• 제목/요약/키워드: Chromosomal study

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Inhibition of chromosomal region maintenance 1 suppresses the migration and invasion of glioma cells via inactivation of the STAT3/MMP2 signaling pathway

  • Shan, Qianqian;Li, Shengsheng;Cao, Qiyu;Yue, Chenglong;Niu, Mingshan;Chen, Xiangyu;Shi, Lin;Li, Huan;Gao, Shangfeng;Liang, Jun;Yu, Rutong;Liu, Xuejiao
    • The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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    • 제24권3호
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    • pp.193-201
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    • 2020
  • Chromosomal region maintenance 1 (CRM1) is associated with an adverse prognosis in glioma. We previously reported that CRM1 inhibition suppressed glioma cell proliferation both in vitro and in vivo. In this study, we investigated the role of CRM1 in the migration and invasion of glioma cells. S109, a novel reversible selective inhibitor of CRM1, was used to treat Human glioma U87 and U251 cells. Cell migration and invasion were evaluated by wound-healing and transwell invasion assays. The results showed that S109 significantly inhibited the migration and invasion of U87 and U251 cells. However, mutation of Cys528 in CRM1 abolished the inhibitory activity of S109 in glioma cells. Furthermore, we found that S109 treatment decreased the expression level and activity of MMP2 and reduced the level of phosphorylated STAT3 but not total STAT3. Therefore, the inhibition of migration and invasion induced by S109 may be associated with the downregulation of MMP2 activity and expression, and inactivation of the STAT3 signaling pathway. These results support our previous conclusion that inhibition of CRM1 is an attractive strategy for the treatment of glioma.

TAR Cloning에 의한 선별적 유전자 분리에 사용되는 TAR Vectors의 유용성에 관한 연구 (The Utility of TAR Vectors Used for Selective Gene Isolation by TAR Cloning.)

  • 박정은;이윤주;정윤희;김재우;김승일;김수현;박인호;선우양일;임선희
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제31권4호
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    • pp.322-328
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    • 2003
  • TAR(Transformation-Associated Recombination) cloning 법은 복잡한 고등생물의 게놈으로부터 유전자나 특정 염색체 부위를 선별적 분리를 가능하게 한다. 이 방법은 목적으로 하는 염색체 부위의 주변에 존재하는 비교적 짧은 게놈 염기서열에 대한 정보를 필요로 하며, spheroplast 형질전환 과정에서 게놈 DNA와 5'-와 3'-표적배열을 지닌 TAR vector 사이에서 일어나는 상동성 재조합과정에 의해 이루어진다. 본 연구에서는 single-copy 유전자의 클론닝에 필요한 specific hook의 최소 크기를 조사하였고, 서로 다른 TAR vector(radial과 unique vector)의 유용성을 조사하기 위해 동일한 single-copy 유전자의 클론닝을 통해 비교하였다. 그 결과, hHPRT 유전자에 대한 TAR cloning의 빈도는 hook의 길이가 750 bp∼63 bp의 범위에서 동일하게 나타났다. radial hook을 사용한 경우보다 unique hook을 사용하였을 경우 형질전환체의 수는 약 20배정도의 감소를 보였으나 목적으로 하는 재조합체의 분리 빈도는 두 배 이상 증가하였다. 그러므로 본 연구에서 two-unique TAR vector는 선별력이 높으므로 일반적 TAR cloning에 사용할 수 있으며, radial TAR vector의 경우는 병리학적 표본과 같이 제한된 게놈 DNA를 사용하는 경우에 더 적합하다고 볼 수 있다. 또한, single-copy 유전자의 분리에 필요로 하는 specific hoot의 최소 길이는 약 60 bp로도 가능하다는 것을 확인하였다.

