• 제목/요약/키워드: Bradyrhizobium

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Identification of csp Homolog in Bradyrhizobium japonicum

  • 노재상;유지철;소재성
    • 한국생물공학회:학술대회논문집
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    • 한국생물공학회 2001년도 추계학술발표대회
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    • pp.602-605
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    • 2001
  • Low-temperature adaptation and protection for environmental stresses were studied in the gram-negative soil bacterium Bradyrhizobium japonicum 61A101c. B. japonicum was more resistant to alcohol, $H_2O_2$, heat and freezing following a pretreatment at $4^{\circ}C$, resulting in approximately 10 to 1,000 folds increased survival compared to mid-exponential-phase cells grown at an optimal temperature at $28^{\circ}C$. This phenomena relate to the cold shock protein expressed when cells are exposed to a downshift in temperature. To confirm the presence of cold shock protein genes in B. japonicum, a PCR strategy was employed using a degenerate primer set, which successfully amplified a putative csp gene fragment. Sequence analysis of the PCR product(200bp) revealed csp-like sequences that were up to 96% identical to csp gene of S. typhimurium.

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시험관내 뿌리혹 생성 실험의 개선된 방법 (An Improved Method for Nodulation Test in Test Tube)

  • 고상균
    • 미생물학회지
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    • 제35권2호
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    • pp.169-172
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    • 1999
  • 한천 사면배지 대신 한지를 사용하여 시험관내 뿌리혹생성 실험방법을 개선하였다. 개선된 이 방법은 기존의 한천-시험관 법에 비해 전체 과정이 간단하며, 특히 굵고 단단한 유근을 갖는 콩과식물에서도 효과적으로 사용할 수 있다. 이 방법을 사용하여 Bradyrhizobium sp. CN9135을 접종한 차풀에서 접종후 7일째부터 조사된 식물개체의 6%에서 뿌리혹이 생기기 시작하여 14일 째에 조사된 모든 식물개체에서 뿌리혹이 생성되었다.

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대두(大豆) 근류균(根瘤菌)의 분리(分離) 및 특성(特性) (Isolation and Characterization of Rhizobia from Soybean Cultivated in Korea)

  • 윤한대;조무제;이계호
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제30권2호
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    • pp.153-162
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    • 1987
  • 한국에서 시험재배 되고 있는 대두(Glycine max.) 101품종의 근류로 부터 근류균을 분리하여 AMA 고체배지 상에서의 생육속도 및 근류형성력에 따라 fast-growing soybean rhizobia 7 균주와 slow-growing soybean rhizobia 9균주를 선발하였다. 선정균의 질소고정력, 미생물학적 특징 및 생화학적 특징을 조사한 결과 slow-growing soybean rhizobia 는 .Bradyrhizobium japonicum 과 일치하였으며, fast-growing soybean rhizobia는 Rhizobium fredii 와 유사하였다.

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Lack of O-Polysaccharide Renders Bradyrhizobium japonicum More Resistant to Organic Acid Stress

  • OH , EUN-TAEX;JU, YOUNG-JUN;KOH, SUNG-CHEOL;KIM, YONG-HWI;KIM, JONG-SUL;SO, JAE-SEONG
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제14권6호
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    • pp.1324-1326
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    • 2004
  • In previous studies, we isolated an isogenic LPS mutant of Bradyrhizobium japonicum 61A101C, which was completely devoid of O-polysaccharide and had altered cell surface characteristics. Subsequently, the mutated gene was identified, cloned, and used to complement the LPS mutant strain JS314 to restore the phenotype. Since it has been reported that in Escherichia coli LPS O-polysaccharide is involved in resistance to an organic acid such as acetic acid under low pH (Barna et al., Molecular Microbiology 43: 629-640, 2002), we compared the organic acid resistance of the three B. japonicum strains; wild-type 61A101C, the LPS mutant JS314, and the complemented strain to determine whether the role of O-polysaccharide in the resistance to organic acid could be generalized. Growth of all three strains was inhibited by the presence of 3 mM acetic acid under acidic condition (pH 5.5). To our surprise, however, in the presence of 2 mM acetic acid, wild-type and the complemented strains did not grow while the $LPS^-$ mutant showed a significant growth. Therefore, unlike in E. coli, the lack of O­polysaccharide of LPS appears to render B. japonicum more resistant to organic acid.

Bradyrhizobium sp. SNU001 nod 유전자 클로닝 (Molecular Cloning of nod Genes from Bradyrhizobium sp. SNU001)

