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RT-PCR에 의한 카네이션괴저바이러스와 카네이션둥근반점바이러스 정밀진단 (Detection of Carnation necrotic fleck virus and Carnation ringspot virus Using RT-PCR)

  • 이시원;강은하;허노열;김상목;김유정;신용길
    • 식물병연구
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    • 제19권1호
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    • pp.36-44
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    • 2013
  • 카네이션은 세계 3대 절화용 화훼작물의 하나로, 농가 생산액 210억 원에 이르는 주요작물이다. 이들은 절화, 종자, 묘 및 삽수의 4 품목으로 수출입 되고 있다. 카네이션과 같은 영양번식성 작물의 경우, 증식하는 과정 중에 바이러스의 확산과 전파가 용이한데, 우리나라에서는 카네이션괴저바이러스(CNFV)와 카네이션둥근반점바이러스(CRSV)를 식물검역 바이러스로 지정하여 수입검사를 수행하고 있다. 본 연구에서는 CNFV와 CRSV를 신속, 정밀하고 쉽게 진단할 수 있는 특이적인 프라이머를 고안하였으며, 높은 검출 감도를 가지는 nested 프라이머 조합을 개발하였다. CNFV를 검사하기 위해 최종 선발된 특이적인 프라이머는 2 세트로 288과 447 bp를, CRSV를 검사하기 위해 최종 선발된 특이적인 프라이머는 2 세트로 503과 549 bp를 증폭하였다. CNFV의 nested는 2 세트 모두 147 bp로 동일하며, CRSV는 각각 395와 347 bp의 밴드를 증폭하였다. 또한, 실험의 신뢰도를 높이기 위하여, 증폭산물에 염기서열 6개를 삽입한 플라스미드를 제작하여 양성대조구로 활용하였다. 본 연구에서 개발한 방법은, 향후 CNFV와 CRSV에 대한 신속, 정밀한 국경검역을 지원할 수 있을 것이라고 기대된다.

낭미충(Cysticercus)과 스파르가눔(Sparganum)에서 추출한 조항원의 면역학적 특성 및 면역진단에의 응용 1. 낭미충에서 추출한 조항원 성분의 면역학적 특성 (Immunological Characterization of Antigens from Custiceycus and Sparganum and Their Application to Immunodiagnosis 1. Immunological Characteristics of Crude Antigenic Components from Cucticercus cellulosae)

  • 김창환
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제26권4호
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    • pp.245-254
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    • 1988
  • 유구낭미충(이하 낭미충)(Cysticercus cellulosae)에서 추출한 조항원으로 낭미충증(cysticercosis), 스파르가눔중(sparganosis) 및 포충중(hydatidosis) 환자 및 정상인 혈청내 IgG 항체와의 혈청학적 반응을 ELISA 및 EITB 방법으로 추적하였다. ELISA에서 낭미충의 조항원 단백은 스파르가눔중 환자 혈청과의 교차 반응도 보였고, 포충증 환자 혈청에 대해서는 낭미충 환자 혈청보다 오히려 높은 흡광도(O.D.)를 보였다. 낭미충 조항원을 SDS-PAGE로 전기영동한 결과 260 KDa∼22 KDa 범위에서 31개의 polypeptide band를 얻었으며 이 중 11개의 분획이 강한 염색성을 나타내었다. 낭미충 조항원과 낭미충중 환자 혈청과의 EITB 반응에서 22개의 항원대가 관찰되었으며 이 중 104 KDa, 82 KDa, 78 KDa 및 59 KDa는 모든 검사 혈청에서 인지되었다. 또 22개의 항원대 중 12개는 정상인 혈청에서도 반응이 관찰되어 교차반응하는 비특이성 항원 성분으로 해석되었다. 낭미충 조항원과 스파르가눔증 환자 혈청과의 반응에서 11개의 항원대가 인지되었으며 이 중 낭미충증 환자 혈청과 교차반응하는 9개의 항원대가 인지되었다. 나머지 163 KDa 및 131 KDa 항원대는 스파르가눔 환자에서만 동정되었다. 낭미충 조항원과 포충증 환자 혈청과의 반응에서는 21개의 항원대가 인지되었는데, 이 중 63 KDa는 포충증 환자에서만 인지되었고 나머지는 낭미충증 환자 혈청과 교차반응하는 항원대이었다. 한편 낭미충 조항원 중 104 KDa, 82 KDa, 72 KDa, 59 KDa및 34 KDa는 낭미충증, 스파르가눔증 및 포충중 환자와 정상인의 혈청에서도 모두 교차반응을 일으키는 항원이었다.

