam, Bo-Hye;Nho, Eun-Soo;Kim, Bong-Seok;Kim, Young-Ok;Kong, Hee Jeong
한국발생생물학회지:발생과생식
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제24권3호
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pp.207-214
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2020
Primary cell culture is a sufficient method frequently used to study the cellular properties and mechanisms of isolated cells in a controlled environment. In this study, an embryonic cell line (FGBC8) derived from the blastula stages of embryos of olive flounder Paralichthys olivaceus was developed. Furthermore, conditions for optimal long-term maintenance of this primary embryonic cell culture were investigated. Morphologically, FGBC8 cells were composed primarily of epithelial-like cells. FGBC8 cells were subcultured for >160 passages over ~830 days. The doubling time of FGBC8 cells was 73.8 h, and the modal diploid chromosome number was 48. FGBC8 cells transfected with green fluorescence protein (GFP)-expression plasmid exhibited a strong signal 48 h after transfection. Consequently, we demonstrated that fish serum is a crucial supplement for the long-term survival and maintenance of comparable morphology in these primary embryonic cells. Our results can be used as a guide for primary embryonic cell cultures for other fish species and may be useful for cell biotechnological applications.
국내에 서식하는 붕어 (Carassius auratus) 3배체 집단을 동정하고 이들을 대상으로 분자생물학적, 세포유전학적 및 형태학적 특징을 분석하였다. 본 자연산 붕어 3배체 집단은 전형적인 3배체의 세포 유전학적 특성들, 즉 이배체에 비해 1.5배의 세포 및 핵의 크기, 3n=150의 염색체수, 그리고 2배체 (3.6pg/cell)에 비해 1.5배 증가된 DNA 함량 (5.4 pg/cell)을 나타내었다. 또한 본 3배 체붕어 집단은 DNA fingerprinting 분석에 의해 유전적인 구성이 동일한 클론 집단인 것으로 판명되었고 클론 3배체 붕어들은 2배체와 비교시 매우 일양한 형태학적 특성을 나타내었으며 모두 암컷인 전암컷 집단이었다. 본 연구의 분석에 사용된 함안 집단의 3배체 붕어 집단 이외에도 논산, 주문진, 속초 및 삼례 붕어 집단을 대상으로 3배체 출현 빈도를 조사한 결과, 모든 지역에서 $80\%$ 이상의 높은 3배체 빈도를 보였다.
Purpose: Neurofibromas of neuroectodermal origin are commonly found in Von Recklinghausens disease or neurofibormatosis type 1. It is an autosomal dominant disease caused by mutation of the long arm of chromosome 17. It can present from small nodules to disfiguring giant tumor. Plexiform neurofibroma is benign in most cases, but it could be transformed into malignant tumor, which requires surgical excision. To cover the defects after the excision, a number of surgical correction methods are available. This study is to report a surgical correction of disfiguring plexiform neurofibroma using anterolateral thigh free flap for extensive defects after surgical excision of neurofibrona. Methods: Data of five neurofibroma patients with an average age of 39 including medical history, physical examination, computed tomography, and magnetic resonance imaging were checked. No disease other than neurofibroma were detected. Biopsy on the excised tissues was performed. The follow-up period was 7 to 27 months. Results: The average size of defects after complete excision of neurofibroma was $13{\times}10{\sim}25{\times}15$ cm. Defects were covered by anterolateral thigh free flap, while donor sites were covered by local flap, split thickness skin graft and regional flap. Throughout follow-up, there were no complication, relapse, or any abnormalities. Conclusion: Despite various surgical correction methods are applicable to defects after excision on disfiguring plexiform neurofibroma, coverage of massive defects is still challenging in plastic and reconstructive surgeon. We have made five successful cases of surgical correction of disfiguring plexiform neurofibroma using anterolateral thigh free flap.
In addition to identifying genetic differences between target populations, it is also important to determine the impact of genetic differences with regard to the respective target populations. In recent years, there has been an increasing number of cases where this approach is needed, and thus various statistical methods must be considered. In this study, genetic data from populations of Southeast and Southwest Asia were collected, and several statistical approaches were evaluated on the Y-chromosome short tandem repeat data. In order to develop a more accurate and practical classification model, we applied gradient boosting and ensemble techniques. To infer between the Southeast and Southwest Asian populations, the overall performance of the classification models was better than that of the decision trees and regression models used in the past. In conclusion, this study suggests that additional statistical approaches, such as data mining techniques, could provide more useful interpretations for forensic analyses. These trials are expected to be the basis for further studies extending from target regions to the entire continent of Asia as well as the use of additional genes such as mitochondrial genes.
전라남도 여수시 거문도에서 발견된 부추속(부추과) 1분류군을 국내 미기록종으로 보고한다. 이 분류군은 지금까지 일본의 남부지방에만 분포하는 것으로 알려졌던 Allium pseudojaponicum Makino로서, 근연종인 산부추(Allium thunbergii G. Don)에 비해 윤이 나는 상록성의 잎, 화경에 측생하는 인경 및 2n=32의 염색체수 등의 특징으로 쉽게 구분된다. 국명은 생육지의 특성을 고려하여 '갯부추'로 신칭하였다. 이 분류군에 대한 형태적 특징을 기재하였고, 도해 및 생태 사진을 제시하였다.