  • 고세리;심웅섭;안정선
    • 미생물학회지
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    • 제30권4호
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    • pp.246-251
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    • 1992
  • 대두 (Glycine max) 뿌리혹의 질소고정 공생균주 Bradyrhizobium japonicum SNU001 의 nod 유전자를 클로닝하였다. Rhizobium meliloti 의 4.5 kb EcoRI/ HindIII 절편을 탐침으로 한 게놈 혼성화 반응을 분리균주의 게놈상에 nod 유전자가 존재함을 확인하고, lambda EMBL3-BamHI vector 를 이용하여 genomic library 를 작성하였다. 작성된 library 로부터 1, 2 차 선별과정을 통해 nod 유전자가 있는 클론 1-5 를 선별하고, 클론 2로부터 nod DABC 탐침과 lambda DNA 탐침을 사용한 혼성화반응을 수행하여 삽입된 genomic DNA 에 대한 부분적인 제한효소 지도를 작성하였다. nod DABC 탐침과 가장 강한 혼성화반응을 보인 phage 클론 lambda CNS-1 의 3.9 kb BamHI 절편을 pBS KS(+) vector 에 subcloning 하고 동일한 탐침을 이용한 혼성화반응을 통해 subclone pBjCNS-1 을 선별하였다. 이 subclone 에 대한 부분적인 제한효소 지도를 작성하여 nod DABC 가 1.8 KpnI/SacI 절편에 존재함을 확인하였다.

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Involvement of Lipopolysaccharide of Bradyrhizobium japonicum in Metal Binding

  • Oh, Eun-Taex;Yun, Hyun-Shik;Heo, Tae-Ryeon;Koh, Sung-Cheol;Oh, Kye-Heon;So, Jae-Seong
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제12권2호
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    • pp.296-300
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    • 2002
  • Bacterial cell surface components are the major factors responsible for pathogenesis and bioremediation. In particular, the surface of a Gram-negative bacterium cell has a variety of components compared to that of a Gram-positive cell. In our previous study, we isolated an isogenic mutant of Bradyrhizobium japonicum, which exhibited altered cell surface characteristics, including an increased hydrophobicity. Polyacrylamide gel electrophoretic analysis of the lipopolysaccharide (LPS) in the mutant demonstrated that the O-polysaccharide part was completely absent. Meanwhile, a gel permeation chromatographic analysis of the exopolysaccharide (EPS) in the mutant demonstrated that it was unaltered. Since LPSs are known to have several anion groups that interact with various cation groups and metal ions, the mutant provided an opportunity to examine the direct role of LPS in metal binding by B. japonicum. Using atomic absorption spectrophotometry, it was clearly demonstrated that LPS was involved in metal binding. The binding capacity of the LPS mutant to various metal ions $(Cd^{2+},\;Cu^{2+},\;Pb^{2+},\;and\;Zn^{2+})$ was 50-70% lower than that of the wild-type strain. Also, through an EPS analysis and desorption experiment, it was found that EPS and centrifugal force had no effect on the metal binding. Accordingly, it would appear that LPS molecules on B. japonicum effect the properties, which precipitate more distinctly metal-rich mineral phase.

근류균(根瘤菌)과 타(他) 근권미생물(根圈微生物)과의 혼합접종(混合接種) 및 항생제처리(抗生劑處理)가 대두(大豆)의 생장(生長)과 근류형성(根瘤形成)에 미치는 영향(影響) (Effects of Coinoculation by Bradyrhizobium japonicum with other Rhizobacteria and of Antibiotic Treatment on Soybean Growth and Nodule Formation)

  • 박병준;김용웅;김광식
    • 한국토양비료학회지
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    • 제29권2호
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    • pp.190-198
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    • 1996
  • Bradyrhizobium japonicum RJB6$str^rnal^r$에 neomycin resistant gene인 Tn5을 삽입한 표지균주를 사용하여 Pseudomonas fluorescens(PS-3)와 Bacillus subtilis(BCAC-4)를 대두에 혼합접종하고, 또한 항생제 처리후 표지균주를 접종한 대두의 생장 및 근류형성율을 조사 분석한 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 5년이상 대두 재배토양에 표지균주인 RJB6 $str^rnal^rneo^r$을 Ps-3와 혼합접종했을 때 접종근류균의 근류형성율은 8.5%, BCAC-4와 혼합접종한 경우는 4.3%였으나, 표지균주, Ps-3라 BCAC-4의 3 균주를 혼합접종했을 때는 2.9% 에 지나지 않았다. 2. 대두를 재배하지 않은 토양에 표지균주을 Ps-3와 혼합접종했을 때 접종근류균의 근류형성은 10.3%, BCAC-4와 혼합접종한 경우은 6%였으며, 표지균주와 Ps-3, BCAC-4의 3 균주를 혼합접종 했을 때 5.0%의 근류형성율을 나타냈다. 3. 혼합접종이 대두 생육상에 미치는 영향은 일반적으로 표지균주와 Ps-3의 혼합접종 처리구에서 가장 양호했다. 4. 항생제를 처리했을 때 5년 이상 대두재배 토양에서 접종근류균의 근류형성은 12.2-25.4% 였으며, 대두를 재배하지 않은 토양에서는 23.7-43.7% 였으나, 항생제 1,000ppm 처리구 에서 43.2%로 가장 높은 근류형성율을 보였다.