Chromosomal Integration에 의해 제조한 Bacillus clausii C5 유래의 alkaline protease의 세제 첨가제 응용성 (Feasibility as a Laundry Detergent Additive of an Alkaline Protease from Bacillus clausii C5 Transformed by Chromosomal Integration)

  • 주한승;최장원
    • KSBB Journal
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    • 제27권6호
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    • pp.352-360
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    • 2012
  • Bacillus clausii I-52 which produced SDS- and $H_2O_2$-tolerant extracellular alkaline protease (BCAP) was isolated from heavily polluted tidal mud flat of West Sea in Incheon, Korea and stable strain (transformant C5) of B. clausii I-52 harboring another copy of BCAP gene in the chromosome was developed using the chromosome integration vector, pHPS9-fuBCAP. When investigated the production of BCAP using B. clausii transformant C5 through pilot-scale submerged fermentation (500 L) at $37^{\circ}C$ for 30 h with an aeration rate of 1 vvm and agitation rate of 250 rpm, protease yield of approximately 105,700 U/mL was achieved using an optimized medium (soybean meal 2%, wheat flour 1%, sodium citrate 0.5%, $K_2HPO_4$ 0.4%, $Na_2HPO_4$ 0.1%, NaCl 0.4%, $MgSO_4{\cdot}7H_2O$ 0.01%, $FeSO_4{\cdot}7H_2O$ 0.05%, liquid maltose 2.5%, $Na_2CO_3$ 0.6%). The enzyme stability of BCAP was increased by addition of polyols (10%, v/v) and also, the stabilities of BCAP towards not only the thermal-induced inactivation at $50^{\circ}C$ but also the SDS and $H_2O_2$-induced inactivation at $50^{\circ}C$ were enhanced. Among the polyols examined, the best result was obtained with propylene glycol (10%, v/v). The BCAP supplemented with propylene glycol exhibited extreme stability against not only the detergent components such as ${\alpha}$-orephin sulfonate (AOS) and zeolite but also the commercial detergent preparations. The granulized enzyme of BCAP was prepared with approximately 1,310,000 U/g of granule. Wash performance analysis using EMPA test fabrics revealed that BCAP granule exhibited high efficiency for removal of protein stains in the presence of anionic surfactants as well as bleaching agents. When compared to Savinase 6T$^{(R)}$ and Everlase 6T$^{(R)}$ manufactured by Novozymes, BCAP under this study probably showed similar or higher efficiency for the removal of protein stains. These results suggest that the alkaline protease produced from B. clausii transformant C5 showing high stability against detergents and high wash performance has significant potential and a promising candidate for use as a detergent additive.

전혈, 림프구와 백혈구 연층 각각의 방사성 동위원소 체외 조사 후 배양을 이용한 생물학적 선량측정 (Biological Dosimetry of In Vitro Irradiation with Radionuclides : Comparison of Whole Blood, Lymphocyte and Buffy Coat Culture)

  • 김종호;이동수;최창운;정준기;이명철;고창순;김종순;김희근;강덕원;송명재
    • 대한핵의학회지
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    • 제29권1호
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    • pp.125-132
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    • 1995
  • The purpose of this study was to establish mononuclear cell cultures such as lymphocytes or buffy coat for the biological dosimetry of in vitro Irradiation of the radionuclide Tc-99m in order to exclude the effect of residual doses seen in the cultures of whole blood. Biological do simetry of Tc-99m on cultured mononuclear cells at doses ranging from 0.05 to 6.00 Gy, by scoring unstable chromosomal aberrations(Ydr) observed in cultured lymphocytes, were performed using peripheral venous blood of healthy normal person. The results showed that; (1) In vitro irradiation of radioisotope in separated lymphocyte or buffy coat showed trace amount of residual doses of isotope after washing. Residual doses of isotopes are increased in proportion to exposed time and irradiated dose without difference between I-131 and Tc-99m. (2) We obtained these linear-quadratic dose response equations in lymphocyte and buffy coat culture after in vitro irradiation of Tc-99m, respectively (Ydr = 0.001949 $D^2$ +0.006279D + 0.000185; Ydr= 0.002531 $D^2$-0.003274 D+0.003488). In conclusion, the linear quadratic dose-response equation from in vitro irradiation of Tc-99m with lymphocyte and buffy coat culture was thought to be useful for assessing Tc-99m induced biological effects. And mono-nuclear cell cultures seem to be the most appropriate experimental model for the assessment of biological dosimetry of internal irradiation of radionuclides.

