We applied serological analysis of cDNA expression library technique to identify cancer-associated genes. We screened cDNA expression libraries of human testis and gastric cancer cell lines with sera of patients with gastric cancers. We identified a gene whose expression is testis-specific among normal tissues. We cloned and characterized this novel gene. It contains D-E-A-D box domain and encodes a putative protein of 630 amino acids with possible helicase activity. It showed wide expression in various cancer tissues and cancer cell lines. (omitted)
SOX (Sry-related HMG box) family proteins, which have an evolutionarily conserved DNA binding domain, have crucial roles in cell differentiation. However, their target genes remain enigmatic. Some members of the SOX family may have roles in regulation of cell proliferation. We established stable NT2/D1 cell lines overexpressing SOX15 (SOX15-NT2/D1), and a modified 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide (MTT) assay showed that the SOX15-NT2/D1 cells exhibited significantly slower growth than the controls. Flow cytometry analysis revealed that an increased fraction of the SOX15-NT2/D1 cells were in G1-G0. In addition, a microarray analysis identified 26 genes that were up-regulated in the SOX15-NT2/D1 cells, but none that were down-regulated genes. Among the up-regulated genes, IGFBP5, S100A4, ID2, FABP5, MTSS1, PDCD4 have been shown to be related to cell proliferation and/or the cell cycle.
Several empty-space leaping methods have been proposed for CPU-based volume ray casting. When sample points are located in semi-transparent cells, however, previous leaping methods perform unnecessary resamplings even if the scalar values on those points are confined within transparent range. A semi-transparent cells leaping method for volume ray casting using the Marching Cubes algorithm is proposed to solve this problem in our previous work. When a ray reaches a semi-transparent cell, our method performs in-out test between current sample point and the bounding box enclosing the triangles generated by the Marching Cubes. If the sample point lies on outside of the bounding box, we estimate the point is regarded as transparent. In this case, the ray advances to the next sample point without performing a resampling operation. We can frequently refer the tables for neighboring voxels, however, when we exploit conventional data structures of the Marching Cubes. We propose modified Marching Cubes tables for solving this problem.
Transactions of the Korean hydrogen and new energy society
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v.29
no.4
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pp.386-392
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2018
Fuel cells are known as eco - friendly energy facilities that can use heat energy and electric energy at the same time. Fuel cells are classified according to the temperature and material used, and solid oxide fuel cell (SOFC) is relatively high temperature ($700-800^{\circ}C$). SOFC requires a hot box consisting of a high temperature stack, a reformer, a burner, and the heat exchangers in order to use energy efficiently. The hot box needs to maintain heat insulation performance at high temperature to reduce heat loss. However, Fibrous insulation, which is widely used, needs to be improved because it has a disadvantage that the thermal conductivity is rapidly increased due to the increase of temperature. Therefore, this study was carried out to develop a thermal insulation, which is applied to multiple layers insulation (MLI) technic, that can be used under SOFC operating conditions and prevent a drastic drop in thermal conductivity at high temperature. The developed insulation is consist of a thermally conductive material, a spacer, and a reflective plate. The thermal conductivity of the insulation was measured by in the thermal conductivity measuring device at high temperature range. As a result, it was confirmed that the developed layers insulation have an good thermal conductivity (0.116 W/mK) than fibrous insulation (0.24 W/mK) as a radiation shielding effect at a high temperature of 1,173 K.
