차풀(Cassia nomame)의 뿌리혹 공생세균인 Bradyrhizobium sp.(Cassia) CN9135의 nodD1 유전자를 중합효소 연쇄반응을 통해 크로닝하여 그 염기서열을 조사하였다. 염기서열로부터 유추된 NodD1 단백질은 Bradyrhizobium elkanii와 가장 높은 95%의 상동성을 나타내었다. 뿐만 아니라 nodD2 사이의 intergenic space 부위의 염기서열도 B. japonicum을 포함하는 다른 bradyrhizobia와는 상동성이 거의 없었으나 B. elkanii와는 88%의 높은 상동성을 나타내었다. 우리의 실험 결과는 Bradyrhizobium sp.(Cassia)가 B. elkanii와 매우 근연한 관계임을 보여 주고 있다.
Bradyrhizobium sp. R938과 VA 내성 균근균인 Glomus mosseae의 동시 접종이 영호 땅콩의 질소고정력에 미치는 영향을 포트 실험을 통하여 조사하였다. 땅콩에 Glomus mosseae와 Bradyrhizobium을 동시에 접종한 처리에서 질소고정력이 Bradyrhizobium만을 접종한 것보다 1.5배 증가되는 결과를 얻었다. 땅콩을 69일 동안 생육시킨 결과 근류의 크기도 내생균근균의 동시 접종으로 인해 증가되었다. 동시접종처리구에서 근류 하나의 평균 중량은 6.7mg으로, Bradyrhizobium만을 접종한 것보다 1.5배 증가되는 결과를 보였다. 이상의 결과로 Bradyrhizobium과 Glomus mosseae의 동시 접종은 양분 흡수의 증진을 통한 질소고정력 증진효과 이외에도 VA 내생균근균으로 인한 호르몬 효과가 있으리라는 점을 추정할 수 있었다.
The genes for ribosomal RNA in Rhizobium meliloti and Bradyrhizobium japonicum were analyzed by southern hybridization of BamHI, EcoRI, HindIII digested chromosomal DNA with purified 5' $^{32}P$-labeled 16S and 23S rRNA. The big differences in the hybridization pattern of both rhizobia were found. The comparative results were discussed in relation to the copy number and conservativity of restriction sites in the rRNA genes of both rhizobia.
전보에서 보고한 Bradyrhizobium japonicum 9 균주와 Rhizobium fredii 7 균주의 균체 중의 단백질 Pattern의 차이를 일차원 및 이차원 전기영동법에 의하여 조사하였다. 일차원 전기영동법 (SDS-PAGE)에 의해서는 두 group의 균체에서 모두 52개의 band가 관찰되었고 그 중 6개의 main band 로써 group 간의 차이가 확인되었으며, 이차원 전기영동법(2D-PAGE)에 의한 두 group간에 단백질 구성은 Rhizobium fredii 에서는 단백질이 산성 쪽에, Bradyrhizobium japonicum 는 alkali성 쪽에 비교적 많이 분포되어 있었다. 또한 두 group 간의 균체 아미노산 조성을 조사한 결과 조선상의 뚜렷한 차이가 없었다. 분리된 근류균을 확인하는데 전기영동법이 유용하였으며, 일차원 전기영동법은 많은 균주를 신속하게 확인할 수 있었고 이차원 전기영동법은 해상력 및 분리된 단백질 spot를 분석하는데 용이하였다.
대두(Glycine max) 뿌리혹의 질소고정 공생균주 Bradyhizobium sp. SNU001 의 nod D 와 nodA 의 염기서열을 결정하였다. 총 314개의 아미노산을 암호화하는 nod D 의 open reading frame (ORF) 은 942bp 로 B. japonicum USDA110 의 nodD1 과 99.4% 의 유사성을 보여주었으며, 총 210개의 아미노산을 암호화하고 콩과식물의 Bradyrhizobium 에서는 처음으로 염기서열이 결정된 nodA 의 ORF 는 630bp 로 B. sp. (Parasponia) 의 nodA 와 81.5% 의 유사성을 보여주었다. nodYAB 오페론과 nodD 상류에서는 9bp의 반복서열을 각각 4번, 2번 가지는 보존적인 nodbox 가 발견되었으며 nodD 의 상류에서는 A, T-rich 서열도 존재하였다.
The root nodules and Glycine max were classified as determinate nodule based on their morphological characteristics, and isolated endosymbiont as a Bradyrhizobium based on its growth rate and single subpolar flagellum. The isolate was similar to B. japonicum USDA110 in utilization of carbon source, growth at 38.deg.C and 2% NaCl, production of $H_{2}$S and especially in the restriction endonuclease digestion pattern of symbiotic genes, allowing them to be placed in sTI group together. The former, however, grew better than the later in broad pH range from 5.0 to 9.5. Infectivity and effectivity of the isolate were confirmed by inoculation of soybean seedlings with the isolates. Characteristics of the reisolated endosymbiont from induced root nodules were identical to those of the first isolate. From these results, it was confirmed that Bradyrhizobium strain isolated from the root nodules of Glycine max was a real symbiont, and was named B. japonicum SNU001.
