In the present study, results of the identification of Gram-positive bacilli (GPB) were analyzed by using the MALDI-TOF MS technique to score each 2-year blood culture at a university hospital. In addition, 16S rRNA sequence analyses and MALDI-TOF MS results are compared to targeting strains that had been isolated two or more times within the same patient, to evaluate the usefulness of MALDI-TOF MS in GPB identification. According to the cut-off (${\geq}1.7$) criteria, there were 410 (57.5%) reliable strains and 303 (42.5%) non-identified strains among the GPB identification results of 713 strains, using a microflex MALDI Biotyper (Bruker Daltonik GmbH, Bremen, Germany). The isolation appeared most often in the following order: Corynebacterium striatum, Bacillus cereus, Bacillus subtilis, Paenibacillus urinalis, and Listeria monocytogenes. Nearly three-fourths, 66 out of 89 (74.2%) of the strains for Corynebacterium striatum; 44 out of 60 (73.3%) strains for Bacillus cereus; and all (25 out of 25, 100%) Listeria monocytogenes strains were identified by their high scores of 2.0 or higher. Most (293 strains out of 303) non-identified strains were strains isolated only once and not significant as infectious bacilli. A total of 43 out of 50 (86.0%) strains matched and were able to be identified based on the 16 rRNA sequencing comparison results of strains that were isolated twice or more within the same patient and significant as infection bacilli. Non-matching among 5 out of 7 strains was not identified, even with MALDI-TOF MS. In conclusion, GPB can be identified in blood cultures using MALDI-TOF MS. This can be done accurately with ease, rapidly, and at a low cost. It is also thought to be helpful in GPB diagnosis and treatment.
재래식메주에 있어서 자연서식한 microflora의 상태에 따라 외부(外部) 내부(內部) 외부(外部)와 내부(內部)의 혼합으로 각각 3구의 재래식 고추장을 담가 숙성과정중의 제화학성분 및 미생물의 동태(動態)를 조사하고 숙성과정에 관여한 미생물을 순수분리하여 이들의 효소활성을 screening하여 우수균주를 선정 및 동정 하였으며 효소적 특성을 비교하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 1. 제화학 성분변화 (1) pH의 변화는 숙성 10일에 급격히 강하하였고 숙성 60일까지 점차 완만한 감소를 보이다가 그 이후는 약간 증가하였다. 메주외부고추장구(區)의 pH가 가장 낮았으며 메주내부고추장구(區)의 메주혼합고추장구(區)의 pH는 서로 비슷하였다. (2) 총산의 면화는 숙성 60일까지 3구(區) 공히 서서히 증가하다가 그 이후 점차 감소하였다. (3) 총질소의 변화는 숙성 60일까지 3구(區) 공히 점진 증가하다가 그후 약간 감소하였다. (4) Trichloroacetic acid에 가용(可容)인 질소의 변화는 숙성 10일에 3구(區) 공히 급격히 증가하였고 그후는 완만한 증가를 보였다. (5) amino태(態) 질소의 변화는 숙성 30일까지 3구(區) 공히 크게 증가하다가 그 이후는 완만하게 증가하였다. (6) 환원당의 변화는 숙성 50일까지 3구(區) 공히 증가하다가 그 이후는 서서히 감소하였다. 2. Microflora의 변화 (1) 호기성세균군(群), 혐기성세균군(群), mold군(群)의 변화는 숙성 $30{\sim}40$일까지 3구 공히 증가하였으나 그 이후는 감소하는 경향이었다. (2) Yeast군(群)의 변화는 3구 공히 숙성 20일까지는 보이지 않다가 pH가 5.4이하로 강하된 때부터 나타나기 시작하며 메주내부 고추장구(區)에서 처음에는 많이 나타났으나 점차로 감소하였고 메주 외부고추장구(區), 메주혼합고추장구(區)는 처음에는 적게 나타났으나 점차로 증가하였다. 3. 효소활성이 우수한 균주 및 그 효소특성 (1) amylase와 protease를 분비하는 우수균주는 Bacillus subtilis-P, Bacillus subtilis-G, Bacillus licheniformis-K, Aspergillus oryzae-B로 동정되었다. (2) amylase activity가 가장 강한 것은 Aspergillus oryzae-B였고 그 다음이 Bacillus subtilis-P Bacillus licheniformis-K, Bacillus subtilis-G의 순서였다. protease activity에 있어서는 Aspergillus oryzae-B와 Bacillus subtilis-P가 거의 비슷하게 우세하였고 Bacillus licheniformis-K, Bacillus subtilis-G의 순서였다. (3) 효소활성에 대한 식염농도 영향은 amylase가 protease보다 식염에 의한 저해를 많이 받고 있어서 고추장 식염농도인 15% NaCl에서 amylase activty는 $45{\sim}65%$, protease activity는 $40{\sim}46%$의 저해를 받았다.