마이크로어레이 진단 기법의 발달은 세포유전학적 관점에서, 다양한 종류의 유전학적 질병과 관련하여 새로운 정보를 제공하고, 질병에 대한 기본적인 통찰력을 제공하는데 매우 중요한 역할을 제공하고 있다. 그동안 많은 연구들에서, 마이크로어레이 기술을 활용한 인간 게놈의 유동성과 다양성을 입증해 주었으며, 게놈의 취약성을 식별하기 위한 보다 정확한 진단기법과 적절한 임상 관리 방법을 효율적으로 제공해 왔다. 앞으로 다양한 유전과 관련된 질병에 기존 세포유전학적 방법을 자동화된 마이크로어레이 방법으로 전환한다면, 보다 효율적인 방법으로 질병을 진단하고, 정확성을 향상시키며, 유전자 배열의 암호화 및 복잡한 특성을 밝히는데 매우 중요한 역할을 할 것으로 생각된다. 또한 이 분석 기법을 활용하여 게놈과 인간의 건강, 질병과의 관계를 분석하여 다양한 정보를 미리 제공하여 질병을 예방하고, 질병의 진단 및 치료에도 도움이 될 수 있는 새로운 혁명을 일으킬 수 있을 것으로 기대된다.
Eucalyptus is one of the major plantation species with wide variety of industrial uses. Polymorphic and informative simple sequence repeats (SSRs) have broad range of applications in genetic analysis. In this study, two individuals of Eucalyptus tereticornis (ET217 and ET86), one individual each from E. camaldulensis (EC17) and E. grandis (EG9) were subjected to whole genome resequencing. Low coverage (10×) genome sequencing was used to find polymorphic SSRs between the individuals. Average number of SSR loci identified was 95,513 and the density of SSRs per Mb was from 157.39 in EG9 to 155.08 in EC17. Among all the SSRs detected, the most abundant repeat motifs were di-nucleotide (59.6%-62.5%), followed by tri- (23.7%-27.2%), tetra- (5.2%-5.6%), penta- (5.0%-5.3%), and hexa-nucleotide (2.7%-2.9%). The predominant SSR motif units were AG/CT and AAG/TTC. Computational genome analysis predicted the SSR length variations between the individuals and identified the gene functions of SSR containing sequences. Selected subset of polymorphic markers was validated in a full-sib family of eucalypts. Additionally, genome-wide characterization of single nucleotide polymorphisms, InDels and transcriptional regulators were carried out. These variations will find their utility in genome-wide association studies as well as understanding of molecular mechanisms involved in key economic traits. The genomic resources generated in this study would provide an impetus to integrate genomics in marker-trait associations and breeding of tropical eucalypts.
연맥의 2배체가 가지고 있는 유용한 유전자를 재배종인 6배체에 도입시키는 이론적인 구상을 이미 알려진 사실에 기초하여 논의하였으며 이 계획의 주요 요점은 (1) 서로 다른 배수 수준 사이의 교량 역할을 하는 이질6배체를 얻기 위하여 4배체인 Avena magna를 이용하는 것이다. 이 A. magna는 6배체 재배종인 A. sativa와는 2개의 게놈이 부분적으로 상동성을 가지거나 또는 하나는 공통적이고 나머지 하나는 부분적으로 공통성을 가지고 있기 때문에 AA BB 게놈 형태보다는 이들 사이에 보다 정상적인 접합이 이루어질 수 있기 때문이다. A. strigosa와 A. magna는 교배친화성이며 42% 이상의 임실율을 보이고 있다. (2) A. strigosa의 목적하는 유전자가 A. magna에 도입되어 있는 4배체를 선발하고 (3) 합성 5배체는 $2^n=21$인 모배우자를 생성함으로써 A. sativa와 완전 또는 거의 완전한 접합이 이루어지게 된다. (4) 결과적으로는 마지막 단계에서 $A^{As}$ 게놈에 대하여 이질성이지만 이것을 자식시키면 동질계통을 얻을 수 있게 된다.
돼지 6번 염색체에서 근내지방 함량과 등지방 두께와 관련된 QTL이 탐색되어진 영역(6q28-6q32)에서 미세지도 작성을 위한 유용한 marker를 개발하기 위하여 실시하였다. 대량 염기서열 분석자료를 근거로, 반복염기서열 분석을 수행한 결과 KP0290F2(TTCC), KP0248C11(AAAT), KP1231C91(TAG), KP1231C92(TTG) 그리고 KP1231C93(GA)의 5 부위에서 다형성을 나타내었다. 이 부위들에 대한 랜드레이스, 재래돼지, 듀록, 요크셔, 버크셔, 오지산돈, 향돈 그리고 민돈의 8품종에 대한 유전자형 분석 결과 평균 대립유전자의 수는 2.13, 4.63, 7.38, 2.75 그리고 6.25로 나타났다. 그리고 8품종에 대한 KP0290F2, KP0248C11, KP1231C91, KP1231C92 그리고 KP1231C93에 대한 평균 heterozygosity 값을 산출한 결과, 0.2110, 0.6865, 0.8304, 0.4057 그리고 0.7051로 나타났으며, 5markers에 대한 8 품종의 평균 heterozygosity 값은 0.6313, 0.5662, 0.5814, 0.6957, 0.4517, 0.4847, 0.5758 그리고 0.5559로 나타났다. KP0248C11, KP1231C91 그리고 KP1231C93은 적절한 대립유전자 수를 나타내었고, 또한 hetetozygosity 값이 높게 나타났을 뿐만 아니라, 표준편차도 적게 나타난 점으로 미루어 보아 앞으로 유용한 marker로서 이용이 가능할 것이라 사료된다. 본 연구의 결과 개발된 marker는 SW71(98.6cM)과 SW1881(121.1 cM) 영역내에 존재하는 유용한 유전자를 발굴하기 위한 미세지도 작성에 유용하게 활용될 수 있는 marker로 판단되며, positional cloning에도 이용 할 수 있을 것이라 사료된다. 또한 돼지 게놈 연구가 완성되어 염기배열이 밝혀지기 전에 이용 가능한 표지인자들을 다량으로 확보 수 있을 것이라 사료된다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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