본 연구에서는 2차원 형광스펙트럼의 PCA 분석을 통하여 발효 공정을 모니터링하고 PCR과 PLS과 같은 다변량 분석기법을 이용하여 공정을 모델링하였다. 재조합 대장균 E. coli 와 효모 S.cerevisiae의 발효 공정 중에 얻어진 많은 양의 2차원 형광스펙트럼 자료는 우선 PCA를 통해 축소된다. 그리고 PCA에서 주성분점수와 적재 산점도는 발효 공정의 정성적 경향을 묘사하기 위해 사용되었다. 또한, PCR과 PLS는 2차원 형광스펙트럼의 분석을 위해 사용되었으며 PLS모델이 보정과 예측 능력에서 PCR모델보다 조금 더 우수한 성능을 나타냈다. 따라서 2차원 형광스펙트럼 자료를 이용하여 생물공정을 모델링 하고자 할 때는 PCR 방법보다는 PLS 방법을 사용하는 것이 유리할 것이다.
Park, Man-Ki;Park, Jeong-Hill;Cho, Jung-Hwan;Kim, Na-Young;Kang, Jong-Seong
Archives of Pharmacal Research
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제15권4호
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pp.376-378
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1992
A chemical tool was developed for the analysis of complex mixtures such as crude drugs by the method of pattern recognition. Pattern recognition was accomplished by a multiple reference peak identification method and three kinds of outlier statistics. This tool was tested on the analysis of synthetic mixtures.
분석이 번거로웠던 현미의 총 식이섬유(TDF) 함량을 신속하면서도 친 환경적인 비파괴 분석방법인 FT-NIRS를 이용하여 예측 모델을 개발하였다. 현미는 국내산으로 전남 지방에서 재배된 47개 품종(516개 시료)에 대해서 AOAC 방법에 준한 효소법에 의해 각 측정 시료별 TDF 함량을 분석하였다. 습식 분석된 TDF 함량의 분석오차범위는 0.17-0.72% 이었다. FT.NIRS로 측정된 스렉트럼의 검량식은 빛의 산란 효과를 최소화하기 위해 수학적 처리를 하였고, 몇 개의 특정 파장이 아닌 전 파장 영역(1,000-2,500nm)에 대해서 PLS법으로 작성하였다 회귀분석과 검량식은 NIRCal chemometric software에 의해 작성되었다. 얻어진 검량식의 정확도는 상관계수(r), SEE 및 SEP로 확인하였다. 현미 중 총 식이섬유 함량에 대한 회귀분석을 행한 결과, 상관계수는 0.9780, SEE는 0.0636, SEP는 0.0642로 측정 정확도가 우수함으로 현장 적용을 위한 실용화도 가능할 것으로 판단된다.
Removal of variability in spectra data before the application of chemometric modeling will generally result in simpler (and presumably more robust) models. Particularly for sparsely sampled data, such as typically encountered in diode array instruments, the use of Savitzky-Golay (S-G) derivatives offers an effective method to remove effects of shifting baselines and sloping or curving apparent baselines often observed with scattering samples. The application of these convolution functions is equivalent to fitting a selected polynomial to a number of points in the spectrum, usually 5 to 25 points. The value of the polynomial evaluated at its mid-point, or its derivative, is taken as the (smoothed) spectrum or its derivative at the mid-point of the wavelength window. The process is continued for successive windows along the spectrum. The original paper, published in 1964 [1] presented these convolution functions as integers to be used as multipliers for the spectral values at equal intervals in the window, with a normalization integer to divide the sum of the products, to determine the result for each point. Steinier et al. [2] published corrections to errors in the original presentation [1], and a vector formulation for obtaining the coefficients. The actual selection of the degree of polynomial and number of points in the window determines whether closely situated bands and shoulders are resolved in the derivatives. Furthermore, the actual noise reduction in the derivatives may be estimated from the square root of the sums of the coefficients, divided by the NORM value. A simple technique to evaluate the actual convolution factors employed in the calculation by the software will be presented. It has been found that some software packages do not properly account for the sampling interval of the spectral data (Equation Ⅶ in [1]). While this is not a problem in the construction and implementation of chemometric models, it may be noticed in comparing models at differing spectral resolutions. Also, the effects on parameters of PLS models of choosing various polynomials and numbers of points in the window will be presented.
The transfer of predictive models using various chemometric techniques has been reported for FTNIR and scanning-grating based NIR instruments with respect relatively dry samples (<10% water). Some of the currently used transfer techniques include slope and bias correction (SBC), direct standardization (DS), piecewise direct standardization (PDS), orthogonal signal correction (OSC), finite impulse transform (FIR) and wavelet transform (WT) and application of neural networks. In a previous study (Greensill et at., 2001) on calibration transfer for wet samples (intact melons) across silicon diode array instrumentation, we reported on the performance of various techniques (SBC, DS, PDS, double window PDS (DWPDS), OSC, FIR, WT, a simple photometric response correction and wavelength interpolative method and a model updating method) in terms of RMSEP and Fearns criterion for comparison of RMSEP. In the current study, we compare these melon transfer results to a similar study employing pairs of spectrometers for non-invasive prediction of soluble solid content of peaches.