본 연구는 Streptococcus mutans를 특이적으로 용균하는 효소를 탐색하고 효소생산 균주의 동정을 수행하였다. 토양으로부터 5,000여주의 알칼리 내성 판주를 선별하였으며 그중 용균활성이 있는 22주를 선별하였으며 가장 용균활성이 높은 균주 1주를 선별하여 Strain No. 4830이라 명명한 후 효소의 생산 조건 및 효소의 특성을 확인한 결과 pH 5에서부터 pH 11에서 안정하였으며 pH 7.0 이상에서 Streptococcus mutans에 대하여 용균활성이 나타났다. 또한 $30^{\circ}C$ 이상에서 효소의 활성을 확인할 수 있었으며 $50^{\circ}C$에서 최대효소활성을 확인하였다. 효소의 열안정성은 $40^{\circ}C$ 이하에서는 안정한 것으로 확인되었다. 균주의 특성을 검토한 결과 균체의 지방산 조성은 중성 조건에서 생장하는 Bacillus계열과는 달리 16-C계열의 지방산함량이 상당히 높은 것을 확인하였으며 Obligate alkalophilic의 특성으로 알려진 branched 15-C 지방산인 $iso-C_{15:0}$와 $anteiso-C_{15:0}$의 함량이 매우 높은 것을 확인할 수 있었다. 또한 생화학적 특성으로 Bacillus 계열로 추정이 가능하였으며 다양한 종류의 당류에 대하여 acid를 형성하지 않은 것으로 확인되어 Strain No. 4830은 Obligate alkalophilic의 특성을 나타내었다. 또한 15% NaCl의 농도에서도 생장하는 것으로 보여 염에 대하여 내성을 갖는 것으로 나타났다. 16S rRNA 분석결과 Bacillus alcalophilus 균주와 94%의 유사성을 나타내었으나 생화학적 및 이화학적인 특성 등에서 Bacillus alcalophilus와 다른 균주로 동정되었다.
Biopolymer를 생산하는 Bacillus subtilis K-1과 유당 이용능이 있는 Bacillus coagulans를 융합시켜 획득된 융합주에 의해 생산된 biopolymer의 특성 변화, 생산성 향상의 연구의 일환으로 두균주의 융합을 시도하였고 융합주의 특성을 조사하였다. 원형질체 융합은 33% PEG(Mw. 6,000), 1% PVP, 10 mM $CaCl_2$이 함유된 fusion fluid(FF)에서 5분간 반응하였고, 항생제가 함유된 선별배지에 중층 후, 3일간 배양했을 때 Bacillus subtillus coagulans 변이주 들간의 융합빈도는 $4.6{\times}10^{-5}{\sim}1.8{\times}10^{-7}$이었다. 융합주의 세포특성 검토에서 분리된 모든 융합주의 segregation 비는 $1{\sim}6%$로 나타나 유전적으로 안정하였고, 각 균주가 요구하는 영양 요구성 marker와 항생제의 함유배지에서 생육이 확인되었다. 주요 융합주의 DNA함량은 모균주보다 $1.6{\sim}2.7$배 높게 나타났다. 융합주의 전자현미경 관찰에서두 모균주는 간상체로서 두꺼운 세포벽과 이중막을 확인할 수 있었고 원형질체 형성과정에서 팽융된 세포에서 구형의 원형질체 방출이 이루어지고, 원형질체 융합과정 및 형성된 융합체에서 융합체내 전형적인 vesicle이 확인되었으며 모균주보다는 큰 형태의 세포를 확인할 수 있었다.