산림토양의 각 토양층으로부터 분리된 세균 중에는 통상 농도의 NB배지에서는 중식이 현저히 저해되고 희석한 DNB 배지에서만 중식이 가능한 세균이 다수 포 되어 있었으며, 이들 세균은 NB배지를 $10^{-1}$~$10^{-4}$배로 희석한 배지에서의 증식양상에 따라 4가지형으로 구분되었다. 본 연구에서는 저영양세균의 기준에 따라 $10^{-4}$NB(1 mg C/liter)배지에서 양호하게 증식하는 Type II와 IV세균을 저영양세균으로 분류하였고, 60개의 Type IV(편성저영양세균; obligate oligotrophic bacteria)균주를 순수분리 하였다. 이들 저영양성 세균중 질소고정능을 갖는 11균주에 대하여 화학분류 및 계통분류학적 특성을 검토한 결과 모든 균주는 주요 균체지방산으로 $C_{18:1}$)을, 퀴논종은 Q-10을 함유하였으며, G+C함량은 61-64 mol%범위를 나타내었다. 16S rDNA염기서열을 결정한 결과 각 균주는 Proteobacteria $\alpha$-subdivision의 BANA domain (Bradyrhizobium, Agromonas, Nitrobacter 및 Afipia)에 속하였고 Bradyrhizobium japonicum 및 Bradyrhizobium elkanii와 98% 이상의 높은 상동성을 나타내었다. 나타내었다.
Bradyrhizobium japonicum ROKS 26 균주를 glycine및 Iysozyme을 처리하여 spheroplast를 형성시킨 후 Agrobacterium tumefaciens에서 분리한 Ti plasmid를 분리하여 형질전환 시키고 octopine 영양 요구성에 의하여 transformants를 분리하였다. 그 결과 Ti plasmid가 도입된 transformants의 형질전환율은 $1{\times}10^{-7}$ 정도 되었다. 얻어진 transformant의 plasmid를 조사한 결과 도입된 Ti plasmid 존재가 확인되었으며, 2차원 전기영동법으로 균체 단백질을 분석한 결과 수용세포인 Bredyrhizobium japonicum ROKS 26과 transformant간의 단백질 구성 차이도 화인되었다. 또한 transformant의 근류 형성력을 조사한 결과 본래의 근류의근류형성력을 가지고 있었으나, crown gall형성에 있어서는 Agrobacterium tumefaciens 15955에 의한 gall보다는 크기에 있어 차이가 있었다.
In the absence of exogeneous nitrogen supply, evaluation of a symbiosis effectiveness of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 in a supernodulating soybean mutant, SS2-2, its wild type, Sinpaldalkong 2, and control genotype, Jangyeobkong, was conducted in this study. Nodules in SS2-2 were initially white and similar to its wild type, Sinpaldalkong 2. At the late stage, the wild type nodules became dark pinkish by maturation, by contrast, mature nodules in SS2-2 remained light green to pinkish, indicating a lack of leghemoglobin. Tap root length was short in nodulated symbiotic SS2-2 than that of its wild type and the control genotype. Nodulated root length and nodule density on root length were significantly increased by B. japonicum inoculation, but no significant increase was observed on root length and percentage of nodulation to total root length. Regardless of Bradyrhizobium inoculation, SS2-2 showed higher nodule dry weight and higher acetylene reduction activity (ARA) when compared with its wild type and the control genotype. Inoculation of B. japonicum leaded the increase of ARA in 47 days after planting (DAP), in part because of nodule development. Supernodulating mutant, SS2-2, less responded to B. japonicum induction in terms of nitrogen fixation and nodulation characteristics than its wild type. Thus, interaction of supernodulating soybean mutant with Bradyrhizobium had less symbiotically associated response than normal nodulating soybean.
Bradyrhizobium japonicum 은 콩과 식물의 뿌리에 감염하여 뿌리흑을 형성 질소를 고정하는 독특한 능력을 갖는 토양 세균이며 미생물 비료제로 사용되고 있다. 본 연구에서는 저온에서 전처리한 B . japonicum 균주를 여러 가지 환경스트레스 조건에 노출하였을 때 생균수의 변화를 확인하였다. 저온 전처리는 16시간 동안 $4^{\circ}C$의 조건을 유지했다. 다양한 스트레스(알콜, 과산화수소, 고온, 건조)에 노출하였을 때, 저온 전처리한 것이 그렇지 않는 것보다 10~1,000배 정도 높은 생균수를 유지하였다. 이러한 내성중진 현상에 전처리 동안 새로운 단백질 합성이 수반되는 것을 단백질 합성 저해제 인 chloramphenicol을 전처리 과정에 포함하여 확인하였다. 저온 스트레스 내성에 관여하는 유전자를 B. japonicum genome 으로부터 중폭하였고 염기서열 분석을 실시하였다. 실험에서 확인된 B . japonicum의 CSP (Cold shock protein) 단백질의 부분적 아미노산 서열은 이미 확인된 다른 균주의 Csp 단백질과 유사함을 확인하였다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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