[Purpose] Doxorubicin (DOX) is a potent anti-cancer drug that appears to have severe myotoxicity due to accumulation. The skeletal muscle has a regeneration capacity through satellite cell activation when exposed to extracellular stimulus or damage. Endurance exercise (EXE) is a therapeutic strategy that improves pathological features and contributes to muscle homeostasis. Thus, this study investigated the effect of EXE training in mitigating chronic DOX-induced myotoxicity. [Methods] Male C57BL/6J mice were housed and allowed to acclimatize with free access to food and water. All the mice were randomly divided into four groups: sedentary control (CON, n=9), exercise training (EXE, n=9), doxorubicin treatment (DOX, n=9), doxorubicin treatment and exercise training (DOX+EXE, n=9) groups. The animals were intraperitoneally injected with 5 mg/kg/week of DOX treatment for 4 weeks, and EXE training was initiated for treadmill adaptation for 1 week and then performed for 4 weeks. Both sides of the soleus (SOL) muscle tissues were dissected and weighed after 24 hours of the last training sessions. [Results] DOX chemotherapy induced an abnormal myofiber's phenotype and transition of myosin heavy chain (MHC) isoforms. The paired box 7 (PAX7) and myoblast determination protein 1 (MYOD) protein levels were triggered by DOX, while no alterations were shown for the myogenin (MYOG). DOX remarkably impaired the a-actinin (ACTN) protein, but the EXE training seems to repair it. DOX-induced myotoxicity stimulated the expression of the forkhead box O3 (FOXO3a) protein, which was accurately controlled and adjusted by the EXE training. However, the FOXO3a-mediated downstream markers were not associated with DOX and EXE. [Conclusion] EXE postconditioning provides protective effects against chronic DOX-induced myotoxicity, and should be recommended to alleviate cancer chemotherapy-induced late-onset myotoxicity.
Woojung Heo;Hyeonjeong Hwang;Jimin Kim;Seung Hee Oh;Youngseok Yu;Jae-Hyung Lee;Kyuhyung Kim
BMB Reports
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v.56
no.3
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pp.153-159
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2023
Neuronal differentiation is highly coordinated through a cascade of gene expression, mediated via interactions between trans-acting transcription factors and cis-regulatory elements of their target genes. However, the mechanisms of transcriptional regulation that determine neuronal cell-fate are not fully understood. Here, we show that the nuclear transcription factor Y (NF-Y) subunit, NFYA-1, is necessary and sufficient to express the flp-3 neuropeptide gene in the IL1 neurons of C. elegans. flp-3 expression is decreased in dorsal and lateral, but not ventral IL1s of nfya-1 mutants. The expression of another terminally differentiated gene, eat-4 vesicular glutamate transporter, is abolished, whereas the unc-8 DEG/ENaC gene and pan-neuronal genes are expressed normally in IL1s of nfya-1 mutants. nfya-1 is expressed in and acts in IL1s to regulate flp-3 and eat-4 expression. Ectopic expression of NFYA-1 drives the expression of flp-3 gene in other cell-types. Promoter analysis of IL1-expressed genes results in the identification of several cis-regulatory motifs which are necessary for IL1 expression, including a putative CCAAT-box located in the flp-3 promoter that NFYA-1 directly interacts with. NFYA-1 and NFYA-2, together with NFYB-1 and NFYC-1, exhibit partly or fully redundant roles in the regulation of flp-3 or unc-8 expression, respectively. Taken together, our data indicate that the NF-Y complex regulates neuronal subtype-specification via regulating a set of terminal-differentiation genes.
Young-Saeng Jang;Sun-Hee Park;Seung-Goo Kang;Jung-Shin Lee;Hyun-Jeong Ko;Pyeung-Hyeun Kim
IMMUNE NETWORK
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v.23
no.5
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pp.37.1-37.11
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2023
Forkhead box P3-positive (Foxp3+)-inducible Tregs (iTregs) are readily generated by TGF-β1 at low TCR signaling intensity. TGF-β1-mediated Foxp3 expression is further enhanced by retinoic acid (RA) and lactoferrin (LF). However, the intensity of TCR signaling required for induction of Foxp3 expression by TGF-β1 in combination with RA and LF is unknown. Here, we found that either RA or LF alone decreased TGF-β1-mediated Foxp3 expression at low TCR signaling intensity. In contrast, at high TCR signaling intensity, the addition of either RA or LF strongly increased TGF-β1-mediated Foxp3 expression. Moreover, decreased CD28 stimulation was more favorable for TGF-β1/LF-mediated Foxp3 expression. Lastly, we found that at high signaling intensities of both TCR and CD28, combined treatment with TGF-β1, RA, and LF induced robust expression of Foxp3, in parallel with powerful suppressive activity against responder T cell proliferation. Our findings that TGFβ/RA/LF strongly generate high affinity Ag-specific iTreg population would be useful for the control of unwanted hypersensitive immune reactions such as various autoimmune diseases.
