• 제목/요약/키워드: Chimeric protein

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Progress and Prospect of Rice Biotechnology in Korea

  • Tae Young, Chung
    • 한국잠사학회:학술대회논문집
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    • 한국잠사학회 1997년도 Progress and Future Development of Sericultural Science and Technology 40th Anniversary Commemoration Symposium
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    • pp.23-49
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    • 1997
  • This is a progress report of rice biotechnology including development of gene transformation system, gene cloning and molecular mapping in rice. The scope of the research was focused on the connection between conventional breeding and biotech-researches. Plant transformation via Agrobacterium or particle bombardment was developed to introduce one or several genes to recommended rice cultivars. Two chimeric genes containing a maize ribosome inactivating protein gene (RIP) and a gerbicide resistant gene (bar) were introduced to Nipponbare, a Japonica cultivar, and transmitted to Korean cultivars. The homozygous progenies of herbicide resistant transgenic plant showed good fertility and agronomic characters. To explore the genetic resourses in rice, over 8,000 cDNA clones from immature rice seed have been isolated and sequenced. About 13% of clones were identified as enzymes related to metabolic pathway. Among them, twenty clones have high homology with genes encoding enzymes in the photorespiratory carbon cycle reaction. Up to now about 100 clones were fully sequenced and registered at EMBL and GenBank. For the mapping of quantitative tarits loci (QTL) and eternal recombinant inbred population with 164 F13 lines (MGRI) was developed from a cross between Milyang 23 and Gihobyeo, Korean rice cultivars. After construction of fully saturated RFLP and AFLP map, quantitative traits using MGRI population were analyzed and integrated into the molecular map. Eighty seven loci were determined with 27 QTL characters including yield and yield components on rice chromosomes. Map based cloning was also tried to isolate semi-dwarf (sd-1) gene in rice. A DNA probe, RG 109, the most tightly linked to sd-1 gene was used to screen from bacterial artifical chromosome (BAC) libraries and five over lapping clones presumably containing sd-1 gene were isolated. Rice genetic database including results of biotech reasearch and classical genetics is provided at Korea Rice Genome Server which is accessible with world wide web (www) browser. The server provides rice cDNA sequences and map informations linked with phenotypic images.

Co-Expression of a Chimeric Protease Inhibitor Secreted by a Tumor-Targeted Salmonella Protects Therapeutic Proteins from Proteolytic Degradation

  • Quintero, David;Carrafa, Jamie;Vincent, Lena;Kim, Hee Jong;Wohlschlegel, James;Bermudes, David
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제28권12호
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    • pp.2079-2094
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    • 2018
  • Sunflower trypsin inhibitor (SFTI) is a 14-amino-acid bicyclic peptide that contains a single internal disulfide bond. We initially constructed chimeras of SFTI with N-terminal secretion signals from the Escherichia coli OmpA and Pseudomonas aeruginosa ToxA, but only detected small amounts of protease inhibition resulting from these constructs. A substantially higher degree of protease inhibition was detected from a C-terminal SFTI fusion with E. coli YebF, which radiated more than a centimeter from an individual colony of E. coli using a culture-based inhibitor assay. Inhibitory activity was further improved in YebF-SFTI fusions by the addition of a trypsin cleavage signal immediately upstream of SFTI, and resulted in production of a 14-amino-acid, disulfide-bonded SFTI free in the culture supernatant. To assess the potential of the secreted SFTI to protect the ability of a cytotoxic protein to kill tumor cells, we utilized a tumor-selective form of the Pseudomonas ToxA (OTG-PE38K) alone and expressed as a polycistronic construct with YebF-SFTI in the tumor-targeted Salmonella VNP20009. When we assessed the ability of toxin-containing culture supernatants to kill MDA-MB-468 breast cancer cells, the untreated OTG-PE38K was able to eliminate all detectable tumor cells, while pretreatment with trypsin resulted in the complete loss of anticancer cytotoxicity. However, when OTG-PE38K was co-expressed with YebF-SFTI, cytotoxicity was completely retained in the presence of trypsin. These data demonstrate SFTI chimeras are secreted in a functional form and that co-expression of protease inhibitors with therapeutic proteins by tumor-targeted bacteria has the potential to enhance the activity of therapeutic proteins by suppressing their degradation within a proteolytic environment.

