• 제목/요약/키워드: Cdk5

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Gene expression profiles of skin from cyclin dependent kinases 5-knockdown mice

  • Shanshan Yang;Dingxing Jiao;Tao Song;Ping Rui;Ruiwen Fan;Zengjun Ma
    • Animal Bioscience
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    • 제37권4호
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    • pp.567-575
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    • 2024
  • Objective: This study aimed to identify genes regulated by cyclin dependent kinases 5 (CDK5) that participate in hair pigmentation in mice. Methods: The mRNA expression profiles of skin samples from CDK5-knockdown mice were constructed using high-throughput RNA sequencing and compared with those of wild-type mice. Results: In total, 8,002 known genes were differentially expressed between CDK5-knockdown and wild-type mice. Of these, 3,658 were upregulated and 4,344 were downregulated in the skin of CDK5-knockdown mice. An additional 318 previously unknown genes were also differentially expressed, with 171 downregulated and 147 upregulated genes in the skin of CDK5-knockdown mice. Of the known genes expressed in mouse skin, 80 were associated with hair color, with 61 showing lower expression and 19 exhibiting higher expression in skin of CDK5-knockdown mice. Importantly, the expression of the tyrosinase-related protein 1 (TYRP1) and the calcium signaling pathway were also found to be regulated by CDK5, suggesting that pigmentation is regulated by CDK5 via the calcium signaling pathway and TYRP1. Conclusion: The transcriptome profiles obtained from the skin of CDK5-knockdown mice compared to wild-type mice provide a valuable resource to help understand the mechanism by which CDK5 regulates melanogenesis in mice and other animals.

7-Chloro-4-nitro-benzo[1,2,5]oxadliazole 1-oxide의 CDK4 활성저해 (Inhibition of CDK4 activity by 7-chloro-4-nitro-benzo[1,2,5]oxadiazole 1-oxide)

  • 전용진;고종희;연승우;김태용
    • 약학회지
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    • 제50권1호
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    • pp.52-57
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    • 2006
  • The activation of cyclin dependent kinase 4 (CDK4) is found in more than half of all human cancers. Therefore CDK4 is an attractive target for the development of a novel anticancer agent. For mass screening of CDK4 inhibitor, we set up in vitro kinase assay for CDK4 activity using a cyclin D1-CDK4 fusion protein, which is constitutively active and exhibits enhanced stability. From the screening of representative compound library of Korea Chemical Bank, we found that 7-chloro-4-nitro-benzo[1,2,5]oxadiazole 1-oxide (FBP-1248) selectively inhibited CDK4 activity in vitro by ATP competitive manner. This compound prevented the phosphorylation of retinoblatsoma tumor suppressor protein, Rb, and inhibited cell growth through cell cycle arrest. In summary, we developed an efficient assay system for CDK4 activity in vitro and identified the CDK4 inhibitory compound, FBP-1248.

Cyclin-dependent kinase 1 결합 단백질 CDK2AP1은 kinesin superfamily protein 5A (KIF5A)을 매개로 Kinesin-1와 결합 (CDK2AP1, a Cyclin-Dependent Kinase 2-Associated Protein, Interacts with Kinesin-1 through Kinesin Superfamily Protein 5A (KIF5A))