Transactions of the Korean hydrogen and new energy society
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v.22
no.5
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pp.609-615
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2011
A 5 kW class SOFC system for cogeneration power units was consisted of a hot box part and cold BOPs. High temperature components such as a stack, a fuel reformer, a catalytic combustor, and heat exchanges are arranged in the bot box considering their operating temperatures for the system efficiency. The hot box was made of ceramic boards for the thermal insulation. A 5 kW class SOFC stack was composed of 2 sub-modules and each module had 64 cells with $15{\times}15cm^2$ area and stainless steel interconnects. The 5 kW class SOFC system was operated with a hydrogen and a city gas. With a hydrogen, the total power of the stacks was about 7.1 kWDC and electrical efficiency was about 49.3% at 80 A. With a city gas, the total power of the stacks was about 5.7 $kW_{DC}$ and electrical efficiency was about 38.8% at 60 A. Under self-sustained operating condition, the system efficiency including a power conditioning loss and a consumed power by BOPs was about 30.2%.
Acharya, Raju;Han, Jie;Parsons, Robert L.;Brennan, James J.
Geomechanics and Engineering
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v.11
no.5
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pp.625-638
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2016
This paper presents field study and numerical modeling results for a single-cell low-fill concrete box culvert under a flexible pavement subjected to traffic loading. The culvert in the field test was instrumented with displacement transducers to capture the deformations resulting from different combinations of static and traffic loads. A low-boy truck with a known axle configuration and loads was used to apply seven static load combinations and traffic loads at different speeds. Deflections under the culvert roof were measured during loading. Soil and pavement samples were obtained by drilling operation on the test site. The properties of the soil and pavement layers were determined in the laboratory. A 3-D numerical model of the culvert was developed using a finite difference program FLAC3D. Linear elastic models were used for the pavement layers and soil. The numerical results with the material properties determined in the laboratory were compared with the field test results. The observed deflections in the field test were generally smaller under moving loads than static loads. The maximum deflections measured during the static and traffic loads were 0.6 mm and 0.41 mm respectively. The deflections computed by the numerical method were in good agreement with those observed in the field test. The deflection profiles obtained from the field test and the numerical simulation suggest that the traffic load acted more like a concentrated load distributed over a limited area on the culvert. Elastic models for culverts, pavement layers, and surrounding soil are appropriate for numerical modeling of box culverts under loading for load rating purposes.
D. N. Kwon;H. K. Shin;C. K. Hwang;D. W. Ok;Kim, J. H.
Proceedings of the KSAR Conference
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2001.03a
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pp.19-19
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2001
Mammalian urothelium undergoes unique membrane specialization by making the asymmetric unit membrane (AUM) that is covered with the apical cell surface during terminal differentiation. The AUM contains several major integral membrane proteins including uroplakin Ia, Ib, II and III. The genes for uroplakins have been cloned from humans and mice, but not from porcine. In this study, we report the cloning of the UPII genomic DNA, which codes for the full length open reading frame for the uroplakin II protein. The deduced amino acid sequence encodes of a hydrophobic NH$_2$-terminal peptide, a prosequence, and a mature protein. The prosequence contains three potential N-glycosylation sites and a RGRR cleavage site that may be involved in uroplakin II processing and maturation. Northern and immunohistochemistry analyses showed that the porcine UPII gene is only expressed in urothelium and that the protein was specifically localized in urothelial superficial cells. A 2kb of upstream in the promoter sequence contains multiple transcription factor binding sites, including GC-box, SPI, AP2, and GATA-box sites, but not for TATA or CAAT-box sequences. Comparison of the porcine UPII promoter sequence with that of the murine by MEME system presented two conserved motifs, suggesting a cis-acting regulatory role for the conserved sequences. Sequence homology between two species in motif A and B was 79% and 80% respectively, although their relative locations were different. During the gestation, mouse bladder at estrus stages and day 10 after parturition showed higher UPII expression, while showed lower expression at peri-implantation stage. Taken together, our results showed that the porcine UPII gene was expressed highly and specifically in the bladder urothelium and that steroid hormones for implantation changed the expression of UPII in the bladder, although the biological significance of UPII remains to be not determined.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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