It is becoming more and more clear that each cell, even those of the same type, has a unique identity. This sophistication and the diversity of cell types in tissue are what are pushing the necessity for spatially distributed omics at the single-cell (SC) level. Single-cell chemical assessment, which also provides considerable insight into biological, clinical, pharmacodynamic, pathological, and toxicity studies, is crucial to the investigation of cellular omics (genomics, metabolomics, etc.). Mass spectrometry (MS) as a tool to image and profile single cells and subcellular organelles facilitates novel technical expertise for biochemical and biomedical research, such as assessing the intracellular distribution of drugs and the biochemical diversity of cellular populations. It has been illustrated that ambient mass spectrometry (AMS) is a valuable tool for the rapid, straightforward, and simple analysis of cellular and sub-cellular constituents and metabolites in their native state. This short review examines the advances in ambient mass spectrometry (AMS) and ambient mass spectrometry imaging (AMSI) on single-cell analysis that have been authored in recent years. The discussion also touches on typical single-cell AMS assessments and implementations.
Luong, Hoang Van;Long, Nguyen Van;Duong, Vu Binh;Toan, Nguyen Linh;Minh, Nguyen Van;Quang, Le Bach;Kim, Nam-Hyuck;Byun, Sang-Yo
KSBB Journal
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v.24
no.2
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pp.177-181
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2009
This study was initiated to investigate the impacts of media types and other components on the callogenensis and cell mass production of Panax vietnamensis in the first step of the cell biomass procedure. Four media were checked: Murashige-Skoog (MS), White, Gamborg and Nitch-AII. All the four media were shown potential media for Panax vietnamensis callogenensis and cell mass production, in which the MS medium showed the best results: the successful callogenensis ratio and cell mass formation were 30% and 62,93 ${\pm}$ 3,63 mg (DW) respectively, the Nitch medium showed the lowest results: the successful callogenensis ratio and cell mass formation were 15% and 27,10 ${\pm}$ 2,24 mg (DW) respectively. The results showed that the MS medium is the most suitable medium for Panax vietnamensis callogenensis and cell mass production.
Relationships between red ceil volume $(^{51}Cr-cell)$, total blood volume (red cell volume divided by hematocrit ratio), and extracellular fluid volume (SCN distribution space) and body weight (ranging between 73 and 384 grams) or lean body mass were studied in 59 nembutalized rats. Lean body mass was determined by means of underwater weighing method on rats clipped and eviscerated. There were positive correlations between body weight or lean body mass and the absolute values (in milliliters) of body fluid volumes. Body fluid volumes expressed on the body weight or lean body mass basis, however, showed negative correlations between body weight (grams) or lean body weight (grams) with one exception. Red cell volume expressed as % lean body mass showed a positive correlation with lean body mass. The other results are summarized as follows: 1. Body density of rats was 1.0561 $(range:\;1.0123{\sim}1.0781)$ and 19.8% body weight of total body fat was obtained. The mean value of lean body mass was 80.2% body weight 2. The correlation between body weight and lean body mass was high, namely, coefficient of correlation was r=.99. 3. The correlation between the absolute value of red cell volume (ml) and body weight showed a high correlation, namely, r= 92 and between the lean body mass coefficient of correlation was r=.93. On a weight basis, red cell volume was 2.67 ml/100 gm body weight or 3.48 ml/100 gm lean body mass. The coefficient of correlation between body weight (grams) and red cell volume (% body weight) was r=-. 30. The coefficient of correlation between lean body mass (grams) and red cell volume (% lean body mass) was r=. 50. Thus, the following regression equation was obtained. Red cell volume (% lean body mass)=. 00243 Lean body mass (gm)+3. 12. 4. Total blood volume was 6.06% body weight or 7.83% lean body mass. The correlation between these blood volume values and body weight or lean body mass were negative, namely, r= -.43 and r=-.42 respectively. 5. Extracellular volume (SCN space) was 30.0% body weight or 37.2% lean body mass. These percentage values showed negative correlations between body weight or lean body mass and coefficients of correlation were r=-.40 and r=-.54 respectively. 6. The rate of increase in body weight or lean body mass is accompanied by a smaller rate of increase in blood volume and extracellular fluid volume. The rate of increase in red ceil volume paralled that of lean body mass.