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1.48$\mu\textrm{m}$ Diode Laser로 보조 부화처리 후 이식된 생쥐배의 정상임신에 관한 연구 (Normal Pregnancy of Mouse Embryos Transferred after Assisted Hatching by a 1.48$\mu\textrm{m}$ Diode Laser)

  • 김은영;이봉경;남화경;이금실;윤산현;박세필;정길생;임진호
    • 한국가축번식학회지
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    • 제22권3호
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    • pp.287-292
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    • 1998
  • 본 실험은 1.48$\mu\textrm{m}$ diode laser의 인간배에 대한 적용 가능성 여부를 조사하기 위한 예비실험으로, 체외생산된 생쥐배에 1.48$\mu\textrm{m}$ diode laser를 이용한 zona pellucida (ZP) drilling 처리가 배의 부화와 체내발달에 효과적인지를 조사하고자 실시하였다. 그 결과는 다음과 같다. 발달단계가 상이한(4-세포기배, 배반포기배) 생쥐배에 laser ZP drilling 처리한 후 72시간 (배반포기배) 또는 120시간 (4-세포기배) 동안 배양하였던 바, laser ZP drilling 처리를 받은 배반포기배의 부화율(81.8%)이 대조군 (54. 2%)이나 laser ZP drilling 처리를 받은 4-세포기배 (45.5%) 보다 유의하게 높게 나타났다(p<0.05). 또한, laser ZP drilling된 배반포기배를 가임신이 유도된 대리모에 이식하였던 바, 처리군 (48.7%)의 착상율이 대조군 (43.6%)보다 약간 높게 나타났다. 한편, 임신된 대리모 일부는 분만을 유도하였던 바, 태어난 모든 새끼는 처리군에 관계없이 정상적인 염색체수 (n=40), 정상적인 성장과 생식기능을 나타내었다. 이러한 결과는 1.48$\mu\textrm{m}$ diode laser를 이용한 ZP drilling이 생쥐배의 부화를 증진시키고 정상적인 임신을 유도할 수 있어 인간배에 대한 적용 간으성을 시사한다고 하겠다.

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임상검체에서 분리된 Escherichia coli와 Klebsiella pneumoniae의 Extended-Spectrum β-Lactamase 유전자형 및 분자유전학적 특성 (Molecular Characteristics of Extended-Spectrum β-Lactamase Genes in Clinical Isolates of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae)

  • 정경석
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제38권1호
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    • pp.26-33
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    • 2006
  • Recently, the rapid increase in extended-spectrum ${\beta}$-lactamase (ESBL) producing clinical isolates has become a serious problem. In this study, the epidemiologic features and molecular characteristics of ESBL among clinical isolates of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae, antibiotic susceptibility testing, genotype of the ESBL and patterns of chromosomal DNA from PFGE (pulsed field gel electrophoresis) were observed. A total of 53 ESBL-producing clinical isolates (30 of E. coli and 23 of Klebsiella pneumoniae) were collected from two university hospitals in the period of June to July in 2002 and 2003 respectively. The antibiotic resistance frequency of those 53 strains was tested by the disk agar diffusion method with the result that all the strains were resistant to cephalothin. To other antibiotics, the resistance rates of E. coli (30 isolates) were in order of ceftazidime (90.0%), cefotaxime and aztreonam (respectively 83.3%). Also, the resistance rates of K. pneumoniae (23 isolates) were in order of aztreonam (78.3%), ceftazidime (73.9%) and cefotaxime (65.3%). Also the sensitivity of ceftazidime-clavulanic acid were 100% in E. coli and 95.7% in K. pneumoniae. And the sensitivity of cefotaxime-clavulanic acid was 96.7% in E. coli and 91.3% in K. pneumoniae. The types of the ESBL genes were determined by using polymerase chain reaction (PCR). Among the 30 isolates of ESBL-producing E. coli, 6 (20.0%) have SHV only, 5 (16.7%) have TEM only and, 18 (60.0%) have both of TEM and SHV. Among the 23 isolates of ESBL-producing K. pneumoniae, 7 (30.4%) have SHV only, 2 (8.7%) have TEM only, and 14 (60.9%) have both of TEM and SHV. These results show that 52 strains, with only one exception, were confirmed as either TEM or SHV. The patterns of Xba I-digested chromosomal DNA of ESBL-producing E. coli and K. pneumoniae isolates were analyzed by PFGE. PFGE patterns of E. coli and K. pneumoniae were multiclonal, but many strains were grouped into a few types. Therefore, it seems that there were clonal outbreaks or possible horizontal spread. In conclusion, the TEM and SHV ${\beta}$-lactamase are most widely spread in E. coli and K. pneumoniae in Korea. As these types are usually carried by plasmids, the spread of these ${\beta}$-lactamase genes could compromise the future usefulness of third generation cephalosporins for the treatment of infections caused by E. coli and K. pneumoniae.