본 연구에서는 토양 및 근권에 존재하는 Bacillus 속의 식물 생장 촉진 활성, 식물 병원성 곰팡이의 생장 억제활성, 미네랄 가용화능 및 세포 외 효소활성을 확인해 보고자 하였다. 식물 병원성 곰팡이에 대한 항진균 활성에서 DDP257은 10종의 병원성 곰팡이에서 항진균 활성이 모두 나타났다. 식물 생장 촉진 인자인 indole-3-acetic acid 생성능에서는 ANG20이 70.97 ㎍/ml로 가장 높게 나타났다. 추가적으로 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase 생성능 조사에서는 총 10종에서 생성능을 확인하였고, 질소 고정능과 siderophore 생성능 조사에서는 대부분의 분리균주에서 활성을 확인하였다. 이후 분리된 균주에 대하여 phosphate, calcite, zinc과 같은 미네랄 가용화능을 확인하였으며 세포외 효소활성에서도 대부분의 효소에서 활성이 나타났다. 특히 alkaline phosphatase, esterase (C4), acid phosphatase, naphtol-AS-BI-phosphohydrolase에서 선별된 균주 모두 유사한 활성을 보였다. 이는 Bacillus 속이 다양한 유기물과 항생물질 및 세포 외 효소를 분비함으로써 이러한 결과가 나타난 것으로 판단된다. 따라서, 본 연구 결과를 통해 토양의 환경 개선에 기여하는 균주를 활용하여 미생물 제제로써의 가능성을 제시한다.
During sporulation, Bacillus thuringiensis strains produce crystals consist of toxin proteins highly specific against insect pests. Their host specificities are desirable from a standpoint of environmental safety, but also limit market potential. Thus, development of improved Bacillus thuringiensis strains having broad host spectrum will contribute to increase its use. For the construction of Bacillus thuringiensis strain having broad host spectrum, we cloned cry1C gene encoding a toxin protein highly toxic against Spodoptera exigua from a B. thuringiensis isolate and constructed two recombinant plasmids, pUBClC and plC60. The plasmid PUBC1C has a replication origin of the natural plasmid pBC16 from B. cereus which is closely related species to B. thuringiensis, and the pBC16 was known to be replicated by rolling-circle mechanism. The plasmid pIC60 has a replication origin of a resident 60 MDa plasmid from B. thuringiensis subsp. kurstaki HD263, and it is believed that the pIC60 is replicated in a theta mode. The two plasmids were introduced into B. thuringiensis subsp. kurstaki cryB strain, and the transformed strains produced well-shaped bipyramidal crystals. We confirmed the expression of the cry1C gene by SDS-PAGE, and Western blotting. By investigating the segregational stability, it was found that the plasmid pIC60 is more stable than the pUBC1C.