저밀도 리포단백질 수용체 관련 단백질 5(LRP5) 유전자 적중 생쥐의 개발 (Development of Low Density Lipoprotein Receptor-Related Protein 5 (LRP5) Gene Targeted Mouse)

  • 박효영;김철민;이상미;정영희;문승주;강만종
    • Reproductive and Developmental Biology
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    • 제29권1호
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    • pp.19-24
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    • 2005
  • 저밀도 리포단백질 수용체 관련 단백질 5(LRP5)는 간과 췌장을 포함하여 많은 조직에서 발현하며 아포리포단백질 E와 결합한다. 이와 같은 LRP5 유전자의 체내 기능을 규명하기 위하여 LRP5 유전자가 결손된 생쥐를 개발하였다. 먼지 LRP5 genomic DNA는 TT2 ES 세포로부터 분리하였으며 LRP5 유전자의 엑손 18에 neo 유전자를 삽입한 vector를 구축하고 TT2 ES 세포에 도입하였다. 178개의 G418 내성을 보인 세포 중 상동유전자 재조합에 의하여 targeting vector가 LRP5 유전자 위치에 삽입된 clone은 3개였다. 키메라 생쥐는 상실배기 수정을 ES 세포와 응집시켜 생산하였으며 생산된 키메라 생쥐는 C57BL/6 생쥐와 교미를 유도하여 heterozygous를 얻었다. 또한 이들 heterozygous간의 교배에 의하여 LRP5 유전자 결손 생쥐를 생산하였다. 이러한 생쥐는 LRP5 유전자의 체내 기능연구에 있어서 모델로 이용될 것으로 생각된다.

Regulation of Nrf2 Transactivation Domain Activity by p160 RAC3/SRC3 and Other Nuclear Co-Regulators

  • Lin, Wen;Shen, Guoxiang;Yuan, Xiaoling;Jain, Mohit R.;Yu, Siwang;Zhang, Aihua;Chen, J. Don;Kong, Ah-Ng Tony
    • BMB Reports
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    • 제39권3호
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    • pp.304-310
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    • 2006
  • Transcription factor NF-E2-related factor 2 (Nrf2) regulates the induction of Phase II detoxifying enzymes and antioxidant enzymes in response to many cancer chemopreventive compounds. In this study, we investigated the role of receptor associated coactivator (RAC3) or steroid receptor coactivator-3 (SRC3) and other nuclear co-regulators including CBP/p300 (CREB-binding protein), CARM1 (Coactivator-associated arginine methyltransferase), PRMT1 (Protein arginine methyl-transferase 1), and p/CAF (p300/CBP-associated factor) in the transcriptional activation of a chimeric Gal4-Nrf2-Luciferase system containing the transactivation domain (TAD) of Nrf2 in HepG2 cells. The results indicated that RAC3 up-regulated the transactivation activity of Gal4-Nrf2-(1-370) in a dose-dependent manner. The enhancement of transactivation domain activity of Gal4-Nrf2-(1-370) by RAC3 was dampened in the presence of dominant negative mutants of RAC3. Next we studied the effects of other nuclear co-regulators including CBP/p300, CARM1, PRMT1 and p/CAF, and the results showed that they had different level of positive effects on this transactivation domain activity of Gal4-Nrf2-(1-370). But importantly, synergistic effects of these co-regulators in the presence of RAC3/SRC3 on the transactivation activity of Gal4-Nrf2-(1-370) were observed. In summary, our present study showed for the first time that the 160 RAC3/SRC3 is involved in the functional transactivation of TAD of Nrf2 and that the other nuclear co-regulators such as CBP/p300, CARM1, PRMT1 and p/CAF can also transcriptionally activate this TAD of Nrf2 and that they could further enhance the transactivation activity mediated by RAC3/SRC3.