The optimal conditions for production of Monascus sp. KM100l cell mass on submerged culture and production of monacolin K on rice solid culture were investigated. An overproducing mutant of Monascus pigments, KM 1001 mutant, from Monascus purpureus KCCM60016 was selected by NTG treatment. The optimal medium for the production of KM100l mutant cell mass is instructed to be composed of 3% glucose, 2% yeast extract, 0.1 % KH$_2$PO$_4$, 0.05% The optimal conditions for production of Monascus sp. KM100l cell mass on submerged culture and production of monacolin K on rice solid culture were investigated. An overproducing mutant of Monascus pigments, KM 1001 mutant, from Monascus purpureus KCCM60016 was selected by NTG treatment. The optimal medium for the production of KM100l mutant cell mass is instructed to be composed of 3% glucose, 2% yeast extract, 0.1 % KH$_2$The optimal conditions for production of Monascus sp. KM100l cell mass on submerged culture and production of monacolin K on rice solid culture were investigated. An overproducing mutant of Monascus pigments, KM 1001 mutant, from Monascus purpureus KCCM60016 was selected by NTG treatment. The optimal medium for the production of KM100l mutant cell mass is instructed to be composed of 3% glucose, 2% yeast extract, 0.1 % $(KH_2PO_4$, 0.05% $MgSO_4{\cdot}7H_2O$, 0.2% L-asparagine, pH 4.5, and the optimal inoculum size and shaking speed were $1.5{\times}10^6$ spores/50 m1 medium and 150 rpm, respectively. On optimal conditions, 4.1 g/l of the cell mass was obtained at 28$^{\circ}C$ for 3 days. The mycelium were inoculated on 500 g of steamed rice using vinyl bag ($30.6{\times}44$ cm) and incubated at $30^{\circ}C$, 85% humidity for 21 days. Lactone form monacolin K was rapidly increased for 2 days and reached highest concentration of monacolin K (2,930 mg/kg) for 15 days, and monacolin K was decreased after 15 days.
Continuous on-line monitoring of cell concentration and growth rate in aerobic batch fermentation process was carried out by analyzing the exhaust gas composition of tormentor with a quadrupole mass spectrometer. From the mass spectrometric analyses of major gaseous components, i.e. $N_2$, $O_2$, $CO_2$ and $H_2O$, and the material balance equations for oxygen and carbon dioxide, oxygen uptake rate (OUR) rind carbon dioxide evolution rate (CER) were instantaneously calculated using a computer (16-bit IBM PC-AT) interfaced to a quadrupole mass spectrometer. The calculated OUR and CER data were used for the estimation of cell concentration and growth rate of Candida utilis during batch culture. It was found that the cell concentration could be satisfactorily estimated from the data of OUR arid CER during the culture and this method could be successfully und for the continuous monitoring of cell growth and growth rate.
A simple whole-cell-based sensing system is proposed for determining the cell mass of H. pluvialis using ultraviolet fluorescence spectroscopy. An emission signal at 368 nm was used to detect the various kinds of green, green-brown, brown-red, and red H. pluvialis cells. The fluorescence emission intensities of the cells were highest at 368 nm with an excitation wavelength of 227 nm. An excitation wavelength of 227 nm was then selected for cell-mass sensing, as the emission fluorescence intensities of the cell suspensions were highest at this wavelength after subtracting the background interference. The emission fluorescence intensities of HPLC-grade water, filtered water, and HPLC-grade water containing a modified Bold's basal medium (MBBM) were measured and the difference was less than 1.6 for the selected wavelengths. Moreover, there was no difference in the emission intensity at 368 nm among suspensions of the various morphological states of the cells. A calibration curve of the fluorescence emission intensities. and cell mass was obtained with a high correlation ($R^2=0.9938$) for the various morphological forms of H. pluvialis. Accordingly, the proposed method showed no significant dependency on the various morphological cell forms, making it applicable for cell-mass measurement. A high correlation was found between the fluorescence emission intensities and the dry cell weight with a mixture of green, green-brown, brown-red, and red cells. In conclusion, the proposed model can be directly used for cell-mass sensing without any pretreatment and has potential use as a noninvasive method for the online determination of algal biomass.
