An HPLC assay method of a drug to be applied to the pharmacokinetic studies of the drug should be completely validated. The validation process for an HPLC assay method in a biological sample was discussed using the data obtained from the development of HPLC method for the simultaneous quantitation of verapamil and norverapamil in human serum. The validation criteria included were specificity, linearity, accuracy, precision, sensitivity, recovery, drug stability, and ruggedness of an assay method.
A liquid-based colorimetric assay using a pH indicator was introduced for high-throughput monitoring of lysine decarboxylase activity. The assay is based on the color change of bromocresol purple, measured at 595 nm in liquid reaction mixture, due to an increase of pH by the production of cadaverine. Bromocresol purple was selected as the indicator because it has higher sensitivity than bromothymol blue and pheonol red within a broad range and shows good linearity within the applied pH. We applied this for simple determination of lysine decarboxylase reusability using 96-well plates, and optimization of conditions for enzyme overexpression with different concentrations of IPTG on lysine decarboxylase. This assay is expected to be applied for monitoring and quantifying the liquid-based enzyme reaction in biotransformation of decarboxylase in a high-throughput way.
E. coli has long been widely used as a host system for the manufacture of recombinant proteins intended for human therapeutic use. When considering the impurities to be eliminated during the downstream process, residual host cell DNA is a major safety concern. The presence of residual E. coli host cell DNA in the final products is typically determined using a conventional slot blot hybridization assay or total DNA Threshold assay. However, both the former and latter methods are time consuming, expensive, and relatively insensitive. This study thus attempted to develop a more sensitive real-time PCR assay for the specific detection of residual E. coli DNA. This novel method was then compared with the slot blot hybridization assay and total DNA Threshold assay in order to determine its effectiveness and overall capabilities. The novel approach involved the selection of a specific primer pair for amplification of the E. coli 16S rRNA gene in an effort to improve sensitivity, whereas the E. coli host cell DNA quantification took place through the use of SYBR Green I. The detection limit of the real-time PCR assay, under these optimized conditions, was calculated to be 0.042 pg genomic DNA, which was much higher than those of both the slot blot hybridization assay and total DNA Threshold assay, where the detection limits were 2.42 and 3.73 pg genomic DNA, respectively. Hence, the real-time PCR assay can be said to be more reproducible, more accurate, and more precise than either the slot blot hybridization assay or total DNA Threshold assay. The real-time PCR assay may thus be a promising new tool for the quantitative detection and clearance validation of residual E. coli host cell DNA during the manufacturingprocess for recombinant therapeutics.
Ganoderma lucidum has been traditionally used as a medicine for treatment of bronchitis, arthritis, and high blood pressure, and it has been reported to display many biological activities including anticancer and immune activities. Since mushroom mycelium is known to have excellent biological activities together with mushroom fruiting body, studies on biological activities of mushroom mycelium have been actively conducted. Thus, the present study compared the biological activities before and after the cultivation of Ganoderma lucidum mycelium on Atractylodes rhizoma. When the radical scavenging activity was assessed by the DPPH assay, ARGL (ethanol extract of Atractylodes rhizoma mycelium fermented with Ganoderma lucidum) showed radical scavenging activity of 5.58~82.56% at concentrations of $10{\sim}500{\mu}g/assay$, while AR (ethanol extract of Atractylodes rhizoma) showed radical scavenging activity of 5.27~72.08% at the same concentrations. When measured by using the ABTS assay, ARGL showed higher radical scavenging activity than AR, which was consistent with the result obtained by the DPPH assay. In the MTT assay, the cytotoxicity of ARGL against all cell lines was higher than that of AR. In particular, the cytotoxicities of AR and ARGL against Hep3B at a concentration of $400{\mu}g/assay$ were 71.81% and 86.40%, respectively. In addition, the result obtained by the SRB assay was consistent with the result obtained by the MTT assay. According to the results mentioned above, there is a high probability that medicinal herb cultures using mycelium can be used as sources of functional foods since the cytotoxicities against cancer cells and antioxidant activities increased when the mycelium was fermented with Atractylodes rhizoma.
MTT (3-(4, 5-dimethyl thiazol-2-yl)-2, 5-diphenyl tetrazolium bromide) reduction assay is a method that validates the viability of an active cell. Dehydrogenase in mitochondria converts yellow colored insoluble tetrazolium salt to purple colored water-soluble formazan. Sperm also have mitochondria in the midpiece, therefore sperm viability could be evaluated by MTT reduction assay. Several studies have already demonstrated the capability of application of the MTT reduction assay to sperm of several species in Hepes-BSA buffer. Because most liquid semen was diluted in extender like BTS (Beltsville Thawing Solution), Modena or Androhep when it is used or transferred, semen needed another dilution in Hepes-BSA buffer to assess sperm viability. In this study, we evaluated boar sperm viability especially in BTS extended semen and compared the efficiency of this test with eosin-nigrosin staining. We used the fresh BTS extended semen from a local A.I center. Semen sample was diluted to $3.0{\times}10^7$ sperms/ml in BTS. The rates of formazan production were measured in 96-well microtiter plates immediately and 1h after incubation at $17^{\circ}C$ using a spectrophotometer at wave length 560 nm. Simultaneously, split samples of the same semen were tested, using eosin-nigrosin staining to compare the efficiency of the MTT assay of sperm viability in BTS. The correlation between the results of these tests was calculated using Student-t test and ANOVA. The results revealed a strong correlation between the results of MTT reduction rate and the results that were simultaneously determined by eosin-nigrosin staining at 1 h. In conclusion, the MTT reduction test was an effective and simple method to validate sperm viability and it could be used as a simple tool to evaluate sperm viability in the local A.I center and laboratory.