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Calcium Ionophore를 이용한 소 배반포로 부터의 배아주 유사세포의 효과적인 분리 (Efficient Establishment of Presumptive Embryonic Stem Cells from Bovine Blastocysts by Exposure to Calcium Ionophore)

  • 김선욱;류재웅;이철상;한용만;박정선;유대열;이경광
    • 한국발생생물학회지:발생과생식
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    • 제3권1호
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    • pp.45-51
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    • 1999
  • 소 배반포로부터 배아주 (embryonic stem, ES) 유사세포를 분리하기 위해서는 영양외배엽 (trophectoderm, TE) 세포를 제거하는 것이 효과적이다. 따라서 본 실험은 효과적으로 TE를 제거하기 위한 calcium ionophore A23187 (CIPA) 처리조건을 확립하고, 분리해낸 ES 유사세포의 in vitro 다능성 (pluripotency)을 검증하고자 수행하였다. CIPA 농도 및 처리시간을 달리 하였을 때 50 $\mu$M에서 25분간 처리한 군이 colony 형성율 (51%)및 10 passage 까지의 배양성적 (4.8%)에서 가장 좋은 결과를 나타내었다. 또한 CIPA를 처리하지 않은 군과의 비교에서도 약 5배의 높은 결과를 보임으로서 본 실험에서 확립된 CIPA 처리조건은 가시적인 toxicity 없이 ES 유사세포의 확립에 이용될 수 있음을 시사하였다. 확립된 ES 유사세포는 heterogeneous한 alkaline phosphatase (AP) 활성을 보여 소 ES 유사세포에 대한 타 보고들과 유사한 결과를 보였다. In vitro 부양배양 (suspension culture)에서는 embryoid body로 분화가 가능하였으며, 약 70% 정도의 euploidism을 보였다. 따라서 본 실험에서 확립된 CIPA의 처리조건이 소 배반포로부터 ES 유사세포를 확립하는데 효과적으로 이용될 수 있음을 확인할 수 있었다.

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Target DNA 염기서열 내에 존재하는 비상동성 간격이 상동성재조합을 이용한 클로닝 빈도에 미치는 영향 (Effect of Non-homologous Spacing in Target DNA Sequence on the Frequency of Cloning Based Homologous Recombination)

  • 김재우;도은주;윤세련;정윤희;윤영호;임선희;선우양일;박인호
    • 미생물학회지
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    • 제41권4호
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    • pp.239-245
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    • 2005
  • Transformation-associated recombination (TAR) 클로닝 법은 복잡한 게놈으로부터 염색체 내의 특정부위나 유전자를 선택적으로 분리할 수 있다. 이 방법은 목적 유전자에 근접한 작은 게놈DNA 염기서열 정보를 필요로 한다. 이 기술은 효모의 spheroplast transformation을 시키는 동안 목적으로 하는 유전자의 5' 또는 3' 서열을 포함하고 있는 TAR vector와 게놈DNA사이에서 일어나는 상동성재조합에 의해 이루어진다. 본 연구에서는 plasmid 모델시스템을 이용하여 target hooks 내에 존재하는 비상동성 염기서 열이 상동성재조합에 미치는 영향을 조사하였다. plasmid에 존재하는HIS3유전자와 변형시킨 his3-TRP1-his3 단편 사이의 상동성재조합의 효율은 $Ura^+$ 형질전환체의 형질분석에 의해 이루어졌다. $Ura^+$ 형질전환체의 수는 7종류의 서로 달리 변형된 his3-TRP1-his3 단편들을 사용하였을 매 거의 동일하게 나타났다. 그러나 $Trp^+His^+$ positive recombinants의 빈도는 변형된 his3-TRP1-his3 단편 내에 비상동성 영역에 부정확한 간격을 지닐 때 현저한 감소를 나타내었다. 이러한 결과로서, 부정확한 간격이 target hook과 substrate DNA 사이에 일어나는 상동성재조합을 방해하는 것으로 사료된다. 그러므로 이종간의 상동유전자를 클로닝 할 때에는 target hook내의 비상동성 염기서열이 존재한다면 이것이 정확한 간격을 지니는지 여부를 중요란 요인으로 고려해야 한다.