In this study, the optimization of culture medium using a Sterigmatomyces elviae mutant was investigated using statistical analysis to increase the cell mass and lactosucrose ($^4G-{\beta}$-D-galactosylsucrose) production. In basal medium, the cell mass and lactosucrose production were 4.12 g/l and 140.91 g/l, respectively. However, because of the low cell mass and lactosucrose production, optimization of culture medium was carried out to increase the cell mass and lactosucrose production. Culture media were optimized by the S. elviae mutant using analysis of variance (ANOVA) and response surface methodology (RSM). Central composite designs using RSM were utilized in this investigation. Quadratic models were obtained for cell mass and lactosucrose production. In the case of cell mass, optimal components of the medium were as follows: sucrose 1.13%, yeast extract 0.99%, bactopeptone 2.96%, and ammonium sulfate 0.40%. The predicted maximum value of cell mass was about 5.20 g/l and its experimental value was 5.08 g/l. In the case of lactosucrose production, optimal components of the medium were as follows: sucrose 0.96%, yeast extract 1.2%, bactopeptone 3.0%, and ammonium sulfate 0.48%. Then, the predicted maximum value of lactosucrose production was about 194.12 g/l and the corresponding experimental value was about 183.78 g/l. Therefore, by culturing using predicted conditions, the real cell mass and lactosucrose production increased to 23.3% and 30.42%, respectively.
Journal of the Korean Society of Food Science and Nutrition
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v.36
no.2
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pp.186-193
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2007
The prevalence of diabetes has increased to 8% of population. Unlike type 2 diabetes in the western countries, Korean diabetic patients are nonobese and have low serum insulin levels. As the increased prevalence of diabetes and the peculiar characteristics may be related to dietary fat contents, we determined their effects on insulin resistance, insulin secretion and pancreatic $\beta-cell$ mass in 90% pancreatectomized (Px) diabetic rats in the present study. The rats were provided with low fat diet (LF, 10 energy% fat), moderate fat diet (MF, 25 energy% fat) and high fat diet (HF, 40 energy% fat) for 6 months. HF increased body weight and epidydimal fat pads parallel with increased food intake compared to LF and MF. Fasting serum glucose and insulin levels and homeostasis model assessment of insulin resistance were higher in HF, compared to LF and MF, indicating that HF increased insulin resistance. Rats fed LF and MF diets reduced insulin resistance, but only rats fed MF improved pancreatic $\beta-cell$ mass and insulin secretion capacity, measured by hyperglycemic clamp and in situ pancreatic perfusion. LF had low insulin secretion capacity and pancreatic $\beta-cell$ mass, indicating the increased possibility of diabetic prevalence and progression. MF increased $\beta-cell$ mass by stimulating $\beta-cell$ proliferation and neogenesis and reducing $\beta-cell$ apoptosis. In conclusion, MF is effective for the prevention of prevalence and progression of diabetes.
An accurate and efficient method for measuring the mass of hairy roots using conductometry is established. A conductivity equation expressed in terms of the concentration of the ion species in the medium is suggested. By using this equation, the effect of the individual ions on the total conductivity can be quantitatively analyzed. An equation for the in situ estimation of the cell growth coefficient for determining the mass of hairy roots is established based on measurements of the nitrogen concentration and conductivity during cultivation. The proposed equation does not require preliminary experiments to determine the cell growth coefficient. Instead, the physiological characteristics of the plant species are reflected by introducing the cellular nitrogen content. Since the cell growth coefficient is determined by measuring the major ionic nutrient concentrations, it is more effective to express the dynamics of an actual culture system. This improved method for determining the mass of hairy roots was successfully utilized in a fed-batch culture system.
The small pituitary mass was incidentally found in 40-years-old women with renal cell carcinoma. The endocrinological and ophthalmological evaluation revealed no deficit and the short-term follow-up was recommended. In 6 months later, the visual disturbance was reported and the size of mass was increased. The tumor was removed totally via the trans-sphenoid approach. The post-operative endocrinological insufficiency was not noticed. During one year of follow-up period, there was no evidence of recurrence without adjuvant radiotherapy. The clinical features of pituitary metastasis from renal cell carcinoma were similar to those of pituitary adenoma. The possibility of pituitary metastasis should be kept in mind in patients with sellar mass and renal cell carcinoma.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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