• 제목/요약/키워드: CO1 (cytochrome C oxidase 1)

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광합성세균 Rhodopseudomonas gelatinosa 의 시토크롬 c 산화효소의 정제 및 특성 (Purification and Characterization of Cytochrome c Oxidase from Photosynthetic Bacterium, Rhodopseudomonas gelatinosa)

  • 강대길;최원기
    • 미생물학회지
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    • 제30권2호
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    • pp.101-107
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    • 1992
  • 화학 영양성으로 배양한 Rps. gelatinosa 에서 2회의 시토크롬 c 친화성 크로마토그래피와 DEAE-Sephacel 이온 교환 크로마토그래피 등 3 단계의 크로마토그래피를 수행하여 시토로콤 c 산화효소를 정제하였다. 정제된 시토크롬 c 산화효소는 Sephacryl S-300 에 의한 분자걍이 약 110,000 Da 이고 SDS-gel 전기영동에 의한 분자량이 약 52.000 Da 으로써 이량체일 것으로 보인다. 전제된 시토크롬 c 산화효소는 온도데 매우 불안정하고 말 심장 시토크롬 c 를 기질로 사용했을때 Km 값은 $20\mu$M, Vmax 값은 44unit/mg prot. 이며 pH 6.4 의 효소방응 최적 pH 와 25.deg.C 의 최적 온도를 보였다. 환원된 시토크롬 c 산화효소는 554, 523, 421 nm 에서 .alpha., .betha. soret 흡수대를 보였고 chromatophore 에서와 마찬가지로 KCN 과 $NaN_{3}$ 에 의해서는 효소 활성도가 저해를 받았지만 CO 와 antimycin A, myxothiazol 에 의해서는 효소 활성도가 저해를 받지 않았다. 빛을 에너지원으로 배양하거나 또는 화학영양성으로 배양하든지 모두 시토크롬 c-551 이 생성되었고 환원된 시토크롬 c-551 은 시토크롬 c 산화효소에 의해 산화되었다. 시토크롬 c-551 을 기질고 이용하였을 때 시토크롬 c 산화효소의 Km 값은 $26\mu$M 이었고 Vmax 값은 31.unit./mg prot. 로써 말심장의 시토크롬 c 를 기질로 이용할때 보다 오히려 낮았다. 이와 같은 결과로 보아 화학 영양성은 배양한 Rhodopseudomonas gelatinosa 에서 호흡에 의한 전자전달은 시토크롬 c-551 이 시토크롬 $bc_{1}$ 복합체로 부터 전자를 받아 b-형 시토크롬 c 산화효소에 전자를 전달해 주고 최정적으로 산소를 환원시킬 것으로 생각된다.

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Two species of Tortanus (Eutortanus) (Copepoda: Calanoida: Tortanidae) new to Korea

  • Lim, Byung-Jin;Min, Gi-Sik
    • Journal of Species Research
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    • 제3권1호
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    • pp.27-34
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    • 2014
  • Two species of Tortanus (Eutortanus) are newly recorded from shallow Korean waters: T. (E.) vermiculus Shen, 1955 and T. (E.) komachi Itoh, Ohtsuka and Sato, 2001. As a result of this study, five species are reported in the subgenus of the family Tortanidae in Korea. The sequence of cytochrome c oxidase subunit 1 (CO1) is also provided as a molecular characteristic.

흰쥐에서 Treadmill 훈련에 따른 심근의 적응과 cytochrome oxidase 활성에 관한 세포화학적 연구 (Cytochemical Study on the Cytochrome Oxidase Activity and Myocardial Adaptation to Treadmill Exercise in Rat)