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위성영상의 형태추출을 통한 지도화 : 고빈도 공간필터 사용을 중심으로 (The Line Feature Extraction for Automatic Cartography Using High Frequency Filters in Remote Sensing : A Case Study of Chinju City)

  • 정인철
    • 한국지역지리학회지
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    • 제2권2호
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    • pp.183-196
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    • 1996
  • 지도의 형태는 전통적으로 항공사진이나 위성사진을 이용한 수작업에 의해 추출되어 왔으나, 최근의 원격탐사 기술의 발달은 지도의 형태추출에 새로운 혁신을 가져다 주었다. 공간필터기법을 이용하면 지도형태 추출의 자동화가 가능한데, 특히 선의 추출을 고빈도필터를 이용하여 가능하다. 본 연구에서는 먼저 필터와 지도화의 관계에 대해 이론적으로 고찰한 다음 지도의 선형화와 관련하여 유용하다고 알려진 필터들을 소개하였다. 그리고 이 필터들을 진주시의 SPOT Panchromatic 영상에 적용하였다. 적용한 결과 본고에서 소개한 필터적용 영상이 전반적으로 초기영상보다 개선되어 선형화작업에 매우 유용함을 확인하였다. 특히 초기영상이 포함된 필터영상들의 해석이 용이하였고 선형화가 명확하였다. 그러나 문헌에서 유용성이 인정된 필터라도 일부 필터는 진주시의 경우 선형화작업이 전혀 불가능하였다.

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Simple sequence repeat (SSR) marker를 이용한 벼 품종 식별 (Identification of Rice Variety Using Simple Sequence Repeat (SSR) Marker)

  • 권용삼;박은경;박찬웅;배경미;이승인;조일호
    • 생명과학회지
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    • 제16권6호
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    • pp.1001-1005
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    • 2006
  • SSR markers를 이용하여 벼의 품종간 유전적 유연관계 분석과 품종식별 방법에 대한 연구를 수행하여 얻어진 결과를 요약하면 다음과 같다. SSR primer 50개와 벼 보급종 21품종을 PCR 반응시킨 결과 다형성을 뚜렷하게 나타내는 primer는 23개였으며, 각 marker에 의해 발생된 대립유전자의 수는 $2{\sim}9$까지 검출되었고, 평균값은 3.00개로 나타났다. 유전적 다형성 정도를 나타내어 주는 SSR marker의 PIC 값은 최소 0.091에서부터 최대 0.839까지 다양하게 분석되었다. SSR marker를 이용하여 분석된 벼 21품종에 대한 전체 유전적 유사도는 $0.59{\sim}0.92$의 범위에 속하였고 유사도 지수 0.65를 기준으로 할 때 4개의 그룹으로 구분되었다. SSR marker중에서 RM206, RM225, RM418, RM478은 marker genotype에 의해 21 품종에 대해 각각 고유한 밴드 특성을 나타내어 품종판별이 가능한 것으로 나타났다. 금후 이 연구결과는 벼 보급종의 품종식별을 위해 효과적으로 이용될 수 있는 것으로 나타났다.