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우리나라 토착근류균(土着根瘤菌)의 제(諸) 특성(特性) 연구(硏究) -I. 영남지역(嶺南地域) 토착(土着) 대두근류균(大豆根瘤菌)의 접종효과(接種效果)와 취락형태적(聚落形態的) 분포특성(分布特性) (Characteristics of Indigenous Rhizobium to Korean Soils -I. Symbiotic Potentials of Bradyrhizobium japonicum Populations and Their Colony Morphological Characteristics in Yeongnam Soils)

  • 강위금;;정연태
    • 한국토양비료학회지
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    • 제23권1호
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    • pp.60-66
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    • 1990
  • 영남지역(嶺南地域)의 수종(數種) 토양통(土壤統)에서 경작여부(耕作與否)에 따른 토착(土着) 대두근류균(大豆根瘤菌)의 분포특성(分布特性)을 구명(究明)하였다. 이를 위하여, 토양통(土壤統)이 서로 다른 5개(個) 지점(地點)의 경작지(耕作地)와 미경작지(未耕作地) 토양(土壤)의 대두(大豆) 접종효과(接種效果)(Soil inoculum potential)와 토착근류균(土着根瘤菌)의 취락형태적(聚落形態的) 분포특성(分布特性)을 조사(調査)하였는데 그 결과(結果)는 다음과 같았다. 1. 영남지역(嶺南地域)에 분포(分布)한 토착(土着) 대두근류균(大豆根瘤菌)의 밀도(密度)는 경작지(耕作地)의 경우 $10^4Cells/g$. soil 이상(以上)이었으나 미경작지(未耕作地)에서는 경미(輕微)하였다. 2. 경작지(耕作地) 토양(土壤)의 대두(大豆) 접종효과(接種效果)(Soil inoculum potential)는 NifTAL의 우수근류근(優秀根瘤菌) 접종제(接種劑) TAL 보다 좋았고, 대두근류균(大豆根瘤菌)의 질소고정(窒素固定) 특성면(特性面)에서 근류(根瘤) 무게가 근류수(根瘤數)를 보상(報償)하였다. 3. 토착(土着) 대두근류균(大豆根瘤菌)의 취락형태별(聚落形態別) 분포(分布)는 경작여부(耕作與否)에 따라 상이(相異)하였는데, "Dry"형(形) 기경지(旣耕地)에서, "Wet"형(形)은 미경작지(未耕作地)에서 각각(各各) 우점경향(優占傾向)을 보였다. 4. 토착(土着) 대두근류균(大豆根瘤菌)의 취락형태별(聚落形態別) 공생효과(共生效果)는 "Dry"형(形)이 "Wet"형(形)보다 좋았다. 따라서 숙전(熟田)에서의 대두생육(大豆生育)은 "Dry"형(形) 토착(土着) 대두근류균(大豆根瘤菌)의 밀도(密度)에 크게 영향(影響)을 받을 것으로 판단(判斷)되었다.

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대두(大豆)-근류균(根瘤菌) 공생(共生)에서 뿌리분비물(分泌物)과 화학주성(化學走性)이 숙주인식(宿主認識)에 미치는 영향(影響) (The Effect of Root Exudate and Chemotaxis on Host Recognition in Soybean-Bradyrhizobium Symbiosis)

  • 강상재;박우철
    • Current Research on Agriculture and Life Sciences
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    • 제11권
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    • pp.121-132
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    • 1993
  • 대두(大豆)-근류균(根瘤菌)의 공생(共生)에서 숙주식물(宿主植物)의 Root Exudate에 대한 근류균(根瘤菌)의 화학주성(化學走性)이 근류형성(根瘤形性)(숙주식물(宿主植物))에 미치는 영향(影響)을 밝히기 위해 연구(硏究)한 결과(結果)는 다음과 같다. 대두(大豆) Seed Lectin은 품종간(品種間) 차이(差異)가 없었으며 분자량(分子量) 120,000정도(程度)의 4개(個)의 동일(同一)한 subunit를 가지는 물질(物質)이며, Pea Seed Lectin은 분자량(分子量) 44,000정도(程度)이며 15,000과 7,000정도(程度)의 두 종류(種類)의 subunit를 가지는 물질(物質)이며 대두(大豆) lectin은 표준 lectin 항체와 침강선을 형성하였다. 그러나 완두의 lectin은 표준 lectin과 항원-항체반응이 없었으므로 두 lectin은 동일 항원이 되지 않아 서로 다른 물질이었다. 팔달의 Crude Root Exudate에 대(對)한 근류균(根瘤菌)의 화학주성(化學走性) 비(比)는 KCTC 2422는 각각(各各) 3.5이고 LPN-100은 1.4이며 LCR-101은 각각(各各) 1.4이었다. 뿌리분비물의 각 fraction에 대한 근류균의 화학주성은 중성분획이 가장 높고 양성분획이 그다음이며 음성분획이 가장 낮은 화학주성을 나타내어 각물질에 대한 근류균의 친화도에 차이가 있었다. 근류형성(根瘤形性)의 정도(程度)는 KCTC 2422의 경우(境遇)는 접종(接種)후 7日경부터 Nitrogenase Activity가 나타났으며 LCR-101는 15일 이후(以後)에 Nitrogenase Activity를 나타내었다. LPN-100은 Nitrogenase Activity가 전혀 나타나지 않아 근류균(根瘤菌)의 화학주성(化學走性)이 숙주인식과정(宿主認識過程)에 영향(影響)을 미쳤음을 확인(確認)할 수 있었다.

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