  • 김명훈;표세영;정영주;박성우;서미경;이원희;엄상화;김무성;이정구;석대현
    • 생명과학회지
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    • 제33권7호
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    • pp.531-537
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    • 2023
  • 세포 내 수송 및 축삭 수송은 kinesin 및 cytoplasmic dynein과 같은 미세소관 의존성 모터단백질에 의해 운반된다. Kinesin은 미세소관을 따라 미세소관의 플러스 쪽 끝으로 이동하고, dynein은 미세소관의 마이너스 쪽 끝으로 이동한다. Kinesin-1은 kinesin superfamily protein (KIF)중에서 처음으로 확인된 kinesin으로, 카복실(C)-말단 영역과 cargo간 결합을 통해 세포내 소기관, 신경전달물질 수용체 및 mRNA-단백질 복합체를 포함한 다양한 cargo의 세포내 수송 기능을 수행한다. Kinesin-1은 다양한 cargo들을 수송하지만, kinsin-1과 cargo 사이를 매개하는 어댑터/스캐폴더 단백질은 아직 완전히 확인되지 않았다. KIF5A의 C-말단 영역과 상호 작용하는 어댑터 단백질을 규명하기 위해 효모 2-하이브리드 스크리닝을 하여, cyclin-dependent kinase 2-associated protein 1 (CDK2AP1)를 확인하였다. CDK2AP1은 KIF5A의 C-말단 영역에 결합하고 KIF3A, KIF5B, KIF5C 및 kinesin light chain 1 (KLC1)과는 결합하지 않았다. CDK2AP1의 C-말단 영역은 KIF5A와의 결합에 필수적이었다. HEK-293T 세포에 CDK2AP1 및 kinesin-1은 동시 발현하여 면역침강하면 CDK2AP1 및 kinesin-1은 같이 면역침강하였다. 그리고 CDK2AP1 및 kinesin-1은 세포내에서도 같은 위치에 발현하였다. 이러한 결과들은 KIF5A-CDK2AP1결합은 kinesin-1이 cargo를 운반할 때 kinesin-1과 cargo 사이를 연결하는 어댑터 단백질 역할을 시사한다.

Cytotoxic Activities of 6-Arylamino-7-halo-5,8-quinolinediones against Human Tumor Cell Lines

  • Ryu, Chung-Kyu;Kang, Hye-Yung;Yi, Yu-Jini;Lee, Chong-Ock
    • Archives of Pharmacal Research
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    • 제23권1호
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    • pp.42-45
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    • 2000
  • 6-Arylamino-7-halo-5,8-quinolinediones (4a-4k, 5a-5b) were tested for in vitro cytotoxicity against human solid tumor cell lines such as A 549 (non-small cell lung). SK-OV-3 (ovarian), SK-MEL-2 (melanoma), HCT-15 (colon) and XF 498 (CNS) by SRB assay. The arylamino-7-chloro-5,8-quinolinediones 4 were also evaluated for cyclin-dependent kinase (CDK2 and CDK4) inhibitory effect. Among them, the 5,8-quinolinediones 4a and 5a with 7-(4-fluorophenyl) amino group were found to be potent cytotoxic against HCT 15, SKOV-3 and XF 498, and the compounds 4f and 4i showed inhibitory activities for the CDK4.

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Increase of Cdk5 and p35 during Retinoic Acid-Induced Neuronal Differentiation of SK-N-BE(2)C cells

  • Lee, Jong-Hee;Kim, Kyung-Tai
    • 한국생물물리학회:학술대회논문집
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    • 한국생물물리학회 2002년도 제9회 학술 발표회 프로그램과 논문초록
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    • pp.46-46
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    • 2002
  • Cdk5, a neuronal Cdc2-like kinase, exhibits a variety of functions in neuronal differentiation and neurocytoskeleton dynamics as well as neuronal degeneration and cell death. However, its role in retinoic acid (RA)-induced differentiation has not been reported yet. We newly found that RA treatment of SK-N-BE(2)C, human neuroblastoma, increased expression of Cdk5 concomitantly with a neuronal specific activator, p35.(omitted)

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P25: A hidden target for AD therapeutic.