클로렐라 추출물을 trypsin으로 가수분해하여 얻은 가수분해물을 이용하여 항균, 미백과 항암 활성을 분석하였다. Tyrosinase inhibition assay를 이용하여 미백활성을 측정한 결과 클로렐라 가수분해물의 효소활성에 대한 IC/sub 50/(50% inhibitory concentration)은 12%로 나타났다. In vitro에서 인체 폐암세포인 A-549에 대한 클로렐라 가수분해물의 항암 활성을 분석한 결과 클로렐라 가수분해물 0.15%에서 88.2%의 높은 암세포 억제율을 보였다.
현재는 재조합 Erythropoietin의 생물학적 활성을 mouse를 이용한 in vivo bioassay로 실시하고 있으나, 이 방법의 여러가서 불편함으로 인하여, 이를 대체하기 위해 Ba/F3 세포주를 이용한 in vitro assay 방법을 확립하였으나, 위에 상술한 바와 같이 in vitro assay는 erythropoietin의 당분포에 의한 차이를 보이지 않게 때문에, 이를 보완하기 위해서는 in vivo bio-activity와 정량적인 상관관계가 있는 당단백질의 isoform 분석법인 Capillary zone electrophoresis (CZE) 와 sialic acid 함량 결과를 동시에 분석해야 했다. 위의 결과 sialic acid 함량은 erythropoietin 원액에서 10 mol/mol,EPO 이상의 sialic acid 함량을 가져야 되며, CZE 결과는 재조합 erythropoietin이 isoform 분포가 isoform 3의 경우 5.594~0.593%, isoform 4의 경우 31.598~11.704%, isoform 5의 경우 37.033~29.301%, isoform 6의 경우 27.837~18.807%, isoform 7의 경우 17.085~7.824%, isoform 8의 경우 7.642~1.964%을 보여줌과 동시에 isoform 4의 면적은 isoform 5의 면적보다 항상 작아야한다. 이상 두 가지 시험결과와 in vitro assay 결과를 combine해서 in vivo assay를 대체할 수 있다는 좋은 실험적 data를 얻었으므로 이상 위의 3가지 분석법을 활용한 combined in vitro bioassay 법의 기초를 확립하였다.
Nierode, Gregory;Kwon, Paul S.;Dordick, Jonathan S.;Kwon, Seok-Joon
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제26권2호
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pp.213-225
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2016
To reduce attrition in drug development, it is crucial to consider the development and implementation of translational phenotypic assays as well as decipher diverse molecular mechanisms of action for new molecular entities. High-throughput fluorescence and confocal microscopes with advanced analysis software have simplified the simultaneous identification and quantification of various cellular processes through what is now referred to as high-content screening (HCS). HCS permits automated identification of modifiers of accessible and biologically relevant targets and can thus be used to detect gene interactions or identify toxic pathways of drug candidates to improve drug discovery and development processes. In this review, we summarize several HCS-compatible, biochemical, and molecular biology-driven assays, including immunohistochemistry, RNAi, reporter gene assay, CRISPR-Cas9 system, and protein-protein interactions to assess a variety of cellular processes, including proliferation, morphological changes, protein expression, localization, post-translational modifications, and protein-protein interactions. These cell-based assay methods can be applied to not only 2D cell culture but also 3D cell culture systems in a high-throughput manner.
미백제를 선발하기 위해 주로 사용하는 현재의 방법은 in vitro 타이로시네이즈 활성 및 항산화능을 측정하는 것이다. 이 결과에 기초하여 다음 단계인 멜라노사이트에서의 멜라닌 생성량을 측정한다. 세포 내의 멜라닌 생성량 측정 법은 시간, 인력 및 숙련도가 요구된다. 따라서 초기 선발 방법의 신뢰성이 중요하다. 200개 중국시료 중 측정범위 내에서 세포독성이 없는 34개를 대상으로 세포 내 멜라닌량, 타이로시네이즈 활성, 항산화능의 상관관계를 조사하였다. 조사결과 직선의 상판관계를 확인할 수 없었다. 이 결과는 현재 선발방법의 한계 및 새로운 방법이 필요함을 보여주었다.
Aralia elata seeds were successively extracted with water, methanol, ethanol, acetone and chloroform. The crude extracts were investigated for antioxidant and antidiabetic activities. The antioxidant properties of various extracts were evaluated by antioxidant tests, such as DPPH free radical-scavenging activity, hydroxyl radical-scavenging assay, metal-chelating activity, lipid peroxidation inhibition activity and reducing power assay. The 70% methanol extract exhibited the highest activity in the in vitro models of DPPH free radical-scavenging activity, metal-chelating activity, and reducing power assay. Acetone extract showed good effects on lipid peroxidation inhibition and hydroxyl radical-scavenging assay at a low concentration. In addition, the $\alpha$-glucosidase inhibition assay showed that 70% methanol extract had the highest activity. These results indicate the high possibility of using A. elata seeds for medical application due to their efficient antioxidant properties.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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