버크셔 품종의 돼지 성장과 육질관련 후보유전자의 단일염기 다형성에 관한 연구 (Investigation of Single Nucleotide Polymorphisms in Porcine Candidate Gene for Growth and Meat Quality Traits in the Berkshire Breed)

  • 김상욱;정지혜;도경탁;김관석;도창희;박준규;주영국;김태숙;최봉환;김태헌;송기덕;조병욱
    • 생명과학회지
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    • 제17권12호
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    • pp.1622-1626
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    • 2007
  • 4개의 후보 유전자를 분석해본 결과, 돼지의 주요 염색체 부위 및 유전자들이 주요 경제성 요인들과 관계가 있는 것으로 확인됐다. 양돈업계에서 DNA 기술을 이용한 염색체 정보를 활용하기 위해 본 연구에서는 4개의 후보 유전자에서 생성된 중합효소연쇄반응(PCR) 생성물을 비교 재 서열 함으로써 단일염기변이(SNP) 표지들을 개발했다. 또한 이들 4개의 SNP에 대해 PCR 제한효소 절편길이 다형 성(RFLP)분석을 전개한 후, 이를 대한민국 내 버크셔 종 돼지 개체군의 유전자형을 분석하는데 활용했다. 본 연구는 유용한 단일염기변이를 식별하고 돼지개체군 내 경제적으로 중요한 특성들과 SNP의 연관성을 확인하는 데 그 목적이 있다.

혈역학적으로 의미있는 선천성 심기형을 가진 극소 저체중 출생아의 임상경과 및 예후 (Clinical course and prognosis of hemodynamically significant congenital heart defects in very low birth weight infants)

  • 유혜수;김지은;박수경;서현주;정유진;최서희;정수인;김성훈;양지혁;허준;장윤실;전태국;강이석;박원순;박표원;이흥재
    • Clinical and Experimental Pediatrics
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    • 제52권4호
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    • pp.481-487
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    • 2009
  • 목 적 : 본 연구는 단일 기관에서 혈역학적으로 의미 있는 선천성 심기형을 가진 극소 저체중 출생아의 임상경과와 치료성적 및 예후 인자를 알아보고자 하였다. 방 법 : 1994년 11월부터 2007년 12월까지 13년간 삼성서울병원 신생아 집중치료실에 입원하였던 출생 체중 1,500 g 미만의 극소 저체중 출생아 1,098명을 대상으로 의무기록을 후향적으로 조사하였다. 선천성 심기형을 가진 대상아 33명의 임상경과, 합병증, 예후를 조사하였고 이들을 대조군 1,065명과 비교하였다. 결 과 : 총 극소 저체중 출생아 1,098명 중 33명(3%)에서 선천성 심기형이 있었으며, 이들 중 7명(21%)에서 선천기형 및 염색체 이상을 동반하였다. 심기형 종류로는 심실 중격 결손이 21명(64%)으로 가장 많았다. 자궁 내 성장 지연은 심기형군이 대조군에 비해 높았으나(34% vs. 20%), 재태기간, 출생체중, 신생아 호흡 곤란 증후군, 기관지폐 형성 이상, 괴사성 장염, 뇌실내 출혈, 그리고 낭종성 뇌실주위 백질 연화증의 빈도는 심기형군과 대조군 사이에 차이가 없었다. 심장수술은 단순 심기형에서 4명(19%), 복합 심기형에서 9명(75%)에게 시행되었고, 9명(69%)이 다단계 수술을, 10명(77%)은 조기 중재시술을 받았다. 심기형군의 사망률은 대조군에 비해 증가되어 있었고(27% vs. 16%), 특히 염색체 이상 및 다발성 기형을 동반한 경우에만 증가되었고(86% vs. 11%), 그 외 단순, 복합 심기형 여부(19% vs. 42%)와는 상관관계가 없었다. 결 론 : 극소 저체중 출생아에서 발생한 선천성 심기형의 예후는 심기형 자체의 복합성 보다는 동반된 선천 기형 및 염색체 이상이 결정한다.