  • Ha, Il-Ho
    • 한국응용약물학회:학술대회논문집
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    • 한국응용약물학회 2006년도 Spring Conference
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    • pp.95-105
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    • 2006
  • Alzheimer's disease (AD) is an irreversible, progressive brain disorder that is characterized by dementia. Amounts of p25 and cdk5 kinase activity are specifically upregulated in AD patient's brain samples. Considerable evidence now points importance of p25/cdk5 in generation of A$\beta$ peptides and hyperphosphorylation of tau linking amyloid plaques and neurofibrillary tangles, two major pathological hallmarks of AD. We demonstrated that P25/CDK5 phosphorylates BACE1, the first step protease to produce A$\beta$. P25/CDK5 inhibitors to reduce BACE1 phosphorylation and the secretion of A$\beta$ are screened through in silica, in vitro, and cell-based assays. Out of 4.3 million chemicals we finally selected two compounds to have IC50 of 10 microM in cell-based assays. The inhibitors block Tau phosphrorylation as well as BACE1 phosphorylation. In conclusion P25 should be one of the best targets for AD therapeutics.

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연부조직 육종에서 면역조직화학적 예후인자 (Immunohistochemical Prognostic Factors in Soft Tissue Sarcoma)

  • 최경운;김정일;문남훈
    • 대한골관절종양학회지
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    • 제14권2호
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    • pp.106-118
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    • 2008
  • 목적: 세포주기의 조절곤란은 종양의 발생과 진행에 영향을 미친다. 몇가지 알려진 연부조직 육종에 대한 면역 조직화학적 예후인자 들이 있지만 상반된 연구도 있고 G1/S phase관계되는 인자에 대한 연구는 거의 없는 상태이다. 따라서 저자는 연부조직 육종의 재발 및 전이와 관계된 G1/S phase 세포조절주기 단백의 면역화학적 예후인자를 알아보고자 하였다. 대상 및 방법: 1998년 1월부터 2005년 12월까지 연부조직 육종으로 진단된 환자 중 최소한 1년이상 추시관찰이 가능하고 파라핀 블록의 보존상태가 비교적 양호한 43예의 환자를 대상으로 연구하였다. 지방육종 15예, 악성 섬유성조직구증 13예, 횡문근육종 5예, 활막육종 5예, 평활근육종 3예, 섬유육종이 2예였다. 모든 환자의 조직은 전 절제술로 제거된 조직을 대상으로 Cyclin D1, Cyclin E, CDK4, CDK, p16, p27, Rb, E2F-1, p53, Ki-67 등의 면역 조직화학적 발현을 조직 microarray 방법을 사용하여 측정하고 환자의 국소 재발 및 전이에 따른 예후를 비교 분석하였다. 결과: 국소 재발은 8예(19%)에서 일어났으며 이것은 Cyclin E(p=0.024), E2F-1(p=0.046)의 발현과 연관이 있었다. 전이는 16예(37%)에서 일어났으며 CDK4의 증가와 연관이 있었다(p=0.031). 결론: Cyclin E와 E2F-1이 연부조직 육종의 국소 재발과 관련있는 예후를 제공해주었고, CDK4가 전이를 예측할 수 있는 독립적인 예후를 제공해주었다. 따라서 조직 검사시 이들 표식자들의 적절한 사용이 환자의 예후를 예측하고 치료의 범위를 결정 짖는데 중요한 도움을 줄 수 있을 것이다.

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자생 식물로 부터 Cyclin-dependent Kinase 4/Cyclin D1 저해물질의 탐색 (Searching of Cyclin-Dependent Kinase 4/Cyclin D1 Enzyme Inhibition Materials from the Native Plants)

  • 김미란;하지홍;권병목;정하원;안병태;유시용;성낙도
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제43권3호
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    • pp.174-178
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    • 2000
  • 인체 세포의 세포주기를 조절하는 Cyclin-dependent Kinase(CDK) 중 CDK4/Cyclin D1 효소 저해 물질을 찾기 위하여 국내에 자생하는 37과 87종의 식물 추출물을 탐색한 결과, 50%$(5\;{\mu}g/ml)$ 이상의 CDK4/Cyclin D1 호소 저해활성을 보인 것은 단삼(Salvia miltiorrhiza), 노박덩굴(Celastrus orbiculatus), 삼백초(Saurus chinensis), 목단(Paeonia suffruticosa) 및 오이풀(Sanguisorba officinalis)이었다. 이들 중에서 목단과 오이풀 추출물이 가장 높은 56%의 저해율을 각각 나타내었다. 또한 추출물에서 활성물질을 추출 정제하여 2차원 NMR 등을 포함한 각종 기기분석을 통하여 cryptotanshinone으로 동정하였다.

