Ju-Chan Park;Keun-Tae Kim;Hyeon-Ki Jang;Hyuk-Jin Cha
International Journal of Stem Cells
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제16권2호
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pp.234-243
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2023
The recent advances in human pluripotent stem cells (hPSCs) enable to precisely edit the desired bases in hPSCs to be used for the establishment of isogenic disease models and autologous ex vivo cell therapy. The knock-in approach based on the homologous directed repair with Cas9 endonuclease, causing DNA double-strand breaks (DSBs), produces not only insertion and deletion (indel) mutations but also deleterious large deletions. On the contrary, due to the lack of Cas9 endonuclease activity, base editors (BEs) such as adenine base editor (ABE) and cytosine base editor (CBE) allow precise base substitution by conjugated deaminase activity, free from DSB formation. Despite the limitation of BEs in transition substitution, precise base editing by BEs with no massive off-targets is suggested to be a prospective alternative in hPSCs for clinical applications. Considering the unique cellular characteristics of hPSCs, a few points should be considered. Herein, we describe an updated and optimized protocol for base editing in hPSCs. We also describe an improved methodology for CBE-based C to T substitutions, which are generally lower than A to G substitutions in hPSCs.
The new Junction Field Effect Transistors (JFETs) with Silicon-germanium (SiGe) layers is investigated. This structure uses SiGe layer to prevent out diffusion of boron in the channel region. In this paper, we report electrical properties of SiGe JFET measured under various design parameters influencing the performance of the device. Simulation results show that out diffusion of boron is reduced by the insertion SiGe layers. Because the SiGe layer acts as a barrier to prevent the spread of boron. This proposed JFET, regardless of changes in fabrication processes, accurate and stable cutoff voltage can be controlled. It is easy to maintain certain electrical characteristics to improve the yield of JFET devices.
YKR049C is a mitochondrial protein in Saccharomyces cerevisiae that is conserved among yeast species, including Candida albicans. However, no biological function for YKR049C has been ascribed based on its primary sequence information. In the present study, NMR spectroscopy was used to determine the putative biological function of YKR049C based on its solution structure. YKR049C shows a well-defined thioredoxin fold with a unique insertion of helices between two $\beta$-strands. The central $\beta$-sheet divides the protein into two parts; a unique face and a conserved face. The 'unique face' is located between ${\beta}2$ and ${\beta}3$. Interestingly, the sequences most conserved among YKR049C families are found on this 'unique face', which incorporates L109 to E114. The side chains of these conserved residues interact with residues on the helical region with a stretch of hydrophobic surface. A putative active site composed by two short helices and a single Cys97 was also well observed. Our findings suggest that YKR049C is a redox protein with a thioredoxin fold containing a single active cysteine.
배추 무사마귀병의 발병에 관여하는 환경요인의 영향을 구명하고 약제처리 방법을 연구한 결과는 다음과 같다. 배추 무사마귀병의 발병율은 근침지접종이나 관주 접종 보다는 전염원 삽입접종에서 현저히 높았다. 발병 유인으로 pH와 온도를 조사한 결과 토양 pH는 5-6에서, 토양온도는 $20-25^{\circ}C$에서 발병율이 높았고 pH 7.0이상, 토양온도 $30^{\circ}C$ 이상에서는 발병율이 급격히 감소하였다. 배추 무사마귀병의 방제를 위해서는 fluazinam 0.5% 분제의 토양살포나 종자분의의 단용처리보다는 둘을 병용처리하는 것이 효과적이다.
아르곤-산소분위기에서 텅스텐산화물 표적을 사용한 rf 마그네트론 스파타링 방법으로 전기적 착색 텅스텐산화물 박막이 ITO가 피복된 유리기판 위에 제작되었다. 사파타링에 의한 제작 조건 중 특히 기판온도가 막의 화학적 안정성에 미치는 영향이 연구되었다. 박막은 리듐퍼코로라이트와 황산 전해질 속에서 전기화학적으로 이온의 주입과 추출 과정이 반복되었으며 또한 착색성을 나타내었다. 착색성을 나타낸 텅스텐 산화물박막들 중에서 기판 온도가 $150^{\circ}C$에서 제작된 막의 내구성이 가장 안정되었다.
본 워터마크를 삽입 할 수 있는 임베디드 시스템을 구현 하였다. 워터마크 삽입을 위해 DWT와 Data Matrix가 사용되었다. DWT(Discrete Wavelet Transform)는 주파수 공간에서 워터마크를 삽입하기 위해 사용되었고, Data Matrix는 워터마크로 사용되었다. 데이터 매트릭스는 미국의 Data Matrix사가 만든 이차원 바코드로 오류검출 및 복원 알고리즘을 가지고 있어 작은 에러는 복원이 가능하다. 시스템으로는 PDA를 사용하였고, 틀로는 EVC를 사용하였다. 삽입 알고리즘은 다음과 같다. DWT를 한 경우 4개의 서브밴드로 나누어지며, 그 중 cV(horizontal detail)와 cH(vertical detail)를 선택하여 4*4블록 단위로 나눈다. 나누어진 블록과 대응하는 워터마크의 픽셀 값에 의해 계수에 일정 값(가중치)을 더하거나 때주어 워터마크를 삽입한다. 추출 알고리즘은 역으로 이루어진다. 성능평가는 PDA에서 워터마크 삽입 알고리즘을 통하여 워터마크를 삽입, 추출된 영상을 가지고 Matlap을 이용하여 평가하였다.