카루넨-루베 변환을 이용한 탄성파 그라운드 롤 억제 효과 (Effect of Ground Roll Suppression Based on Karhunen-Loeve Transform)

  • 장성형;이동훈
    • 지구물리와물리탐사
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    • 제22권4호
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    • pp.177-185
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    • 2019
  • 육상 탄성파 탐사자료에서 쉽게 관찰되는 그라운드 롤은 표면파의 일종으로 대표적인 일관성 잡음이다. 반사파 자료처리 과정에서 그라운드 롤은 잡음에 해당하기 때문에 제거하게 되는데, 반사 신호와 중첩되는 경우 반사파 신호음이 손상되는 문제가 발생한다. 본 연구에서는 반사 신호음 손실을 줄이면서 그라운드 롤을 효과적으로 억제할 수 있는 방법을 찾기 위해 카루넨-루베 변환을 중심으로 살펴보고 그 결과를 분석하였다. 균질 탄성매질에서 구한 인공자료 수치 모형 실험에서 그라운드 롤이 뚜렷하게 감소된 것을 확인할 수 있으나 현장자료 적용실험에서는 띠통과 필터링 결과와 큰 차이점을 발견할 수 없었다. 이러한 현상은 현장자료에서 여러 주파수 대역을 포함하고 있는 그라운드 롤에 대해 선형 수평정렬 모음(Linear moveout gather)을 계산하기 어렵기 때문으로 여길 수 있다. 이에 비해서 특이값 분해 필터링 결과는 그라운드 롤이 상당부분 감소되었음을 확인할 수 있었다. 특이값 분해 필터링은 반사파를 중심으로 정규 수평정렬 모음(Normal moveout gather)을 계산하기가 쉬워 카루넨-루베 변환 필터링 보다 그라운드 롤 억제효과가 큰 것으로 여겨진다.

Characterization of rDNAs and Tandem Repeats in the Heterochromatin of Brassica rapa

  • Lim, Ki-Byung;de Jong, Hans;Yang, Tae-Jin;Park, Jee-Young;Kwon, Soo-Jin;Kim, Jung Sun;Lim, Myung-Ho;Kim, Jin A;Jin, Mina;Jin, Yong-Moon;Kim, Seog Hyung;Lim, Yong Pyo;Bang, Jae-Wook;Kim, Ho-Il;Park, Beom-Seok
    • Molecules and Cells
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    • 제19권3호
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    • pp.436-444
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    • 2005
  • We describe the morphology and molecular organization of heterochromatin domains in the interphase nuclei, and mitotic and meiotic chromosomes, of Brassica rapa, using DAPI staining and fluorescence in situ hybridization (FISH) of rDNA and pericentromere tandem repeats. We have developed a simple method to distinguish the centromeric regions of mitotic metaphase chromosomes by prolonged irradiation with UV light at the DAPI excitation wavelength. Application of this bleached DAPI band (BDB) karyotyping method to the 45S and 5S rDNAs and 176 bp centromere satellite repeats distinguished the 10 B. rapa chromosomes. We further characterized the centromeric repeat sequences in BAC end sequences. These fell into two classes, CentBr1 and CentBr2, occupying the centromeres of eight and two chromosomes, respectively. The centromere satellites encompassed about 30% of the total chromosomes, particularly in the core centromere blocks of all the chromosomes. Interestingly, centromere length was inversely correlated with chromosome length. The morphology and molecular organization of heterochromatin domains in interphase nuclei, and in mitotic and meiotic chromosomes, were further characterized by DAPI staining and FISH of rDNA and CentBr. The DAPI fluorescence of interphase nuclei revealed ten to twenty conspicuous chromocenters, each composed of the heterochromatin of up to four chromosomes and/or nucleolar organizing regions.

HlyA유전자 Primer를 이용한 PCR에 의한 식품으로부터 Listeria monocytogenes의 신속 검출 방법 (Polymerase Chain Reaction for the Rapid Detection of Listeria monocytogenes in Foods Using HlyA Gene Primers)