  • 최정목;이충식
    • Applied Microscopy
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    • 제31권1호
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    • pp.59-70
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    • 2001
  • 흰쥐를 실험 대상으로 하여 Treadmill 운동을 실시하여 운동에 의한 심근의 적응과 cytochrome oxidase 활성에 관한 세포화학적 연구 알아보고자 실험을 실시하였다. 실험동물은 SD계 웅성 흰쥐를 이용하여 출생 3개월 정도의 체중 $150{\pm}10g$정도로 실험을 시작하였다. 실험군은 일상 대조군과 운동군 2개군으로 나누고, 각각 1일, 3일, 1주일, 4주일, 8주일 및 12주일 동안 각각 4마리씩 운동시켜 실험에 이용하였다. 형태 계측학적 방법으로 심장의 무게변화, 심근섬유와 모세혈관의 비, 그리고 CO 활성정도를 측정하였다. 광학및 전자현미경을 이용하여 관찰한 결과 다음과 같은 결론을 얻었다. 심장무게 변화는 모든 실험군에서 실험기간에 비례하여 증가하였다. 일상 대조군에 비해 운동군에서 유의한 증가를 보였다. 모세혈관과 근섬유 비율은 일상 대조군에서는 유의한 변화가 없었고, 운동군에서는 운동 4주일 이후부터 유의한 증가를 보였다. Cytochrome oxidase C 활성율은 일상 대조군에서는 유의한 변화가 없었고, 운동군에서는 운동 1주일 이후부터 유의한 증가를 보였다. 사립체에 CO활성 형태는 일상 대조군에서는 I형과 III형이, 운동군에서는 실험기간에 비례해서는 II형과 III형이 많이 관찰되었다. 이상과 같은 실험결과들을 미루어볼 때 Treadmill 운동결과 CO의 활성과 심근섬유와 모세혈관의 비율이 운동에 의해 변화를 보여, 흰쥐의 심근에서는 treadmill 운동은 약 4주 정도에서 심장의 적응성이 어느 정도 이루어지는 것으로 사료된다.

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Rhabditidae과 선충의 CO II 유전자 클로닝 및 염기서열 분석 (Cloning and Sequencing of the Mitochondrial Cytochrome c Oxidase Subunit II Gene from Rhabditidae Family Nematode)

  • 이상몽;손홍주;김근기;홍창오;박현철
    • 한국환경과학회지
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    • 제28권1호
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    • pp.75-84
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    • 2019
  • Cytochrome c oxidase subunit II gene(CO II gene) is subunit of cytochrome oxidase, which is complex IV of mitochondria electron transport system. It has been frequently used in molecular phylogenetic studies because the speed of its DNA variation is faster than that of nucleus. It is especially useful in phylogenetic study of molecular biology in insects. In this study, we cloned and sequenced CO II gene of mitochondria DNA from Rhabditidae family nematode. Our results showed that this gene is comprised of 696 base pairs(bp). In the analysis of similarity of this gene with other known genes of 14 species of nematodes in Rhabditida order, we identified that this gene has high similarity with that of Caenorhabditis briggsae(86.0%) and C. elegans(85.6%) in Rhabditidae family. On the meanwhile, it has very low similarity with that of Angiostrongylus cantonensis(31.8%) in Angiostrongylidae family and Metastrongylus salmi(31.6%) in Metastrongylidae family. Based on the results of this study, we suggest that this nematode is closely related with that of Caenorhabditis genus in Rhabditidae family.

성페로몬을 이용한 열대거세미나방 포획과 시토크롬 옥시다제 1(CO1)에서 종내 변이군 특이적 단일염기다형성 분포 (Sex Pheromone Trapping of Spodoptera frugiperda (Noctuidae: Lepidoptera) in Korea and the Distribution of Intraspecies-specific Single Nucleotide Polymorphisms in the Cytochrome c Oxidase Subunit 1 (CO1))

  • 서보윤;정진교;이관석;양창열;조점래;김양표
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제59권3호
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    • pp.217-231
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    • 2020
  • 2019년에 서남해안 지역인 고창군의 옥수수 밭 주변에서 성페로몬을 이용하여 열대거세미나방(Spodoptera frugiperda) 성충을 효과적으로 모니터링하는 방법을 조사하였다. 총 함량이 300 또는 1000 ㎍인 2종류 성분 조성의 성페로몬 미끼[(100%) (Z)-9-tetradecenyl acetate and (2%) (Z)-7-dodecenyl acetate]를 설치한 깔대기형 트랩과 델타형 트랩 중에서 열대거세미나방은 300 ㎍ 미끼의 깔대기형 트랩에서 8월 6일에 처음 잡혔고 가장 많이 포획되었다. 또한 깔대기형 트랩 모두에서 비표적 종인 뒷흰가는줄무늬밤나방(Mythimna loreyi)이 많이 포획되었다. 총 함량이 1000 ㎍인 위의 2종류 성분 조성과 4종류 성분 조성의 미끼[(100%) (Z)-9-tetradecenyl acetate, (8%) (Z)-11-hexadecenyl acetate, (2%) (Z)-7-dodecenyl acetate, and (1%) (Z)-9-dodecenyl acetate]를 설치한 날개형 트랩에서 열대거세미나방은 비슷한 수준의 낮은 포획수를 보였으나 뒷흰가는줄무늬밤나방은 4종류 성분 조성의 미끼에서 훨씬 더 많이 포획되었다. 성페로몬 트랩에 포획된 열대거세미나방 70마리의 미토콘드리아 시토크롬 옥시다제 1(CO1)의 부분염기서열(1,004 bp)을 이용하여 계통수를 분석한 결과, 두 개의 종내 변이군으로 나눠졌으며 66마리가 CO1-RS로, 나머지 4마리는 CO1-CS로 분지되었다. 또한 두 개의 CO1 변이군과 기주식물계통(벼, 옥수수)에서 일관되게 차이가 있는 총 12개의 CO1 단일염기다형성(SNP)이 확인되었으며, 전체 73마리 중 4마리만 CO1-CS 그룹(옥수수계통 포함)과 동일한 패턴을 보였으며 나머지 69마리는 CO1-RS그룹(벼계통 포함)과 같았다.