사상성 진균인 Aspergillus nidulans에서 유성분화초기단계, 또는 유성분화유도를 위한 세포내 조건 형성과정에 관여할 것으로 예상되는 유전자를 탐색하였다. 선행연구결과를 통해 유성분화를 전혀 하지 못하는 NSD (never in sexual development) 돌연변이주가 분리되어 nsdA, nsdB, nsdC, 그리고 nsdD의 4상 보군으로 동정된 바 있다. 본 연구에서는 이들 유전자 중 nsdC 유전자를 분리하고자 A. nidulans AMAl-Not I Genomic DNA library로 nsdC6 돌연변이균주를 형질전환하여 야생형처럼 유성분화를 할 수 있는 형질전환체를 분리하고 이들로부터 약 10 kb genomic DNA가 삽입된 library DNA를 분리하였다. Genomic priming system (GPS)을 이용하여 nsdC6 돌연변이를 상보하는 유전자의 부분 서열을 확보한 후 전체 DNA 염기서열을 결정하였다. 유전자분석 결과 nsdC는 intron 없이 1,929염기(643개의 아미노산)로 구성된 Open reading frame (ORF)를 가지며, 약 1kb 정도의 비교적 긴 5'-UTR 부위에 2개의 intron을 가지고 있음이 확인되었다. 또한 NsdC polypeptide의 중앙에 $C_2H_2C_2H_2C_2HC$ 형의 zinc finger DNA binding domain과 C 말단 부위에 coiled-coil domain이 존재하였다. nsdC6 돌연변이는ORF의 407 bp와 408 bp사이에 엽기 T가 삽입되어 frameshift가 일어난 것으로 밝혀졌다. 따라서 nsdC6 돌연변이균주는 단지 139개 아미노산만 갖고 있는 결실 단백질이 생산됨을 알 수 있었다.
Previously, it was reported that the nonhomologous C-terminal regions of the D-hydantoinases are nonessential for catalysis, but affect the oligomeric structure of the enzyme [3]. In an effort to further confirm the above observation, the C-terminal region-inserted enzyme was constructed by attaching a peptide (22 residues) at the C-terminal of the D-hydantoinase from Bacillus thermocatenulatus GH2, and its structural and biochemical properties were compared with both the wild-type and C-terminal region-truncated enzymes. As a result, native tetrameric D-hydantoinase was dimerized as the truncated enzyme, and the inserted mutant with a new sequence was expressed as a catalytically active form in E. coli. Expression level of the inserted and truncated enzymes were found to be significantly increased compared to the level of the wild-type enzyme, and this appears to be due to the reduced toxic effect of the mutant enzymes on host cells. Dimerized enzymes exhibited increased thermo- and pH stabilities considerably when compared with the corresponding wild-type enzyme. Comparison of the substrate specificity between the mutant and wild-type enzymes suggests that the substrate specificity of the D-hydantoinase is closely linked with the oligomeric structure.
Park, G.C.;Lee, J.;Chung, H.C.;Jeong, W.J.;Yang, H.H.;Yoon, J.H.;Park, H.R.;Gu, H.B.;Lee, K.S.
한국전기전자재료학회:학술대회논문집
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한국전기전자재료학회 2004년도 춘계학술대회 논문집
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pp.21-23
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2004
We report experimental results demonstrating a novel metal defined polymer optical waveguide with a low loss in electro-optic polymers for the first time. The polymer optical waveguides are created using a metal film on the top of upper cladding without any conventional etching process. The fabricated waveguides have an excellent lateral optical mode confinement at both 1.31 ${\square}m$ and 1.55 ${\square}m$ wavelength, resulting in a fiber-to lens optical insertion loss of ~ 7 dB at 1.55 ${\square}m$ and ~4.5 dB at 1.31 ${\square}m$ wavelength in a 3.5cm total length for TM polarizations, respectively. We also present the optical loss dependence of the waveguide as a function of optical wavelengths. These results may be used in the complex design of integrated polymer optical circuits that need simpler and cheaper fabrication process.
기반암의 상부 토양층에 협재하는 속도이상층이 레일리파 위상속도와 수직변위의 스펙트럼 진폭에 미치는 영향을 분석하기 위하여 Thomsen-Haskell 방법을 사용하였다. 기본모델은 횡파속도(${\nu}_s$) 300 m/s의 토양층이 9 m 두께로 ${\nu}_s$가 1000 m/s인 반무한 기반암 위에 쌓여 있다. 토양층 내에 두께 1, 2, 3 m, S파속도 150, 225, 375, 450 m/s인 삽입층은 지표부터 깊이 1 m 간격으로 놓여있다. 레일리파 위상속도($C_R$)는 4 ~ 30 Hz 주파수 구간에서 계산하였다. 삽입층 모델은 두께가 1 m일 때, 기본모델과 삽입모델의 위상속도 차이인 ${\Delta}C_R$에 민감하게 반응하는 주파수 대역은 8 ~ 20 Hz이며, 이 주파수 대역은 삽입층의 두께가 증가할수록 넓어진다. 1차 고차모드의 저주파 차단주파수 바로 위의 주파수 구간을 제외하면, 모든 모델에서 기본모드의 스펙트럼 진폭이 1차 고f차모드보다 크다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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