  • 최영춘;박부길;오덕환
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제29권6호
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    • pp.1016-1024
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    • 2000
  • 본 연구는 식품에 존재하는 L. monocytogenes균의 신속한 검출방법을 조사하기 위하여 hlyA 유전자 primer 를 사용하여 PCR 기법으로 행하였으며 primer의 특이성과 PCR의 민감성, L. monocytogenes균의 검출을 위한 최적조건 및 우유 및 소고기의 적용시험을 각각 조사하였다 PCR 특이성 실험에서는 L. monocytogenes 20주에 대한 PCR 분석 결과 모두 713 bp 크기의 PCR products를 확인할 수 있었고, Listeria spp. 및 다른 세균에서는 동일한 Poducts가 증폭되지 않으므로써 hiyA based primer의 L. monocytogenes에 대한 PCR 특이성이 관찰되었다. PCR 분석법의 민감도는 L. monocytogenes ATCC 19111의 1 pg DNA와 2.4$\times$$10^4$cell 수준에서 target DNA가 증폭되었다. Tailing의 제거와 민감도를 높이기 위하여 PCR cycle 수에 따른 최적조건을 조사한 결과 20~30 cycle 정도의 PCR clcyle 수가 좋은 것으로 나타났으며 민감도는 20 cycle PCR amplification을 행한 후 한번 더 10~15 cycle로 처리했을 때 훨씬 증가하였다. 한편, 우유(10 mL)와 쇠고기 절편(10g)에 0~$10^{7}$ CFU/mL 또는 g 수준으로 L. monocytogenes를 신속하게 검출하기 위하여 PCR을 적용한 결과, 우유시료에서는 2번 PCR을 반복함으로써 2 cells까지 검출할 수 있었고, 쇠고기 절편은 LEB로 35$^{\circ}C$에서 24시간 증균하여 PCR합으로써 2.6$\times$$10^2$cell가지 검출할 수 있었다.

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제 2급 와동에서 구치부 복합레진의 미세변연누출에 관한 연구 (MICROLEAKAGE OF POSTERIOR PACKABLE COMPOSITE RESIN hi THE GINGIVAL MARGINS OF CLASS II CAVITIES)

  • 최수진;김미자;권혁춘
    • Restorative Dentistry and Endodontics
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    • 제27권3호
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    • pp.249-256
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    • 2002
  • The use of flowable composite resins as liners in class II packable composite restoration has been suggested by some manufacturers. However, the contributions of this technique are unproven. The purpose of this study was to compare the gingival microleakage in class II packable composite restorations with or without the use of flowable composite resins as liners. Slot cavities were prepared on both proximals of 80 extracted human molars and randomly assigned to 8 groups of 20 each. The gingival margins were located at 1mm above CEJ in 80 cavities (group1-4) and 1mm below CEJ in 80 cavities (group5-8). The prepared teeth were mounted in the customized tray with adjacent teeth to simulate clinical conditions and metallic matrix band (Sectional matrix) and wooden wedges were applied. After acid etching and application of Single Bond, each group was restored with the following materials using incremental placement technique: Group 1,5 (Filtek P60), group 2, 3, 4 and group 6, 7, 8 (AeliteFlo, TetricFlow, Revolution/ Filtek P60). All specimens were thermocycled 500 times between 5$^{\circ}C$ and 55$^{\circ}C$ with 1 mimute dwell time, immersed 2% methylene blue dye for 24 hours and then rinsed with tab water. The specimens were embedded in clear resin and sectioned longitudinally through the center of restoration with a low speed diamond saw. Dye penetration at gingival margin was viewed at 20 magnification and analyzed on a scale of 0 to 4. Kruscal-Wallis One way analysis and Mann-Whitney Rank sum test were used to analyze the results. The results of this study were as follows. 1. The leakage values seen at the enamel margin were significantly lower than those seen at the dentin margin(P<0.05). 2. On the enamel margin, packable composite resins with flowable liners showed lower leakage than those without flowable liners, but there were no significant differences among the four groups(P>0.05). 3. On the dentin margin, four groups demonstrated moderate to severe leakage, and there were no significant differences in leakage values(P>0.05).