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유방암 세포 주 MCF-7에서의 녹차 추출물이 p53 경로에 미치는 영향 (Effects of Green Tea Extract on the p53 Pathway in the MCF-7 Breast Cancer Cell Line)

  • 곽인석
    • 생명과학회지
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    • 제28권11호
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    • pp.1316-1320
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    • 2018
  • 녹차(GT) 추출물의 효과를 인간 유방암 유래 세포인 MCF-7 세포를 사용하여 조사 하였다. GT추출물의 세포 독성 효과를 MTT 방법을 사용하여 관찰한 결과, MCF-7 세포는 현저한 세포 독성 효과를 보였고, 이 독성 효과는 GT추출물 농도 의존적으로 증가하였다. p53과 관련 단백질인 p21/cip1과 CDK2의 연관성을 조사하기 위해 GT추출물 처리 후 웨스턴 분석법을 통해 이들 단백질의 발현을 조사하였다. GT추출물 처리 후, MCF-7 세포에서 p53 단백질의 양은 농도에 따라 현저하게 증가 하였다. p21/cip1 단백질의 발현은 낮은 농도의 GT추출물에서 증가되며, 고농도에서도 감소하지 않았다. 그러나 CDK2의 단백질의 양은 높은 농도의 GT추출물에서 CDK2 발현의 급격한 감소가 관찰되었다. 이 결과는 GT추출물의 처리는 MCF-7 세포에서 p53와 p21/cip1를 증가시켜, 그 결과로 활성화 된 p21/cip1는 CDK2의 발현을 억제 함을 나타내고 있다. GT추출물이 MCF-7 세포의 세포주기에 어떤 영향을 미치는지 확인하기 위하여 FACS 분석으로 관찰한 결과, MCF-7 세포에서 세포주기의 G1 단계가 점차 증가하는 결과를 보였다. 이 결과는 GT추출물의 유방암 세포에서의 항암 효과는 세포주기의 G1 단계에서 MCF-7 세포를 정지시키는 p53에 의해 조절된다는 사실을 명확하게 보여 주고 있다.

온청음(溫淸飮)의 조성 용량변화가 Hep3B 세포의 G1 arrest 기전에 미치는 영향 (Change of Ratio of Onchungeum Composition Induces Different G1 Arrest Mechanisms in Hep3B Cells)

  • 구인모;김길훤;신흥묵
    • 동의생리병리학회지
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    • 제22권5호
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    • pp.1250-1255
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    • 2008
  • Onchungeum(OCE), a herbal formula, has been used for treatment of anemia, discharging blood and skin diseases. In the previous study, we investigated the anti-cancer effect of OCE by G1 arrest of the cell cycle in human hepatocarcinoma cells, Hep3B cells. In this study, it was examined that the difference of anti-proliferative mechanisms by change in the ratio of OCE composition (OCE I) in Hep3B cells. Treatment of OCE I exhibited a relatively strong anti-proliferative activity and caused various morphological changes such as membrane shrinkage and cell floating. In addition, OCE-I arrests the cell cycle at G1 phase, which was associated with the down-regulation of cyclin D1 and Cdk6 expressions. The G1 arrest was also associated with the induction of Cdk inhibitors p27 and p21. Moreover, both p21 and p27 were detected by immunoprecipitation with anti-Cdk4 and anti-Cdk2 antibodies in OCE I-treated cells but in case of OCE, p21 did not make any complexes with Cdk4 and Cdk2. These results suggest that the change in the ratio of OCE composition might induce different mechanisms in anti-cancer efficacy of OCE, which may confer characteristic principles in oriental medical formula.