Molecular Characterization of Hard Ticks by Cytochrome c Oxidase Subunit 1 Sequences

  • Gou, Huitian;Xue, Huiwen;Yin, Hong;Luo, Jianxun;Sun, Xiaolin
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제56권6호
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    • pp.583-588
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    • 2018
  • Although widely studied, the natural diversity of the hard tick is not well known. In this study, we collected 194 sequences from 67 species, covering 7 genera of hard tick. The 5' region of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 region (586 bp) has been used to investigate intra- and inter-species variation and the phylogenetic tree of neighbor joining method has been used for assessment. As a result, by comparing the K2P-distance of intra- and interspecies, 30 samples (15.2%) shown that interspecies distance was larger than the minimum interspecfic distance. From the phylogenetic analysis, 86.8% (49) of the species were identified correctly at the genus level. On deeper analysis on these species suggested the possibility of presence cryptic species. Therefore, further work is required to delineate species boundaries and to develop a more complete understanding of hard tick diversity over larger scale.

First Record of Cleantioides planicauda (Crustacea: Isopoda: Holognathidae) from South Korea

  • Song, Ji-Hun;Kim, Min-Seop;Min, Gi-Sik
    • Animal Systematics, Evolution and Diversity
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    • 제30권1호
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    • pp.26-32
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    • 2014
  • Cleantioides planicauda (Benedict, 1899) has previously been recorded in China and Japan. In the present study, to our knowledge, we report for the first time the occurrence of this species in South Korea. Here, we provide detailed descriptions and illustrations of the diagnostic characteristics of C. planicauda. Further, for the first time, we determined the partial sequence of mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 (CO1) gene of C. planicauda for molecular characteristic. Additionally, we provide a key to the Korean species and distribution of the genus Cleantioides. As a result of this study, four species of the genus Cleantioides, including C. planicauda, have now been recorded in South Korea.

New Report of Two Species of Genus Pentias (Crustacea: Malacostraca: Isopoda) from South Korea

  • Song, Ji-Hun;Min, Gi-Sik
    • 환경생물
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    • 제33권2호
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    • pp.177-181
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    • 2015
  • Two marine isopods, Pentias hayi Richardson, 1904 and P. thompsoni Collinge, 1916 were verified as unrecorded species in South Korea. The genus Pentias is reported for the first time in South Korea. These two isopods were collected from Heuksan-do Island and Ulleung-do Island from South Korea, respectively. We provide descriptions of the diagnostic characteristics, illustrations of two species and their partial sequences of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 (CO1) for molecular characteristics.

New Record of Three Isopod Species (Crustacea: Malacostraca: Isopoda) from South Korea

  • Song, Ji-Hun;Min, Gi-Sik
    • 환경생물
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    • 제33권2호
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    • pp.182-188
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    • 2015
  • Three marine isopods, Symmius yamaguchiensis Shimomura, 2008, Colanthura pigmentata Kensley, 1980 and Synidotea nipponensis Nunomura, 1985 are reported for the first time in South Korea. The family Chaetiliidae, and genera Symmius and Colanthura are new to South Korea. We provide descriptions of the diagnostic characteristics, illustrations of three species and their partial sequences of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 (CO1) for molecular characteristics.

A New Record of Sea Star Genus Nearchaster (Asteroidea: Notomyotida: Benthopectinidae) from East Sea, Korea

  • Shin, Sook
    • Animal Systematics, Evolution and Diversity
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    • 제31권2호
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    • pp.135-138
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    • 2015
  • An asteroid specimen was collected in adjacent water of Gisamun, Gangwon-do in the East Sea, Korea at a depth of 170 m by fishing net at May 2013. It was identified as Nearchaster (Nearchaster) pedicellaris (Fisher, 1910) belonging to family Benthopectinidae of order Notomyotida, which was new to the Korean fauna. The genus, family, and order of this species were also new to Korean waters. The partial sequence of mitochodrial cytochrome c oxidase subunit 1 (CO1) was determined for the first time and registered at GenBank.