The transformation of Bacillus subtilis K-54 and J-10 was carried out with constructed vectors containing structure and enhancer genes of aprN and prtR, to increase their fibrinolytic enzyme activity. Bands for the aprN and prtR genes were identified from B. subtilis J-10 by PCR that was carried out with the constructed primers for the genes. In addition, the gene fragments contained promoter site based on the results of analysing their nucleotide sequence. The two gene fragments, aprN and prtR, obtained by the PCR, were, then, inserted to vector such as T-vector and E.coli/Bacillus shuttle vector. The constructed vector were designated as pAPR2 (aprN), pENC2 (prtR) and pFLA1 (aprN and prtR), respectively. The constructed vector was used for transformation of the strains of B.subtilis J-10 and B. subtilis K-54 and the fribrinolytic activity of the transformed strains was investigated. The introduction of the vector, pAPR2 and the fibrinolytic activity of the transformed strains was investigated. The introduction of the vector, pAPR2 and pFLA1, resulted in the increase of fibrinolyitic enzyme activity in B. subtilis J-10 by 27.3% and 16%, respectively. However, the introduction of pENC2 to B. subtilis J-10 did not seem to induce increase of the enzyme activity. The strain of B.subtilis K-54 transformed with pENC2 showed an increased fibrinolytic activity by 5 folds compared with that of the original strain of B. subtilis K-54.
Yun, Hyun Sun;Heo, Ju Hee;Son, Seok Jun;Park, Mi Ri;Oh, Sangnam;Song, Min-Ho;Kim, Jong Nam;Go, Gwang-Woong;Cho, Ho-Seong;Choi, Nag-Jin;Jo, Seung-Wha;Jeong, Do-Youn;Kim, Younghoon
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제24권8호
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pp.1105-1108
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2014
We investigated whether Bacillus spp., newly isolated from Korean traditional food resources, influence the resistance of hosts to foodborne pathogens, by using Caenorhabditis elegans as a surrogate host model. Initially, we selected 20 Bacillus spp. that possess antimicrobial activity against various foodborne pathogens, including Staphylococcus aureus. Among the selected strains, six strains of Bacillus spp. used in preconditioning significantly prolonged the survival of nematodes exposed to S. aureus. Based on 16S rRNA gene sequencing, all six strains were identified as B. licheniformis. Our findings suggest that preconditioning with B. licheniformis may modulate the host defense response against S. aureus.
Emerging of antibiotic resistance of pathogenic bacteria is now a very serious problem in the clinics to treat the diseases, which have been easy to cure by antibiotic treatments before. Unfortunately, antibiotics developed till now are not effective any more against the resistant bacteria. Lots of efforts to discover new antibiotics having novel and unique structures and functions are really urgent and undergoing in the whole world. In this study, we tried to screen and isolate Same unique bacterial strains producing antibacterial substances from the sea water, which is the poor environment for bacteria 10 make their growing. Three bacterial strains among 916 strains isolated showed inhibition clear zone on the marine agar plate growing pathogenic bacteria including Acinetobacter baumannii, Edwardsiella tarda, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Salmonella enterica. One of them, which was identified as Bacillus sp. DH-9 from 16S rRNA gene analysis, showed especially considerable antibacterial activity against S. aureus which is notorious for methicillin resistant S. aureus (MRSA). The growth of S. aureus was totally inhibited when the supernatant of Bacillus sp. DH-9 culture was treated on.
뽕나무하늘소(Apriona germari) 및 왕똥풍뎅이 (Aphodius apicalis) 사충으로부터 4종의 Bacillus thuringiensis를 분리하였다. B. thuringiensis의 편모 항원에 의한 동정 결과, 4종의 분리된 B. thuringiensis 중에서 1종은 darmstadiensis 아종으로 판명되었으나, 나머지 3종은 33종의 어느 B. thuringiensis 편모 항체와도 반응하지 않았다. 분리된 균주의 포자와 내독소 단백질 혼합물을 이용하여 뽕나무하늘소와 왕똥풍뎅이, 누에(Bombyx mori) 및 빨간집모가(Cules pipiens pallens) 유충에 대하여 생물검정한 결과, 이들 분리주들은 검정된 곤충에 대하여 독성을 갖지 않는 것으로 나타났다. 아울러 SDS-PAGE와 agarose gel electrophoresis를 이용하여 분리된 4종의 B. thuringiensis의 내독소 단백질과 plasmid DNA 패턴을 조사한 결과, darmstadiensis와 이미 보고된 20종의 무독성 B. thuringiensis와 차이를 보여 새로운 무독성 균주로 사료된다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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