• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제28권9호
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• pp.1549-1552
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• 2007

The cytoplasmic domain of syndecan-4, a type I transmembrane heparan sulfate proteoglycan, was overexpressed as a fused form with the ubiquitin molecule in Escherichia coli, and the fusion protein was purified using immobilized metal affinity chromatography (IMAC). The cytoplasmic domain was released from its fusion partner by using yeast ubiquitin hydrolase (YUH), and subsequently purified by reverse phase chromatography. The integrity of the resulting peptide fragment was checked by MALDI-TOF and NMR spectroscopy. The yield of the peptide was 3.0-1.5 mg per liter in LB or minimal medium, respectively. The recombinant expression and purification of this domain will enable us its structural and functional studies using multidimensional NMR spectroscopy.

• Molecules and Cells
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• 제26권5호
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• pp.443-453
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• 2008

The Bric-a-brac, Tramtrack, Broad-complex (BTB) domain is a protein-protein interaction domain that is found in many zinc finger transcription factors. BTB containing proteins play important roles in a variety of cellular functions including regulation of transcription, regulation of the cytoskeleton, protein ubiquitination, angiogenesis, and apoptosis. Here, we report the cloning and characterization of a novel human gene, KLHL31, from a human embryonic heart cDNA library. The cDNA of KLHL31 is 5743 bp long, encoding a protein product of 634 amino acids containing a BTB domain. The protein is highly conserved across different species. Western blot analysis indicates that the KLHL31 protein is abundantly expressed in both embryonic skeletal and heart tissue. In COS-7 cells, KLHL31 proteins are localized to both the nucleus and the cytoplasm. In primary cultures of nascent mouse cardiomyocytes, the majority of endogenous KLHL31 proteins are localized to the cytoplasm. KLHL31 acts as a transcription repressor when fused to GAL4 DNA-binding domain and deletion analysis indicates that the BTB domain is the main region responsible for this repression. Overexpression of KLHL31 in COS-7 cells inhibits the transcriptional activities of both the TPA-response element (TRE) and serum response element (SRE). KLHL31 also significantly reduces JNK activation leading to decreased phosphorylation and protein levels of the JNK target c-Jun in both COS-7 and Hela cells. These results suggest that KLHL31 protein may act as a new transcriptional repressor in MAPK/JNK signaling pathway to regulate cellular functions.

• BMB Reports
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• 제28권2호
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• pp.87-93
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• 1995

To investigate the biological functions of the EGF-like domain of mouse betacellulin (BTC), mouse BTC(33-80), a 48-residue peptide corresponding to the EGF-like domain, was synthesized by stepwise solidphase methods using a 9-fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc) strategy. The homogeneity of synthetic mouse BTC(33-80) was confirmed by analytical reversed phase (RP)-HPLC, amimo acid analysis, and fast atom bombardment mass spectrometer (FAB-MS). Three disulfide bond pairings of synthetic mouse BTC(33-80) were established by amino acid analysis of cysteine-containing fragments derived from thermolytic digestion. These were consistent with the pairings of EGF and transforming growth factor ($TGF-{\alpha}$). The EGF-Iike domain of mouse BTC showed equipotent activity in both EGF-receptor binding on A-431 epidermoid carcinoma cells, and mitogenesis on NIH-3T3 fibroblast cells, as compared with authentic h-EGF. Results suggest that the EGF-Iike domain of BTC plays a significant role in mitogenic activity with an EGF-receptor mediated system.

• 대한화학회지
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• 제68권1호
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• pp.25-31
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• 2024

The p97 adenosine triphosphatase is a key player in protein homeostasis, responsible for unfolding ubiquitylated substrates. It engages with various adaptor proteins through its N-terminal domain, with the p97-p47 complex attracting particular attention for its involvement in membrane remodeling. Although the structures of p97 in complex with the Ubiquitin regulatory X (UBX) domain from various adaptors have been reported, the stoichiometry is conflicting. Here, we report the crystal structure of the p97 N-D1 hexamer in complex with the p47 UBX domain at a resolution of 2.7 Å. The structure reveals a stoichiometry of 6:6 between the p97 N-D1 and the p47 UBX domain. These findings provide valuable insights into the binding stoichiometry of p97 N-D1 and p47 UBX domain, which are crucial for understanding the role of p97 and adaptor proteins in cellular processes such as the ubiquitin-proteasome pathway, membrane fusion, and cell cycle regulation.