산소발생용 Cobalt-phosphate (Co-pi) 촉매를 이용한 Gallium Nitride (GaN) 광전극의 광전기화학적 특성 (Photoelectrochemical Properties of Gallium Nitride (GaN) Photoelectrode Using Cobalt-phosphate (Co-pi) as Oxygen Evolution Catalyst)

  • 성채원;배효정;;하준석
    • 마이크로전자및패키징학회지
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    • 제27권2호
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    • pp.33-38
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    • 2020
  • 광전기화학적 물분해에서 광전극으로 이용되는 GaN은 전해질에 대해 높은 안정성을 가지고 있으며 물의 산화 환원준위를 포함하고 있어 외부전압 없이 물분해가 가능하다. 그러나 GaN 광전극의 경우, 재료 자체의 효율이 낮아 상용화하기에는 부족한 실정이다. 본 연구에서는 광효율을 향상시키기 위해 Cobalt phosphate(Co-pi) 촉매를 광전기증착(Photoelectro-deposition)방법을 통하여 GaN 광전극에 도입하였다. Co-pi 촉매 증착 후 SEM, EDS, XPS분석을 진행하여 Co-pi의 증착 여부 및 증착 정도를 확인하고, Potentiostat를 이용해 PEC 특성을 분석하였다. SEM 이미지를 통해 Co-pi가 GaN 표면 위에 20~25 nm 사이즈의 클러스터 형태로 고르게 증착되어 있는 것을 확인하였다. EDS 및 XPS 분석을 통해 GaN 표면의 입자가 Co-pi임을 확인하였다. 이 후 측정된 PEC 특성에서 Co-pi를 증착 시킨 후 0.5 mA/㎠에서 0.75 mA/㎠로 향상된 광전류밀도 값을 얻을 수 있었다. 향상된 원인을 밝히기 위하여, 임피던스 및 Mott-Schottky 측정을 진행하였고, 측정 결과, 50.35 Ω에서 34.16 Ω으로 감소한 분극저항(Rp)과 증가된 donor 농도(ND) 값을 확인하였다. 물분해 전 후, 표면 성분을 분석한 결과 물분해 후에도 Co-pi가 남아있음으로써 Co-pi 촉매가 안정적이라는 것을 확인하였다. 이를 통해, Co-pi가 GaN의 효율 향상을 위한 촉매로서 효과가 있음을 확인하였고, 다른 광전극에 촉매로써 적용시켰을 경우, PEC 시스템의 효율을 향상시킬 수 있을 것으로 판단된다.

NMOS 소자의 제작 및 평가 (Fabrication and Evaluation of NMOS Devices)

  • 이종덕
    • 대한전자공학회논문지
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    • 제16권4호
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    • pp.36-46
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    • 1979
  • 본 연구에서는 N -채널 실리콘 게이트 제작기술에 의하여 일련의 크기를 가지는 커페시터와 트렌지스터들이 제작되었다. 그 결과 다양한 이온 주입 조걸, 즉 B 의 경우 에너지 30keV∼60keV와 도오스 3 × 10 ~ 5 × 10 개/㎠ 그리고 P 의 경우 에너지 1001keV∼ 175keV와 4 ×10 ~ 7×11개/㎠ 도오스 영역에서 이들에 대한 D.C. 인자들의 측정치들이 이론적인 계산치들과 비상, 분석되어 있다. 이 D.C. 인자들에는 threshold전압, 공핍층의 폭, 게이트 산화물 두께, 표면상태, 가동 하전입자 밀도, 전자의 이동도 그리고 마지막으로 누설전류가 있는데, 이중 실제 MOS의 제작에 있어서 특허 중요한 threshold전압에 있어서는, 커어브트레이서와 C - V plot을 통하여 측정된 값들이 실제 재산에서 이용된 SUPREM II 컴퓨우터 프로그램에 의한 결과와 훌륭히 접근하고 있다. 그 밖에 여기나온 D.C.인자들 중에서 도오핑 수준은 기판의 역 게이트 바이어스에서 threshold전압들로 부터 계산된 것이고, 역전도는 정의된 subthreshold 기울기로 부터 추산된 것임을 밝혀 둔다. 마지막으로 이와같은 D. C. 시험 결과들을 종합적으로 평가해 볼 때 만들어진 커페시터와 트렌지스터들이 N -채널 MOS I. C. 기억소자용으로 적합함을 보여주고 있다.

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