Leucine zipper도메인의 융합에 의한 바이오시밀러 레미케이드 Single-chain Fv 항체의 항원 결합력 개선 (The Improved Antigen-binding Activity of Biosimilar Remicade ScFv Antibodies by Fusion of the Leucine Zipper Domain)

  • 김진규;김태환
    • 생명과학회지
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    • 제30권11호
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    • pp.1012-1020
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    • 2020
  • 생쥐의 가변부위가 인간의 정상부위에 연결되어 제조된 바이오시밀러 자연항체치료제인 레미케이드는 암괴사인자-알파(TNF-α)에 특이적인 항체로써 카이메릭 단일클론항체이며 류마티스 관절염치료를 위해 개발되었다. 바이오시밀러 레미케이드 항체의 생물학적 기능을 연구하기 위해 우리는 단백질 데이터 은행을 이용한 생물정보학 분석을 수행하여 레미케이드 자연항체와 암괴사인자-알파 항원간의 결합기작특징을 분석하였다. 자연항체를 생산하는 세포의 유전적 불안정성 때문에 레미케이드 항체생산이 제한되므로 우리는 중 사슬 가변부위를 다중펩타이드 링커에 의해 경 사슬 가변부위에 연결된 레미케이드 ScFv항체(Remicade)를 제조하였다. 더욱이 더 높은 생산과 더 높은 항원결합력을 위해 레미케이드 ScFv를 leucine zipper에 융합시켰다. Remicade와 RemicadeScZip ScFv는 대장균에서 발현되었고 Ni+-NTA-아가로스 컬럼으로 정제하였다. 정제된 단백질들은 예상한대로 sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide electrophoresis에서 28.80 kDa과 33.96 kDa을 나타내었다. Remicade는 ELISA, western blot에서 TNF-α 항원에 대한 결합력이 관찰되지 않았으나 RemicadeScZip은 항원결합력을 나타내었다. 추가적인 BLI분석으로 RemicadeScZip의 TNF-α 항원에 대한 결합력을 재확인시켜주었으며 이 결과는 Leucine zipper가 레미케이드 ScFv의 접힘을 안정화시키고 TNF-α 항원에 대한 결합력을 개선시켰음을 제시해주고 있다.

실용형질이 우수한 녹색 형광실크 형질전환 누에 개발 (Development of the transgenic silkworm producing a improved green fluorescence cocoon)

  • 박옥란;김성완;김성렬;김기영;강석우;구태원;최광호
    • 한국잠사곤충학회지
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    • 제52권2호
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    • pp.117-122
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    • 2014
  • 선행연구를 통하여, 형질전환 누에를 제작하는 원천기술을 개발하고 이를 통해 녹색 형광실크를 생산하는 형질전환 누에를 제작한 바 있다. 본 연구에서는 선행연구에서 개발된 녹색 형광실크 형질전환 누에와 국립농업과 학원이 보유하고 있는 누에 유전자원 중 유색견(絹) 누에품종을 이용하여 형질전환 누에와 유색견 누에품종 간 교차교배를 통한 잡종강세를 이용하여 고치 생산량 및 고치의 색채 등이 향상된 녹색 형광실크 형질전환 누에 1대 잡종(F1) 계통을 개발하였다. 본 연구를 통해 선발된 실용형질이 우수한 농가보급형 녹색 형광실크 형질전환 누에 1대 잡종(F1) 계통은 기존 형질전환 누에의 녹색 형광단백질 뿐 아니라 유색견 누에 특유의 천연 연록색도 함께 갖고 있어 별도의 염색이 필요 없는 차별화된 고급 패션의류나 벽지 등의 고품질 소재로 활용이 가능할 것으로 기대된다.

K562 세포의 방사선 감수성 변화에 영향을 미치는 신호전달인자 (Signal Transduction Factors on the Modulation of Radiosusceptibility in K562 Cells)