High-resolution $^1H$ NMR spectroscopic technique has been widely used as one of the most powerful analytical tools in food chemistry as well as to define molecular structure. The $^1H$ NMR spectra-based metabolomics has focused on classification and chemometric analysis of complex mixtures. The principal component analysis (PCA), an unsupervised clustering method and used to reduce the dimensionality of multivariate data, facilitates direct peak quantitation and pattern recognition. Using a combination of these techniques, the various green teas and black teas brewed were investigated via metabolite profiling. These teas were characterized based on the leaf size and country of cultivation, respectively.
This paper describes a technique combining chemometrics with UV spectroscopy for the determination of the concentra tions of two tissue additives (i.e., wet strength and softening agents) in a cellulose fiber containing solution. In single as ent solutions, the concentration of the additive can be measured by UV spectroscopy at the wavelength where the species having absorption. For a binary (i.e., containing two additives) solution system, the spectral characterization is very complicated. However, if aided by a chemometrical calibration technique, each additive in the binary solution can be quantified simultaneously. The present method is very rapid and simple, it can easily perform a continuous measurement in the changes in the additives' concentration after fiber addition, and therefore this becomes a valuable tool for the adsorption kinetics study of chemical additives onto the cellulose fibers. The time-dependent adsorption behaviors of the wet-strength, softening agent, and their both on fiber were also presented.
Chemometrics의 한 분야인 패턴인지(pattern recognition)법을 한국산 고대 유리시료 94종의 중성자방사화분석으로부터 얻은 다변수데이타에 적용하였다. unsupervised learning의 방법인 주성분분석과 비선형도시법으로 시료를 분류한 결과 유리시료는 6개의 군을 형성하였다. 6개의 참조시료셋트와 시험시료셋트에 supervised learning의 SIMCA법을 적용시켰다. 그 결과 참조시료셋트는 주성분분석법 및 비선형도시법의 결과와 일치하였고 시험시료셋트에서 33개의 시료 중 17개 시료에 대해 시료가 속한 군을 판정할 수 있었다.
Gas Chromatography-Mass Spectrometry (GC-MS) fingerprint analysis, Principle Components Analysis (PCA), and Hierarchical Cluster Analysis (HCA) were introduced for quality assessment of Curcuma longa L. (C. longa). The GC-MS fingerprint method was developed and validated by analyzing 33 batches of samples of C. longa from different geographic locations. 18 chromatographic peaks were selected as characteristic peaks and their relative peak areas (RPA) were calculated for quantitative expression. Two principal components (PCs) were extracted by PCA. C. longa collected from Guizhou and Fujian were separated from other samples by PC1, capturing 71.83% of variance. While, PC2 contributed for their further separation, capturing 11.13% of variance. HCA confirmed the result of PCA analysis. Therefore, GC-MS fingerprint study with chemometric techniques provides a very flexible and reliable method for quality assessment of C. longa.
소염제 piroxicam (PX, 4-hydroxy-2-methyl-N-2-pridyl-2H-1, 2-benzothiazine-3-carboxadiamide-1,1-dioxide)의 착물형성을 전이금속이온, Co(II), Ni(II), Cu(II), Zn(II)과 함께 메탄올(MeOH)/물 이성분 혼합물에서 25$^{\circ}C$, 일정한 pH=5.0와 I=0.1 M에서 분광광도법으로 연구하였다. 컴퓨터 프로그램 SQUAD를 스팩트라 데이터로부터 원하는 정보를 얻는데 사용하였다. Fitting 과정의 output은 안정도 상수, 평가한 안정도 상수의 표준편차, 농도분포 다아그램, 모든 종의 스팩트럼 프로파일이다. Co(II), Ni(II), Cu(II), Zn(II)의 PX 착체의 안정도 순서는 Cu(II) > Co(II) > Ni(II) ${\approx}$ Zn(II) 순서이다. 이것은 이들 금속이 온들이 기하학적 경향이 다른 이유일 것이다. PX의 산성도 상수는 다른 pH 값에서 흡수 스펙트럼으로 부터 위의 조건에서 역시 결정하였다. 컴퓨터 프로그램 DATAN을 PX의 산성도 상수의 결정하는 데 사용하였다. 산성도 상수의 validity는 잘 알려진 컴퓨터 프로그램 SPECFIT/32을 사용하였다. 안정 및 산성도 상수의 용매성질, 음이온과 같은 다른 인자의 효과에 관하여 자세하게 논의하였다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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