• 대한화학회지
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• 제65권5호
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• pp.347-357
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• 2021

이 연구는 우리나라와 에스토니아의 과학과 교육과정을 화학 영역을 중심으로 비교 분석하여 차기 교육과정 개정을 위한 시사점을 도출하는데 목적이 있다. 이를 위해 과학 교과를 중심으로 전반적인 교육과정 설계와 두 나라의 공통 교육과정에 해당하는 과목에서 다루어지는 화학 영역의 핵심 개념을 비교하였다. 분석 결과 첫째로, 에스토니아는 총론에서 제시한 핵심역량이 과학 교과에서 어떻게 구체적으로 연결되는지를 구체적으로 제시하고 있었다. 뿐만 아니라, 탐구 기능 및 태도와 가치를 교육과정 문서에 구체적으로 제시한 특징이 있었다. 둘째로, 화학의 핵심 개념 분석 결과 우리나라에서 다루어지는 개념이 대부분 에스토니아에서도 다루어졌다. 다만, 에스토니아는 더 광범위한 개념을 보다 정성적으로 다루는 경향이 컸다. 화학 과목에서 다루어지는 개념은 우리나라의 공통 교육과정 수준을 넘었으나, 이 과목도 정성적인 접근을 시도한다는 특징이 있었다.

• 대한화학회지
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• 제51권5호
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• pp.433-446
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• 2007

이 연구의 목적은 Small-Scale Chemistry 실험수업이 고등학교 2학년 자연계열 학생의 학업적 자기 효능감 및 과학 관련 정의적 특성에 미치는 영향을 알아보는 것이다. 7차 교육과정 고등학교 화학 I 교과서를 분석하여 SSC 화학 실험 프로그램을 개발하였고, 실험집단은 SSC 실험수업을 실시하고 비교집단은 전통적인 실험수업을 실시하였다. 학생들의 사전 과학성취도 점수를 이용하여 상하 수준으로 나눈 후 이를 구획변인으 로 하는 이원 공변량(2-way ANCOVA) 분석을 통해 두 집단 간의 차이를 알아보았다. 연구 결과 SSC 실험 프 로그램은 전통적 Large-Scale 실험에 비해 학업적 자기효능감의 향상에 유의미한 효과가 있었다. 또한 과학에 대한 정의적 특성 중에서 과학에 대한 직업적 흥미와 창의성 등에서 SSC 실험 집단의 점수가 유의미하게 높 은 것으로 나타났다. SSC 실험수업에 대한 학생들의 인식 조사 결과 대부분의 학생들은 SSC 실험이 편리하 고, 효과적이며 흥미로운 방법이라고 생각하고 있었다.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제29권1호
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• pp.252-254
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• 2008

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제24권5호
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• pp.664-666
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• 2003

• BMB Reports
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• 제43권5호
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• pp.355-362
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• 2010

The sterile alpha motif (SAM) is a putative protein interaction domain involved in a wide variety of biological processes. Here we report the identification and characterization of a novel gene, SAMD4B, which encodes a putative protein of 694 amino acids with a SAM domain. Northern blot and RT-PCR analysis showed that SAMD4B is widely expressed in human embryonic and adult tissues. Transcriptional activity assays show SAMD4B suppresses transcriptional activity of L8G5-luciferase. Over-expression of SAMD4B in mammalian cells inhibited the transcriptional activities of activator protein-1 (AP-1), p53 and p21, and the inhibitory effects can be relieved by siRNA. Deletion analysis indicates that the SAM domain is the main region for transcriptional suppression. The results suggest that SAMD4B is a widely expressed gene involved in AP-1-, p53- and p21-mediated transcriptional signaling activity.

• 한국과학교육학회지
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• 제38권5호
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• pp.625-633
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• 2018

본 연구에서는 TIMSS 공개문항들 중 TIMSS 2011과 TIMSS 2015에 공통으로 사용된 추이문항을 활용하여 우리나라 중학교 2학년 학생들의 화학 영역 성취도 추이를 교육과정 변화에 근거하여 분석하였다. 과학교육을 전공한 연구자 3명과 중학교 현장교사 6명이 참여하여 TIMSS 문항과 교육과정 일치도 분석을 실시하였으며, TIMSS 2015 과학에서 화학 내용영역과 인지영역에 대해 우리나라 학생들의 성취 특성을 분석하였다. 공개된 추이문항을 중심으로 화학 영역 평가주제별로 우리나라 학생들의 정답률과 응답경향을 분석한 결과에 따르면, 화학반응에서의 규칙성, 산화와 환원 등과 같은 일부 평가주제를 우리나라 2009개정 교육과정에서 중학교 3학년 이후에 다루는 까닭에 우리나라 중2 학생들의 정답률이 낮게 나타났다. 과학 인지영역별로는 우리나라 중2 학생들은 성취도 상위국인 싱가포르나 일본학생들에 비해서 적용하기 영역이 상대적으로 취약한 것으로 나타났다. 연구결과를 토대로 주기율표를 포함하여 우리나라 중학교 화학영역 교육과정 및 교수학습 개선 방안을 제안하였다.