  • 양광모;윤선민;정수진;장지연;조월순;도창호;유여진;신영철;이형식;허원주;임영진;정민호
    • Radiation Oncology Journal
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    • 제21권3호
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    • pp.227-237
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    • 2003
  • 목적: 만성 골수성 백혈병 세포인 K562 세포주는 방사선 및 다양한 항암제에 대한 apoptosis에 저항성을 가진다. 지난 연구에서 K562 세포는 방사선에 대하여 내성반응을 보이며, 세포내 PTK의 작용을 억제하고자 방사선 조사와 함께 투여한 herbimycin A (HMA)에 의하여 방사선에 대한 apoptosis와 같은 감수성반응이 유도되는 반면, genistein에 의하여 방사선에 대한 apoptosis 반응이 저해됨을 확인하였다. 본 연구에서는 타이로신 인산화효소 억제에 의한 K562 세포의 방사선 반응변화를 조절하는 신호전달경로를 조사하였다. 대상 및 방법: K562 세포를 지수증식기의 세포들만 선택하여 실험에 이용하였다. 방사선조사는 6 MeV 선형가속기(Clinac 1800C, Varian)를 이 용하여 $200\~300$ cGy/min 선량률로 $0.5\~12 $ Gy를 균일하게 조사하였다. HMA와 genistein은 각각 $0.25/muM,\;25\muM$을 방사선 조사 후 즉시 투여하였다. 실험에서 신호전달 경로로 abl kinase, MAPK family, NF-kB, c-fos, c-myc, thymidine kinase1 (TK1) 등에서의 단백질 또는 유전자 발현 및 활성을 조사하였다. 또한 약제 투여에 따른 유전자 발현차이(differential gene expression)를 조사하였다. 결과: Abl kinase의 발현 및 활성 변화를 조사하였으나 PTK 저해제에 의한 방사선 유도 세포사의 변화와의 연관성을 찾을 수 없었다. 세포 생존 및 사멸의 신호전달체계에서 주요 조절과정인 MAPK family의 관여 여부 확인에서 방사선으로 인한 SAPK/JNK의 활성화의 유도가 관찰되었으나, PTK 저해제에 따른 변화는 없었으며, 또한 MAPK/ERK와 p38 MAPK 활성은 모든 조건에서 변함 없이 일정하였다. 전사인자 활성화에 대한 조사에서 방사선 조사와 함께 genistein을 투여한 경우에 NF-kB활성이 증가하였다. 유전자 발현 차이의 조사에서 genistein 투여에 의한 TK 1 유전자 발현 및 단백질 활성이 증가하였다. 결론: PTK 억제에 의한 K562 세포의 방사선에 대한 반응 변화는 bcrabl kinase 활성과는 무관하게 진행되며, MAPK family 경로 외의 다른 경로를 통한 전사인자 활성화 과정이 연관되어 있음을 확인하였다.

감자의 단백질 분해효소 억제제 II 유전자의 특별한 염기서열의 자연적 제거로 인한 상처 유발성 발현의 소실 (Loss of Specific Sequences in a Natural Variant of Potato Proteinase Inhibitor II Gene Results in a Loss of Wound-Inducible Gene Expression)

  • ;박상규
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제39권2호
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    • pp.104-111
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    • 1996
  • 감자의 genomic DNA library로 부터 분리한 proteinase inhibitor II (pin2) 유전자들의 제한효소 지도를 작성 하였던바 이미 분리된 상처 유발 (wound-inducible)pin2K 유전자의 것과 상이성이 있는 pin2T를 분리하여 염기서열을 결정하였다. 두 유전자의 염기서열은 전체적으로 약 86%의 동일성을 보였으며 특히 promoter 부위의 염기서열은 pin2K 유전자의 전사개시 부위의 상대적인 위치인 -714까지 네부분의 결손(20 내지 60bp)을 제외하던 약 91%수준의동일성을 보였다. 분리한 유전자들의 promoter 부위를 표지 유전자인 CAT와 GUS 유전자에 연결 시킨후 담배에서의 발현을 추적하였던바, pin2K 유전자의 promoter에 의한 표지유전자의 발현은 상처에 의해 발현 되었으나 pin2T 유전자의 promoter에 의한 표지유전자의 발현은 상처 유무와 관계없이 낮은 수준으로 나타났다. 또한 pin2T 유전자의 Promoter 내의 결손은 핵 단백질의 promoter에의 결합에 영향을 주지 않았으며 상처 유발pin2K 유전자의 promoter 염기서열과 비교하였을때 pin2T 유전자의 promoter 부위내에 5'-AGTAAA-3'라는 특별한 염기부위가 자연적으로 제거된것을 알수 있었다. 또한 5'-AGTAAh-3'의 염기부위가 다른 상처 유발 유전자들에서는 흔히 발견되고, 다른 식물 유전자들의 Promoter에서는 쉽게 발견이 되지 않았다. 따라서 상처 유발 pin2K 유전자의 Promoter내에 상처 유발과 관련있는 특별한 염기부위가 자연적으로 결실되어 pin2T 유전자의 발현이 상처 유발성을 잃은것으로 짐작된다.

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